Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1VDG6

Protein Details
Accession H1VDG6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
16-40DPETQQQPQQQWRPHHKHRLSASSAHydrophilic
114-135QYSQPSPSSPQQQRQHHRQSGYHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5, mito 2, extr 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045159  DCAF7-like  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MHFLGHRRSASQQSIDPETQQQPQQQWRPHHKHRLSASSALYQAAQALGSIGVPTAAATANAATANAATASASLPADAATANSNSSHPLLPNPVPSSSAVSSHSQSQQSSASSQYSQPSPSSPQQQRQHHRQSGYFQPNHNHNHNQPPLTSGPVSSPQTSSLQYTPGAASATKPATGSSLPNEPPVANFRWDDEYYNTRDRDDTDRDSNPAAATTDSASVRSLQPHQAHSYSHSHSHSYAHTHSHISSNNTRAHSRSQSYSQQQQRASIPAALLPAHGLQPHRDSTYSLSARSTATETSGPPGLTPSIALFPDHSSPSPSSSSAAAAMNQQQQQQQSPPQFQSGTPRRAGTYSSQHEELHMPAGMMQHGQLSPREYSSSSTAPAAPHIKLDQASPNVPQYQNTSSVPNVLQPGGPGNRPPVLTANTAPALSTMQPQQPQDYQTPSKPPSLSLSHSYSRSSPAAGYEGASTFAPYTPTTPSGSGSQFMSPPDQKYNAPGSQRNISNTPLGLADIRPRADSSMSDGVPGSVAYELANAQPGTSNYLAPWALYAFDWCKWPPQGHGAGKLAVGSYLEDGHNYIQILDTQMVPTPNDVYQPGTPKFNLEFSKVAEATHSYPVTRLLWEPPSSQKQSTDLLATSGDHLRLWSLPSESPVSQSNSITRQGRDTAVTKLTPLALLSNSKTPDHTAPLTSLDWNTVSPSLIITSSIDTTCTIWDIPSLTAKTQLIAHDKEVYDVRFCANSVDVFVSCGQDGSVRMFDLRSLEHSTIIYEPTGKDDRDANGGRISPTLAQQTMSNPPPLLRLATSPHDTHLLATFAQDSNVIRILDVRHPGQALLELRGHGGSLNSIEWSPTRRGVLASGADDCQVLLWDVYNNNHSLSGGPPANGAAQPDNTRSPYASWQCDYEVGNLAWVPHLSSNDQGEWLGVSAGRGLWGVKTCGRTGA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.49
3 0.46
4 0.45
5 0.43
6 0.43
7 0.43
8 0.44
9 0.45
10 0.53
11 0.6
12 0.61
13 0.67
14 0.73
15 0.78
16 0.83
17 0.86
18 0.82
19 0.82
20 0.83
21 0.82
22 0.76
23 0.73
24 0.66
25 0.6
26 0.56
27 0.47
28 0.39
29 0.29
30 0.24
31 0.18
32 0.13
33 0.08
34 0.07
35 0.07
36 0.06
37 0.06
38 0.05
39 0.05
40 0.05
41 0.05
42 0.05
43 0.05
44 0.05
45 0.06
46 0.06
47 0.08
48 0.08
49 0.08
50 0.07
51 0.06
52 0.07
53 0.06
54 0.06
55 0.05
56 0.05
57 0.06
58 0.08
59 0.08
60 0.07
61 0.07
62 0.07
63 0.08
64 0.07
65 0.07
66 0.08
67 0.09
68 0.1
69 0.11
70 0.11
71 0.13
72 0.15
73 0.16
74 0.15
75 0.18
76 0.24
77 0.26
78 0.32
79 0.33
80 0.31
81 0.31
82 0.31
83 0.34
84 0.28
85 0.28
86 0.24
87 0.25
88 0.26
89 0.3
90 0.34
91 0.31
92 0.3
93 0.3
94 0.31
95 0.29
96 0.29
97 0.26
98 0.24
99 0.22
100 0.25
101 0.27
102 0.26
103 0.26
104 0.26
105 0.27
106 0.3
107 0.35
108 0.43
109 0.46
110 0.53
111 0.61
112 0.7
113 0.76
114 0.8
115 0.84
116 0.81
117 0.78
118 0.73
119 0.7
120 0.7
121 0.71
122 0.65
123 0.59
124 0.59
125 0.62
126 0.65
127 0.65
128 0.62
129 0.56
130 0.62
131 0.63
132 0.58
133 0.51
134 0.48
135 0.43
136 0.4
137 0.36
138 0.26
139 0.23
140 0.28
141 0.31
142 0.28
143 0.27
144 0.25
145 0.27
146 0.28
147 0.28
148 0.22
149 0.21
150 0.2
151 0.21
152 0.18
153 0.17
154 0.16
155 0.13
156 0.13
157 0.16
158 0.17
159 0.16
160 0.16
161 0.15
162 0.17
163 0.18
164 0.19
165 0.17
166 0.23
167 0.23
168 0.25
169 0.26
170 0.23
171 0.24
172 0.26
173 0.26
174 0.22
175 0.21
176 0.22
177 0.27
178 0.28
179 0.28
180 0.29
181 0.31
182 0.33
183 0.4
184 0.38
185 0.32
186 0.32
187 0.33
188 0.35
189 0.37
190 0.37
191 0.37
192 0.38
193 0.4
194 0.4
195 0.38
196 0.31
197 0.26
198 0.2
199 0.14
200 0.13
201 0.12
202 0.14
203 0.13
204 0.13
205 0.13
206 0.14
207 0.15
208 0.18
209 0.2
210 0.24
211 0.27
212 0.3
213 0.34
214 0.34
215 0.33
216 0.34
217 0.38
218 0.33
219 0.36
220 0.34
221 0.31
222 0.3
223 0.32
224 0.3
225 0.29
226 0.28
227 0.26
228 0.26
229 0.27
230 0.27
231 0.29
232 0.3
233 0.31
234 0.34
235 0.35
236 0.39
237 0.4
238 0.4
239 0.37
240 0.41
241 0.41
242 0.4
243 0.38
244 0.39
245 0.44
246 0.49
247 0.56
248 0.57
249 0.57
250 0.55
251 0.54
252 0.5
253 0.46
254 0.41
255 0.33
256 0.26
257 0.2
258 0.2
259 0.16
260 0.14
261 0.11
262 0.1
263 0.09
264 0.11
265 0.11
266 0.12
267 0.15
268 0.18
269 0.18
270 0.18
271 0.18
272 0.21
273 0.3
274 0.29
275 0.26
276 0.25
277 0.24
278 0.24
279 0.24
280 0.21
281 0.12
282 0.13
283 0.13
284 0.13
285 0.14
286 0.17
287 0.15
288 0.13
289 0.14
290 0.13
291 0.11
292 0.11
293 0.09
294 0.09
295 0.1
296 0.1
297 0.1
298 0.11
299 0.14
300 0.15
301 0.14
302 0.15
303 0.16
304 0.19
305 0.19
306 0.18
307 0.16
308 0.15
309 0.16
310 0.15
311 0.14
312 0.12
313 0.12
314 0.16
315 0.2
316 0.21
317 0.22
318 0.23
319 0.24
320 0.25
321 0.27
322 0.29
323 0.29
324 0.31
325 0.31
326 0.31
327 0.31
328 0.29
329 0.36
330 0.38
331 0.38
332 0.36
333 0.35
334 0.33
335 0.33
336 0.35
337 0.29
338 0.3
339 0.3
340 0.31
341 0.32
342 0.31
343 0.32
344 0.31
345 0.27
346 0.19
347 0.15
348 0.11
349 0.1
350 0.11
351 0.1
352 0.08
353 0.08
354 0.08
355 0.08
356 0.09
357 0.09
358 0.11
359 0.11
360 0.12
361 0.13
362 0.12
363 0.14
364 0.17
365 0.17
366 0.16
367 0.16
368 0.17
369 0.16
370 0.19
371 0.19
372 0.15
373 0.15
374 0.15
375 0.16
376 0.14
377 0.16
378 0.17
379 0.16
380 0.17
381 0.18
382 0.2
383 0.21
384 0.21
385 0.21
386 0.2
387 0.2
388 0.22
389 0.22
390 0.22
391 0.18
392 0.21
393 0.2
394 0.18
395 0.16
396 0.13
397 0.12
398 0.1
399 0.14
400 0.13
401 0.14
402 0.13
403 0.14
404 0.15
405 0.16
406 0.16
407 0.16
408 0.17
409 0.18
410 0.18
411 0.19
412 0.17
413 0.17
414 0.15
415 0.13
416 0.11
417 0.09
418 0.1
419 0.1
420 0.12
421 0.15
422 0.16
423 0.18
424 0.19
425 0.21
426 0.22
427 0.25
428 0.25
429 0.24
430 0.3
431 0.3
432 0.32
433 0.3
434 0.28
435 0.27
436 0.28
437 0.28
438 0.26
439 0.29
440 0.28
441 0.28
442 0.29
443 0.25
444 0.25
445 0.22
446 0.18
447 0.14
448 0.12
449 0.12
450 0.11
451 0.11
452 0.08
453 0.08
454 0.09
455 0.08
456 0.07
457 0.06
458 0.06
459 0.07
460 0.07
461 0.08
462 0.09
463 0.11
464 0.12
465 0.12
466 0.13
467 0.14
468 0.15
469 0.14
470 0.14
471 0.13
472 0.13
473 0.13
474 0.16
475 0.14
476 0.16
477 0.17
478 0.19
479 0.18
480 0.21
481 0.25
482 0.25
483 0.27
484 0.29
485 0.29
486 0.33
487 0.34
488 0.33
489 0.29
490 0.27
491 0.25
492 0.21
493 0.19
494 0.13
495 0.12
496 0.1
497 0.09
498 0.11
499 0.12
500 0.13
501 0.13
502 0.13
503 0.13
504 0.13
505 0.13
506 0.15
507 0.17
508 0.17
509 0.17
510 0.16
511 0.16
512 0.15
513 0.14
514 0.09
515 0.04
516 0.04
517 0.04
518 0.04
519 0.05
520 0.05
521 0.07
522 0.06
523 0.06
524 0.08
525 0.08
526 0.11
527 0.11
528 0.11
529 0.09
530 0.12
531 0.12
532 0.1
533 0.1
534 0.07
535 0.07
536 0.07
537 0.08
538 0.07
539 0.09
540 0.11
541 0.11
542 0.14
543 0.16
544 0.17
545 0.17
546 0.22
547 0.29
548 0.29
549 0.34
550 0.31
551 0.3
552 0.29
553 0.27
554 0.21
555 0.13
556 0.11
557 0.07
558 0.06
559 0.06
560 0.06
561 0.06
562 0.07
563 0.07
564 0.08
565 0.08
566 0.07
567 0.06
568 0.07
569 0.08
570 0.08
571 0.08
572 0.07
573 0.09
574 0.1
575 0.09
576 0.09
577 0.1
578 0.1
579 0.11
580 0.11
581 0.12
582 0.14
583 0.2
584 0.21
585 0.22
586 0.22
587 0.23
588 0.24
589 0.26
590 0.26
591 0.23
592 0.23
593 0.22
594 0.28
595 0.26
596 0.24
597 0.19
598 0.2
599 0.19
600 0.22
601 0.21
602 0.15
603 0.15
604 0.18
605 0.18
606 0.17
607 0.16
608 0.15
609 0.19
610 0.2
611 0.22
612 0.27
613 0.33
614 0.35
615 0.35
616 0.33
617 0.32
618 0.32
619 0.31
620 0.26
621 0.19
622 0.16
623 0.16
624 0.14
625 0.14
626 0.13
627 0.12
628 0.1
629 0.1
630 0.1
631 0.1
632 0.11
633 0.1
634 0.11
635 0.11
636 0.13
637 0.17
638 0.16
639 0.18
640 0.2
641 0.22
642 0.22
643 0.23
644 0.24
645 0.23
646 0.29
647 0.3
648 0.27
649 0.26
650 0.27
651 0.27
652 0.27
653 0.26
654 0.25
655 0.25
656 0.24
657 0.21
658 0.2
659 0.19
660 0.16
661 0.14
662 0.12
663 0.1
664 0.13
665 0.14
666 0.18
667 0.19
668 0.19
669 0.2
670 0.22
671 0.22
672 0.25
673 0.24
674 0.21
675 0.2
676 0.23
677 0.24
678 0.22
679 0.19
680 0.16
681 0.15
682 0.14
683 0.14
684 0.12
685 0.11
686 0.09
687 0.09
688 0.09
689 0.08
690 0.09
691 0.08
692 0.09
693 0.1
694 0.1
695 0.1
696 0.1
697 0.11
698 0.1
699 0.11
700 0.09
701 0.08
702 0.09
703 0.1
704 0.1
705 0.15
706 0.16
707 0.15
708 0.19
709 0.19
710 0.19
711 0.2
712 0.24
713 0.24
714 0.25
715 0.26
716 0.28
717 0.28
718 0.29
719 0.3
720 0.27
721 0.22
722 0.21
723 0.21
724 0.16
725 0.16
726 0.15
727 0.14
728 0.13
729 0.13
730 0.14
731 0.12
732 0.13
733 0.14
734 0.13
735 0.12
736 0.11
737 0.1
738 0.09
739 0.1
740 0.12
741 0.13
742 0.12
743 0.13
744 0.13
745 0.14
746 0.14
747 0.14
748 0.15
749 0.19
750 0.19
751 0.2
752 0.2
753 0.2
754 0.19
755 0.19
756 0.16
757 0.13
758 0.12
759 0.17
760 0.21
761 0.19
762 0.2
763 0.22
764 0.24
765 0.3
766 0.32
767 0.28
768 0.28
769 0.3
770 0.29
771 0.26
772 0.26
773 0.19
774 0.2
775 0.22
776 0.18
777 0.18
778 0.18
779 0.21
780 0.27
781 0.28
782 0.27
783 0.23
784 0.23
785 0.25
786 0.25
787 0.24
788 0.18
789 0.19
790 0.21
791 0.26
792 0.3
793 0.28
794 0.28
795 0.29
796 0.28
797 0.26
798 0.24
799 0.2
800 0.16
801 0.16
802 0.17
803 0.14
804 0.14
805 0.15
806 0.13
807 0.14
808 0.18
809 0.17
810 0.14
811 0.17
812 0.2
813 0.24
814 0.28
815 0.26
816 0.24
817 0.25
818 0.25
819 0.23
820 0.26
821 0.22
822 0.21
823 0.21
824 0.19
825 0.2
826 0.2
827 0.19
828 0.13
829 0.12
830 0.1
831 0.1
832 0.1
833 0.1
834 0.1
835 0.12
836 0.13
837 0.17
838 0.19
839 0.21
840 0.22
841 0.22
842 0.23
843 0.24
844 0.28
845 0.27
846 0.26
847 0.24
848 0.23
849 0.22
850 0.21
851 0.19
852 0.13
853 0.1
854 0.09
855 0.07
856 0.07
857 0.1
858 0.12
859 0.16
860 0.18
861 0.18
862 0.18
863 0.19
864 0.18
865 0.16
866 0.15
867 0.2
868 0.19
869 0.19
870 0.18
871 0.19
872 0.21
873 0.2
874 0.22
875 0.17
876 0.2
877 0.23
878 0.27
879 0.31
880 0.31
881 0.32
882 0.3
883 0.3
884 0.36
885 0.41
886 0.43
887 0.4
888 0.4
889 0.4
890 0.43
891 0.41
892 0.34
893 0.32
894 0.25
895 0.25
896 0.23
897 0.22
898 0.2
899 0.18
900 0.17
901 0.14
902 0.17
903 0.17
904 0.21
905 0.25
906 0.24
907 0.25
908 0.23
909 0.2
910 0.18
911 0.17
912 0.13
913 0.1
914 0.09
915 0.09
916 0.09
917 0.09
918 0.09
919 0.09
920 0.11
921 0.14
922 0.18
923 0.22
924 0.25