FuNGI

A0A5C3EAN2

Protein Details

Accession

A0A5C3EAN2

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
84-111	TSQFIPPLKLNRKNPPRLKLPRPNPGDP	Hydrophilic
163-186	GGSARPPKSKLFKKKVREIHKAAD	Basic
768-787	LVQHFRKRLKSEPHIKDQLS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
166-184	ARPPKSKLFKKKVREIHKA
562-572	EKKEKEAAKTK

Subcellular Location(s)

nucl 21, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MPPVKSEPNVKSENGRATTAASQRARPANGHPRSNLKAEEDKKDLPPPPPTTYRDIPLLSTNCGQWLTHLMKFAHHTRVDPNDTSQFIPPLKLNRKNPPRLKLPRPNPGDPITDKYNRPMMGKDGQLLTWPGPDDDLQRIEDVIKKEVAAKGPGADQNLIAPGGSARPPKSKLFKKKVREIHKAADSARKTMKEEHFPWVLEDFETSEEWESIRTPIPTGARALQDHIDELKAKRTGSSTNNADANGDVKMQDSKSAIKGEDGIKQESGASTSSSSSSTSHAPWIGKLEGDSSSEASSLHVLFVFDERDAGGFKVVPVSRMYKFLQKPKHSTMTNEQVEQEYQKYQKTKEMDRWALRNKPIAAGSSSVTKQEDSAAWRNWPQVNQLSLPTGMSFGAGRRRNLMAVHGGELLRGDDDDDGNAGRRRKREDSPGAGYDELDYEEEFADDEEIHDPEADVVDDEEAKELEERLKREMARANNMGDDEEAADEASAPEDENQILTGSGKQMMKIMRALAKREGNEAYEKDDDGRNPYATDDSDEDEEESYVANPEKAIQLAREEREKKEKEAAKTKGKSSTTPGTGSGSNTPTDRVEKKPVILGGVQTQQQQPQQSRPGAGHASLAQRATSPTRGASKIGSKQVSRSSSPSLARSVSPGRAESPPVSSETSTSGGNGGSSGLKRRADSPATPATPTSSSSPATASANRAEAKRAKTGTTSSRAASPGTSSPPASKRGSRAGSPTAPRTPANAVEAEIIQLIRDGKIANTSELVQHFRKRLKSEPHIKDQLSAAVRKVAVMDKSTNRLKLKDGF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.49
2	0.46
3	0.39
4	0.39
5	0.44
6	0.43
7	0.45
8	0.39
9	0.38
10	0.44
11	0.5
12	0.49
13	0.44
14	0.49
15	0.51
16	0.56
17	0.6
18	0.57
19	0.58
20	0.6
21	0.63
22	0.56
23	0.52
24	0.54
25	0.53
26	0.56
27	0.54
28	0.54
29	0.53
30	0.58
31	0.56
32	0.52
33	0.56
34	0.55
35	0.55
36	0.58
37	0.58
38	0.58
39	0.58
40	0.56
41	0.52
42	0.47
43	0.42
44	0.43
45	0.41
46	0.37
47	0.35
48	0.31
49	0.28
50	0.28
51	0.25
52	0.18
53	0.24
54	0.25
55	0.25
56	0.3
57	0.28
58	0.31
59	0.37
60	0.4
61	0.41
62	0.38
63	0.38
64	0.38
65	0.47
66	0.49
67	0.46
68	0.46
69	0.43
70	0.43
71	0.43
72	0.39
73	0.36
74	0.3
75	0.31
76	0.29
77	0.34
78	0.42
79	0.49
80	0.55
81	0.61
82	0.7
83	0.79
84	0.84
85	0.82
86	0.83
87	0.83
88	0.86
89	0.86
90	0.85
91	0.84
92	0.83
93	0.8
94	0.75
95	0.69
96	0.65
97	0.57
98	0.54
99	0.52
100	0.5
101	0.46
102	0.45
103	0.48
104	0.43
105	0.42
106	0.38
107	0.36
108	0.36
109	0.37
110	0.35
111	0.3
112	0.28
113	0.28
114	0.28
115	0.23
116	0.19
117	0.18
118	0.15
119	0.14
120	0.16
121	0.16
122	0.19
123	0.2
124	0.19
125	0.18
126	0.18
127	0.19
128	0.22
129	0.22
130	0.21
131	0.19
132	0.18
133	0.22
134	0.25
135	0.26
136	0.24
137	0.22
138	0.21
139	0.24
140	0.26
141	0.25
142	0.22
143	0.19
144	0.18
145	0.18
146	0.16
147	0.12
148	0.1
149	0.08
150	0.09
151	0.13
152	0.16
153	0.18
154	0.24
155	0.28
156	0.35
157	0.45
158	0.53
159	0.61
160	0.68
161	0.74
162	0.78
163	0.84
164	0.87
165	0.87
166	0.86
167	0.82
168	0.8
169	0.76
170	0.71
171	0.64
172	0.63
173	0.54
174	0.5
175	0.48
176	0.42
177	0.38
178	0.43
179	0.47
180	0.47
181	0.48
182	0.49
183	0.47
184	0.45
185	0.43
186	0.36
187	0.3
188	0.21
189	0.19
190	0.14
191	0.12
192	0.12
193	0.11
194	0.1
195	0.1
196	0.1
197	0.1
198	0.1
199	0.1
200	0.12
201	0.12
202	0.12
203	0.15
204	0.17
205	0.18
206	0.2
207	0.22
208	0.22
209	0.22
210	0.24
211	0.22
212	0.21
213	0.21
214	0.19
215	0.17
216	0.16
217	0.17
218	0.21
219	0.21
220	0.2
221	0.2
222	0.22
223	0.26
224	0.28
225	0.35
226	0.32
227	0.34
228	0.36
229	0.34
230	0.33
231	0.27
232	0.24
233	0.16
234	0.13
235	0.08
236	0.08
237	0.1
238	0.1
239	0.12
240	0.13
241	0.14
242	0.17
243	0.2
244	0.19
245	0.17
246	0.21
247	0.21
248	0.25
249	0.26
250	0.24
251	0.22
252	0.22
253	0.21
254	0.18
255	0.17
256	0.11
257	0.09
258	0.08
259	0.09
260	0.1
261	0.1
262	0.11
263	0.1
264	0.12
265	0.13
266	0.13
267	0.14
268	0.17
269	0.16
270	0.16
271	0.19
272	0.18
273	0.16
274	0.15
275	0.14
276	0.12
277	0.14
278	0.13
279	0.11
280	0.1
281	0.1
282	0.1
283	0.09
284	0.09
285	0.08
286	0.07
287	0.07
288	0.06
289	0.07
290	0.08
291	0.08
292	0.07
293	0.07
294	0.06
295	0.06
296	0.07
297	0.07
298	0.06
299	0.06
300	0.06
301	0.11
302	0.11
303	0.12
304	0.13
305	0.17
306	0.17
307	0.22
308	0.23
309	0.26
310	0.31
311	0.38
312	0.46
313	0.48
314	0.54
315	0.56
316	0.62
317	0.54
318	0.54
319	0.54
320	0.54
321	0.5
322	0.44
323	0.39
324	0.32
325	0.32
326	0.28
327	0.22
328	0.16
329	0.15
330	0.18
331	0.2
332	0.21
333	0.26
334	0.29
335	0.33
336	0.38
337	0.45
338	0.49
339	0.5
340	0.56
341	0.56
342	0.58
343	0.55
344	0.51
345	0.43
346	0.37
347	0.35
348	0.29
349	0.24
350	0.19
351	0.18
352	0.16
353	0.16
354	0.14
355	0.14
356	0.13
357	0.12
358	0.12
359	0.13
360	0.14
361	0.2
362	0.2
363	0.21
364	0.22
365	0.26
366	0.26
367	0.25
368	0.24
369	0.22
370	0.23
371	0.22
372	0.21
373	0.19
374	0.17
375	0.16
376	0.13
377	0.09
378	0.07
379	0.07
380	0.06
381	0.06
382	0.14
383	0.17
384	0.17
385	0.19
386	0.2
387	0.21
388	0.21
389	0.21
390	0.17
391	0.15
392	0.16
393	0.15
394	0.14
395	0.13
396	0.13
397	0.11
398	0.07
399	0.06
400	0.05
401	0.04
402	0.04
403	0.04
404	0.04
405	0.05
406	0.07
407	0.1
408	0.13
409	0.16
410	0.19
411	0.25
412	0.3
413	0.34
414	0.42
415	0.47
416	0.5
417	0.52
418	0.51
419	0.47
420	0.42
421	0.38
422	0.28
423	0.21
424	0.14
425	0.09
426	0.07
427	0.06
428	0.06
429	0.05
430	0.05
431	0.05
432	0.05
433	0.04
434	0.05
435	0.06
436	0.06
437	0.06
438	0.06
439	0.06
440	0.05
441	0.06
442	0.05
443	0.04
444	0.04
445	0.04
446	0.04
447	0.04
448	0.05
449	0.04
450	0.05
451	0.05
452	0.05
453	0.1
454	0.13
455	0.14
456	0.17
457	0.21
458	0.21
459	0.24
460	0.3
461	0.29
462	0.33
463	0.34
464	0.32
465	0.29
466	0.29
467	0.26
468	0.2
469	0.16
470	0.1
471	0.07
472	0.06
473	0.05
474	0.04
475	0.04
476	0.04
477	0.04
478	0.04
479	0.04
480	0.04
481	0.05
482	0.05
483	0.05
484	0.06
485	0.06
486	0.06
487	0.06
488	0.06
489	0.06
490	0.11
491	0.11
492	0.11
493	0.14
494	0.15
495	0.16
496	0.17
497	0.19
498	0.21
499	0.23
500	0.25
501	0.28
502	0.31
503	0.3
504	0.32
505	0.31
506	0.27
507	0.29
508	0.27
509	0.25
510	0.21
511	0.21
512	0.19
513	0.2
514	0.19
515	0.2
516	0.22
517	0.18
518	0.17
519	0.18
520	0.18
521	0.16
522	0.18
523	0.14
524	0.13
525	0.14
526	0.14
527	0.14
528	0.13
529	0.12
530	0.1
531	0.08
532	0.07
533	0.08
534	0.08
535	0.07
536	0.07
537	0.08
538	0.09
539	0.09
540	0.1
541	0.09
542	0.14
543	0.19
544	0.21
545	0.29
546	0.31
547	0.35
548	0.44
549	0.46
550	0.44
551	0.48
552	0.52
553	0.51
554	0.58
555	0.62
556	0.62
557	0.64
558	0.65
559	0.64
560	0.6
561	0.54
562	0.5
563	0.5
564	0.43
565	0.4
566	0.38
567	0.32
568	0.31
569	0.31
570	0.29
571	0.23
572	0.2
573	0.19
574	0.2
575	0.19
576	0.23
577	0.25
578	0.25
579	0.32
580	0.34
581	0.35
582	0.37
583	0.36
584	0.32
585	0.3
586	0.26
587	0.23
588	0.24
589	0.24
590	0.23
591	0.24
592	0.25
593	0.27
594	0.32
595	0.3
596	0.33
597	0.39
598	0.38
599	0.39
600	0.36
601	0.38
602	0.34
603	0.31
604	0.26
605	0.22
606	0.23
607	0.24
608	0.23
609	0.18
610	0.17
611	0.19
612	0.2
613	0.2
614	0.18
615	0.19
616	0.24
617	0.25
618	0.26
619	0.28
620	0.32
621	0.36
622	0.43
623	0.44
624	0.39
625	0.43
626	0.5
627	0.5
628	0.45
629	0.42
630	0.4
631	0.42
632	0.44
633	0.42
634	0.37
635	0.34
636	0.32
637	0.33
638	0.31
639	0.29
640	0.29
641	0.28
642	0.27
643	0.28
644	0.31
645	0.27
646	0.27
647	0.23
648	0.24
649	0.25
650	0.22
651	0.21
652	0.21
653	0.21
654	0.18
655	0.16
656	0.15
657	0.12
658	0.12
659	0.11
660	0.08
661	0.1
662	0.11
663	0.16
664	0.21
665	0.23
666	0.24
667	0.27
668	0.34
669	0.36
670	0.37
671	0.38
672	0.42
673	0.42
674	0.42
675	0.39
676	0.35
677	0.31
678	0.32
679	0.29
680	0.23
681	0.22
682	0.22
683	0.22
684	0.21
685	0.23
686	0.23
687	0.23
688	0.22
689	0.26
690	0.28
691	0.27
692	0.32
693	0.34
694	0.36
695	0.41
696	0.4
697	0.37
698	0.38
699	0.44
700	0.46
701	0.46
702	0.45
703	0.38
704	0.4
705	0.39
706	0.37
707	0.31
708	0.27
709	0.24
710	0.27
711	0.28
712	0.25
713	0.31
714	0.34
715	0.38
716	0.4
717	0.41
718	0.41
719	0.48
720	0.52
721	0.49
722	0.52
723	0.54
724	0.56
725	0.57
726	0.58
727	0.54
728	0.53
729	0.5
730	0.47
731	0.44
732	0.4
733	0.37
734	0.31
735	0.27
736	0.26
737	0.25
738	0.22
739	0.18
740	0.14
741	0.11
742	0.12
743	0.12
744	0.1
745	0.11
746	0.11
747	0.1
748	0.17
749	0.19
750	0.19
751	0.2
752	0.2
753	0.24
754	0.27
755	0.32
756	0.3
757	0.35
758	0.4
759	0.46
760	0.52
761	0.53
762	0.59
763	0.64
764	0.7
765	0.74
766	0.76
767	0.8
768	0.81
769	0.76
770	0.7
771	0.62
772	0.59
773	0.53
774	0.47
775	0.38
776	0.35
777	0.34
778	0.31
779	0.31
780	0.28
781	0.26
782	0.28
783	0.34
784	0.34
785	0.42
786	0.48
787	0.53
788	0.51
789	0.5

A0A5C3EAN2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer