Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1V2E1

Protein Details
Accession H1V2E1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
344-365LSDKAQGKDKKRKKRGATSAVEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
349-359QGKDKKRKKRG
Subcellular Location(s) mito 13, nucl 12
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019135  Polycomb_protein_VEFS-Box  
IPR019786  Zinc_finger_PHD-type_CS  
IPR011011  Znf_FYVE_PHD  
IPR001965  Znf_PHD  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046872  F:metal ion binding  
KEGG chig:CH63R_12691  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09733  VEFS-Box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01359  ZF_PHD_1  
CDD cd15489  PHD_SF  
cd21552  VEFS-box_ctSUZ12-like  
Amino Acid Sequences MTLPSRRQRSTPFLQRNILQGMGNTQSSAQKAAASGDVPNGHNDGRPTKRRCFDADHQLADQIFQARDVGDLQRNLRVQVNRIFHKASKRVAAASSDDVVNLKARCKVSLSHVTNAGDVLLYCNSQLCDIRSFKDPGGPYRMARIGLPRPFYIPEDSMRINRDDDGSFDLADSYRLCVELEAAGPTFWPPIIINNPSGDEHASSRQSDTIHWVLTAASSDLFSRRRTLLNLKVKKSPQLLAPTDHVIDVDASWATAFEAGQIRAVESGVEPSITVSGQDTLVYEATDTIIEPPYESPPGTPVRALSNSYVNGDAHGDEEAEEELTPNRSLRVRGATKNYNLKVLSDKAQGKDKKRKKRGATSAVEEGSVTYYLPSEKVCLDSYRCITCGMPHGSFPQLHAHLISLHDEYEYRPQSRTKGAEFEVAHRYETYSFGPEPFALRRPTKAFDLDQFAEGNLSFVTSRFETEDKSTAGAAPLGGRSSRQPLTKPAQAPSKLIIPDIGQPLYDPITRAELQPGTEYRKPEASHEWLIQWHRDALADFSDVPPDEMEYMQEWDKFMLAKRITSNIYFSPAWLSFVKIKSDWLLSSPSRMLEFGKHLTYLLVRGSLDHETVEEALKHIAACRKRLGMENGKHPAAAPKEPPQGPHVRKSAGGCQVCGLVVLGPRLLLCANSDCAKRLYHSDCIRENAKMNIEDPDWVCNQCFDTQVAEHI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.73
2 0.7
3 0.68
4 0.63
5 0.54
6 0.44
7 0.34
8 0.31
9 0.29
10 0.26
11 0.21
12 0.19
13 0.2
14 0.21
15 0.23
16 0.19
17 0.16
18 0.17
19 0.18
20 0.19
21 0.16
22 0.16
23 0.18
24 0.22
25 0.22
26 0.23
27 0.23
28 0.22
29 0.24
30 0.26
31 0.3
32 0.36
33 0.45
34 0.5
35 0.57
36 0.63
37 0.65
38 0.67
39 0.67
40 0.67
41 0.68
42 0.69
43 0.64
44 0.58
45 0.56
46 0.51
47 0.42
48 0.36
49 0.29
50 0.21
51 0.17
52 0.17
53 0.13
54 0.14
55 0.16
56 0.18
57 0.2
58 0.24
59 0.25
60 0.31
61 0.32
62 0.33
63 0.37
64 0.35
65 0.35
66 0.4
67 0.46
68 0.44
69 0.48
70 0.5
71 0.48
72 0.54
73 0.56
74 0.53
75 0.52
76 0.49
77 0.48
78 0.46
79 0.44
80 0.38
81 0.35
82 0.31
83 0.24
84 0.22
85 0.2
86 0.19
87 0.2
88 0.17
89 0.17
90 0.21
91 0.22
92 0.23
93 0.25
94 0.26
95 0.3
96 0.4
97 0.42
98 0.4
99 0.45
100 0.44
101 0.42
102 0.39
103 0.31
104 0.2
105 0.15
106 0.13
107 0.09
108 0.08
109 0.08
110 0.1
111 0.1
112 0.12
113 0.14
114 0.14
115 0.2
116 0.22
117 0.24
118 0.28
119 0.31
120 0.29
121 0.34
122 0.34
123 0.32
124 0.38
125 0.38
126 0.34
127 0.37
128 0.39
129 0.33
130 0.32
131 0.34
132 0.34
133 0.37
134 0.4
135 0.34
136 0.34
137 0.36
138 0.37
139 0.34
140 0.28
141 0.25
142 0.27
143 0.28
144 0.29
145 0.29
146 0.29
147 0.25
148 0.24
149 0.25
150 0.2
151 0.19
152 0.21
153 0.19
154 0.17
155 0.16
156 0.16
157 0.13
158 0.14
159 0.12
160 0.09
161 0.08
162 0.09
163 0.09
164 0.08
165 0.09
166 0.09
167 0.09
168 0.09
169 0.09
170 0.08
171 0.09
172 0.09
173 0.09
174 0.07
175 0.07
176 0.06
177 0.1
178 0.16
179 0.18
180 0.19
181 0.2
182 0.22
183 0.21
184 0.22
185 0.19
186 0.15
187 0.15
188 0.18
189 0.19
190 0.18
191 0.19
192 0.2
193 0.2
194 0.19
195 0.23
196 0.2
197 0.19
198 0.18
199 0.17
200 0.14
201 0.14
202 0.14
203 0.08
204 0.06
205 0.06
206 0.07
207 0.1
208 0.13
209 0.13
210 0.16
211 0.17
212 0.19
213 0.23
214 0.3
215 0.36
216 0.45
217 0.52
218 0.52
219 0.58
220 0.58
221 0.6
222 0.56
223 0.48
224 0.43
225 0.44
226 0.43
227 0.38
228 0.39
229 0.35
230 0.32
231 0.29
232 0.23
233 0.15
234 0.13
235 0.09
236 0.08
237 0.05
238 0.05
239 0.05
240 0.05
241 0.04
242 0.04
243 0.04
244 0.06
245 0.08
246 0.09
247 0.11
248 0.11
249 0.11
250 0.11
251 0.11
252 0.09
253 0.06
254 0.08
255 0.06
256 0.06
257 0.05
258 0.05
259 0.06
260 0.06
261 0.06
262 0.05
263 0.06
264 0.06
265 0.06
266 0.06
267 0.07
268 0.07
269 0.07
270 0.06
271 0.05
272 0.06
273 0.05
274 0.05
275 0.05
276 0.07
277 0.07
278 0.07
279 0.08
280 0.1
281 0.11
282 0.11
283 0.1
284 0.12
285 0.15
286 0.15
287 0.14
288 0.13
289 0.17
290 0.18
291 0.2
292 0.17
293 0.18
294 0.18
295 0.19
296 0.19
297 0.15
298 0.14
299 0.13
300 0.11
301 0.08
302 0.08
303 0.07
304 0.05
305 0.06
306 0.06
307 0.05
308 0.05
309 0.05
310 0.05
311 0.07
312 0.07
313 0.07
314 0.08
315 0.09
316 0.1
317 0.13
318 0.2
319 0.23
320 0.27
321 0.34
322 0.37
323 0.41
324 0.49
325 0.47
326 0.43
327 0.38
328 0.35
329 0.31
330 0.28
331 0.27
332 0.25
333 0.27
334 0.25
335 0.33
336 0.38
337 0.42
338 0.51
339 0.56
340 0.61
341 0.68
342 0.75
343 0.75
344 0.81
345 0.83
346 0.82
347 0.78
348 0.71
349 0.66
350 0.57
351 0.49
352 0.38
353 0.28
354 0.19
355 0.14
356 0.09
357 0.05
358 0.05
359 0.05
360 0.05
361 0.05
362 0.06
363 0.06
364 0.08
365 0.09
366 0.11
367 0.13
368 0.16
369 0.19
370 0.19
371 0.19
372 0.18
373 0.17
374 0.16
375 0.21
376 0.21
377 0.19
378 0.18
379 0.2
380 0.21
381 0.21
382 0.21
383 0.19
384 0.17
385 0.16
386 0.16
387 0.14
388 0.13
389 0.14
390 0.14
391 0.09
392 0.09
393 0.08
394 0.09
395 0.09
396 0.16
397 0.19
398 0.18
399 0.19
400 0.21
401 0.24
402 0.29
403 0.31
404 0.26
405 0.27
406 0.27
407 0.32
408 0.31
409 0.33
410 0.33
411 0.3
412 0.28
413 0.24
414 0.24
415 0.17
416 0.19
417 0.16
418 0.13
419 0.13
420 0.13
421 0.14
422 0.13
423 0.15
424 0.15
425 0.18
426 0.2
427 0.21
428 0.24
429 0.27
430 0.29
431 0.29
432 0.31
433 0.29
434 0.28
435 0.33
436 0.3
437 0.28
438 0.25
439 0.22
440 0.19
441 0.17
442 0.14
443 0.07
444 0.06
445 0.05
446 0.05
447 0.08
448 0.08
449 0.09
450 0.1
451 0.11
452 0.13
453 0.16
454 0.19
455 0.17
456 0.17
457 0.17
458 0.15
459 0.15
460 0.13
461 0.1
462 0.08
463 0.08
464 0.08
465 0.08
466 0.08
467 0.09
468 0.15
469 0.18
470 0.2
471 0.22
472 0.28
473 0.35
474 0.41
475 0.42
476 0.41
477 0.46
478 0.45
479 0.45
480 0.4
481 0.39
482 0.33
483 0.3
484 0.26
485 0.19
486 0.22
487 0.23
488 0.21
489 0.15
490 0.15
491 0.16
492 0.17
493 0.16
494 0.13
495 0.1
496 0.15
497 0.16
498 0.17
499 0.2
500 0.18
501 0.19
502 0.22
503 0.24
504 0.26
505 0.28
506 0.3
507 0.28
508 0.32
509 0.32
510 0.32
511 0.36
512 0.35
513 0.37
514 0.36
515 0.35
516 0.35
517 0.36
518 0.34
519 0.29
520 0.24
521 0.2
522 0.19
523 0.18
524 0.15
525 0.14
526 0.14
527 0.12
528 0.12
529 0.14
530 0.13
531 0.13
532 0.12
533 0.11
534 0.1
535 0.1
536 0.11
537 0.1
538 0.12
539 0.13
540 0.14
541 0.14
542 0.13
543 0.14
544 0.14
545 0.14
546 0.21
547 0.2
548 0.22
549 0.24
550 0.28
551 0.3
552 0.3
553 0.32
554 0.25
555 0.29
556 0.26
557 0.24
558 0.24
559 0.22
560 0.24
561 0.21
562 0.23
563 0.23
564 0.26
565 0.29
566 0.24
567 0.25
568 0.25
569 0.27
570 0.24
571 0.21
572 0.25
573 0.22
574 0.26
575 0.25
576 0.24
577 0.22
578 0.22
579 0.22
580 0.2
581 0.24
582 0.24
583 0.24
584 0.23
585 0.22
586 0.23
587 0.22
588 0.2
589 0.16
590 0.14
591 0.12
592 0.13
593 0.16
594 0.16
595 0.16
596 0.14
597 0.13
598 0.12
599 0.13
600 0.14
601 0.12
602 0.11
603 0.11
604 0.11
605 0.11
606 0.14
607 0.2
608 0.23
609 0.27
610 0.3
611 0.34
612 0.35
613 0.42
614 0.47
615 0.51
616 0.54
617 0.59
618 0.61
619 0.58
620 0.55
621 0.49
622 0.47
623 0.42
624 0.4
625 0.36
626 0.38
627 0.47
628 0.48
629 0.5
630 0.49
631 0.55
632 0.54
633 0.57
634 0.55
635 0.48
636 0.5
637 0.53
638 0.54
639 0.53
640 0.5
641 0.42
642 0.38
643 0.36
644 0.32
645 0.28
646 0.2
647 0.12
648 0.13
649 0.13
650 0.12
651 0.11
652 0.11
653 0.12
654 0.12
655 0.1
656 0.1
657 0.13
658 0.16
659 0.21
660 0.23
661 0.24
662 0.26
663 0.27
664 0.27
665 0.32
666 0.34
667 0.38
668 0.44
669 0.49
670 0.52
671 0.56
672 0.57
673 0.53
674 0.51
675 0.47
676 0.46
677 0.41
678 0.37
679 0.36
680 0.34
681 0.35
682 0.33
683 0.32
684 0.28
685 0.27
686 0.27
687 0.23
688 0.25
689 0.22
690 0.23
691 0.2
692 0.22