Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1W1D7

Protein Details
Accession H1W1D7    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
76-102AQAPAPKASRGPKKKKQSNLHTPAARQHydrophilic
484-507AQLEGRKDKKTQWRRVQDDFKDNEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
81-91PKASRGPKKKK
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 12, mito 4, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039128  TRIP4-like  
IPR009349  Znf_C2HC5  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
KEGG chig:CH63R_05303  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06221  zf-C2HC5  
Amino Acid Sequences MSLVQLSRLLPLPEEELKQVLDYATTLSKTEAAEHFNNLLGDSPQAVEFISSFNSRRQDTKPTAPAPAPSSNSSSAQAPAPKASRGPKKKKQSNLHTPAARQVDAAPPPGASYSKKDREEEYYGGKKPTQPAESSASTSANFKQSLKSANPPPQQQRTAAGYLISDKAKPKSNPVSRSSTPKPTAKPTKVSIAGGTPMAGASTALNDLDAAIRSLELTTNPTMGDDPKARRCNCVATRHPLQTAAPNCQSCGKVICVKEGLGPCTFCGTPLLSSEDVQGMIRELKSERGRERMAADREAHKRAEVSKKPAPFSQNNNSSMSEAESKAREHRDKLLNFQAQNARRTTVRDEAADFDVSGAMAGSGGNIWSTPEDRARELKRQQKILREIEWNARPEYEKRRQVVSIDVVGGKVVRKMAAVERPTTPEGEDVVVHEDVDENDYVGSRKQGGSNGGGGGGGGAFSHNPLLGGLIKPVWDAKGKDKAAQLEGRKDKKTQWRRVQDDFKDNEAVILDGGAHGHSTTADEPDCG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.26
3 0.24
4 0.24
5 0.23
6 0.22
7 0.17
8 0.13
9 0.11
10 0.13
11 0.14
12 0.14
13 0.15
14 0.15
15 0.17
16 0.17
17 0.21
18 0.22
19 0.25
20 0.26
21 0.28
22 0.29
23 0.28
24 0.28
25 0.23
26 0.22
27 0.16
28 0.15
29 0.13
30 0.13
31 0.1
32 0.1
33 0.1
34 0.09
35 0.08
36 0.09
37 0.11
38 0.13
39 0.15
40 0.2
41 0.25
42 0.27
43 0.32
44 0.35
45 0.42
46 0.46
47 0.54
48 0.58
49 0.56
50 0.59
51 0.56
52 0.56
53 0.52
54 0.51
55 0.45
56 0.38
57 0.4
58 0.38
59 0.38
60 0.35
61 0.31
62 0.26
63 0.27
64 0.28
65 0.25
66 0.28
67 0.29
68 0.29
69 0.32
70 0.4
71 0.46
72 0.53
73 0.62
74 0.66
75 0.75
76 0.82
77 0.88
78 0.89
79 0.89
80 0.9
81 0.88
82 0.87
83 0.8
84 0.73
85 0.7
86 0.64
87 0.53
88 0.42
89 0.35
90 0.32
91 0.3
92 0.31
93 0.24
94 0.19
95 0.19
96 0.2
97 0.21
98 0.16
99 0.21
100 0.28
101 0.36
102 0.4
103 0.42
104 0.44
105 0.48
106 0.52
107 0.5
108 0.48
109 0.47
110 0.46
111 0.47
112 0.45
113 0.42
114 0.42
115 0.45
116 0.4
117 0.34
118 0.36
119 0.39
120 0.39
121 0.38
122 0.34
123 0.28
124 0.24
125 0.25
126 0.24
127 0.22
128 0.21
129 0.19
130 0.21
131 0.22
132 0.28
133 0.29
134 0.34
135 0.37
136 0.46
137 0.5
138 0.55
139 0.6
140 0.62
141 0.61
142 0.56
143 0.53
144 0.48
145 0.44
146 0.37
147 0.29
148 0.22
149 0.21
150 0.22
151 0.18
152 0.15
153 0.16
154 0.2
155 0.27
156 0.27
157 0.33
158 0.41
159 0.48
160 0.53
161 0.55
162 0.6
163 0.55
164 0.63
165 0.6
166 0.59
167 0.56
168 0.55
169 0.53
170 0.55
171 0.63
172 0.59
173 0.59
174 0.53
175 0.55
176 0.52
177 0.49
178 0.4
179 0.31
180 0.28
181 0.22
182 0.19
183 0.11
184 0.08
185 0.07
186 0.06
187 0.05
188 0.03
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.05
196 0.05
197 0.05
198 0.04
199 0.04
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.08
205 0.08
206 0.09
207 0.09
208 0.09
209 0.09
210 0.1
211 0.13
212 0.15
213 0.19
214 0.27
215 0.35
216 0.35
217 0.38
218 0.39
219 0.44
220 0.46
221 0.51
222 0.47
223 0.46
224 0.51
225 0.51
226 0.49
227 0.41
228 0.35
229 0.33
230 0.3
231 0.28
232 0.27
233 0.25
234 0.25
235 0.27
236 0.26
237 0.2
238 0.2
239 0.17
240 0.18
241 0.18
242 0.2
243 0.18
244 0.18
245 0.21
246 0.2
247 0.2
248 0.16
249 0.16
250 0.14
251 0.15
252 0.15
253 0.11
254 0.11
255 0.09
256 0.09
257 0.1
258 0.13
259 0.11
260 0.12
261 0.12
262 0.11
263 0.11
264 0.1
265 0.09
266 0.07
267 0.07
268 0.07
269 0.08
270 0.08
271 0.14
272 0.18
273 0.23
274 0.24
275 0.28
276 0.29
277 0.3
278 0.33
279 0.34
280 0.34
281 0.32
282 0.32
283 0.34
284 0.37
285 0.38
286 0.35
287 0.28
288 0.26
289 0.28
290 0.36
291 0.34
292 0.38
293 0.4
294 0.44
295 0.46
296 0.48
297 0.48
298 0.43
299 0.46
300 0.48
301 0.5
302 0.49
303 0.49
304 0.47
305 0.41
306 0.36
307 0.3
308 0.23
309 0.17
310 0.17
311 0.15
312 0.16
313 0.2
314 0.27
315 0.28
316 0.28
317 0.35
318 0.42
319 0.42
320 0.47
321 0.51
322 0.49
323 0.46
324 0.49
325 0.49
326 0.44
327 0.47
328 0.42
329 0.34
330 0.3
331 0.33
332 0.32
333 0.3
334 0.28
335 0.26
336 0.26
337 0.27
338 0.29
339 0.26
340 0.21
341 0.15
342 0.12
343 0.11
344 0.09
345 0.06
346 0.03
347 0.03
348 0.03
349 0.03
350 0.03
351 0.03
352 0.03
353 0.03
354 0.04
355 0.05
356 0.06
357 0.08
358 0.13
359 0.15
360 0.18
361 0.26
362 0.3
363 0.38
364 0.45
365 0.51
366 0.54
367 0.61
368 0.63
369 0.65
370 0.7
371 0.66
372 0.63
373 0.6
374 0.57
375 0.56
376 0.56
377 0.5
378 0.42
379 0.37
380 0.35
381 0.35
382 0.42
383 0.43
384 0.45
385 0.45
386 0.49
387 0.49
388 0.48
389 0.48
390 0.43
391 0.35
392 0.3
393 0.28
394 0.23
395 0.22
396 0.21
397 0.15
398 0.12
399 0.11
400 0.09
401 0.09
402 0.11
403 0.17
404 0.24
405 0.26
406 0.27
407 0.29
408 0.34
409 0.35
410 0.33
411 0.28
412 0.21
413 0.2
414 0.19
415 0.16
416 0.13
417 0.16
418 0.15
419 0.14
420 0.12
421 0.12
422 0.11
423 0.13
424 0.12
425 0.08
426 0.08
427 0.09
428 0.1
429 0.1
430 0.11
431 0.12
432 0.13
433 0.16
434 0.2
435 0.23
436 0.24
437 0.26
438 0.24
439 0.22
440 0.2
441 0.17
442 0.13
443 0.09
444 0.06
445 0.04
446 0.04
447 0.04
448 0.05
449 0.06
450 0.06
451 0.06
452 0.06
453 0.08
454 0.1
455 0.1
456 0.12
457 0.12
458 0.12
459 0.13
460 0.14
461 0.15
462 0.18
463 0.2
464 0.26
465 0.36
466 0.37
467 0.41
468 0.45
469 0.48
470 0.49
471 0.54
472 0.52
473 0.52
474 0.61
475 0.63
476 0.62
477 0.6
478 0.62
479 0.66
480 0.71
481 0.71
482 0.72
483 0.76
484 0.8
485 0.88
486 0.89
487 0.87
488 0.86
489 0.79
490 0.73
491 0.65
492 0.57
493 0.48
494 0.38
495 0.3
496 0.19
497 0.15
498 0.11
499 0.07
500 0.08
501 0.07
502 0.06
503 0.06
504 0.06
505 0.06
506 0.09
507 0.1
508 0.14