Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1V8J7

Protein Details
Accession H1V8J7    Localization Confidence High Confidence Score 17
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
41-65HDEVPSARGHKRKRGRDEVEEKEEEBasic
128-156LSERHKNPSKVTKSKKKKKVAVEVEKETNHydrophilic
638-658NVSKADKKRLKEKGVEARRSHBasic
661-682AMISSQSKWDRRKETNRQGATAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
16-19KGAK
48-55RGHKRKRG
90-99AAKEKKNAPP
131-146RHKNPSKVTKSKKKKK
644-657KKRLKEKGVEARRS
Subcellular Location(s) cyto 13.5, cyto_mito 11.833, mito 9, mito_nucl 7.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR044764  DDX52/Rok1_DEADc  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0030490  P:maturation of SSU-rRNA  
KEGG chig:CH63R_05654  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF00271  Helicase_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd17957  DEADc_DDX52  
cd18787  SF2_C_DEAD  
Amino Acid Sequences MDILKVLSRGIKQPPKGAKGASKPPANLPSAGNRTNPQLFHDEVPSARGHKRKRGRDEVEEKEEERLPEVDFFAPKPDPSEEAAKVKEAAAKEKKNAPPPSPAVKPKLLPEDECRQILRSHRLKLTLLSERHKNPSKVTKSKKKKKVAVEVEKETNQLHPQPLTTFRELRTNYGIAPLLAENLAHQGFKVPTEVQLGALPLLLQPELALKEVPRNEELGDVSKGIDFLAVAPTGSGKTISFLIPAINSIMQKRATVEDQDEHDLSAIIIAPTRELVFQIVNEARKLAQNSGIKVAGMKKGMRLAVEEEEKPESEDEEEEDEDDGEKSDDDEDSETEPARTKSVVKADILVTTPALFFNFLTSGSPTTNRKLPNVTSLILDEADVLLDPLFREQTMAIWSACPNPALRTTFWSATFGSNIETLVTEAQSAKPEPKPLIRLVVGLKDTAVPNVTHKLVYTATEKGKLLGLRQLLHPTAGDDSGPPLRPPFLVFTQTIERATALEEELKYDIPLAAGGATRIAALHSGLADRARADIMRRFRAGEVWILITTDVLARGVDFAGVNGVVNYDVPGSSAAYVHRAGRTGRAGREGGVAVTFYTTDDIPFVKSVANVIAASEKQAGKTGDEANVQKWLLDALPNVSKADKKRLKEKGVEARRSHGAAMISSQSKWDRRKETNRQGATAANKQRMKHARRVDEGDGGEWGGIDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.61
2 0.62
3 0.63
4 0.63
5 0.61
6 0.62
7 0.68
8 0.67
9 0.64
10 0.61
11 0.64
12 0.65
13 0.59
14 0.53
15 0.46
16 0.47
17 0.48
18 0.49
19 0.45
20 0.4
21 0.44
22 0.47
23 0.45
24 0.39
25 0.36
26 0.36
27 0.35
28 0.36
29 0.32
30 0.27
31 0.29
32 0.27
33 0.27
34 0.3
35 0.36
36 0.4
37 0.48
38 0.58
39 0.65
40 0.74
41 0.8
42 0.82
43 0.85
44 0.87
45 0.86
46 0.84
47 0.78
48 0.68
49 0.62
50 0.57
51 0.47
52 0.39
53 0.31
54 0.25
55 0.22
56 0.24
57 0.22
58 0.21
59 0.2
60 0.23
61 0.23
62 0.22
63 0.23
64 0.23
65 0.23
66 0.25
67 0.31
68 0.3
69 0.34
70 0.35
71 0.33
72 0.32
73 0.3
74 0.31
75 0.26
76 0.32
77 0.36
78 0.4
79 0.44
80 0.52
81 0.57
82 0.63
83 0.68
84 0.62
85 0.61
86 0.62
87 0.65
88 0.64
89 0.64
90 0.61
91 0.59
92 0.58
93 0.55
94 0.58
95 0.53
96 0.49
97 0.48
98 0.5
99 0.5
100 0.49
101 0.44
102 0.36
103 0.37
104 0.41
105 0.45
106 0.43
107 0.46
108 0.48
109 0.5
110 0.5
111 0.5
112 0.5
113 0.48
114 0.47
115 0.45
116 0.49
117 0.5
118 0.58
119 0.62
120 0.57
121 0.55
122 0.6
123 0.65
124 0.68
125 0.74
126 0.76
127 0.8
128 0.88
129 0.91
130 0.91
131 0.89
132 0.89
133 0.89
134 0.89
135 0.89
136 0.86
137 0.83
138 0.78
139 0.71
140 0.62
141 0.51
142 0.43
143 0.36
144 0.31
145 0.27
146 0.22
147 0.22
148 0.24
149 0.3
150 0.32
151 0.34
152 0.33
153 0.31
154 0.39
155 0.39
156 0.4
157 0.38
158 0.33
159 0.29
160 0.29
161 0.28
162 0.19
163 0.2
164 0.16
165 0.12
166 0.11
167 0.1
168 0.07
169 0.1
170 0.1
171 0.09
172 0.08
173 0.11
174 0.12
175 0.13
176 0.15
177 0.12
178 0.13
179 0.18
180 0.18
181 0.15
182 0.16
183 0.15
184 0.13
185 0.12
186 0.1
187 0.07
188 0.08
189 0.06
190 0.05
191 0.05
192 0.07
193 0.08
194 0.08
195 0.09
196 0.08
197 0.15
198 0.17
199 0.2
200 0.18
201 0.19
202 0.18
203 0.2
204 0.2
205 0.18
206 0.17
207 0.14
208 0.14
209 0.13
210 0.13
211 0.1
212 0.09
213 0.05
214 0.05
215 0.07
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.07
221 0.07
222 0.07
223 0.05
224 0.06
225 0.08
226 0.08
227 0.08
228 0.08
229 0.09
230 0.08
231 0.09
232 0.09
233 0.09
234 0.1
235 0.1
236 0.13
237 0.13
238 0.14
239 0.14
240 0.16
241 0.16
242 0.17
243 0.19
244 0.18
245 0.2
246 0.23
247 0.22
248 0.19
249 0.18
250 0.16
251 0.13
252 0.1
253 0.08
254 0.05
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.06
259 0.06
260 0.06
261 0.06
262 0.07
263 0.06
264 0.06
265 0.11
266 0.13
267 0.14
268 0.14
269 0.14
270 0.13
271 0.16
272 0.17
273 0.14
274 0.19
275 0.2
276 0.22
277 0.24
278 0.24
279 0.21
280 0.21
281 0.22
282 0.18
283 0.18
284 0.17
285 0.16
286 0.18
287 0.2
288 0.18
289 0.17
290 0.16
291 0.18
292 0.21
293 0.19
294 0.18
295 0.18
296 0.18
297 0.17
298 0.15
299 0.11
300 0.09
301 0.09
302 0.08
303 0.09
304 0.09
305 0.09
306 0.09
307 0.09
308 0.08
309 0.08
310 0.07
311 0.05
312 0.05
313 0.05
314 0.05
315 0.05
316 0.05
317 0.06
318 0.07
319 0.08
320 0.08
321 0.08
322 0.08
323 0.1
324 0.1
325 0.1
326 0.1
327 0.1
328 0.13
329 0.18
330 0.2
331 0.18
332 0.19
333 0.19
334 0.2
335 0.19
336 0.16
337 0.11
338 0.09
339 0.09
340 0.07
341 0.06
342 0.05
343 0.04
344 0.05
345 0.05
346 0.05
347 0.06
348 0.07
349 0.08
350 0.08
351 0.11
352 0.12
353 0.14
354 0.19
355 0.19
356 0.2
357 0.23
358 0.23
359 0.26
360 0.27
361 0.26
362 0.22
363 0.21
364 0.2
365 0.16
366 0.15
367 0.09
368 0.06
369 0.05
370 0.04
371 0.04
372 0.03
373 0.03
374 0.03
375 0.04
376 0.04
377 0.04
378 0.05
379 0.05
380 0.06
381 0.07
382 0.09
383 0.08
384 0.09
385 0.1
386 0.11
387 0.11
388 0.11
389 0.1
390 0.1
391 0.14
392 0.15
393 0.16
394 0.18
395 0.21
396 0.23
397 0.23
398 0.23
399 0.2
400 0.19
401 0.19
402 0.15
403 0.12
404 0.1
405 0.1
406 0.08
407 0.07
408 0.07
409 0.07
410 0.06
411 0.06
412 0.06
413 0.07
414 0.09
415 0.09
416 0.13
417 0.14
418 0.17
419 0.19
420 0.22
421 0.25
422 0.25
423 0.29
424 0.26
425 0.26
426 0.25
427 0.27
428 0.24
429 0.2
430 0.18
431 0.15
432 0.15
433 0.13
434 0.13
435 0.09
436 0.11
437 0.14
438 0.14
439 0.13
440 0.12
441 0.14
442 0.13
443 0.16
444 0.16
445 0.18
446 0.19
447 0.22
448 0.22
449 0.21
450 0.23
451 0.21
452 0.2
453 0.2
454 0.21
455 0.19
456 0.2
457 0.24
458 0.21
459 0.2
460 0.19
461 0.16
462 0.14
463 0.13
464 0.11
465 0.08
466 0.1
467 0.13
468 0.14
469 0.14
470 0.13
471 0.14
472 0.14
473 0.16
474 0.17
475 0.17
476 0.19
477 0.19
478 0.22
479 0.25
480 0.27
481 0.25
482 0.21
483 0.18
484 0.15
485 0.16
486 0.13
487 0.1
488 0.11
489 0.11
490 0.12
491 0.13
492 0.13
493 0.12
494 0.11
495 0.11
496 0.07
497 0.07
498 0.06
499 0.06
500 0.06
501 0.06
502 0.05
503 0.05
504 0.05
505 0.05
506 0.05
507 0.05
508 0.05
509 0.05
510 0.05
511 0.06
512 0.07
513 0.07
514 0.08
515 0.07
516 0.08
517 0.09
518 0.09
519 0.12
520 0.18
521 0.24
522 0.29
523 0.3
524 0.31
525 0.31
526 0.33
527 0.31
528 0.28
529 0.23
530 0.2
531 0.19
532 0.17
533 0.16
534 0.13
535 0.12
536 0.09
537 0.07
538 0.05
539 0.05
540 0.05
541 0.06
542 0.06
543 0.06
544 0.06
545 0.05
546 0.06
547 0.06
548 0.06
549 0.05
550 0.06
551 0.05
552 0.05
553 0.06
554 0.05
555 0.05
556 0.06
557 0.06
558 0.07
559 0.07
560 0.08
561 0.09
562 0.11
563 0.13
564 0.15
565 0.15
566 0.17
567 0.17
568 0.22
569 0.29
570 0.32
571 0.33
572 0.36
573 0.35
574 0.34
575 0.36
576 0.31
577 0.23
578 0.18
579 0.16
580 0.11
581 0.11
582 0.1
583 0.07
584 0.08
585 0.07
586 0.07
587 0.08
588 0.09
589 0.1
590 0.1
591 0.11
592 0.1
593 0.1
594 0.12
595 0.12
596 0.13
597 0.11
598 0.12
599 0.15
600 0.14
601 0.16
602 0.19
603 0.19
604 0.17
605 0.22
606 0.23
607 0.2
608 0.25
609 0.26
610 0.25
611 0.3
612 0.31
613 0.28
614 0.32
615 0.3
616 0.26
617 0.23
618 0.2
619 0.15
620 0.16
621 0.15
622 0.15
623 0.2
624 0.21
625 0.22
626 0.23
627 0.27
628 0.29
629 0.4
630 0.42
631 0.44
632 0.53
633 0.62
634 0.68
635 0.72
636 0.77
637 0.77
638 0.8
639 0.84
640 0.76
641 0.72
642 0.69
643 0.62
644 0.52
645 0.44
646 0.35
647 0.26
648 0.27
649 0.27
650 0.24
651 0.23
652 0.27
653 0.29
654 0.36
655 0.42
656 0.48
657 0.51
658 0.6
659 0.71
660 0.78
661 0.83
662 0.86
663 0.84
664 0.77
665 0.7
666 0.66
667 0.62
668 0.61
669 0.58
670 0.56
671 0.55
672 0.53
673 0.61
674 0.65
675 0.65
676 0.65
677 0.67
678 0.68
679 0.71
680 0.78
681 0.72
682 0.69
683 0.63
684 0.54
685 0.45
686 0.36
687 0.27