Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1VPX4

Protein Details
Accession H1VPX4    Localization Confidence High Confidence Score 17.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
144-163LSQKVGKDGRKRNGIKKKSSBasic
691-716YSSNSLTRHFKRKHLSKMKADDKIECHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
150-161KDGRKRNGIKKK
506-529RRLKAALRRLPPRSKAYRDARREI
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 13, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021842  DUF3435  
IPR013762  Integrase-like_cat_sf  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0015074  P:DNA integration  
GO:0006310  P:DNA recombination  
KEGG chig:CH63R_10621  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF11917  DUF3435  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
Amino Acid Sequences MPPRQRCHVDASNSDDSLSPSDDDISDGTSNANEDVFDVNEDEDGPSTDATDIEDLDKEAELDVEDQIMLFGGNLHPPDYWRRAVEEMNESEFEGQDYSPSTMALLDNVEEQWRLYCEVLNRDPRHCYETLSIKLLYNFFDWYLSQKVGKDGRKRNGIKKKSSLGTYWKIFRLVFERAMGERIASKLGRSMRKVIGRLAEKHGLNDQARANRIMTIDQLKQHIEETLSTTRKMFEVGEVRILAVLFVLLVAPAGARRRAIARLRFRDIRVVLARDPQGGPHKLLIRFTPKFTKEYLGAKAQNTYPIPETMFDPSLLLSPHVFLLGILFRHQAFRAGSLISPDQLKKLDICPDELELPLPLREKLNDTYIFRRAVLGTEGYVLSTNEPISEAMMGAWFKRIGELMGLEYSTILYSLRYNAANGFDQSADVSEALRNLVLGHASSEPFRHHYLGREIGADLWGILRGQRPQQALIKQSGSIGHSISRRRPTDLTQEQSASIATHPTIRRLKAALRRLPPRSKAYRDARREINNEKQRLRRELKQTIIHEWTDNQAVDDIERQLRGDSFTKPAVADTCRPQGPAQKRLLAALTAPLIATLEDQYKRRDNAIDAVSAYCLVQEGCTTHRPRSQSKDSLPKTPSSGSEVSPLSLATLSVYARNKTERPRRCFLCIGQAHCLLPDDPRVDNLIQEFYSSNSLTRHFKRKHLSKMKADDKIECKVCKMPLVHRMHLQRHAFEVHGTVS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.43
3 0.37
4 0.32
5 0.28
6 0.21
7 0.15
8 0.17
9 0.16
10 0.17
11 0.15
12 0.16
13 0.14
14 0.13
15 0.13
16 0.12
17 0.13
18 0.12
19 0.12
20 0.08
21 0.09
22 0.11
23 0.11
24 0.11
25 0.11
26 0.11
27 0.11
28 0.12
29 0.11
30 0.1
31 0.11
32 0.11
33 0.1
34 0.11
35 0.11
36 0.1
37 0.11
38 0.12
39 0.1
40 0.11
41 0.12
42 0.11
43 0.12
44 0.12
45 0.1
46 0.09
47 0.09
48 0.08
49 0.09
50 0.08
51 0.08
52 0.08
53 0.07
54 0.07
55 0.06
56 0.05
57 0.04
58 0.05
59 0.06
60 0.09
61 0.1
62 0.11
63 0.11
64 0.14
65 0.22
66 0.26
67 0.29
68 0.27
69 0.31
70 0.33
71 0.36
72 0.39
73 0.39
74 0.37
75 0.37
76 0.36
77 0.32
78 0.3
79 0.27
80 0.22
81 0.15
82 0.12
83 0.09
84 0.11
85 0.12
86 0.11
87 0.11
88 0.11
89 0.11
90 0.11
91 0.11
92 0.09
93 0.08
94 0.09
95 0.1
96 0.11
97 0.1
98 0.1
99 0.11
100 0.12
101 0.13
102 0.12
103 0.15
104 0.18
105 0.26
106 0.33
107 0.42
108 0.44
109 0.45
110 0.49
111 0.49
112 0.5
113 0.43
114 0.39
115 0.36
116 0.41
117 0.41
118 0.4
119 0.38
120 0.34
121 0.37
122 0.34
123 0.29
124 0.22
125 0.19
126 0.16
127 0.16
128 0.15
129 0.16
130 0.18
131 0.18
132 0.19
133 0.19
134 0.25
135 0.32
136 0.39
137 0.45
138 0.51
139 0.58
140 0.67
141 0.73
142 0.76
143 0.79
144 0.81
145 0.8
146 0.79
147 0.78
148 0.73
149 0.7
150 0.65
151 0.62
152 0.61
153 0.57
154 0.54
155 0.47
156 0.45
157 0.41
158 0.38
159 0.35
160 0.31
161 0.28
162 0.25
163 0.25
164 0.23
165 0.25
166 0.22
167 0.18
168 0.15
169 0.14
170 0.16
171 0.13
172 0.13
173 0.16
174 0.24
175 0.29
176 0.31
177 0.36
178 0.39
179 0.45
180 0.47
181 0.45
182 0.46
183 0.45
184 0.46
185 0.46
186 0.46
187 0.4
188 0.4
189 0.39
190 0.38
191 0.33
192 0.34
193 0.32
194 0.3
195 0.32
196 0.32
197 0.3
198 0.25
199 0.25
200 0.22
201 0.21
202 0.21
203 0.22
204 0.22
205 0.24
206 0.22
207 0.22
208 0.22
209 0.2
210 0.16
211 0.14
212 0.17
213 0.22
214 0.23
215 0.23
216 0.23
217 0.22
218 0.21
219 0.22
220 0.17
221 0.15
222 0.19
223 0.19
224 0.22
225 0.21
226 0.21
227 0.2
228 0.2
229 0.14
230 0.08
231 0.07
232 0.03
233 0.03
234 0.03
235 0.02
236 0.02
237 0.02
238 0.02
239 0.04
240 0.06
241 0.07
242 0.07
243 0.08
244 0.11
245 0.18
246 0.25
247 0.33
248 0.41
249 0.47
250 0.53
251 0.57
252 0.55
253 0.56
254 0.5
255 0.47
256 0.41
257 0.38
258 0.32
259 0.33
260 0.33
261 0.28
262 0.27
263 0.24
264 0.27
265 0.25
266 0.25
267 0.24
268 0.29
269 0.28
270 0.29
271 0.3
272 0.32
273 0.32
274 0.34
275 0.38
276 0.35
277 0.35
278 0.35
279 0.35
280 0.3
281 0.32
282 0.33
283 0.31
284 0.32
285 0.31
286 0.32
287 0.29
288 0.31
289 0.27
290 0.25
291 0.2
292 0.18
293 0.18
294 0.16
295 0.17
296 0.14
297 0.15
298 0.13
299 0.11
300 0.1
301 0.11
302 0.11
303 0.1
304 0.07
305 0.07
306 0.07
307 0.07
308 0.06
309 0.05
310 0.06
311 0.06
312 0.07
313 0.07
314 0.08
315 0.08
316 0.09
317 0.09
318 0.12
319 0.11
320 0.12
321 0.12
322 0.12
323 0.12
324 0.13
325 0.13
326 0.1
327 0.12
328 0.11
329 0.11
330 0.11
331 0.12
332 0.11
333 0.13
334 0.19
335 0.17
336 0.19
337 0.19
338 0.19
339 0.2
340 0.18
341 0.17
342 0.1
343 0.1
344 0.09
345 0.09
346 0.09
347 0.08
348 0.09
349 0.12
350 0.13
351 0.18
352 0.2
353 0.21
354 0.24
355 0.27
356 0.27
357 0.24
358 0.23
359 0.18
360 0.16
361 0.15
362 0.11
363 0.08
364 0.08
365 0.08
366 0.07
367 0.07
368 0.07
369 0.06
370 0.06
371 0.06
372 0.05
373 0.06
374 0.05
375 0.05
376 0.05
377 0.05
378 0.04
379 0.05
380 0.06
381 0.05
382 0.06
383 0.06
384 0.06
385 0.06
386 0.06
387 0.05
388 0.06
389 0.06
390 0.06
391 0.06
392 0.07
393 0.06
394 0.06
395 0.06
396 0.05
397 0.04
398 0.03
399 0.04
400 0.04
401 0.06
402 0.08
403 0.08
404 0.08
405 0.09
406 0.12
407 0.12
408 0.12
409 0.12
410 0.1
411 0.1
412 0.1
413 0.09
414 0.07
415 0.06
416 0.06
417 0.06
418 0.06
419 0.06
420 0.06
421 0.05
422 0.05
423 0.05
424 0.05
425 0.04
426 0.06
427 0.06
428 0.07
429 0.08
430 0.09
431 0.1
432 0.13
433 0.14
434 0.15
435 0.15
436 0.19
437 0.23
438 0.26
439 0.26
440 0.24
441 0.22
442 0.2
443 0.19
444 0.15
445 0.1
446 0.06
447 0.06
448 0.05
449 0.06
450 0.07
451 0.09
452 0.13
453 0.17
454 0.19
455 0.22
456 0.28
457 0.3
458 0.31
459 0.33
460 0.31
461 0.26
462 0.26
463 0.24
464 0.2
465 0.17
466 0.14
467 0.14
468 0.18
469 0.21
470 0.27
471 0.33
472 0.34
473 0.37
474 0.38
475 0.39
476 0.45
477 0.5
478 0.48
479 0.43
480 0.42
481 0.38
482 0.36
483 0.32
484 0.22
485 0.14
486 0.11
487 0.08
488 0.14
489 0.14
490 0.21
491 0.26
492 0.26
493 0.28
494 0.3
495 0.37
496 0.39
497 0.48
498 0.49
499 0.52
500 0.59
501 0.65
502 0.7
503 0.69
504 0.69
505 0.67
506 0.66
507 0.68
508 0.7
509 0.72
510 0.72
511 0.72
512 0.71
513 0.71
514 0.7
515 0.67
516 0.68
517 0.66
518 0.66
519 0.66
520 0.65
521 0.64
522 0.68
523 0.67
524 0.64
525 0.65
526 0.66
527 0.67
528 0.68
529 0.65
530 0.61
531 0.59
532 0.52
533 0.44
534 0.36
535 0.31
536 0.27
537 0.24
538 0.18
539 0.15
540 0.14
541 0.13
542 0.15
543 0.15
544 0.13
545 0.14
546 0.14
547 0.13
548 0.14
549 0.17
550 0.17
551 0.17
552 0.19
553 0.2
554 0.21
555 0.2
556 0.21
557 0.21
558 0.22
559 0.24
560 0.25
561 0.31
562 0.3
563 0.32
564 0.32
565 0.38
566 0.42
567 0.46
568 0.46
569 0.45
570 0.45
571 0.45
572 0.44
573 0.35
574 0.28
575 0.22
576 0.18
577 0.12
578 0.12
579 0.1
580 0.09
581 0.08
582 0.09
583 0.08
584 0.12
585 0.15
586 0.18
587 0.23
588 0.29
589 0.3
590 0.33
591 0.34
592 0.31
593 0.36
594 0.36
595 0.33
596 0.28
597 0.27
598 0.25
599 0.22
600 0.19
601 0.11
602 0.09
603 0.07
604 0.06
605 0.06
606 0.08
607 0.12
608 0.2
609 0.23
610 0.27
611 0.32
612 0.37
613 0.44
614 0.51
615 0.57
616 0.59
617 0.64
618 0.7
619 0.69
620 0.73
621 0.68
622 0.62
623 0.57
624 0.5
625 0.44
626 0.4
627 0.38
628 0.31
629 0.34
630 0.31
631 0.27
632 0.25
633 0.22
634 0.16
635 0.14
636 0.13
637 0.08
638 0.09
639 0.09
640 0.15
641 0.18
642 0.19
643 0.22
644 0.27
645 0.32
646 0.4
647 0.5
648 0.55
649 0.59
650 0.67
651 0.69
652 0.71
653 0.72
654 0.65
655 0.65
656 0.61
657 0.58
658 0.55
659 0.53
660 0.46
661 0.4
662 0.39
663 0.28
664 0.25
665 0.26
666 0.22
667 0.2
668 0.21
669 0.25
670 0.23
671 0.25
672 0.25
673 0.22
674 0.2
675 0.21
676 0.2
677 0.17
678 0.22
679 0.2
680 0.2
681 0.18
682 0.22
683 0.29
684 0.36
685 0.45
686 0.45
687 0.54
688 0.63
689 0.7
690 0.78
691 0.8
692 0.83
693 0.82
694 0.89
695 0.89
696 0.87
697 0.8
698 0.78
699 0.71
700 0.71
701 0.68
702 0.58
703 0.52
704 0.49
705 0.49
706 0.47
707 0.47
708 0.46
709 0.49
710 0.56
711 0.57
712 0.59
713 0.65
714 0.65
715 0.69
716 0.66
717 0.58
718 0.54
719 0.53
720 0.46
721 0.38