Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3E4I1

Protein Details
Accession A0A5C3E4I1    Localization Confidence Low Confidence Score 9.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
985-1011TDPLPFQRVKKLRNPWRDNRQVKVSRDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 11, mito 6, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR007275  YTH_domain  
IPR045168  YTH_prot  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04146  YTH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50882  YTH  
CDD cd00590  RRM_SF  
cd21134  YTH  
Amino Acid Sequences MTHNPATSQRPSRADPARKQTLGDADRRNMSPAGAALPSDRVAHPPARHIASPPPAQYPHFSPGHHNIPPSMNAHSHHHPAQQGGASFQSYGSPASVDAYGYGGPPYHPGRHNVESHHFARPPSRTKSQSSGSGSAPSPHDVAPPGSHYTPHFSPSYPAVSSNPSVGHSGGRTRWAWVPIEVPQAHLPDDAQLQYAPYPGAYYPSPAASAVSNASSSHQSYQQSYGGEGSVPTTPAYGVQASPNYTQPYPYHLHPGHYGPHPGHNSHTNVVAPGRGSWSGSPQATMQPTGVVRDNAAGGGSRRQSNQPGRSGNAQRRTSSNSSGHHSSPHRACAPLPHRPSAVPLDAQSNASEAGTLPSQPLDLVGEEAQEESAVLTVPAPASEADPDFDADGPHDVINAERIPGSGLRPHYHPQQGPRSDWVLWCGNVPQDATVEELWEVFSRLTPDEYQNWAASSEAREQAGELADPDVDGHGVLSIFIISRSNCAFVNYASPAHLDRAVKYFHGKQVRPRDPRCPKLVCRVRKKDDEAQAGVAGQRGRGIHVAWLKQQRELERAQMDASAAITPDPLSLESPTRLSTEPMSPSRKDSTQVAAGLTSAGSYSSSGSASYTSTNSSLFRHPAFRHRFFILKSLRSDDLDRSIETGYWATQPHNENVLDQAYRNSETVYLIFGVNQTGQFHGYAKMAGPIHTPTAEAKTKGDQRRRASLSSVRSAASSSVTPATILESADENTGEVDPNLSGVSSPSDSSTRRSHPTLDKRDIETARGLFGTLSIDGVGDATHALPMTSPLPLSPTLEDAGLENALSPQRNDTITPRTAGSIAQSNTWPYTSTKSVNSEVAPERPKLASALSEEASVGRVTAEPDEYGVRRVDMETESAQTNSSQSDQPSLAPSDSASWSSADPRMAEQIALRAVIHNLRLDEMESRGKAEMLESQLRSSSNDTDATVTARGSEHGGGEGDERTPPRQSSSDSWGKPFRVEWIRTDPLPFQRVKKLRNPWRDNRQVKVSRDGTELEPGVGRQLLDEWNRLHAAAPVDSTKASKNAEPNKASTHAASDEDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.7
3 0.72
4 0.74
5 0.69
6 0.67
7 0.63
8 0.63
9 0.58
10 0.58
11 0.55
12 0.51
13 0.55
14 0.54
15 0.52
16 0.43
17 0.37
18 0.31
19 0.25
20 0.23
21 0.18
22 0.17
23 0.15
24 0.17
25 0.18
26 0.18
27 0.18
28 0.18
29 0.21
30 0.28
31 0.29
32 0.33
33 0.39
34 0.41
35 0.41
36 0.41
37 0.45
38 0.46
39 0.5
40 0.46
41 0.46
42 0.44
43 0.46
44 0.47
45 0.44
46 0.43
47 0.41
48 0.39
49 0.4
50 0.45
51 0.51
52 0.49
53 0.45
54 0.42
55 0.42
56 0.44
57 0.39
58 0.35
59 0.31
60 0.31
61 0.36
62 0.38
63 0.4
64 0.41
65 0.43
66 0.4
67 0.39
68 0.4
69 0.37
70 0.32
71 0.28
72 0.26
73 0.22
74 0.2
75 0.19
76 0.16
77 0.13
78 0.13
79 0.11
80 0.1
81 0.09
82 0.11
83 0.11
84 0.1
85 0.09
86 0.1
87 0.1
88 0.1
89 0.1
90 0.09
91 0.09
92 0.14
93 0.18
94 0.24
95 0.26
96 0.31
97 0.38
98 0.44
99 0.48
100 0.49
101 0.51
102 0.51
103 0.51
104 0.54
105 0.48
106 0.44
107 0.48
108 0.49
109 0.5
110 0.51
111 0.57
112 0.54
113 0.58
114 0.64
115 0.61
116 0.62
117 0.61
118 0.57
119 0.5
120 0.5
121 0.45
122 0.41
123 0.38
124 0.31
125 0.26
126 0.23
127 0.23
128 0.2
129 0.22
130 0.2
131 0.22
132 0.24
133 0.23
134 0.25
135 0.24
136 0.29
137 0.28
138 0.29
139 0.27
140 0.23
141 0.25
142 0.27
143 0.3
144 0.24
145 0.24
146 0.23
147 0.26
148 0.26
149 0.26
150 0.23
151 0.2
152 0.21
153 0.19
154 0.2
155 0.17
156 0.22
157 0.21
158 0.25
159 0.24
160 0.26
161 0.3
162 0.31
163 0.3
164 0.27
165 0.28
166 0.26
167 0.34
168 0.31
169 0.3
170 0.3
171 0.29
172 0.28
173 0.26
174 0.22
175 0.16
176 0.18
177 0.16
178 0.13
179 0.12
180 0.12
181 0.12
182 0.13
183 0.11
184 0.08
185 0.09
186 0.08
187 0.11
188 0.11
189 0.13
190 0.13
191 0.14
192 0.15
193 0.14
194 0.15
195 0.12
196 0.13
197 0.11
198 0.11
199 0.11
200 0.1
201 0.12
202 0.14
203 0.15
204 0.16
205 0.2
206 0.21
207 0.23
208 0.26
209 0.27
210 0.25
211 0.24
212 0.23
213 0.19
214 0.17
215 0.14
216 0.12
217 0.1
218 0.1
219 0.09
220 0.09
221 0.08
222 0.09
223 0.11
224 0.1
225 0.1
226 0.12
227 0.15
228 0.18
229 0.19
230 0.22
231 0.24
232 0.23
233 0.26
234 0.23
235 0.26
236 0.27
237 0.27
238 0.33
239 0.3
240 0.33
241 0.33
242 0.35
243 0.34
244 0.34
245 0.36
246 0.28
247 0.35
248 0.35
249 0.33
250 0.34
251 0.35
252 0.35
253 0.32
254 0.33
255 0.26
256 0.24
257 0.24
258 0.21
259 0.16
260 0.13
261 0.14
262 0.13
263 0.13
264 0.13
265 0.16
266 0.2
267 0.19
268 0.2
269 0.18
270 0.22
271 0.22
272 0.22
273 0.18
274 0.16
275 0.17
276 0.18
277 0.2
278 0.15
279 0.14
280 0.14
281 0.14
282 0.11
283 0.11
284 0.1
285 0.08
286 0.13
287 0.16
288 0.17
289 0.19
290 0.22
291 0.31
292 0.39
293 0.44
294 0.46
295 0.47
296 0.47
297 0.54
298 0.59
299 0.59
300 0.6
301 0.56
302 0.5
303 0.5
304 0.55
305 0.51
306 0.49
307 0.46
308 0.4
309 0.42
310 0.44
311 0.42
312 0.41
313 0.39
314 0.4
315 0.38
316 0.4
317 0.36
318 0.33
319 0.33
320 0.37
321 0.4
322 0.42
323 0.42
324 0.39
325 0.39
326 0.38
327 0.41
328 0.36
329 0.32
330 0.24
331 0.21
332 0.21
333 0.21
334 0.22
335 0.18
336 0.14
337 0.12
338 0.11
339 0.1
340 0.07
341 0.07
342 0.07
343 0.07
344 0.07
345 0.06
346 0.07
347 0.06
348 0.06
349 0.06
350 0.06
351 0.07
352 0.07
353 0.07
354 0.07
355 0.07
356 0.07
357 0.05
358 0.05
359 0.04
360 0.04
361 0.03
362 0.03
363 0.03
364 0.04
365 0.04
366 0.04
367 0.05
368 0.05
369 0.06
370 0.07
371 0.07
372 0.07
373 0.08
374 0.08
375 0.08
376 0.08
377 0.07
378 0.07
379 0.08
380 0.08
381 0.07
382 0.07
383 0.07
384 0.07
385 0.09
386 0.09
387 0.08
388 0.07
389 0.07
390 0.08
391 0.09
392 0.1
393 0.12
394 0.14
395 0.16
396 0.19
397 0.22
398 0.27
399 0.33
400 0.34
401 0.37
402 0.44
403 0.46
404 0.45
405 0.45
406 0.42
407 0.37
408 0.35
409 0.31
410 0.24
411 0.2
412 0.19
413 0.17
414 0.14
415 0.14
416 0.14
417 0.1
418 0.08
419 0.08
420 0.1
421 0.09
422 0.08
423 0.07
424 0.07
425 0.07
426 0.07
427 0.07
428 0.05
429 0.06
430 0.07
431 0.08
432 0.1
433 0.11
434 0.13
435 0.15
436 0.18
437 0.19
438 0.18
439 0.18
440 0.16
441 0.15
442 0.14
443 0.13
444 0.14
445 0.13
446 0.13
447 0.13
448 0.13
449 0.14
450 0.13
451 0.1
452 0.07
453 0.06
454 0.05
455 0.05
456 0.05
457 0.04
458 0.04
459 0.04
460 0.03
461 0.03
462 0.03
463 0.03
464 0.03
465 0.03
466 0.03
467 0.04
468 0.05
469 0.05
470 0.07
471 0.07
472 0.08
473 0.08
474 0.1
475 0.1
476 0.09
477 0.13
478 0.12
479 0.12
480 0.11
481 0.12
482 0.11
483 0.11
484 0.15
485 0.12
486 0.12
487 0.14
488 0.14
489 0.14
490 0.17
491 0.19
492 0.21
493 0.29
494 0.29
495 0.35
496 0.45
497 0.54
498 0.59
499 0.6
500 0.65
501 0.66
502 0.7
503 0.68
504 0.64
505 0.57
506 0.6
507 0.66
508 0.64
509 0.66
510 0.7
511 0.69
512 0.7
513 0.72
514 0.69
515 0.68
516 0.64
517 0.54
518 0.45
519 0.39
520 0.33
521 0.27
522 0.21
523 0.14
524 0.08
525 0.09
526 0.08
527 0.09
528 0.09
529 0.09
530 0.11
531 0.15
532 0.16
533 0.2
534 0.27
535 0.26
536 0.28
537 0.31
538 0.29
539 0.29
540 0.28
541 0.28
542 0.22
543 0.22
544 0.2
545 0.17
546 0.15
547 0.12
548 0.11
549 0.06
550 0.05
551 0.05
552 0.05
553 0.04
554 0.04
555 0.05
556 0.05
557 0.05
558 0.06
559 0.08
560 0.08
561 0.09
562 0.1
563 0.12
564 0.12
565 0.12
566 0.13
567 0.15
568 0.19
569 0.24
570 0.27
571 0.26
572 0.29
573 0.31
574 0.3
575 0.29
576 0.26
577 0.24
578 0.23
579 0.24
580 0.2
581 0.17
582 0.16
583 0.14
584 0.12
585 0.08
586 0.04
587 0.03
588 0.03
589 0.04
590 0.04
591 0.05
592 0.05
593 0.05
594 0.06
595 0.06
596 0.07
597 0.08
598 0.08
599 0.08
600 0.09
601 0.1
602 0.1
603 0.12
604 0.14
605 0.15
606 0.16
607 0.21
608 0.22
609 0.31
610 0.39
611 0.41
612 0.42
613 0.41
614 0.43
615 0.38
616 0.45
617 0.41
618 0.37
619 0.35
620 0.35
621 0.34
622 0.33
623 0.34
624 0.27
625 0.26
626 0.24
627 0.22
628 0.19
629 0.18
630 0.17
631 0.16
632 0.14
633 0.09
634 0.1
635 0.11
636 0.1
637 0.15
638 0.17
639 0.18
640 0.21
641 0.2
642 0.19
643 0.2
644 0.21
645 0.16
646 0.14
647 0.15
648 0.13
649 0.14
650 0.14
651 0.12
652 0.11
653 0.11
654 0.11
655 0.1
656 0.09
657 0.08
658 0.08
659 0.08
660 0.08
661 0.08
662 0.08
663 0.08
664 0.07
665 0.08
666 0.09
667 0.09
668 0.1
669 0.1
670 0.1
671 0.09
672 0.13
673 0.13
674 0.13
675 0.14
676 0.13
677 0.14
678 0.14
679 0.15
680 0.11
681 0.17
682 0.19
683 0.18
684 0.18
685 0.24
686 0.32
687 0.4
688 0.47
689 0.5
690 0.53
691 0.61
692 0.64
693 0.59
694 0.56
695 0.54
696 0.51
697 0.47
698 0.44
699 0.35
700 0.31
701 0.29
702 0.25
703 0.2
704 0.14
705 0.11
706 0.1
707 0.1
708 0.1
709 0.09
710 0.11
711 0.1
712 0.09
713 0.08
714 0.08
715 0.09
716 0.1
717 0.09
718 0.07
719 0.07
720 0.08
721 0.07
722 0.06
723 0.06
724 0.05
725 0.06
726 0.06
727 0.05
728 0.05
729 0.05
730 0.07
731 0.07
732 0.08
733 0.09
734 0.13
735 0.14
736 0.18
737 0.24
738 0.26
739 0.3
740 0.32
741 0.37
742 0.44
743 0.54
744 0.59
745 0.61
746 0.6
747 0.59
748 0.65
749 0.59
750 0.51
751 0.45
752 0.36
753 0.29
754 0.25
755 0.22
756 0.14
757 0.13
758 0.12
759 0.08
760 0.07
761 0.06
762 0.06
763 0.05
764 0.06
765 0.05
766 0.04
767 0.04
768 0.04
769 0.04
770 0.04
771 0.04
772 0.04
773 0.06
774 0.07
775 0.07
776 0.07
777 0.07
778 0.09
779 0.1
780 0.12
781 0.11
782 0.13
783 0.13
784 0.13
785 0.13
786 0.11
787 0.12
788 0.1
789 0.09
790 0.07
791 0.08
792 0.1
793 0.1
794 0.1
795 0.11
796 0.14
797 0.15
798 0.16
799 0.19
800 0.25
801 0.26
802 0.27
803 0.25
804 0.24
805 0.24
806 0.22
807 0.2
808 0.2
809 0.19
810 0.19
811 0.2
812 0.21
813 0.21
814 0.21
815 0.2
816 0.15
817 0.19
818 0.22
819 0.24
820 0.26
821 0.3
822 0.32
823 0.34
824 0.32
825 0.33
826 0.32
827 0.36
828 0.35
829 0.31
830 0.31
831 0.28
832 0.28
833 0.23
834 0.21
835 0.17
836 0.18
837 0.21
838 0.19
839 0.18
840 0.18
841 0.17
842 0.17
843 0.14
844 0.1
845 0.07
846 0.07
847 0.08
848 0.09
849 0.1
850 0.09
851 0.11
852 0.14
853 0.14
854 0.16
855 0.15
856 0.14
857 0.14
858 0.15
859 0.16
860 0.14
861 0.16
862 0.15
863 0.17
864 0.18
865 0.17
866 0.17
867 0.15
868 0.15
869 0.13
870 0.14
871 0.15
872 0.14
873 0.18
874 0.18
875 0.19
876 0.22
877 0.23
878 0.2
879 0.18
880 0.17
881 0.17
882 0.18
883 0.18
884 0.15
885 0.14
886 0.14
887 0.17
888 0.2
889 0.18
890 0.17
891 0.18
892 0.21
893 0.21
894 0.2
895 0.18
896 0.19
897 0.18
898 0.18
899 0.16
900 0.13
901 0.15
902 0.17
903 0.18
904 0.16
905 0.16
906 0.16
907 0.17
908 0.17
909 0.17
910 0.18
911 0.22
912 0.2
913 0.22
914 0.21
915 0.21
916 0.2
917 0.19
918 0.2
919 0.2
920 0.27
921 0.26
922 0.26
923 0.28
924 0.29
925 0.3
926 0.28
927 0.25
928 0.22
929 0.22
930 0.22
931 0.22
932 0.22
933 0.22
934 0.2
935 0.16
936 0.15
937 0.14
938 0.14
939 0.14
940 0.14
941 0.12
942 0.13
943 0.13
944 0.13
945 0.14
946 0.14
947 0.12
948 0.15
949 0.16
950 0.17
951 0.21
952 0.22
953 0.25
954 0.28
955 0.32
956 0.34
957 0.41
958 0.49
959 0.47
960 0.52
961 0.54
962 0.52
963 0.49
964 0.44
965 0.44
966 0.44
967 0.44
968 0.44
969 0.46
970 0.5
971 0.49
972 0.51
973 0.48
974 0.46
975 0.5
976 0.47
977 0.44
978 0.49
979 0.56
980 0.6
981 0.64
982 0.67
983 0.72
984 0.79
985 0.84
986 0.83
987 0.86
988 0.9
989 0.87
990 0.84
991 0.84
992 0.82
993 0.77
994 0.76
995 0.7
996 0.62
997 0.59
998 0.54
999 0.45
1000 0.43
1001 0.39
1002 0.31
1003 0.27
1004 0.23
1005 0.23
1006 0.21
1007 0.18
1008 0.12
1009 0.14
1010 0.19
1011 0.21
1012 0.26
1013 0.25
1014 0.28
1015 0.29
1016 0.29
1017 0.27
1018 0.24
1019 0.24
1020 0.21
1021 0.23
1022 0.21
1023 0.22
1024 0.22
1025 0.24
1026 0.23
1027 0.25
1028 0.26
1029 0.28
1030 0.36
1031 0.44
1032 0.53
1033 0.55
1034 0.55
1035 0.56
1036 0.56
1037 0.54
1038 0.45
1039 0.4
1040 0.33