Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q8SSI4

Protein Details
Accession Q8SSI4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
365-389EIRRIAKHRFLPKPLKNTLKRIHESHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
367-399RRIAKHRFLPKPLKNTLKRIHESHEAAERRRKA
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 14, cyto 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020472  G-protein_beta_WD-40_rep  
IPR007287  Sof1  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
KEGG ecu:ECU02_0240  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04158  Sof1  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MKISTIYHKPEEVCKERKKDVQYSSFAKDEVYHPFMREREFVRALNAVKIERMLSKPFVAALSYHKEGIHVLARHPHQSLFASGSFDGQVMLWDMEQRNLLKRFECNNPIKGLGVDREANVYAGQGKSVRRLGDAKVYHCNSEVLDLDMMETLNVGTSKGIEIFDLERDFPKQQMSTKYPLCISSSPVLTSIIGVGEQGGLSLFDARVGKIVHSVSIGSKTNGISFSPNGDVFVSGDEDSCIYLHDIRYLHEPSGVYRGHGNAVLSVAFNSLGTEIASGSFDKTIRIFGVNERKSRDTYYNRRMQNVFGVKYSHDSQFIVSGSDDGSVRLWKGYASRKLGPLSRKEKDALEYSKALKEKYEDVGEIRRIAKHRFLPKPLKNTLKRIHESHEAAERRRKAREVEEEFIG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.61
2 0.66
3 0.69
4 0.74
5 0.74
6 0.74
7 0.75
8 0.74
9 0.72
10 0.71
11 0.68
12 0.62
13 0.54
14 0.46
15 0.38
16 0.32
17 0.32
18 0.32
19 0.29
20 0.29
21 0.34
22 0.36
23 0.37
24 0.39
25 0.34
26 0.37
27 0.4
28 0.38
29 0.37
30 0.4
31 0.37
32 0.37
33 0.36
34 0.29
35 0.25
36 0.26
37 0.24
38 0.22
39 0.24
40 0.24
41 0.24
42 0.25
43 0.24
44 0.24
45 0.23
46 0.2
47 0.18
48 0.19
49 0.23
50 0.23
51 0.24
52 0.23
53 0.23
54 0.22
55 0.25
56 0.26
57 0.21
58 0.22
59 0.28
60 0.3
61 0.33
62 0.34
63 0.31
64 0.26
65 0.26
66 0.26
67 0.22
68 0.21
69 0.21
70 0.2
71 0.2
72 0.18
73 0.16
74 0.14
75 0.1
76 0.09
77 0.08
78 0.08
79 0.07
80 0.11
81 0.11
82 0.13
83 0.16
84 0.16
85 0.22
86 0.26
87 0.27
88 0.25
89 0.31
90 0.34
91 0.39
92 0.47
93 0.45
94 0.45
95 0.46
96 0.45
97 0.4
98 0.36
99 0.31
100 0.24
101 0.21
102 0.19
103 0.17
104 0.18
105 0.17
106 0.17
107 0.14
108 0.12
109 0.12
110 0.1
111 0.11
112 0.12
113 0.13
114 0.17
115 0.2
116 0.2
117 0.2
118 0.23
119 0.24
120 0.3
121 0.32
122 0.3
123 0.36
124 0.37
125 0.35
126 0.33
127 0.32
128 0.23
129 0.22
130 0.2
131 0.13
132 0.12
133 0.11
134 0.1
135 0.1
136 0.09
137 0.06
138 0.06
139 0.04
140 0.04
141 0.05
142 0.04
143 0.04
144 0.04
145 0.05
146 0.06
147 0.06
148 0.05
149 0.07
150 0.07
151 0.1
152 0.1
153 0.11
154 0.11
155 0.13
156 0.14
157 0.13
158 0.15
159 0.14
160 0.18
161 0.25
162 0.28
163 0.32
164 0.33
165 0.34
166 0.32
167 0.32
168 0.3
169 0.24
170 0.23
171 0.2
172 0.19
173 0.17
174 0.17
175 0.16
176 0.13
177 0.12
178 0.09
179 0.06
180 0.05
181 0.04
182 0.04
183 0.03
184 0.03
185 0.03
186 0.03
187 0.03
188 0.03
189 0.03
190 0.03
191 0.05
192 0.06
193 0.06
194 0.08
195 0.08
196 0.09
197 0.11
198 0.11
199 0.09
200 0.1
201 0.1
202 0.09
203 0.12
204 0.13
205 0.11
206 0.12
207 0.12
208 0.13
209 0.13
210 0.13
211 0.11
212 0.11
213 0.12
214 0.13
215 0.12
216 0.12
217 0.11
218 0.11
219 0.09
220 0.1
221 0.09
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.07
226 0.07
227 0.06
228 0.06
229 0.05
230 0.07
231 0.07
232 0.11
233 0.11
234 0.12
235 0.17
236 0.18
237 0.17
238 0.18
239 0.18
240 0.16
241 0.22
242 0.2
243 0.16
244 0.16
245 0.17
246 0.15
247 0.16
248 0.15
249 0.09
250 0.1
251 0.1
252 0.08
253 0.08
254 0.07
255 0.06
256 0.06
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.05
261 0.05
262 0.05
263 0.05
264 0.06
265 0.06
266 0.06
267 0.08
268 0.08
269 0.09
270 0.09
271 0.1
272 0.11
273 0.12
274 0.12
275 0.18
276 0.29
277 0.33
278 0.37
279 0.4
280 0.42
281 0.42
282 0.45
283 0.47
284 0.46
285 0.51
286 0.57
287 0.61
288 0.61
289 0.65
290 0.61
291 0.55
292 0.54
293 0.51
294 0.43
295 0.37
296 0.36
297 0.31
298 0.34
299 0.35
300 0.28
301 0.22
302 0.2
303 0.19
304 0.21
305 0.21
306 0.17
307 0.14
308 0.13
309 0.11
310 0.12
311 0.12
312 0.09
313 0.1
314 0.1
315 0.1
316 0.1
317 0.1
318 0.1
319 0.16
320 0.25
321 0.32
322 0.37
323 0.41
324 0.45
325 0.5
326 0.55
327 0.55
328 0.56
329 0.58
330 0.55
331 0.55
332 0.52
333 0.51
334 0.49
335 0.5
336 0.45
337 0.41
338 0.42
339 0.41
340 0.45
341 0.44
342 0.4
343 0.34
344 0.32
345 0.31
346 0.32
347 0.33
348 0.29
349 0.3
350 0.37
351 0.37
352 0.38
353 0.36
354 0.36
355 0.36
356 0.39
357 0.44
358 0.45
359 0.52
360 0.57
361 0.64
362 0.7
363 0.75
364 0.8
365 0.81
366 0.83
367 0.8
368 0.82
369 0.81
370 0.8
371 0.78
372 0.73
373 0.7
374 0.69
375 0.65
376 0.59
377 0.6
378 0.55
379 0.56
380 0.61
381 0.63
382 0.59
383 0.62
384 0.62
385 0.59
386 0.62
387 0.67
388 0.66