FuNGI

A0A5C3DQ45

Protein Details

Accession

A0A5C3DQ45

Localization Confidence

Low

Confidence Score

7.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
972-991	IYDLGKKKLLRKCENKSFPT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto_nucl 14.333, cyto 13.5, nucl 12, mito_nucl 6.999

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR004871 Cleavage/polyA-sp_fac_asu_C IPR018846 Cleavage/polyA-sp_fac_asu_N IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003676 F:nucleic acid binding
Pfam	View protein in Pfam PF03178 CPSF_A PF10433 MMS1_N

Amino Acid Sequences

MDGMHLYNLTLQPSGSVNATVVGQFSGTRQQEIIVAKGSRLELLRPDTQTGKVETVLSHDAFGVVRSLAAFRLTGGSKDYLIVGSDSGRIVILEYQPGTNSFDKVHQETFGRSGSRRIVPGQYLATDPKGRATMIGAMEKAKLVYILNRDAQANLTISSPLEAHRPNGIIHHIVGVDVGFENPLFACLEVDYSESDHDPSGRAFEEAEKTLTYYELDLGLNHVVRKWSEPVDPRSNLLIQVPGGYNQNQEKWDGPSGVLVCSEDYITYKHQDQPEHCVPIPRRLNPIEKSSERRGMLIVASVLHKMKNAFFFLVQTEDGDLFKITMEHQDDEIRSLKIKYFDTVPVASGLAILRSGFLFVASEYGPQLLYSFQKLGDDDDLPEYISTDYDENGAGRRRPQLPTFTPRPLDNLVQVDEVPSLDPILDAKPLNPLASDSPQIFAACGRGAKSSFRMLRHGLEAQEAVSSDLPGVPSAVWTTKITRQDEHDSYIILSFVNGTLVLSIGETIEEVSDSGFLTSSPTLAVQQLSEDALLQVHPHGIRHILVDKQVNEWATPSLPNGRQTTIVATCTNERQVVVALSSNELVYFELDMDGQLNEHQERKAMGAAVLTTSMADCPEGRQRTPYLAVGCDDSTVRIISLEPDSTLASISIQALTAPASSICVAEMQDATVDRNHATTFVNIGLQNGVLLRTVLDAVTGQLTDTRTRFLGSKAVRLIRTRVHGQSAVMALSTRTWLSFTYQDRLQFVPLIFDALDHAWSFSAELCPEGLIGIVGSTLRIFTIPSLASKLKQDNVALSYTPRKIASHPDEQGLFYVVEAEHRTLSPGAQRRRTEALEKELKPHQRGVLDLNPAEFGLIRAAAGNWASCVRVVDGVQAQTTHKIELDDNEAAFSLAIVPFASADKESLLVVGSAVDVILAPRSFKKAYLTTYRLTDGGRSLELLHKTEVDDIPLVLRPFQGRLLAGIGKALRIYDLGKKKLLRKCENKSFPTAIVSLDAQGSRIVVGDMQESIIFACYKPLENRLVTFADDVMPKFVTRCTMLDYDTVAAGDKFGNLYVLRIDGDTSRSVDEDPTGMTIVHEKPVLMGSAHKATLLAHYFVGDIITSLNRTVMVPGGREVLLYTGISGTVGALIPFVSKEDVDTLSALESHLRQENNSLVGRDHLAYRSSYAPVKSVIDGDLCESFGMLPPAKQNAIAQELDRKPNEINKKLAQLREGATGF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.18
2	0.15
3	0.14
4	0.12
5	0.13
6	0.14
7	0.12
8	0.11
9	0.09
10	0.09
11	0.08
12	0.1
13	0.19
14	0.19
15	0.21
16	0.2
17	0.21
18	0.25
19	0.27
20	0.28
21	0.26
22	0.25
23	0.24
24	0.27
25	0.27
26	0.25
27	0.24
28	0.24
29	0.23
30	0.29
31	0.35
32	0.34
33	0.37
34	0.37
35	0.39
36	0.4
37	0.38
38	0.34
39	0.29
40	0.28
41	0.25
42	0.27
43	0.29
44	0.25
45	0.22
46	0.2
47	0.19
48	0.18
49	0.18
50	0.14
51	0.09
52	0.08
53	0.09
54	0.09
55	0.09
56	0.1
57	0.1
58	0.09
59	0.14
60	0.15
61	0.15
62	0.18
63	0.19
64	0.18
65	0.19
66	0.19
67	0.14
68	0.14
69	0.14
70	0.11
71	0.11
72	0.12
73	0.12
74	0.11
75	0.1
76	0.09
77	0.1
78	0.13
79	0.13
80	0.15
81	0.16
82	0.17
83	0.18
84	0.19
85	0.23
86	0.21
87	0.21
88	0.19
89	0.24
90	0.29
91	0.32
92	0.32
93	0.31
94	0.32
95	0.33
96	0.35
97	0.34
98	0.32
99	0.28
100	0.32
101	0.36
102	0.38
103	0.38
104	0.38
105	0.39
106	0.38
107	0.41
108	0.38
109	0.33
110	0.31
111	0.31
112	0.32
113	0.3
114	0.27
115	0.27
116	0.26
117	0.24
118	0.22
119	0.22
120	0.23
121	0.23
122	0.26
123	0.23
124	0.23
125	0.24
126	0.23
127	0.21
128	0.15
129	0.12
130	0.1
131	0.14
132	0.19
133	0.23
134	0.26
135	0.28
136	0.28
137	0.28
138	0.28
139	0.25
140	0.21
141	0.17
142	0.15
143	0.13
144	0.13
145	0.13
146	0.12
147	0.11
148	0.15
149	0.16
150	0.17
151	0.2
152	0.22
153	0.21
154	0.24
155	0.26
156	0.22
157	0.21
158	0.22
159	0.18
160	0.16
161	0.16
162	0.12
163	0.1
164	0.08
165	0.08
166	0.06
167	0.05
168	0.06
169	0.06
170	0.07
171	0.06
172	0.06
173	0.07
174	0.07
175	0.08
176	0.08
177	0.09
178	0.09
179	0.1
180	0.11
181	0.11
182	0.12
183	0.12
184	0.12
185	0.12
186	0.12
187	0.14
188	0.13
189	0.12
190	0.12
191	0.16
192	0.19
193	0.2
194	0.21
195	0.18
196	0.18
197	0.18
198	0.18
199	0.15
200	0.11
201	0.1
202	0.1
203	0.1
204	0.1
205	0.11
206	0.13
207	0.14
208	0.14
209	0.14
210	0.14
211	0.15
212	0.18
213	0.2
214	0.21
215	0.27
216	0.34
217	0.41
218	0.47
219	0.48
220	0.47
221	0.46
222	0.44
223	0.38
224	0.32
225	0.26
226	0.17
227	0.19
228	0.17
229	0.15
230	0.17
231	0.17
232	0.2
233	0.21
234	0.25
235	0.22
236	0.24
237	0.24
238	0.26
239	0.28
240	0.25
241	0.22
242	0.23
243	0.23
244	0.21
245	0.2
246	0.16
247	0.12
248	0.12
249	0.12
250	0.08
251	0.08
252	0.1
253	0.12
254	0.15
255	0.18
256	0.23
257	0.27
258	0.33
259	0.34
260	0.41
261	0.45
262	0.49
263	0.46
264	0.49
265	0.47
266	0.51
267	0.56
268	0.5
269	0.5
270	0.48
271	0.55
272	0.51
273	0.56
274	0.54
275	0.52
276	0.55
277	0.55
278	0.58
279	0.5
280	0.47
281	0.41
282	0.35
283	0.3
284	0.24
285	0.18
286	0.12
287	0.12
288	0.13
289	0.13
290	0.12
291	0.13
292	0.13
293	0.15
294	0.18
295	0.19
296	0.19
297	0.18
298	0.19
299	0.19
300	0.2
301	0.17
302	0.14
303	0.13
304	0.12
305	0.12
306	0.11
307	0.1
308	0.07
309	0.07
310	0.07
311	0.07
312	0.12
313	0.15
314	0.15
315	0.16
316	0.2
317	0.2
318	0.22
319	0.24
320	0.19
321	0.18
322	0.18
323	0.2
324	0.21
325	0.21
326	0.2
327	0.21
328	0.23
329	0.25
330	0.25
331	0.22
332	0.19
333	0.18
334	0.16
335	0.14
336	0.11
337	0.07
338	0.07
339	0.06
340	0.05
341	0.05
342	0.06
343	0.05
344	0.05
345	0.05
346	0.05
347	0.07
348	0.06
349	0.07
350	0.07
351	0.07
352	0.07
353	0.07
354	0.07
355	0.07
356	0.08
357	0.1
358	0.1
359	0.1
360	0.12
361	0.12
362	0.14
363	0.15
364	0.14
365	0.13
366	0.14
367	0.14
368	0.13
369	0.12
370	0.11
371	0.09
372	0.08
373	0.08
374	0.07
375	0.07
376	0.07
377	0.08
378	0.07
379	0.1
380	0.14
381	0.14
382	0.17
383	0.23
384	0.26
385	0.29
386	0.32
387	0.37
388	0.4
389	0.47
390	0.51
391	0.5
392	0.49
393	0.45
394	0.46
395	0.41
396	0.36
397	0.31
398	0.27
399	0.23
400	0.22
401	0.21
402	0.18
403	0.15
404	0.13
405	0.1
406	0.07
407	0.06
408	0.05
409	0.05
410	0.05
411	0.06
412	0.08
413	0.08
414	0.08
415	0.13
416	0.13
417	0.14
418	0.13
419	0.13
420	0.14
421	0.16
422	0.18
423	0.14
424	0.14
425	0.15
426	0.15
427	0.13
428	0.1
429	0.09
430	0.09
431	0.09
432	0.09
433	0.1
434	0.11
435	0.13
436	0.15
437	0.21
438	0.25
439	0.26
440	0.29
441	0.3
442	0.31
443	0.32
444	0.32
445	0.25
446	0.22
447	0.2
448	0.16
449	0.14
450	0.12
451	0.1
452	0.08
453	0.07
454	0.06
455	0.06
456	0.06
457	0.06
458	0.06
459	0.05
460	0.05
461	0.06
462	0.07
463	0.08
464	0.09
465	0.12
466	0.17
467	0.24
468	0.26
469	0.26
470	0.31
471	0.36
472	0.37
473	0.37
474	0.32
475	0.26
476	0.24
477	0.23
478	0.18
479	0.1
480	0.08
481	0.05
482	0.05
483	0.04
484	0.04
485	0.03
486	0.03
487	0.04
488	0.04
489	0.03
490	0.03
491	0.03
492	0.03
493	0.03
494	0.03
495	0.03
496	0.03
497	0.03
498	0.03
499	0.03
500	0.04
501	0.04
502	0.04
503	0.04
504	0.06
505	0.06
506	0.06
507	0.05
508	0.06
509	0.06
510	0.07
511	0.08
512	0.06
513	0.06
514	0.06
515	0.06
516	0.06
517	0.05
518	0.05
519	0.05
520	0.05
521	0.04
522	0.04
523	0.06
524	0.06
525	0.06
526	0.07
527	0.08
528	0.08
529	0.1
530	0.12
531	0.11
532	0.14
533	0.17
534	0.17
535	0.17
536	0.19
537	0.18
538	0.15
539	0.15
540	0.13
541	0.1
542	0.1
543	0.1
544	0.13
545	0.15
546	0.19
547	0.2
548	0.2
549	0.2
550	0.2
551	0.23
552	0.18
553	0.18
554	0.15
555	0.14
556	0.14
557	0.15
558	0.16
559	0.12
560	0.11
561	0.1
562	0.1
563	0.09
564	0.08
565	0.09
566	0.08
567	0.08
568	0.08
569	0.07
570	0.07
571	0.06
572	0.06
573	0.05
574	0.05
575	0.04
576	0.04
577	0.04
578	0.04
579	0.04
580	0.04
581	0.04
582	0.04
583	0.06
584	0.06
585	0.08
586	0.08
587	0.08
588	0.09
589	0.1
590	0.1
591	0.09
592	0.09
593	0.08
594	0.08
595	0.07
596	0.07
597	0.06
598	0.04
599	0.04
600	0.04
601	0.03
602	0.04
603	0.03
604	0.05
605	0.12
606	0.14
607	0.15
608	0.17
609	0.18
610	0.2
611	0.22
612	0.23
613	0.17
614	0.16
615	0.16
616	0.16
617	0.15
618	0.13
619	0.11
620	0.08
621	0.08
622	0.07
623	0.06
624	0.05
625	0.05
626	0.06
627	0.07
628	0.07
629	0.07
630	0.07
631	0.08
632	0.07
633	0.07
634	0.06
635	0.05
636	0.05
637	0.05
638	0.05
639	0.04
640	0.04
641	0.04
642	0.05
643	0.04
644	0.04
645	0.04
646	0.04
647	0.05
648	0.05
649	0.05
650	0.05
651	0.05
652	0.06
653	0.06
654	0.05
655	0.06
656	0.06
657	0.07
658	0.07
659	0.07
660	0.07
661	0.07
662	0.07
663	0.08
664	0.09
665	0.08
666	0.09
667	0.09
668	0.1
669	0.1
670	0.1
671	0.09
672	0.08
673	0.08
674	0.07
675	0.06
676	0.04
677	0.04
678	0.04
679	0.04
680	0.04
681	0.04
682	0.04
683	0.04
684	0.04
685	0.05
686	0.04
687	0.04
688	0.06
689	0.07
690	0.1
691	0.1
692	0.11
693	0.11
694	0.12
695	0.13
696	0.12
697	0.19
698	0.18
699	0.22
700	0.25
701	0.29
702	0.31
703	0.31
704	0.33
705	0.29
706	0.32
707	0.32
708	0.29
709	0.28
710	0.27
711	0.25
712	0.25
713	0.21
714	0.17
715	0.13
716	0.11
717	0.08
718	0.07
719	0.08
720	0.06
721	0.05
722	0.06
723	0.06
724	0.09
725	0.15
726	0.17
727	0.2
728	0.22
729	0.24
730	0.25
731	0.26
732	0.24
733	0.21
734	0.18
735	0.16
736	0.14
737	0.13
738	0.11
739	0.1
740	0.1
741	0.08
742	0.09
743	0.07
744	0.07
745	0.06
746	0.06
747	0.06
748	0.06
749	0.07
750	0.06
751	0.06
752	0.06
753	0.06
754	0.06
755	0.06
756	0.05
757	0.03
758	0.03
759	0.03
760	0.03
761	0.03
762	0.03
763	0.03
764	0.03
765	0.03
766	0.03
767	0.04
768	0.04
769	0.07
770	0.07
771	0.08
772	0.13
773	0.13
774	0.15
775	0.18
776	0.21
777	0.21
778	0.23
779	0.23
780	0.21
781	0.22
782	0.22
783	0.19
784	0.18
785	0.21
786	0.2
787	0.21
788	0.2
789	0.19
790	0.19
791	0.28
792	0.32
793	0.35
794	0.35
795	0.36
796	0.36
797	0.35
798	0.34
799	0.26
800	0.2
801	0.11
802	0.11
803	0.08
804	0.09
805	0.1
806	0.11
807	0.1
808	0.1
809	0.12
810	0.1
811	0.11
812	0.16
813	0.24
814	0.3
815	0.37
816	0.39
817	0.42
818	0.46
819	0.48
820	0.48
821	0.44
822	0.46
823	0.47
824	0.47
825	0.47
826	0.48
827	0.51
828	0.47
829	0.46
830	0.41
831	0.33
832	0.33
833	0.35
834	0.34
835	0.32
836	0.3
837	0.28
838	0.24
839	0.22
840	0.21
841	0.15
842	0.1
843	0.06
844	0.06
845	0.05
846	0.05
847	0.05
848	0.07
849	0.07
850	0.06
851	0.06
852	0.07
853	0.07
854	0.07
855	0.08
856	0.08
857	0.09
858	0.09
859	0.12
860	0.14
861	0.14
862	0.15
863	0.15
864	0.15
865	0.17
866	0.18
867	0.15
868	0.13
869	0.14
870	0.14
871	0.16
872	0.21
873	0.18
874	0.17
875	0.17
876	0.16
877	0.15
878	0.14
879	0.11
880	0.07
881	0.05
882	0.05
883	0.05
884	0.05
885	0.05
886	0.06
887	0.07
888	0.06
889	0.06
890	0.06
891	0.07
892	0.07
893	0.07
894	0.07
895	0.06
896	0.05
897	0.05
898	0.05
899	0.04
900	0.04
901	0.03
902	0.03
903	0.03
904	0.06
905	0.06
906	0.07
907	0.08
908	0.13
909	0.14
910	0.15
911	0.21
912	0.23
913	0.29
914	0.37
915	0.4
916	0.39
917	0.41
918	0.41
919	0.37
920	0.33
921	0.28
922	0.21
923	0.2
924	0.17
925	0.15
926	0.15
927	0.19
928	0.21
929	0.21
930	0.2
931	0.18
932	0.19
933	0.23
934	0.21
935	0.18
936	0.16
937	0.14
938	0.14
939	0.17
940	0.16
941	0.13
942	0.14
943	0.13
944	0.14
945	0.16
946	0.16
947	0.13
948	0.14
949	0.17
950	0.17
951	0.16
952	0.17
953	0.15
954	0.14
955	0.14
956	0.12
957	0.09
958	0.09
959	0.12
960	0.17
961	0.25
962	0.28
963	0.34
964	0.39
965	0.47
966	0.51
967	0.59
968	0.61
969	0.63
970	0.7
971	0.76
972	0.81
973	0.76
974	0.78
975	0.71
976	0.62
977	0.55
978	0.45
979	0.35
980	0.28
981	0.24
982	0.18
983	0.16
984	0.15
985	0.12
986	0.11
987	0.11
988	0.08
989	0.08
990	0.07
991	0.06
992	0.07
993	0.07
994	0.07
995	0.08
996	0.08
997	0.07
998	0.07
999	0.08
1000	0.08
1001	0.07
1002	0.11
1003	0.11
1004	0.15
1005	0.18
1006	0.23
1007	0.27
1008	0.28
1009	0.29
1010	0.3
1011	0.3
1012	0.27
1013	0.26
1014	0.21
1015	0.19
1016	0.19
1017	0.18
1018	0.16
1019	0.16
1020	0.15
1021	0.15
1022	0.15
1023	0.15
1024	0.16
1025	0.17
1026	0.2
1027	0.21
1028	0.22
1029	0.23
1030	0.23
1031	0.21
1032	0.19
1033	0.18
1034	0.13
1035	0.11
1036	0.1
1037	0.09
1038	0.08
1039	0.07
1040	0.07
1041	0.1
1042	0.09
1043	0.1
1044	0.1
1045	0.11
1046	0.11
1047	0.1
1048	0.12
1049	0.11
1050	0.13
1051	0.14
1052	0.15
1053	0.15
1054	0.15
1055	0.16
1056	0.16
1057	0.15
1058	0.13
1059	0.12
1060	0.12
1061	0.12
1062	0.11
1063	0.11
1064	0.15
1065	0.15
1066	0.17
1067	0.16
1068	0.15
1069	0.15
1070	0.17
1071	0.17
1072	0.13
1073	0.14
1074	0.16
1075	0.2
1076	0.2
1077	0.19
1078	0.18
1079	0.17
1080	0.23
1081	0.24
1082	0.21
1083	0.17
1084	0.17
1085	0.17
1086	0.17
1087	0.17
1088	0.1
1089	0.07
1090	0.07
1091	0.08
1092	0.09
1093	0.09
1094	0.09
1095	0.09
1096	0.1
1097	0.11
1098	0.14
1099	0.15
1100	0.15
1101	0.16
1102	0.19
1103	0.18
1104	0.18
1105	0.17
1106	0.14
1107	0.13
1108	0.12
1109	0.11
1110	0.08
1111	0.08
1112	0.08
1113	0.08
1114	0.06
1115	0.06
1116	0.06
1117	0.06
1118	0.06
1119	0.06
1120	0.06
1121	0.07
1122	0.08
1123	0.08
1124	0.08
1125	0.09
1126	0.12
1127	0.14
1128	0.14
1129	0.14
1130	0.14
1131	0.13
1132	0.13
1133	0.12
1134	0.12
1135	0.11
1136	0.14
1137	0.19
1138	0.2
1139	0.19
1140	0.23
1141	0.27
1142	0.3
1143	0.32
1144	0.29
1145	0.24
1146	0.26
1147	0.28
1148	0.25
1149	0.24
1150	0.22
1151	0.21
1152	0.21
1153	0.23
1154	0.23
1155	0.24
1156	0.27
1157	0.26
1158	0.25
1159	0.26
1160	0.28
1161	0.26
1162	0.25
1163	0.23
1164	0.2
1165	0.19
1166	0.2
1167	0.18
1168	0.16
1169	0.14
1170	0.13
1171	0.11
1172	0.13
1173	0.17
1174	0.15
1175	0.16
1176	0.2
1177	0.25
1178	0.25
1179	0.26
1180	0.26
1181	0.26
1182	0.3
1183	0.3
1184	0.28
1185	0.34
1186	0.38
1187	0.45
1188	0.43
1189	0.4
1190	0.39
1191	0.46
1192	0.55
1193	0.51
1194	0.54
1195	0.52
1196	0.61
1197	0.66
1198	0.66
1199	0.6
1200	0.55
1201	0.51

A0A5C3DQ45

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer