Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q8SRN8

Protein Details
Accession Q8SRN8    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
446-465SFSIMKRKAMERKLAKEKKKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
450-465MKRKAMERKLAKEKKK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 11, nucl 10, cyto 10, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016887  F:ATP hydrolysis activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
KEGG ecu:ECU06_1250  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF00271  Helicase_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd18787  SF2_C_DEAD  
Amino Acid Sequences MEKSGKIKGGSFKTMGLDYRLLRNILYEGPTPIQRKTIPLILERRSLMGVGRTGSGKTLCYLIPAIQRAISGEKTLVIVPTKELVIQARRVLKRLARGIEEAWKLIEICTPGKIEGMSADMLVVDEIDRILEEPSLKSVFDRINESLSCQKVFFSATLPDHPLNMKVVEIETRINETVKHFFFYIPSESKEAALLRILDKTRKTIVFAATKYAVELLLEILNKNNFESRGIYSSMDDEARRANFRDFNTSKFSILVVTDVAARGLDIPYLDTVVNYDLCDERTFLHRVGRVRGMGVQYSFVTYTDVFHFFNIQETYLPDVEIGTIPQEYLDTYDFREFEHLKSIASKGHQKCLEFRRKVSVPAEYKDKIKMFKTHSMFERRETLLDRLNEMNSKKALPEREKEKPENKEYRDQTFIPYARKDSRIHLSAFGVAKDDYVRERREKFSFSIMKRKAMERKLAKEKKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.4
3 0.35
4 0.33
5 0.29
6 0.35
7 0.36
8 0.33
9 0.3
10 0.29
11 0.28
12 0.26
13 0.28
14 0.22
15 0.22
16 0.25
17 0.32
18 0.33
19 0.31
20 0.34
21 0.32
22 0.34
23 0.35
24 0.38
25 0.35
26 0.4
27 0.47
28 0.45
29 0.49
30 0.46
31 0.43
32 0.37
33 0.34
34 0.28
35 0.24
36 0.22
37 0.18
38 0.19
39 0.19
40 0.18
41 0.21
42 0.2
43 0.16
44 0.15
45 0.16
46 0.14
47 0.15
48 0.16
49 0.18
50 0.23
51 0.24
52 0.25
53 0.23
54 0.23
55 0.23
56 0.25
57 0.22
58 0.17
59 0.15
60 0.15
61 0.15
62 0.16
63 0.16
64 0.14
65 0.14
66 0.14
67 0.15
68 0.14
69 0.14
70 0.15
71 0.17
72 0.2
73 0.23
74 0.27
75 0.35
76 0.36
77 0.38
78 0.42
79 0.4
80 0.44
81 0.48
82 0.47
83 0.41
84 0.42
85 0.42
86 0.45
87 0.42
88 0.34
89 0.27
90 0.24
91 0.21
92 0.18
93 0.18
94 0.13
95 0.12
96 0.14
97 0.15
98 0.14
99 0.15
100 0.14
101 0.12
102 0.1
103 0.11
104 0.09
105 0.08
106 0.08
107 0.07
108 0.07
109 0.06
110 0.06
111 0.04
112 0.03
113 0.03
114 0.03
115 0.03
116 0.04
117 0.05
118 0.06
119 0.07
120 0.07
121 0.1
122 0.11
123 0.11
124 0.11
125 0.15
126 0.16
127 0.17
128 0.21
129 0.19
130 0.23
131 0.23
132 0.26
133 0.27
134 0.27
135 0.26
136 0.21
137 0.2
138 0.17
139 0.18
140 0.16
141 0.12
142 0.15
143 0.16
144 0.19
145 0.23
146 0.22
147 0.22
148 0.22
149 0.21
150 0.17
151 0.15
152 0.13
153 0.09
154 0.1
155 0.1
156 0.11
157 0.11
158 0.1
159 0.12
160 0.13
161 0.13
162 0.13
163 0.14
164 0.19
165 0.19
166 0.19
167 0.17
168 0.17
169 0.18
170 0.19
171 0.22
172 0.18
173 0.19
174 0.21
175 0.2
176 0.2
177 0.21
178 0.18
179 0.14
180 0.13
181 0.12
182 0.1
183 0.14
184 0.15
185 0.17
186 0.17
187 0.2
188 0.22
189 0.22
190 0.24
191 0.23
192 0.27
193 0.29
194 0.29
195 0.29
196 0.27
197 0.26
198 0.23
199 0.2
200 0.15
201 0.08
202 0.08
203 0.06
204 0.06
205 0.06
206 0.06
207 0.08
208 0.08
209 0.09
210 0.09
211 0.1
212 0.08
213 0.09
214 0.12
215 0.12
216 0.14
217 0.15
218 0.15
219 0.14
220 0.14
221 0.14
222 0.13
223 0.11
224 0.09
225 0.11
226 0.12
227 0.13
228 0.13
229 0.15
230 0.18
231 0.19
232 0.29
233 0.27
234 0.29
235 0.34
236 0.34
237 0.32
238 0.27
239 0.26
240 0.17
241 0.16
242 0.13
243 0.07
244 0.06
245 0.06
246 0.06
247 0.06
248 0.05
249 0.04
250 0.04
251 0.04
252 0.04
253 0.04
254 0.05
255 0.05
256 0.06
257 0.06
258 0.05
259 0.06
260 0.07
261 0.07
262 0.07
263 0.08
264 0.07
265 0.08
266 0.09
267 0.09
268 0.09
269 0.13
270 0.15
271 0.15
272 0.19
273 0.21
274 0.23
275 0.27
276 0.29
277 0.26
278 0.24
279 0.27
280 0.24
281 0.22
282 0.2
283 0.17
284 0.13
285 0.14
286 0.13
287 0.1
288 0.11
289 0.09
290 0.1
291 0.11
292 0.14
293 0.13
294 0.13
295 0.14
296 0.13
297 0.17
298 0.15
299 0.13
300 0.12
301 0.13
302 0.16
303 0.15
304 0.15
305 0.1
306 0.1
307 0.1
308 0.1
309 0.09
310 0.06
311 0.06
312 0.06
313 0.06
314 0.06
315 0.05
316 0.07
317 0.08
318 0.08
319 0.11
320 0.14
321 0.14
322 0.14
323 0.2
324 0.19
325 0.19
326 0.25
327 0.23
328 0.21
329 0.23
330 0.24
331 0.22
332 0.25
333 0.33
334 0.29
335 0.37
336 0.4
337 0.39
338 0.46
339 0.53
340 0.6
341 0.55
342 0.55
343 0.56
344 0.55
345 0.59
346 0.54
347 0.53
348 0.48
349 0.47
350 0.52
351 0.45
352 0.45
353 0.46
354 0.46
355 0.42
356 0.41
357 0.45
358 0.44
359 0.51
360 0.53
361 0.53
362 0.57
363 0.61
364 0.59
365 0.55
366 0.55
367 0.47
368 0.45
369 0.42
370 0.39
371 0.36
372 0.36
373 0.36
374 0.31
375 0.32
376 0.34
377 0.32
378 0.33
379 0.28
380 0.27
381 0.27
382 0.3
383 0.37
384 0.39
385 0.46
386 0.49
387 0.57
388 0.65
389 0.71
390 0.74
391 0.74
392 0.77
393 0.79
394 0.77
395 0.77
396 0.74
397 0.71
398 0.68
399 0.6
400 0.55
401 0.54
402 0.52
403 0.48
404 0.47
405 0.48
406 0.48
407 0.52
408 0.49
409 0.47
410 0.51
411 0.5
412 0.48
413 0.45
414 0.4
415 0.41
416 0.41
417 0.34
418 0.28
419 0.23
420 0.22
421 0.19
422 0.2
423 0.2
424 0.25
425 0.31
426 0.36
427 0.42
428 0.47
429 0.52
430 0.54
431 0.51
432 0.55
433 0.59
434 0.57
435 0.63
436 0.61
437 0.63
438 0.62
439 0.68
440 0.67
441 0.65
442 0.69
443 0.68
444 0.74
445 0.78