FuNGI

H1VIR8

Protein Details

Accession

H1VIR8

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
92-117	ISIATLTSKPKRKRGVKVLEKKANAP	Hydrophilic
294-313	PPMKSVTKAKAPRKKPRTIT	Hydrophilic
345-370	AAQPKGKKRASKAKKPKKAPPPEPVL	Basic
719-746	PSAQPPPPSPKRGRGRPKKNAEPTKATS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
100-169	KPKRKRGVKVLEKKANAPPLKSTKEAEAGPPQKKNVKTKGTAEKSDTKSKTTKAKATTKKGGVKSRHFAK
294-310	PPMKSVTKAKAPRKKPR
348-365	PKGKKRASKAKKPKKAPP
698-707	NRPRGRPRKN
720-739	SAQPPPPSPKRGRGRPKKNA

Subcellular Location(s)

nucl 24.5, cyto_nucl 15

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR017956 AT_hook_DNA-bd_motif IPR027784 Slx4_ascomycetes IPR018574 Structure-sp_endonuc_su_Slx4
Gene Ontology	GO:0033557 C:Slx1-Slx4 complex GO:0017108 F:5'-flap endonuclease activity GO:0003677 F:DNA binding GO:0006310 P:DNA recombination GO:0006281 P:DNA repair GO:0006260 P:DNA replication GO:0006996 P:organelle organization
KEGG	chig:CH63R_05453 -
Pfam	View protein in Pfam PF09494 Slx4
CDD	cd22999 SAP_SLX4

Amino Acid Sequences

MGSPFRSTRHDAYTLSSSPGLPPLDQLKSQFPKESPVRSGSVAMSMPDHASRHFNGDSSFLRQEPSAIDLTTPCKTPIESPALQHDEDVTVISIATLTSKPKRKRGVKVLEKKANAPPLKSTKEAEAGPPQKKNVKTKGTAEKSDTKSKTTKAKATTKKGGVKSRHFAKLKTGNGETKEVTEPSPPKQDTNEPLELEAALRRRMDWTPPPVDNDQTARSKSSIVRDDLLSSAAKSPNREAPKEMFESLLRNYGRPNENTPKRPSAEPLDSESPVFKKRKMIEAVSVKDSSKMPPPMKSVTKAKAPRKKPRTITELATAAYEVPDATEPETISTPPQESVQDEAEAAQPKGKKRASKAKKPKKAPPPEPVLLSPTAALRQAANQDYVFGTSSQLAREHSPTFLRDLQSALQASNSLREEDPFVTPINSDAIEPEPKQKLWDIGARDEDGRLLDLEVIDLADTPQAVPSPAAGLNPFGYAGVENPGAPLPAHIPSDASFPDIEDLLSKAPEGNDIAEPKQAAPLPAHIPSDVSFPDIDDLLGDQMGDIVPSEQQEVPAFVSSARAARTVSDTAPVVLISSGSGPNVVTDPESPPARLPSASEEEVTKPEAEKAVIRPAPKIPKPDFTLYTDTQLSREIASYGFKPVKRRQAMLALLDQCWTSKQRTALASLPTNHPASTASKAQAITSKPPKPVATTSPNRPRGRPRKNSEAELSSSEPPPSAQPPPPSPKRGRGRPKKNAEPTKATSSMATTARTGRAKATTLAPVAPKVVSPPKKAKASAVIEIPDSASDGSLSPSPSACSSPEPMFSPPPEDVSVSIGDDTEMSLVASSTTSDPAALFAHITTAVTSAAPTTDAKKPSFHEMMLMYDPIVLEDLAAWLNTGQLSRVGYDGEVSASEVKQWCESKSVCCLWRESLRGKERKRY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.44
2	0.41
3	0.37
4	0.3
5	0.27
6	0.31
7	0.27
8	0.21
9	0.23
10	0.26
11	0.29
12	0.31
13	0.33
14	0.38
15	0.43
16	0.46
17	0.48
18	0.42
19	0.47
20	0.52
21	0.56
22	0.51
23	0.49
24	0.49
25	0.44
26	0.46
27	0.38
28	0.35
29	0.28
30	0.24
31	0.21
32	0.19
33	0.19
34	0.19
35	0.19
36	0.17
37	0.21
38	0.22
39	0.26
40	0.26
41	0.26
42	0.24
43	0.28
44	0.29
45	0.31
46	0.33
47	0.27
48	0.28
49	0.26
50	0.26
51	0.22
52	0.23
53	0.19
54	0.16
55	0.17
56	0.18
57	0.22
58	0.23
59	0.23
60	0.2
61	0.19
62	0.2
63	0.23
64	0.28
65	0.32
66	0.32
67	0.33
68	0.41
69	0.44
70	0.43
71	0.4
72	0.33
73	0.26
74	0.24
75	0.22
76	0.13
77	0.09
78	0.08
79	0.08
80	0.07
81	0.06
82	0.08
83	0.08
84	0.14
85	0.22
86	0.32
87	0.4
88	0.49
89	0.6
90	0.67
91	0.76
92	0.81
93	0.84
94	0.85
95	0.89
96	0.91
97	0.9
98	0.83
99	0.77
100	0.73
101	0.72
102	0.64
103	0.55
104	0.53
105	0.53
106	0.55
107	0.53
108	0.48
109	0.43
110	0.45
111	0.44
112	0.4
113	0.42
114	0.45
115	0.49
116	0.51
117	0.51
118	0.53
119	0.59
120	0.63
121	0.63
122	0.63
123	0.63
124	0.68
125	0.74
126	0.74
127	0.73
128	0.7
129	0.7
130	0.67
131	0.7
132	0.63
133	0.57
134	0.55
135	0.56
136	0.59
137	0.57
138	0.59
139	0.58
140	0.66
141	0.71
142	0.75
143	0.79
144	0.78
145	0.79
146	0.79
147	0.79
148	0.78
149	0.76
150	0.76
151	0.74
152	0.75
153	0.69
154	0.62
155	0.63
156	0.64
157	0.61
158	0.58
159	0.55
160	0.51
161	0.52
162	0.54
163	0.45
164	0.39
165	0.36
166	0.31
167	0.27
168	0.29
169	0.28
170	0.29
171	0.38
172	0.36
173	0.35
174	0.38
175	0.44
176	0.43
177	0.48
178	0.48
179	0.39
180	0.39
181	0.37
182	0.33
183	0.26
184	0.24
185	0.19
186	0.16
187	0.16
188	0.16
189	0.19
190	0.2
191	0.26
192	0.3
193	0.35
194	0.39
195	0.41
196	0.45
197	0.44
198	0.45
199	0.41
200	0.37
201	0.35
202	0.33
203	0.33
204	0.3
205	0.28
206	0.3
207	0.3
208	0.34
209	0.35
210	0.33
211	0.34
212	0.32
213	0.33
214	0.3
215	0.29
216	0.21
217	0.16
218	0.17
219	0.19
220	0.2
221	0.21
222	0.23
223	0.3
224	0.35
225	0.36
226	0.36
227	0.36
228	0.4
229	0.42
230	0.39
231	0.33
232	0.28
233	0.29
234	0.26
235	0.29
236	0.24
237	0.21
238	0.22
239	0.27
240	0.31
241	0.31
242	0.38
243	0.41
244	0.49
245	0.56
246	0.6
247	0.6
248	0.58
249	0.57
250	0.53
251	0.5
252	0.48
253	0.44
254	0.44
255	0.4
256	0.38
257	0.37
258	0.34
259	0.29
260	0.3
261	0.3
262	0.26
263	0.3
264	0.33
265	0.41
266	0.44
267	0.44
268	0.46
269	0.52
270	0.54
271	0.5
272	0.49
273	0.4
274	0.37
275	0.35
276	0.28
277	0.27
278	0.31
279	0.29
280	0.32
281	0.36
282	0.4
283	0.43
284	0.47
285	0.47
286	0.43
287	0.51
288	0.55
289	0.61
290	0.64
291	0.69
292	0.75
293	0.76
294	0.81
295	0.8
296	0.79
297	0.77
298	0.71
299	0.66
300	0.6
301	0.53
302	0.44
303	0.36
304	0.28
305	0.2
306	0.16
307	0.12
308	0.06
309	0.05
310	0.05
311	0.06
312	0.07
313	0.08
314	0.08
315	0.09
316	0.1
317	0.1
318	0.1
319	0.11
320	0.11
321	0.1
322	0.12
323	0.11
324	0.12
325	0.14
326	0.15
327	0.14
328	0.13
329	0.13
330	0.15
331	0.16
332	0.15
333	0.15
334	0.17
335	0.19
336	0.27
337	0.3
338	0.31
339	0.37
340	0.48
341	0.54
342	0.63
343	0.72
344	0.75
345	0.82
346	0.85
347	0.87
348	0.86
349	0.87
350	0.84
351	0.81
352	0.78
353	0.71
354	0.66
355	0.57
356	0.49
357	0.39
358	0.31
359	0.23
360	0.15
361	0.14
362	0.11
363	0.1
364	0.07
365	0.09
366	0.12
367	0.13
368	0.14
369	0.13
370	0.13
371	0.13
372	0.14
373	0.13
374	0.09
375	0.09
376	0.09
377	0.09
378	0.09
379	0.1
380	0.11
381	0.12
382	0.14
383	0.15
384	0.15
385	0.16
386	0.16
387	0.19
388	0.21
389	0.2
390	0.17
391	0.18
392	0.17
393	0.19
394	0.18
395	0.14
396	0.11
397	0.11
398	0.11
399	0.13
400	0.13
401	0.12
402	0.11
403	0.12
404	0.14
405	0.14
406	0.15
407	0.12
408	0.12
409	0.11
410	0.11
411	0.11
412	0.09
413	0.08
414	0.07
415	0.07
416	0.09
417	0.11
418	0.12
419	0.16
420	0.17
421	0.17
422	0.18
423	0.18
424	0.18
425	0.18
426	0.21
427	0.19
428	0.2
429	0.21
430	0.21
431	0.2
432	0.18
433	0.16
434	0.12
435	0.1
436	0.07
437	0.06
438	0.05
439	0.05
440	0.05
441	0.04
442	0.04
443	0.03
444	0.03
445	0.03
446	0.03
447	0.03
448	0.03
449	0.03
450	0.04
451	0.04
452	0.04
453	0.04
454	0.06
455	0.06
456	0.06
457	0.06
458	0.07
459	0.07
460	0.07
461	0.07
462	0.05
463	0.05
464	0.05
465	0.05
466	0.06
467	0.06
468	0.06
469	0.06
470	0.06
471	0.07
472	0.06
473	0.06
474	0.06
475	0.08
476	0.09
477	0.08
478	0.09
479	0.09
480	0.11
481	0.11
482	0.1
483	0.08
484	0.08
485	0.08
486	0.08
487	0.07
488	0.06
489	0.06
490	0.06
491	0.06
492	0.06
493	0.06
494	0.06
495	0.07
496	0.07
497	0.08
498	0.09
499	0.11
500	0.12
501	0.12
502	0.13
503	0.12
504	0.14
505	0.13
506	0.12
507	0.1
508	0.13
509	0.14
510	0.16
511	0.17
512	0.14
513	0.14
514	0.14
515	0.15
516	0.12
517	0.11
518	0.09
519	0.08
520	0.09
521	0.08
522	0.08
523	0.05
524	0.05
525	0.04
526	0.04
527	0.04
528	0.03
529	0.03
530	0.03
531	0.03
532	0.03
533	0.03
534	0.04
535	0.04
536	0.07
537	0.07
538	0.08
539	0.08
540	0.09
541	0.09
542	0.09
543	0.09
544	0.07
545	0.08
546	0.08
547	0.09
548	0.09
549	0.09
550	0.09
551	0.1
552	0.13
553	0.13
554	0.13
555	0.13
556	0.13
557	0.12
558	0.12
559	0.11
560	0.08
561	0.06
562	0.06
563	0.04
564	0.05
565	0.05
566	0.05
567	0.06
568	0.05
569	0.06
570	0.06
571	0.06
572	0.06
573	0.07
574	0.09
575	0.13
576	0.14
577	0.14
578	0.15
579	0.16
580	0.17
581	0.16
582	0.15
583	0.16
584	0.21
585	0.21
586	0.21
587	0.2
588	0.21
589	0.22
590	0.22
591	0.17
592	0.12
593	0.13
594	0.13
595	0.12
596	0.13
597	0.14
598	0.22
599	0.24
600	0.24
601	0.25
602	0.31
603	0.39
604	0.4
605	0.46
606	0.4
607	0.44
608	0.49
609	0.52
610	0.48
611	0.44
612	0.47
613	0.4
614	0.4
615	0.36
616	0.31
617	0.27
618	0.25
619	0.21
620	0.15
621	0.15
622	0.12
623	0.1
624	0.12
625	0.12
626	0.16
627	0.2
628	0.22
629	0.29
630	0.35
631	0.45
632	0.47
633	0.48
634	0.46
635	0.49
636	0.51
637	0.47
638	0.46
639	0.38
640	0.34
641	0.33
642	0.29
643	0.2
644	0.19
645	0.18
646	0.14
647	0.16
648	0.18
649	0.23
650	0.25
651	0.29
652	0.32
653	0.34
654	0.37
655	0.35
656	0.36
657	0.34
658	0.34
659	0.29
660	0.25
661	0.22
662	0.2
663	0.22
664	0.22
665	0.2
666	0.22
667	0.22
668	0.23
669	0.26
670	0.26
671	0.3
672	0.36
673	0.4
674	0.39
675	0.44
676	0.44
677	0.43
678	0.45
679	0.44
680	0.45
681	0.47
682	0.54
683	0.61
684	0.69
685	0.67
686	0.68
687	0.71
688	0.72
689	0.76
690	0.77
691	0.74
692	0.76
693	0.79
694	0.8
695	0.75
696	0.68
697	0.6
698	0.53
699	0.49
700	0.4
701	0.36
702	0.3
703	0.24
704	0.21
705	0.21
706	0.2
707	0.22
708	0.25
709	0.3
710	0.38
711	0.47
712	0.54
713	0.59
714	0.61
715	0.66
716	0.71
717	0.75
718	0.78
719	0.8
720	0.84
721	0.86
722	0.91
723	0.91
724	0.92
725	0.92
726	0.88
727	0.85
728	0.8
729	0.77
730	0.69
731	0.59
732	0.48
733	0.4
734	0.38
735	0.32
736	0.27
737	0.21
738	0.22
739	0.28
740	0.29
741	0.27
742	0.26
743	0.27
744	0.28
745	0.28
746	0.29
747	0.27
748	0.27
749	0.29
750	0.27
751	0.24
752	0.24
753	0.22
754	0.18
755	0.19
756	0.27
757	0.31
758	0.37
759	0.45
760	0.51
761	0.57
762	0.59
763	0.58
764	0.58
765	0.56
766	0.54
767	0.49
768	0.43
769	0.37
770	0.36
771	0.32
772	0.22
773	0.17
774	0.13
775	0.08
776	0.07
777	0.07
778	0.09
779	0.11
780	0.12
781	0.12
782	0.12
783	0.14
784	0.15
785	0.16
786	0.16
787	0.18
788	0.21
789	0.23
790	0.25
791	0.26
792	0.29
793	0.31
794	0.31
795	0.32
796	0.28
797	0.29
798	0.28
799	0.26
800	0.23
801	0.21
802	0.21
803	0.18
804	0.17
805	0.13
806	0.11
807	0.1
808	0.1
809	0.07
810	0.06
811	0.05
812	0.05
813	0.05
814	0.05
815	0.05
816	0.07
817	0.07
818	0.09
819	0.09
820	0.09
821	0.09
822	0.1
823	0.11
824	0.1
825	0.1
826	0.08
827	0.1
828	0.1
829	0.1
830	0.09
831	0.08
832	0.08
833	0.08
834	0.08
835	0.07
836	0.07
837	0.09
838	0.1
839	0.13
840	0.2
841	0.24
842	0.26
843	0.3
844	0.33
845	0.4
846	0.42
847	0.38
848	0.36
849	0.33
850	0.36
851	0.34
852	0.31
853	0.23
854	0.2
855	0.19
856	0.15
857	0.15
858	0.09
859	0.07
860	0.06
861	0.08
862	0.07
863	0.07
864	0.07
865	0.06
866	0.07
867	0.08
868	0.08
869	0.08
870	0.1
871	0.11
872	0.12
873	0.13
874	0.13
875	0.12
876	0.13
877	0.13
878	0.11
879	0.1
880	0.11
881	0.13
882	0.12
883	0.17
884	0.18
885	0.2
886	0.25
887	0.27
888	0.27
889	0.31
890	0.33
891	0.34
892	0.4
893	0.45
894	0.44
895	0.44
896	0.46
897	0.46
898	0.52
899	0.54
900	0.53
901	0.56
902	0.62
903	0.69

H1VIR8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer