FuNGI

H1V444

Protein Details

Accession

H1V444

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
13-40	NDVAEPPHKRSRKPNPKTRDHQNAYIDP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
22-25	RSRK

Subcellular Location(s)

nucl 10.5, mito 9, cyto_nucl 9, cyto 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR035426 Gemin2/Brr1
Gene Ontology	GO:0000387 P:spliceosomal snRNP assembly
KEGG	chig:CH63R_07147 -
Pfam	View protein in Pfam PF04938 SIP1

Amino Acid Sequences

MSSKRSYAASDVNDVAEPPHKRSRKPNPKTRDHQNAYIDPTWGQKYVFSSAAGSTTVPVDPDLDFEDDADAMAYLKSVRTQANGIPHLLVAPKVPIGPQLPKELQNDDDEAEEGEAVEEDRDIYSTGQGDFRGYYQDGAYMARPDNWVDHRAARDHDAEGGEWQGNEGIYDVDDVEEDNTDPEAAIREAYFAAILSKFNTLRKTLHATPPPNIVAALPHTHGYHVGAFGPKSGTFAIWSQRLRATDPHPAQVASMDKDGVLRVVRVLLGGSFLRRGAELGERTSRWLWALLARLPERGGLNHAETGWVRDLGRRAVLMMQSLADMAALRDALEGEGMDLGVHDAVDESSDDEDALREMDVEERDGEEPDGDGKPGEETPIAAAKVPTETTKLTEEADPTPKKPAVDDGEVEDGEIDEDADDDQKSEAMDVSEDGEVDEGEIAEDPPAQTLEEARARLLAQLDTAAEVAPSEAPSEEAIAEVEDEEGTVDQLRARMNMRVTLTMILTVAGEFYGQRDLLEFRDPFTGM

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.29
2	0.26
3	0.26
4	0.25
5	0.27
6	0.36
7	0.4
8	0.45
9	0.56
10	0.66
11	0.7
12	0.78
13	0.82
14	0.82
15	0.88
16	0.91
17	0.91
18	0.91
19	0.86
20	0.84
21	0.81
22	0.77
23	0.73
24	0.66
25	0.57
26	0.46
27	0.44
28	0.39
29	0.32
30	0.26
31	0.22
32	0.23
33	0.26
34	0.26
35	0.22
36	0.21
37	0.2
38	0.21
39	0.19
40	0.16
41	0.12
42	0.12
43	0.12
44	0.11
45	0.1
46	0.1
47	0.1
48	0.11
49	0.13
50	0.14
51	0.13
52	0.13
53	0.14
54	0.12
55	0.12
56	0.1
57	0.07
58	0.06
59	0.06
60	0.06
61	0.05
62	0.06
63	0.08
64	0.11
65	0.13
66	0.15
67	0.17
68	0.21
69	0.29
70	0.31
71	0.3
72	0.27
73	0.26
74	0.25
75	0.23
76	0.2
77	0.12
78	0.11
79	0.11
80	0.11
81	0.11
82	0.14
83	0.17
84	0.23
85	0.25
86	0.31
87	0.33
88	0.38
89	0.41
90	0.4
91	0.38
92	0.34
93	0.33
94	0.26
95	0.24
96	0.19
97	0.16
98	0.14
99	0.11
100	0.08
101	0.07
102	0.06
103	0.05
104	0.05
105	0.04
106	0.05
107	0.05
108	0.06
109	0.06
110	0.07
111	0.08
112	0.1
113	0.11
114	0.12
115	0.12
116	0.12
117	0.12
118	0.12
119	0.15
120	0.14
121	0.14
122	0.12
123	0.13
124	0.13
125	0.14
126	0.15
127	0.13
128	0.14
129	0.15
130	0.15
131	0.15
132	0.19
133	0.2
134	0.22
135	0.21
136	0.24
137	0.25
138	0.27
139	0.28
140	0.27
141	0.26
142	0.24
143	0.24
144	0.21
145	0.19
146	0.17
147	0.16
148	0.13
149	0.11
150	0.11
151	0.09
152	0.08
153	0.07
154	0.07
155	0.05
156	0.05
157	0.05
158	0.05
159	0.04
160	0.04
161	0.05
162	0.05
163	0.05
164	0.05
165	0.05
166	0.05
167	0.05
168	0.05
169	0.05
170	0.06
171	0.06
172	0.07
173	0.06
174	0.07
175	0.07
176	0.07
177	0.07
178	0.05
179	0.06
180	0.07
181	0.07
182	0.07
183	0.1
184	0.12
185	0.15
186	0.17
187	0.18
188	0.19
189	0.22
190	0.29
191	0.3
192	0.37
193	0.42
194	0.43
195	0.42
196	0.46
197	0.42
198	0.35
199	0.3
200	0.22
201	0.16
202	0.15
203	0.15
204	0.11
205	0.11
206	0.11
207	0.11
208	0.11
209	0.12
210	0.1
211	0.09
212	0.09
213	0.09
214	0.09
215	0.1
216	0.11
217	0.09
218	0.1
219	0.1
220	0.09
221	0.09
222	0.1
223	0.13
224	0.17
225	0.18
226	0.18
227	0.2
228	0.21
229	0.22
230	0.24
231	0.24
232	0.28
233	0.29
234	0.3
235	0.28
236	0.27
237	0.25
238	0.23
239	0.22
240	0.14
241	0.13
242	0.1
243	0.1
244	0.1
245	0.1
246	0.09
247	0.07
248	0.06
249	0.05
250	0.06
251	0.06
252	0.05
253	0.05
254	0.04
255	0.05
256	0.05
257	0.06
258	0.06
259	0.06
260	0.06
261	0.06
262	0.06
263	0.06
264	0.1
265	0.11
266	0.13
267	0.16
268	0.16
269	0.18
270	0.19
271	0.18
272	0.14
273	0.13
274	0.12
275	0.11
276	0.14
277	0.14
278	0.18
279	0.18
280	0.18
281	0.18
282	0.19
283	0.17
284	0.14
285	0.15
286	0.12
287	0.13
288	0.13
289	0.13
290	0.13
291	0.12
292	0.14
293	0.13
294	0.12
295	0.11
296	0.12
297	0.14
298	0.14
299	0.15
300	0.12
301	0.12
302	0.13
303	0.13
304	0.12
305	0.1
306	0.09
307	0.08
308	0.08
309	0.07
310	0.05
311	0.04
312	0.03
313	0.04
314	0.03
315	0.03
316	0.04
317	0.04
318	0.04
319	0.04
320	0.04
321	0.04
322	0.04
323	0.04
324	0.03
325	0.03
326	0.03
327	0.03
328	0.03
329	0.03
330	0.03
331	0.03
332	0.04
333	0.04
334	0.05
335	0.05
336	0.05
337	0.05
338	0.05
339	0.05
340	0.05
341	0.06
342	0.04
343	0.04
344	0.05
345	0.08
346	0.08
347	0.09
348	0.09
349	0.1
350	0.11
351	0.12
352	0.12
353	0.09
354	0.09
355	0.1
356	0.1
357	0.09
358	0.08
359	0.08
360	0.09
361	0.09
362	0.1
363	0.08
364	0.08
365	0.1
366	0.13
367	0.13
368	0.12
369	0.12
370	0.12
371	0.13
372	0.14
373	0.13
374	0.12
375	0.13
376	0.15
377	0.17
378	0.18
379	0.18
380	0.19
381	0.2
382	0.22
383	0.3
384	0.3
385	0.29
386	0.34
387	0.34
388	0.32
389	0.3
390	0.34
391	0.31
392	0.32
393	0.32
394	0.3
395	0.31
396	0.31
397	0.3
398	0.22
399	0.16
400	0.12
401	0.11
402	0.07
403	0.03
404	0.04
405	0.04
406	0.06
407	0.06
408	0.06
409	0.06
410	0.07
411	0.07
412	0.08
413	0.08
414	0.07
415	0.08
416	0.08
417	0.1
418	0.09
419	0.09
420	0.09
421	0.08
422	0.07
423	0.07
424	0.07
425	0.04
426	0.05
427	0.05
428	0.05
429	0.06
430	0.07
431	0.07
432	0.07
433	0.08
434	0.08
435	0.08
436	0.09
437	0.15
438	0.18
439	0.19
440	0.18
441	0.19
442	0.19
443	0.21
444	0.22
445	0.16
446	0.12
447	0.13
448	0.13
449	0.12
450	0.12
451	0.1
452	0.07
453	0.07
454	0.07
455	0.07
456	0.07
457	0.07
458	0.07
459	0.08
460	0.09
461	0.1
462	0.09
463	0.08
464	0.08
465	0.08
466	0.08
467	0.07
468	0.07
469	0.06
470	0.06
471	0.06
472	0.06
473	0.06
474	0.07
475	0.07
476	0.08
477	0.11
478	0.13
479	0.15
480	0.17
481	0.22
482	0.24
483	0.29
484	0.3
485	0.3
486	0.31
487	0.3
488	0.28
489	0.24
490	0.21
491	0.16
492	0.13
493	0.1
494	0.09
495	0.06
496	0.06
497	0.05
498	0.07
499	0.1
500	0.1
501	0.1
502	0.12
503	0.14
504	0.16
505	0.24
506	0.23
507	0.21

H1V444

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer