Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1VJA4

Protein Details
Accession H1VJA4    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
374-397PTAAPPPPEVKKPKRSPTPPPTIQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
384-387KKPK
Subcellular Location(s) cyto 10.5, cyto_nucl 9, mito 7, nucl 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008547  DUF829_TMEM53  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
KEGG chig:CH63R_12608  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05705  DUF829  
Amino Acid Sequences MASNQPAGAAGPLPAMQELSPTTFLYDPPSAVLDPNSPRLIVIFSWMSAQDVHIAKYTSRYMALYPSASILLVKCPFIHTLSTRISKRQIKPAVPVVRSLADAAPAAFSGGGQPQLLLHVFSNGGATNYAKFLELYADADRAGRLALPPHVTLYDSCPGGFHWMRSYRALSASMPRVLAPLAHVFIGWFWLFHVPLGRIGFFGKMWAALRQKALLGSEKRRAYLYSKEDEMIHWADVERHAEEAKENGFNVRKERFDGSQHVAHAKLNPSRYWGLVKEMWDADLKTIEPAPKGAEDPVPEPPKTAPESESPQVASASPNATLESDTPKVELTSPKVMAEPDVSKAAPAPAPAPALAQPVPAPEPAKAAPEPEAPTAAPPPPEVKKPKRSPTPPPTIQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.11
3 0.1
4 0.12
5 0.13
6 0.15
7 0.17
8 0.16
9 0.18
10 0.18
11 0.19
12 0.22
13 0.22
14 0.19
15 0.18
16 0.21
17 0.19
18 0.19
19 0.21
20 0.21
21 0.23
22 0.29
23 0.28
24 0.25
25 0.25
26 0.24
27 0.25
28 0.18
29 0.19
30 0.15
31 0.14
32 0.16
33 0.16
34 0.16
35 0.14
36 0.14
37 0.16
38 0.16
39 0.17
40 0.18
41 0.2
42 0.19
43 0.23
44 0.25
45 0.2
46 0.21
47 0.2
48 0.18
49 0.22
50 0.25
51 0.21
52 0.19
53 0.18
54 0.17
55 0.16
56 0.16
57 0.12
58 0.15
59 0.15
60 0.15
61 0.14
62 0.16
63 0.18
64 0.19
65 0.22
66 0.18
67 0.23
68 0.29
69 0.36
70 0.37
71 0.4
72 0.47
73 0.52
74 0.56
75 0.6
76 0.61
77 0.57
78 0.61
79 0.67
80 0.67
81 0.58
82 0.54
83 0.47
84 0.4
85 0.37
86 0.32
87 0.22
88 0.15
89 0.14
90 0.12
91 0.1
92 0.08
93 0.08
94 0.06
95 0.06
96 0.06
97 0.07
98 0.07
99 0.07
100 0.07
101 0.07
102 0.09
103 0.09
104 0.09
105 0.08
106 0.08
107 0.08
108 0.08
109 0.09
110 0.08
111 0.08
112 0.08
113 0.08
114 0.08
115 0.08
116 0.09
117 0.08
118 0.08
119 0.08
120 0.09
121 0.09
122 0.1
123 0.1
124 0.1
125 0.1
126 0.11
127 0.1
128 0.08
129 0.08
130 0.06
131 0.05
132 0.07
133 0.1
134 0.12
135 0.12
136 0.13
137 0.13
138 0.14
139 0.14
140 0.16
141 0.16
142 0.14
143 0.14
144 0.13
145 0.13
146 0.19
147 0.19
148 0.16
149 0.19
150 0.22
151 0.24
152 0.26
153 0.28
154 0.22
155 0.23
156 0.24
157 0.19
158 0.2
159 0.21
160 0.2
161 0.19
162 0.17
163 0.16
164 0.14
165 0.13
166 0.1
167 0.09
168 0.08
169 0.08
170 0.07
171 0.07
172 0.07
173 0.09
174 0.07
175 0.05
176 0.05
177 0.06
178 0.07
179 0.07
180 0.09
181 0.07
182 0.1
183 0.11
184 0.11
185 0.1
186 0.11
187 0.11
188 0.09
189 0.09
190 0.06
191 0.07
192 0.07
193 0.12
194 0.13
195 0.14
196 0.15
197 0.15
198 0.16
199 0.15
200 0.16
201 0.18
202 0.2
203 0.23
204 0.3
205 0.3
206 0.31
207 0.31
208 0.31
209 0.28
210 0.32
211 0.32
212 0.28
213 0.29
214 0.29
215 0.28
216 0.27
217 0.27
218 0.2
219 0.15
220 0.12
221 0.11
222 0.11
223 0.12
224 0.13
225 0.1
226 0.09
227 0.09
228 0.09
229 0.1
230 0.11
231 0.11
232 0.11
233 0.1
234 0.14
235 0.17
236 0.19
237 0.23
238 0.24
239 0.24
240 0.26
241 0.29
242 0.28
243 0.28
244 0.32
245 0.33
246 0.33
247 0.33
248 0.32
249 0.29
250 0.27
251 0.26
252 0.26
253 0.25
254 0.25
255 0.24
256 0.27
257 0.27
258 0.28
259 0.28
260 0.24
261 0.25
262 0.25
263 0.26
264 0.25
265 0.24
266 0.24
267 0.22
268 0.21
269 0.17
270 0.15
271 0.14
272 0.11
273 0.14
274 0.14
275 0.13
276 0.14
277 0.15
278 0.14
279 0.15
280 0.16
281 0.16
282 0.17
283 0.18
284 0.26
285 0.29
286 0.27
287 0.28
288 0.27
289 0.29
290 0.3
291 0.3
292 0.23
293 0.25
294 0.31
295 0.31
296 0.33
297 0.28
298 0.27
299 0.25
300 0.23
301 0.19
302 0.15
303 0.14
304 0.13
305 0.13
306 0.12
307 0.12
308 0.13
309 0.13
310 0.16
311 0.17
312 0.17
313 0.17
314 0.17
315 0.17
316 0.19
317 0.23
318 0.23
319 0.28
320 0.29
321 0.29
322 0.3
323 0.29
324 0.28
325 0.28
326 0.24
327 0.19
328 0.21
329 0.2
330 0.19
331 0.2
332 0.21
333 0.18
334 0.17
335 0.15
336 0.15
337 0.16
338 0.16
339 0.17
340 0.16
341 0.19
342 0.19
343 0.19
344 0.17
345 0.18
346 0.2
347 0.21
348 0.21
349 0.17
350 0.22
351 0.21
352 0.26
353 0.23
354 0.24
355 0.25
356 0.28
357 0.31
358 0.28
359 0.3
360 0.25
361 0.27
362 0.29
363 0.28
364 0.24
365 0.23
366 0.27
367 0.3
368 0.39
369 0.47
370 0.53
371 0.61
372 0.7
373 0.78
374 0.83
375 0.87
376 0.88
377 0.89