FuNGI

A0A5C3E1N3

Protein Details

Accession

A0A5C3E1N3

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1171-1195	RIPNIFARRQQQQQQQQQQQQQQQQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 18, cyto_nucl 13.5, cyto 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039745 Vps54 IPR012501 Vps54_C IPR019515 VPS54_N
Gene Ontology	GO:0005829 C:cytosol GO:0000938 C:GARP complex GO:0015031 P:protein transport GO:0042147 P:retrograde transport, endosome to Golgi
Pfam	View protein in Pfam PF07928 Vps54 PF10475 Vps54_N

Amino Acid Sequences

MSTGIDEAATSSSRNVGTSSASSSPHIIGDETVSSIQLRNGIASPGSPGSEADSTINSTTFAPSILASRLGRSLYSSAGAAGSSLSLSGSGFNSPSLALTGFNAVSTVLNNPSKRQHPIDPKSSRFPPVTPNHVPADIPKVKKAELDPYLSSVRPEWDRFMRNQSMGRQGKATIEQQQQQQQQQQQQQQQQHRSNDSSYDSEPLGKANRRHRPTASMASLSADLQAVPPPQARKRLPNLSTVPQVFFSEDFDLGNPYTFDQVTERFKVASVSPAEQNGGVAPTYDVALNQMLQEKLSYYSDVIEQHLIIEIGQQSSSFFAALENLNDLNAEAESCLRKIDDLKSELVSIDEKQAKKGLRVIREQQHRRQLERKQIAVQNVRQIIERRDLIRLLLQQGETEEALDLLNKLRSVLRRPHCEQEHVRPDADGTVSIKDASADTEVALSELRCLASIPAQLEEMEQTLSGMLEQDLIAILRQDIDARLAVHRRYSTSSSTSTNGNDYFATISDQSGKQPSAAGPLAPTESLLTPSKAPASPFGHSARALSTADSDLESRIVPHVIGLAKTGCIEKAVATYREVAIQAIHETWRETLSRSRSEMAETVQWLLSEDLSKYDDPDNLPPPAARIRDLEHTSFLNMGRELFEVLIECLKAIDGQCKLVLCILDDLHTSNTSTIESTATDAANNDPTPGLPSPPTMPQGVPTNLPAKLSDVVVASAEQAHSLCARLLGLRATTHAALELPPFLVVFQLCWSFVLSSEQLCRKMIVGLRGTVLSQAKGFLANFHRRRIERAAKAVEEETWAQAEVGAEIQAQIHQIVKSAVEDPADFVVTGSEVQQDEASNKQGKLEAETADSSEGAAPASTKTLGIEDRQYFVVDASLDVLSLLVDYLKVIINLPLLTTEAMARVVEFLKQFNSRTCQVVLGAGAMRSAGLKNITAKHLALASQSLSIMISLIPYIRETVRRHLSPKQAVMLTEFDKLRRDFQEHQYEIHAKLVAIMSDRLTVHCRTLSAIDWNAEKPAAEDQEGDEVKEAEPNRYAADLVKETATLHKVLSKYLQAVVVEHVIGQVLRSIDARIAQEFEKVPVQNHHALDRMQTDARYLGTKLSALKHVEWKDEALQQVLASKRVAPPPTVSVTSSAGPSTPSNEVAPGSPAVDKPAASPFGPVTYKPRIPNIFARRQQQQQQQQQQQQQQQQHSQSGSPRASTDVPGTSTPADAQRSVETTPRTSIQCEPKVIK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.15
2	0.15
3	0.14
4	0.17
5	0.19
6	0.23
7	0.22
8	0.24
9	0.24
10	0.26
11	0.25
12	0.23
13	0.22
14	0.18
15	0.15
16	0.16
17	0.16
18	0.15
19	0.15
20	0.14
21	0.14
22	0.14
23	0.15
24	0.16
25	0.15
26	0.15
27	0.16
28	0.17
29	0.17
30	0.16
31	0.19
32	0.16
33	0.17
34	0.15
35	0.14
36	0.17
37	0.18
38	0.18
39	0.16
40	0.16
41	0.18
42	0.19
43	0.19
44	0.15
45	0.15
46	0.15
47	0.14
48	0.13
49	0.11
50	0.1
51	0.13
52	0.14
53	0.18
54	0.17
55	0.19
56	0.21
57	0.21
58	0.21
59	0.22
60	0.22
61	0.18
62	0.19
63	0.17
64	0.15
65	0.14
66	0.14
67	0.1
68	0.09
69	0.07
70	0.06
71	0.05
72	0.05
73	0.05
74	0.05
75	0.07
76	0.08
77	0.09
78	0.09
79	0.09
80	0.1
81	0.1
82	0.1
83	0.1
84	0.1
85	0.09
86	0.09
87	0.13
88	0.12
89	0.12
90	0.11
91	0.1
92	0.1
93	0.1
94	0.12
95	0.16
96	0.22
97	0.23
98	0.27
99	0.34
100	0.39
101	0.45
102	0.48
103	0.52
104	0.57
105	0.64
106	0.71
107	0.73
108	0.73
109	0.75
110	0.74
111	0.7
112	0.61
113	0.55
114	0.54
115	0.53
116	0.56
117	0.53
118	0.53
119	0.5
120	0.48
121	0.46
122	0.39
123	0.41
124	0.4
125	0.37
126	0.38
127	0.37
128	0.37
129	0.41
130	0.42
131	0.41
132	0.38
133	0.41
134	0.38
135	0.39
136	0.42
137	0.38
138	0.36
139	0.28
140	0.28
141	0.27
142	0.28
143	0.3
144	0.35
145	0.39
146	0.42
147	0.49
148	0.5
149	0.49
150	0.52
151	0.51
152	0.54
153	0.53
154	0.51
155	0.44
156	0.39
157	0.39
158	0.38
159	0.37
160	0.35
161	0.38
162	0.41
163	0.46
164	0.53
165	0.55
166	0.57
167	0.6
168	0.58
169	0.59
170	0.63
171	0.65
172	0.65
173	0.67
174	0.7
175	0.72
176	0.75
177	0.75
178	0.74
179	0.71
180	0.66
181	0.6
182	0.55
183	0.5
184	0.43
185	0.36
186	0.32
187	0.27
188	0.26
189	0.24
190	0.23
191	0.26
192	0.29
193	0.35
194	0.42
195	0.52
196	0.55
197	0.6
198	0.61
199	0.6
200	0.61
201	0.63
202	0.58
203	0.5
204	0.45
205	0.41
206	0.39
207	0.32
208	0.25
209	0.16
210	0.11
211	0.09
212	0.12
213	0.11
214	0.12
215	0.16
216	0.21
217	0.26
218	0.35
219	0.39
220	0.44
221	0.52
222	0.6
223	0.59
224	0.62
225	0.63
226	0.59
227	0.62
228	0.56
229	0.48
230	0.39
231	0.38
232	0.31
233	0.26
234	0.23
235	0.18
236	0.16
237	0.15
238	0.14
239	0.15
240	0.14
241	0.14
242	0.12
243	0.1
244	0.12
245	0.11
246	0.12
247	0.12
248	0.17
249	0.22
250	0.24
251	0.24
252	0.22
253	0.23
254	0.24
255	0.22
256	0.23
257	0.21
258	0.21
259	0.22
260	0.23
261	0.23
262	0.21
263	0.21
264	0.15
265	0.12
266	0.09
267	0.08
268	0.07
269	0.07
270	0.07
271	0.07
272	0.06
273	0.07
274	0.08
275	0.08
276	0.08
277	0.12
278	0.11
279	0.11
280	0.12
281	0.11
282	0.13
283	0.14
284	0.14
285	0.1
286	0.11
287	0.14
288	0.15
289	0.15
290	0.14
291	0.13
292	0.12
293	0.12
294	0.11
295	0.08
296	0.1
297	0.09
298	0.09
299	0.09
300	0.09
301	0.08
302	0.09
303	0.1
304	0.07
305	0.06
306	0.05
307	0.08
308	0.08
309	0.09
310	0.09
311	0.09
312	0.09
313	0.09
314	0.09
315	0.07
316	0.06
317	0.06
318	0.04
319	0.07
320	0.08
321	0.08
322	0.09
323	0.08
324	0.09
325	0.13
326	0.18
327	0.22
328	0.24
329	0.26
330	0.26
331	0.27
332	0.26
333	0.23
334	0.19
335	0.13
336	0.18
337	0.22
338	0.21
339	0.22
340	0.27
341	0.28
342	0.28
343	0.35
344	0.34
345	0.35
346	0.41
347	0.48
348	0.52
349	0.62
350	0.67
351	0.68
352	0.72
353	0.69
354	0.68
355	0.68
356	0.66
357	0.67
358	0.66
359	0.61
360	0.59
361	0.59
362	0.61
363	0.6
364	0.55
365	0.51
366	0.47
367	0.45
368	0.4
369	0.39
370	0.34
371	0.32
372	0.32
373	0.27
374	0.26
375	0.26
376	0.24
377	0.25
378	0.24
379	0.21
380	0.21
381	0.19
382	0.17
383	0.17
384	0.18
385	0.14
386	0.11
387	0.09
388	0.07
389	0.06
390	0.06
391	0.06
392	0.06
393	0.08
394	0.07
395	0.08
396	0.11
397	0.15
398	0.2
399	0.3
400	0.36
401	0.43
402	0.47
403	0.56
404	0.55
405	0.6
406	0.59
407	0.6
408	0.61
409	0.55
410	0.51
411	0.42
412	0.39
413	0.33
414	0.28
415	0.19
416	0.12
417	0.1
418	0.1
419	0.1
420	0.1
421	0.08
422	0.08
423	0.08
424	0.08
425	0.07
426	0.07
427	0.07
428	0.07
429	0.07
430	0.07
431	0.06
432	0.05
433	0.06
434	0.06
435	0.05
436	0.06
437	0.06
438	0.08
439	0.11
440	0.11
441	0.11
442	0.11
443	0.11
444	0.11
445	0.11
446	0.09
447	0.07
448	0.06
449	0.05
450	0.05
451	0.05
452	0.04
453	0.04
454	0.04
455	0.04
456	0.04
457	0.04
458	0.04
459	0.04
460	0.04
461	0.04
462	0.04
463	0.04
464	0.04
465	0.05
466	0.05
467	0.06
468	0.07
469	0.08
470	0.1
471	0.13
472	0.14
473	0.17
474	0.17
475	0.18
476	0.21
477	0.23
478	0.24
479	0.24
480	0.26
481	0.26
482	0.26
483	0.26
484	0.23
485	0.23
486	0.2
487	0.17
488	0.14
489	0.12
490	0.12
491	0.1
492	0.11
493	0.08
494	0.08
495	0.1
496	0.11
497	0.12
498	0.14
499	0.13
500	0.12
501	0.13
502	0.13
503	0.14
504	0.14
505	0.13
506	0.11
507	0.12
508	0.12
509	0.11
510	0.11
511	0.07
512	0.07
513	0.1
514	0.1
515	0.1
516	0.1
517	0.11
518	0.13
519	0.13
520	0.14
521	0.17
522	0.2
523	0.2
524	0.23
525	0.25
526	0.24
527	0.23
528	0.23
529	0.18
530	0.17
531	0.16
532	0.12
533	0.11
534	0.1
535	0.1
536	0.1
537	0.09
538	0.07
539	0.07
540	0.07
541	0.06
542	0.07
543	0.06
544	0.06
545	0.05
546	0.08
547	0.08
548	0.08
549	0.08
550	0.08
551	0.08
552	0.09
553	0.09
554	0.06
555	0.06
556	0.06
557	0.06
558	0.09
559	0.12
560	0.12
561	0.13
562	0.14
563	0.14
564	0.15
565	0.15
566	0.11
567	0.08
568	0.08
569	0.08
570	0.07
571	0.07
572	0.06
573	0.07
574	0.07
575	0.09
576	0.09
577	0.09
578	0.14
579	0.18
580	0.21
581	0.22
582	0.23
583	0.22
584	0.23
585	0.23
586	0.19
587	0.16
588	0.14
589	0.13
590	0.12
591	0.11
592	0.1
593	0.09
594	0.08
595	0.07
596	0.07
597	0.07
598	0.08
599	0.08
600	0.09
601	0.1
602	0.12
603	0.13
604	0.16
605	0.18
606	0.16
607	0.17
608	0.15
609	0.16
610	0.19
611	0.18
612	0.15
613	0.14
614	0.16
615	0.22
616	0.24
617	0.23
618	0.2
619	0.2
620	0.19
621	0.19
622	0.17
623	0.12
624	0.1
625	0.09
626	0.09
627	0.08
628	0.08
629	0.07
630	0.07
631	0.06
632	0.06
633	0.06
634	0.05
635	0.05
636	0.04
637	0.04
638	0.05
639	0.05
640	0.09
641	0.09
642	0.1
643	0.11
644	0.11
645	0.11
646	0.11
647	0.11
648	0.08
649	0.08
650	0.08
651	0.08
652	0.08
653	0.09
654	0.09
655	0.09
656	0.09
657	0.07
658	0.08
659	0.07
660	0.07
661	0.07
662	0.07
663	0.06
664	0.07
665	0.08
666	0.08
667	0.08
668	0.08
669	0.08
670	0.1
671	0.1
672	0.09
673	0.08
674	0.08
675	0.11
676	0.11
677	0.11
678	0.09
679	0.1
680	0.12
681	0.14
682	0.16
683	0.14
684	0.14
685	0.15
686	0.2
687	0.2
688	0.19
689	0.18
690	0.19
691	0.19
692	0.19
693	0.17
694	0.14
695	0.14
696	0.13
697	0.12
698	0.1
699	0.09
700	0.09
701	0.09
702	0.07
703	0.06
704	0.06
705	0.05
706	0.05
707	0.05
708	0.05
709	0.06
710	0.05
711	0.05
712	0.05
713	0.06
714	0.06
715	0.07
716	0.08
717	0.07
718	0.08
719	0.1
720	0.1
721	0.09
722	0.09
723	0.08
724	0.08
725	0.08
726	0.07
727	0.06
728	0.06
729	0.06
730	0.05
731	0.06
732	0.05
733	0.05
734	0.06
735	0.06
736	0.06
737	0.07
738	0.08
739	0.07
740	0.08
741	0.11
742	0.1
743	0.1
744	0.15
745	0.17
746	0.18
747	0.18
748	0.18
749	0.15
750	0.18
751	0.2
752	0.21
753	0.2
754	0.19
755	0.2
756	0.2
757	0.19
758	0.19
759	0.17
760	0.12
761	0.1
762	0.1
763	0.09
764	0.11
765	0.1
766	0.12
767	0.18
768	0.27
769	0.3
770	0.34
771	0.4
772	0.39
773	0.45
774	0.49
775	0.52
776	0.47
777	0.52
778	0.51
779	0.46
780	0.47
781	0.42
782	0.34
783	0.26
784	0.22
785	0.15
786	0.12
787	0.11
788	0.09
789	0.09
790	0.09
791	0.07
792	0.06
793	0.05
794	0.05
795	0.05
796	0.05
797	0.05
798	0.05
799	0.05
800	0.07
801	0.07
802	0.08
803	0.08
804	0.08
805	0.09
806	0.1
807	0.11
808	0.09
809	0.1
810	0.1
811	0.1
812	0.1
813	0.09
814	0.08
815	0.07
816	0.06
817	0.07
818	0.06
819	0.07
820	0.07
821	0.08
822	0.08
823	0.09
824	0.1
825	0.11
826	0.16
827	0.17
828	0.17
829	0.18
830	0.2
831	0.2
832	0.23
833	0.24
834	0.2
835	0.19
836	0.2
837	0.19
838	0.16
839	0.16
840	0.12
841	0.1
842	0.08
843	0.06
844	0.06
845	0.05
846	0.05
847	0.07
848	0.07
849	0.06
850	0.06
851	0.08
852	0.1
853	0.11
854	0.18
855	0.18
856	0.19
857	0.2
858	0.2
859	0.18
860	0.17
861	0.16
862	0.1
863	0.09
864	0.08
865	0.08
866	0.07
867	0.07
868	0.06
869	0.05
870	0.05
871	0.05
872	0.03
873	0.03
874	0.03
875	0.04
876	0.05
877	0.05
878	0.06
879	0.07
880	0.08
881	0.08
882	0.08
883	0.08
884	0.08
885	0.08
886	0.08
887	0.07
888	0.07
889	0.07
890	0.07
891	0.07
892	0.07
893	0.08
894	0.1
895	0.1
896	0.1
897	0.13
898	0.17
899	0.18
900	0.21
901	0.26
902	0.26
903	0.28
904	0.28
905	0.25
906	0.23
907	0.22
908	0.18
909	0.15
910	0.14
911	0.11
912	0.09
913	0.08
914	0.08
915	0.07
916	0.07
917	0.07
918	0.07
919	0.09
920	0.13
921	0.16
922	0.19
923	0.2
924	0.2
925	0.19
926	0.19
927	0.18
928	0.15
929	0.14
930	0.12
931	0.11
932	0.11
933	0.1
934	0.09
935	0.08
936	0.07
937	0.06
938	0.05
939	0.04
940	0.05
941	0.05
942	0.06
943	0.08
944	0.09
945	0.16
946	0.19
947	0.28
948	0.36
949	0.38
950	0.42
951	0.48
952	0.56
953	0.56
954	0.57
955	0.53
956	0.47
957	0.44
958	0.43
959	0.39
960	0.31
961	0.29
962	0.27
963	0.22
964	0.26
965	0.27
966	0.3
967	0.3
968	0.34
969	0.36
970	0.44
971	0.54
972	0.5
973	0.5
974	0.51
975	0.5
976	0.44
977	0.41
978	0.33
979	0.21
980	0.23
981	0.22
982	0.17
983	0.15
984	0.15
985	0.13
986	0.15
987	0.16
988	0.15
989	0.18
990	0.18
991	0.19
992	0.19
993	0.18
994	0.17
995	0.19
996	0.19
997	0.22
998	0.23
999	0.23
1000	0.24
1001	0.24
1002	0.23
1003	0.22
1004	0.19
1005	0.15
1006	0.17
1007	0.17
1008	0.16
1009	0.16
1010	0.16
1011	0.25
1012	0.25
1013	0.24
1014	0.19
1015	0.18
1016	0.17
1017	0.22
1018	0.21
1019	0.15
1020	0.17
1021	0.18
1022	0.18
1023	0.18
1024	0.18
1025	0.16
1026	0.2
1027	0.19
1028	0.19
1029	0.18
1030	0.17
1031	0.17
1032	0.21
1033	0.21
1034	0.16
1035	0.15
1036	0.18
1037	0.18
1038	0.2
1039	0.23
1040	0.22
1041	0.22
1042	0.24
1043	0.26
1044	0.22
1045	0.23
1046	0.23
1047	0.2
1048	0.17
1049	0.14
1050	0.12
1051	0.1
1052	0.09
1053	0.08
1054	0.09
1055	0.08
1056	0.09
1057	0.09
1058	0.1
1059	0.11
1060	0.15
1061	0.16
1062	0.15
1063	0.17
1064	0.16
1065	0.2
1066	0.2
1067	0.22
1068	0.24
1069	0.24
1070	0.25
1071	0.28
1072	0.33
1073	0.36
1074	0.37
1075	0.37
1076	0.34
1077	0.34
1078	0.35
1079	0.32
1080	0.3
1081	0.26
1082	0.24
1083	0.23
1084	0.21
1085	0.22
1086	0.21
1087	0.19
1088	0.17
1089	0.16
1090	0.18
1091	0.2
1092	0.22
1093	0.26
1094	0.28
1095	0.31
1096	0.38
1097	0.39
1098	0.41
1099	0.39
1100	0.39
1101	0.37
1102	0.38
1103	0.36
1104	0.28
1105	0.26
1106	0.22
1107	0.26
1108	0.25
1109	0.23
1110	0.19
1111	0.21
1112	0.24
1113	0.31
1114	0.33
1115	0.29
1116	0.31
1117	0.35
1118	0.39
1119	0.39
1120	0.34
1121	0.31
1122	0.31
1123	0.3
1124	0.27
1125	0.22
1126	0.17
1127	0.17
1128	0.17
1129	0.18
1130	0.18
1131	0.19
1132	0.18
1133	0.2
1134	0.2
1135	0.19
1136	0.2
1137	0.17
1138	0.16
1139	0.16
1140	0.16
1141	0.19
1142	0.19
1143	0.18
1144	0.18
1145	0.23
1146	0.25
1147	0.23
1148	0.25
1149	0.21
1150	0.26
1151	0.28
1152	0.28
1153	0.28
1154	0.34
1155	0.4
1156	0.42
1157	0.5
1158	0.48
1159	0.52
1160	0.61
1161	0.64
1162	0.66
1163	0.66
1164	0.7
1165	0.68
1166	0.72
1167	0.76
1168	0.76
1169	0.76
1170	0.77
1171	0.81
1172	0.84
1173	0.85
1174	0.85
1175	0.84
1176	0.82
1177	0.79
1178	0.76
1179	0.74
1180	0.72
1181	0.69
1182	0.67
1183	0.61
1184	0.57
1185	0.55
1186	0.56
1187	0.5
1188	0.43
1189	0.38
1190	0.37
1191	0.36
1192	0.35
1193	0.33
1194	0.28
1195	0.28
1196	0.28
1197	0.3
1198	0.26
1199	0.25
1200	0.25
1201	0.26
1202	0.25
1203	0.23
1204	0.25
1205	0.26
1206	0.27
1207	0.28
1208	0.32
1209	0.3
1210	0.3
1211	0.33
1212	0.35
1213	0.34
1214	0.35
1215	0.42
1216	0.46
1217	0.49

A0A5C3E1N3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer