Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1VGJ8

Protein Details
Accession H1VGJ8    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
211-237INEGTNSRRKRRKPLPDGRQSKRRGRGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
217-244SRRKRRKPLPDGRQSKRRGRGGGVRGGR
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto 5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019481  TFIIIC_triple_barrel  
Pfam View protein in Pfam  
PF10419  TFIIIC_sub6  
Amino Acid Sequences MPPVSWARGYHYKHWAGPHRKPDEPKHHRILSDDENDDEPAAEPEEDEEMDQGQMETSGDAFDADFESDPAADIQILDLHSDKPMFAYKGKVFEGQWSRNLGTEVIFTEHDAENPIPALRHLQGGVDMLAASWSRINTTEKRLEPRHEAAAQDDPLKEIRRQNGIHIPITADKTGERKRQTRFLENLMALKVKRGEKDEVTVYAHAAPKQINEGTNSRRKRRKPLPDGRQSKRRGRGGGVRGGRGGSLVAGEVGSEKVEPDRTAEGAAGAPDGSLSMPTPATWAELEGQAGQAGANDDEASEDDYDDYEDGGEIE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.63
2 0.66
3 0.66
4 0.7
5 0.73
6 0.7
7 0.72
8 0.76
9 0.78
10 0.79
11 0.79
12 0.79
13 0.77
14 0.76
15 0.7
16 0.66
17 0.62
18 0.59
19 0.57
20 0.5
21 0.43
22 0.39
23 0.38
24 0.34
25 0.28
26 0.2
27 0.14
28 0.13
29 0.11
30 0.09
31 0.1
32 0.12
33 0.11
34 0.1
35 0.1
36 0.09
37 0.09
38 0.09
39 0.08
40 0.06
41 0.06
42 0.06
43 0.06
44 0.05
45 0.05
46 0.05
47 0.05
48 0.05
49 0.05
50 0.06
51 0.07
52 0.07
53 0.07
54 0.07
55 0.07
56 0.08
57 0.07
58 0.06
59 0.05
60 0.05
61 0.05
62 0.07
63 0.07
64 0.08
65 0.09
66 0.09
67 0.1
68 0.1
69 0.1
70 0.09
71 0.13
72 0.14
73 0.15
74 0.21
75 0.22
76 0.27
77 0.29
78 0.3
79 0.27
80 0.33
81 0.4
82 0.36
83 0.37
84 0.36
85 0.35
86 0.33
87 0.34
88 0.26
89 0.18
90 0.16
91 0.14
92 0.11
93 0.11
94 0.1
95 0.12
96 0.12
97 0.12
98 0.13
99 0.12
100 0.1
101 0.11
102 0.11
103 0.08
104 0.08
105 0.11
106 0.09
107 0.1
108 0.1
109 0.1
110 0.1
111 0.11
112 0.1
113 0.07
114 0.07
115 0.05
116 0.06
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.05
121 0.05
122 0.07
123 0.11
124 0.14
125 0.2
126 0.26
127 0.28
128 0.35
129 0.38
130 0.4
131 0.42
132 0.42
133 0.41
134 0.35
135 0.33
136 0.28
137 0.29
138 0.26
139 0.22
140 0.19
141 0.15
142 0.16
143 0.18
144 0.18
145 0.18
146 0.2
147 0.25
148 0.25
149 0.29
150 0.33
151 0.34
152 0.33
153 0.29
154 0.27
155 0.23
156 0.25
157 0.21
158 0.14
159 0.12
160 0.18
161 0.24
162 0.29
163 0.32
164 0.36
165 0.4
166 0.48
167 0.53
168 0.54
169 0.51
170 0.49
171 0.49
172 0.44
173 0.42
174 0.35
175 0.31
176 0.23
177 0.22
178 0.22
179 0.19
180 0.21
181 0.23
182 0.26
183 0.25
184 0.29
185 0.29
186 0.26
187 0.26
188 0.24
189 0.21
190 0.2
191 0.21
192 0.18
193 0.17
194 0.16
195 0.14
196 0.17
197 0.18
198 0.16
199 0.17
200 0.22
201 0.28
202 0.37
203 0.43
204 0.49
205 0.56
206 0.61
207 0.68
208 0.73
209 0.77
210 0.8
211 0.84
212 0.85
213 0.87
214 0.91
215 0.89
216 0.88
217 0.84
218 0.82
219 0.8
220 0.76
221 0.68
222 0.64
223 0.66
224 0.63
225 0.65
226 0.59
227 0.51
228 0.46
229 0.42
230 0.36
231 0.27
232 0.2
233 0.11
234 0.07
235 0.06
236 0.05
237 0.04
238 0.05
239 0.05
240 0.05
241 0.05
242 0.05
243 0.06
244 0.08
245 0.1
246 0.11
247 0.13
248 0.15
249 0.16
250 0.16
251 0.16
252 0.15
253 0.13
254 0.13
255 0.1
256 0.08
257 0.07
258 0.06
259 0.06
260 0.05
261 0.05
262 0.05
263 0.07
264 0.07
265 0.07
266 0.09
267 0.09
268 0.11
269 0.1
270 0.11
271 0.12
272 0.13
273 0.14
274 0.13
275 0.13
276 0.11
277 0.11
278 0.09
279 0.08
280 0.09
281 0.08
282 0.08
283 0.08
284 0.08
285 0.09
286 0.1
287 0.11
288 0.1
289 0.1
290 0.09
291 0.1
292 0.11
293 0.11
294 0.1
295 0.08