Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1V8M9

Protein Details
Accession H1V8M9    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
43-63TGSGPSKPSRNKPFRTRDGLGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
38-54KRKPETGSGPSKPSRNK
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 13.5, cyto 10
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011146  HIT-like  
IPR036265  HIT-like_sf  
IPR032566  Znf-C2HE  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003824  F:catalytic activity  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006139  P:nucleobase-containing compound metabolic process  
KEGG chig:CH63R_04441  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01230  HIT  
PF16278  zf-C2HE  
Amino Acid Sequences MVADDSDPEDAITQDEIKGTSPAPDAPRNAFTELMTRKRKPETGSGPSKPSRNKPFRTRDGLGAYIEDPLSFPASRVIYHNDDFVAINDLYPKASVHTLLLPRSPKHSLLHPFEAFENAEFLVSVQKEVLRLKDLVAKELQRRFGKGSKAEEAREAVLDGRVEPESGALPQGRDWHAEIITGIHAHPSMNHLHIHVLSRDMYSGCMKHRKHYNSFNTPFLIDVADFPLAADDPRRHPGHEGYLMKSSLICWRCGENFGNQFARLKEHLAVEFAEWERE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.12
3 0.12
4 0.13
5 0.14
6 0.13
7 0.14
8 0.15
9 0.2
10 0.24
11 0.29
12 0.31
13 0.34
14 0.38
15 0.38
16 0.39
17 0.35
18 0.3
19 0.33
20 0.37
21 0.41
22 0.46
23 0.45
24 0.49
25 0.54
26 0.58
27 0.54
28 0.57
29 0.57
30 0.59
31 0.65
32 0.64
33 0.66
34 0.65
35 0.68
36 0.64
37 0.65
38 0.66
39 0.66
40 0.7
41 0.73
42 0.79
43 0.81
44 0.83
45 0.76
46 0.72
47 0.67
48 0.61
49 0.51
50 0.42
51 0.34
52 0.26
53 0.23
54 0.16
55 0.11
56 0.09
57 0.11
58 0.1
59 0.09
60 0.12
61 0.13
62 0.14
63 0.17
64 0.21
65 0.23
66 0.24
67 0.24
68 0.2
69 0.2
70 0.2
71 0.18
72 0.17
73 0.12
74 0.11
75 0.12
76 0.12
77 0.11
78 0.11
79 0.1
80 0.08
81 0.08
82 0.09
83 0.08
84 0.13
85 0.16
86 0.17
87 0.21
88 0.23
89 0.23
90 0.27
91 0.28
92 0.26
93 0.25
94 0.31
95 0.34
96 0.37
97 0.43
98 0.39
99 0.37
100 0.35
101 0.35
102 0.28
103 0.2
104 0.15
105 0.08
106 0.08
107 0.07
108 0.06
109 0.08
110 0.07
111 0.07
112 0.07
113 0.07
114 0.09
115 0.1
116 0.11
117 0.1
118 0.11
119 0.11
120 0.16
121 0.16
122 0.16
123 0.18
124 0.2
125 0.23
126 0.26
127 0.32
128 0.28
129 0.29
130 0.31
131 0.34
132 0.36
133 0.35
134 0.36
135 0.36
136 0.37
137 0.36
138 0.34
139 0.31
140 0.26
141 0.21
142 0.18
143 0.11
144 0.1
145 0.09
146 0.08
147 0.08
148 0.08
149 0.07
150 0.07
151 0.07
152 0.06
153 0.06
154 0.08
155 0.07
156 0.07
157 0.08
158 0.12
159 0.13
160 0.14
161 0.15
162 0.15
163 0.15
164 0.15
165 0.14
166 0.11
167 0.11
168 0.09
169 0.08
170 0.07
171 0.07
172 0.06
173 0.07
174 0.08
175 0.1
176 0.11
177 0.12
178 0.11
179 0.13
180 0.14
181 0.17
182 0.15
183 0.15
184 0.14
185 0.13
186 0.14
187 0.13
188 0.13
189 0.14
190 0.15
191 0.19
192 0.27
193 0.28
194 0.34
195 0.44
196 0.49
197 0.55
198 0.63
199 0.68
200 0.7
201 0.73
202 0.69
203 0.61
204 0.53
205 0.46
206 0.36
207 0.27
208 0.16
209 0.13
210 0.12
211 0.1
212 0.1
213 0.09
214 0.09
215 0.08
216 0.09
217 0.12
218 0.13
219 0.17
220 0.25
221 0.26
222 0.27
223 0.3
224 0.35
225 0.39
226 0.45
227 0.44
228 0.4
229 0.44
230 0.43
231 0.39
232 0.35
233 0.28
234 0.27
235 0.25
236 0.24
237 0.21
238 0.25
239 0.27
240 0.32
241 0.33
242 0.33
243 0.37
244 0.41
245 0.42
246 0.38
247 0.4
248 0.37
249 0.4
250 0.33
251 0.31
252 0.28
253 0.29
254 0.28
255 0.27
256 0.26
257 0.22
258 0.26