Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q8SQX4

Protein Details
Accession Q8SQX4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
80-107DLLSSKEETNRKRRIRKEKSRKEAEYWLHydrophilic
341-362ELEARRDKRERHSQRVDMHTHSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
90-101RKRRIRKEKSRK
Subcellular Location(s) nucl 12.5, mito 10, cyto_nucl 9, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036279  5-3_exonuclease_C_sf  
IPR008918  HhH2  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
IPR044752  PIN-like_EXO1  
IPR006086  XPG-I_dom  
IPR006084  XPG/Rad2  
IPR006085  XPG_DNA_repair_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0035312  F:5'-3' DNA exonuclease activity  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006281  P:DNA repair  
KEGG ecu:ECU11_0760  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00867  XPG_I  
PF00752  XPG_N  
CDD cd09901  H3TH_FEN1-like  
cd09857  PIN_EXO1  
Amino Acid Sequences MGISGLLPIVAPKLVKKHISSYKRQRVGVDGHAWLYQILPCVAEEMFFKVPTKRHVDLFEEKVKLLESYGIIPVIVLDGDLLSSKEETNRKRRIRKEKSRKEAEYWLMRNDPAKAKGFMRQCIAVTREVVSDIARMLERINVEYIISPYESDAQLCFLQRIGYIDCILTEDSDLIPYGSSKVLYKFDSAFVQEFNRECLSEVKGKDFEENILDISILSGCDYLASIQGVGVVTAHRLLSREKTVERVVEYLKYRKPVPSSYLEDFSRAKKTFLHQIVYDPIQKRRRHLQDAGEKLDFLGTLKEEEYVVESALPELFFKPSSRAKAIKRHFIPLARREGSEELEARRDKRERHSQRVDMHTHSPYFK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.31
3 0.33
4 0.42
5 0.51
6 0.59
7 0.66
8 0.71
9 0.75
10 0.78
11 0.77
12 0.7
13 0.66
14 0.64
15 0.61
16 0.55
17 0.46
18 0.4
19 0.38
20 0.36
21 0.29
22 0.24
23 0.17
24 0.14
25 0.12
26 0.11
27 0.1
28 0.12
29 0.12
30 0.11
31 0.11
32 0.14
33 0.16
34 0.16
35 0.18
36 0.21
37 0.25
38 0.31
39 0.38
40 0.36
41 0.38
42 0.42
43 0.47
44 0.5
45 0.53
46 0.54
47 0.48
48 0.45
49 0.41
50 0.37
51 0.3
52 0.23
53 0.19
54 0.12
55 0.12
56 0.14
57 0.13
58 0.12
59 0.11
60 0.11
61 0.08
62 0.07
63 0.04
64 0.03
65 0.03
66 0.04
67 0.04
68 0.05
69 0.05
70 0.06
71 0.07
72 0.13
73 0.2
74 0.28
75 0.37
76 0.47
77 0.56
78 0.65
79 0.75
80 0.81
81 0.85
82 0.89
83 0.91
84 0.91
85 0.93
86 0.93
87 0.87
88 0.81
89 0.79
90 0.75
91 0.73
92 0.64
93 0.58
94 0.49
95 0.45
96 0.41
97 0.37
98 0.34
99 0.29
100 0.3
101 0.28
102 0.28
103 0.34
104 0.37
105 0.36
106 0.33
107 0.31
108 0.28
109 0.3
110 0.31
111 0.26
112 0.22
113 0.2
114 0.17
115 0.16
116 0.16
117 0.11
118 0.1
119 0.08
120 0.08
121 0.07
122 0.07
123 0.07
124 0.09
125 0.09
126 0.09
127 0.1
128 0.09
129 0.09
130 0.1
131 0.1
132 0.09
133 0.08
134 0.07
135 0.07
136 0.09
137 0.09
138 0.08
139 0.08
140 0.09
141 0.1
142 0.1
143 0.1
144 0.08
145 0.08
146 0.08
147 0.1
148 0.09
149 0.09
150 0.09
151 0.09
152 0.09
153 0.09
154 0.09
155 0.07
156 0.06
157 0.06
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.04
162 0.04
163 0.04
164 0.05
165 0.05
166 0.06
167 0.06
168 0.08
169 0.11
170 0.12
171 0.13
172 0.13
173 0.14
174 0.15
175 0.15
176 0.14
177 0.12
178 0.13
179 0.13
180 0.13
181 0.14
182 0.13
183 0.12
184 0.13
185 0.14
186 0.16
187 0.19
188 0.19
189 0.2
190 0.21
191 0.22
192 0.22
193 0.21
194 0.19
195 0.15
196 0.15
197 0.12
198 0.1
199 0.09
200 0.07
201 0.07
202 0.06
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.03
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.05
212 0.04
213 0.04
214 0.06
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.04
219 0.05
220 0.05
221 0.06
222 0.05
223 0.06
224 0.08
225 0.12
226 0.16
227 0.2
228 0.2
229 0.24
230 0.25
231 0.27
232 0.26
233 0.25
234 0.22
235 0.24
236 0.28
237 0.3
238 0.31
239 0.32
240 0.32
241 0.34
242 0.36
243 0.35
244 0.37
245 0.37
246 0.41
247 0.42
248 0.45
249 0.41
250 0.41
251 0.38
252 0.36
253 0.38
254 0.32
255 0.29
256 0.27
257 0.3
258 0.37
259 0.4
260 0.4
261 0.33
262 0.35
263 0.39
264 0.39
265 0.43
266 0.36
267 0.4
268 0.44
269 0.46
270 0.48
271 0.54
272 0.6
273 0.61
274 0.64
275 0.65
276 0.67
277 0.72
278 0.72
279 0.62
280 0.53
281 0.45
282 0.39
283 0.29
284 0.2
285 0.14
286 0.09
287 0.1
288 0.1
289 0.11
290 0.1
291 0.11
292 0.13
293 0.11
294 0.11
295 0.1
296 0.1
297 0.1
298 0.11
299 0.11
300 0.08
301 0.09
302 0.1
303 0.11
304 0.13
305 0.18
306 0.24
307 0.3
308 0.36
309 0.42
310 0.48
311 0.57
312 0.64
313 0.69
314 0.66
315 0.66
316 0.66
317 0.66
318 0.68
319 0.65
320 0.68
321 0.59
322 0.56
323 0.54
324 0.51
325 0.46
326 0.43
327 0.38
328 0.31
329 0.37
330 0.4
331 0.38
332 0.44
333 0.46
334 0.47
335 0.53
336 0.61
337 0.63
338 0.7
339 0.79
340 0.78
341 0.81
342 0.84
343 0.8
344 0.74
345 0.7
346 0.65