Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3EFM6

Protein Details
Accession A0A5C3EFM6    Localization Confidence Low Confidence Score 9.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
860-883QASDLSMRSKEKKRLKNVFGFKKSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
870-875EKKRLK
Subcellular Location(s) mito 16.5, cyto_mito 10.5, nucl 6, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR043154  Sec-1-like_dom1  
IPR043127  Sec-1-like_dom3a  
IPR001619  Sec1-like  
IPR027482  Sec1-like_dom2  
IPR036045  Sec1-like_sf  
Gene Ontology GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF00995  Sec1  
Amino Acid Sequences MPPKSLVTTLRDRYLHTIRSVQPPSRWKVLVVDSFTKELLNSVLKMYDILQENVAQVDNIELSRASQPTLEACYLLTPTSHNVDRIIRDLAPEAGRQPTYAAGHIFFVDALSDALVHKLTSSPAEPKLRQLIELYTNFWPVEAQAFSLKSPQSFYNLFQPVGGLYGPDPMEAMRTIEEELQFSTQAILNVCVTLNEFPLIRYYNPSHPPLGPLQPPKDALKSQTAAANMYQGSARMARLRGNNNDGGIPGQGSQGPAVGEHFTKKLAFRVQAAIDEYVRDNEPKVESTRPRSVLFITDRSMDTVAPFLHEFTYQAMCNDLLPIEDGTRYHYTFYTSEGERQEKDAILSDEDNVWTGIRHLHIAEAIDKLTKDFKQHAGEQGAFADPNSSLNDMRDMLASLPHMQEMKEKLSLHLTMAQDCMNRFEKSKLPAQAMVEQNCATRLTPEGAKPKTLVEEMVPLLDDRNVSNTDKVRIIALYIMYCDGVPDEDRKRLFQHARLGRYEMEAVDNLVHLGTQVVKDPSSGGWDMFFKKGKRKQQPVGENEFELSRYQPLVKLMVEDHFGGKLEQSTFPYVRDAPPETAVSGLSLPVQTSALARVGLGSASTATSSTSGAASAAGRTQPSSLRSAKPTWHQKGRVAGGGVGGSGNNGGVERVDNRQRVLLFVAGGMTYSEMRSAYQISERLGKDVYVGSSHVFTPEGFVDVLKHFGKASSRDAAATGTGSGGQHQHGGEQQHHHHQHGGGVQSGNRLPVGASKLSKPVNDRSAIRNTSLQHGALPPGSNGNHHHSTGYAATSSPISPVDQASYDRRFQTSHPPQHQQQQHQQMHAPQAHKGAAIPQHLTADPTNGGMGGRASPSPSQASDLSMRSKEKKRLKNVFGFKKS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.52
3 0.46
4 0.5
5 0.48
6 0.57
7 0.61
8 0.58
9 0.58
10 0.62
11 0.64
12 0.64
13 0.59
14 0.51
15 0.5
16 0.53
17 0.52
18 0.5
19 0.5
20 0.46
21 0.46
22 0.45
23 0.39
24 0.3
25 0.24
26 0.22
27 0.19
28 0.17
29 0.16
30 0.17
31 0.17
32 0.18
33 0.18
34 0.2
35 0.2
36 0.21
37 0.2
38 0.21
39 0.21
40 0.22
41 0.21
42 0.14
43 0.1
44 0.1
45 0.1
46 0.09
47 0.09
48 0.08
49 0.1
50 0.15
51 0.15
52 0.15
53 0.14
54 0.16
55 0.17
56 0.22
57 0.21
58 0.16
59 0.16
60 0.17
61 0.17
62 0.16
63 0.14
64 0.11
65 0.14
66 0.2
67 0.22
68 0.21
69 0.24
70 0.28
71 0.3
72 0.32
73 0.32
74 0.26
75 0.26
76 0.26
77 0.27
78 0.25
79 0.23
80 0.22
81 0.24
82 0.24
83 0.22
84 0.21
85 0.22
86 0.22
87 0.23
88 0.22
89 0.18
90 0.19
91 0.19
92 0.18
93 0.13
94 0.11
95 0.09
96 0.07
97 0.07
98 0.06
99 0.06
100 0.06
101 0.07
102 0.07
103 0.07
104 0.07
105 0.08
106 0.09
107 0.12
108 0.14
109 0.18
110 0.26
111 0.34
112 0.34
113 0.39
114 0.47
115 0.44
116 0.43
117 0.4
118 0.37
119 0.37
120 0.37
121 0.35
122 0.28
123 0.3
124 0.28
125 0.26
126 0.21
127 0.14
128 0.16
129 0.13
130 0.13
131 0.14
132 0.15
133 0.16
134 0.21
135 0.21
136 0.18
137 0.21
138 0.2
139 0.22
140 0.23
141 0.25
142 0.3
143 0.32
144 0.31
145 0.28
146 0.27
147 0.22
148 0.21
149 0.19
150 0.1
151 0.07
152 0.11
153 0.11
154 0.11
155 0.11
156 0.09
157 0.11
158 0.11
159 0.12
160 0.09
161 0.1
162 0.11
163 0.13
164 0.14
165 0.13
166 0.14
167 0.14
168 0.13
169 0.12
170 0.13
171 0.12
172 0.13
173 0.13
174 0.13
175 0.12
176 0.13
177 0.12
178 0.11
179 0.11
180 0.1
181 0.1
182 0.1
183 0.09
184 0.09
185 0.13
186 0.15
187 0.14
188 0.19
189 0.22
190 0.29
191 0.34
192 0.37
193 0.36
194 0.34
195 0.37
196 0.36
197 0.38
198 0.37
199 0.39
200 0.39
201 0.4
202 0.42
203 0.42
204 0.42
205 0.38
206 0.35
207 0.35
208 0.32
209 0.3
210 0.3
211 0.28
212 0.25
213 0.23
214 0.23
215 0.15
216 0.15
217 0.13
218 0.11
219 0.12
220 0.11
221 0.12
222 0.13
223 0.14
224 0.18
225 0.25
226 0.31
227 0.34
228 0.38
229 0.39
230 0.36
231 0.36
232 0.31
233 0.25
234 0.19
235 0.15
236 0.1
237 0.09
238 0.09
239 0.09
240 0.09
241 0.09
242 0.08
243 0.08
244 0.09
245 0.09
246 0.09
247 0.11
248 0.11
249 0.11
250 0.13
251 0.14
252 0.17
253 0.21
254 0.22
255 0.23
256 0.27
257 0.26
258 0.28
259 0.29
260 0.25
261 0.2
262 0.2
263 0.18
264 0.15
265 0.15
266 0.13
267 0.11
268 0.13
269 0.14
270 0.16
271 0.18
272 0.24
273 0.28
274 0.35
275 0.42
276 0.42
277 0.42
278 0.41
279 0.39
280 0.38
281 0.36
282 0.32
283 0.26
284 0.25
285 0.25
286 0.25
287 0.24
288 0.17
289 0.13
290 0.13
291 0.11
292 0.1
293 0.1
294 0.1
295 0.1
296 0.1
297 0.1
298 0.1
299 0.13
300 0.11
301 0.11
302 0.12
303 0.11
304 0.11
305 0.11
306 0.08
307 0.06
308 0.07
309 0.07
310 0.07
311 0.07
312 0.07
313 0.12
314 0.14
315 0.14
316 0.15
317 0.15
318 0.17
319 0.17
320 0.2
321 0.19
322 0.17
323 0.22
324 0.24
325 0.27
326 0.24
327 0.26
328 0.25
329 0.2
330 0.2
331 0.19
332 0.16
333 0.15
334 0.15
335 0.13
336 0.13
337 0.12
338 0.12
339 0.09
340 0.08
341 0.06
342 0.06
343 0.07
344 0.07
345 0.08
346 0.07
347 0.08
348 0.08
349 0.09
350 0.1
351 0.09
352 0.09
353 0.09
354 0.09
355 0.09
356 0.12
357 0.12
358 0.14
359 0.16
360 0.21
361 0.25
362 0.27
363 0.32
364 0.32
365 0.31
366 0.29
367 0.26
368 0.21
369 0.17
370 0.14
371 0.1
372 0.06
373 0.07
374 0.08
375 0.08
376 0.08
377 0.09
378 0.1
379 0.1
380 0.1
381 0.09
382 0.09
383 0.08
384 0.08
385 0.09
386 0.09
387 0.08
388 0.09
389 0.09
390 0.08
391 0.12
392 0.13
393 0.15
394 0.17
395 0.18
396 0.17
397 0.2
398 0.2
399 0.17
400 0.2
401 0.18
402 0.15
403 0.16
404 0.17
405 0.15
406 0.15
407 0.18
408 0.15
409 0.16
410 0.16
411 0.18
412 0.21
413 0.23
414 0.29
415 0.28
416 0.27
417 0.29
418 0.3
419 0.34
420 0.33
421 0.32
422 0.27
423 0.24
424 0.22
425 0.2
426 0.19
427 0.12
428 0.09
429 0.08
430 0.09
431 0.11
432 0.15
433 0.22
434 0.22
435 0.23
436 0.23
437 0.22
438 0.22
439 0.2
440 0.17
441 0.1
442 0.12
443 0.11
444 0.11
445 0.1
446 0.08
447 0.08
448 0.08
449 0.08
450 0.05
451 0.08
452 0.1
453 0.1
454 0.14
455 0.15
456 0.16
457 0.17
458 0.17
459 0.15
460 0.13
461 0.12
462 0.1
463 0.1
464 0.07
465 0.07
466 0.07
467 0.06
468 0.06
469 0.06
470 0.05
471 0.05
472 0.05
473 0.09
474 0.11
475 0.16
476 0.17
477 0.18
478 0.2
479 0.27
480 0.3
481 0.32
482 0.39
483 0.41
484 0.45
485 0.45
486 0.45
487 0.38
488 0.35
489 0.31
490 0.21
491 0.16
492 0.12
493 0.11
494 0.08
495 0.08
496 0.06
497 0.05
498 0.05
499 0.03
500 0.04
501 0.04
502 0.04
503 0.07
504 0.07
505 0.08
506 0.08
507 0.09
508 0.09
509 0.11
510 0.11
511 0.09
512 0.09
513 0.12
514 0.14
515 0.16
516 0.21
517 0.2
518 0.29
519 0.37
520 0.46
521 0.54
522 0.61
523 0.66
524 0.71
525 0.78
526 0.76
527 0.76
528 0.68
529 0.58
530 0.49
531 0.41
532 0.32
533 0.24
534 0.17
535 0.1
536 0.09
537 0.09
538 0.1
539 0.11
540 0.13
541 0.12
542 0.13
543 0.13
544 0.13
545 0.14
546 0.13
547 0.12
548 0.11
549 0.11
550 0.1
551 0.09
552 0.1
553 0.1
554 0.11
555 0.13
556 0.17
557 0.17
558 0.18
559 0.2
560 0.19
561 0.19
562 0.22
563 0.23
564 0.2
565 0.22
566 0.21
567 0.19
568 0.18
569 0.17
570 0.13
571 0.1
572 0.08
573 0.07
574 0.06
575 0.06
576 0.06
577 0.07
578 0.06
579 0.06
580 0.07
581 0.08
582 0.07
583 0.07
584 0.07
585 0.07
586 0.06
587 0.06
588 0.05
589 0.04
590 0.04
591 0.05
592 0.04
593 0.05
594 0.05
595 0.06
596 0.06
597 0.06
598 0.06
599 0.06
600 0.06
601 0.06
602 0.06
603 0.07
604 0.08
605 0.08
606 0.09
607 0.1
608 0.12
609 0.14
610 0.2
611 0.23
612 0.26
613 0.3
614 0.32
615 0.36
616 0.42
617 0.51
618 0.54
619 0.58
620 0.58
621 0.59
622 0.64
623 0.62
624 0.56
625 0.47
626 0.39
627 0.31
628 0.26
629 0.22
630 0.14
631 0.1
632 0.06
633 0.05
634 0.05
635 0.04
636 0.04
637 0.04
638 0.04
639 0.05
640 0.07
641 0.13
642 0.2
643 0.21
644 0.22
645 0.26
646 0.26
647 0.26
648 0.26
649 0.21
650 0.15
651 0.14
652 0.13
653 0.09
654 0.09
655 0.08
656 0.07
657 0.06
658 0.06
659 0.07
660 0.06
661 0.07
662 0.08
663 0.09
664 0.1
665 0.14
666 0.16
667 0.17
668 0.24
669 0.24
670 0.25
671 0.24
672 0.22
673 0.2
674 0.2
675 0.19
676 0.12
677 0.13
678 0.12
679 0.13
680 0.13
681 0.12
682 0.11
683 0.1
684 0.11
685 0.11
686 0.12
687 0.1
688 0.1
689 0.12
690 0.12
691 0.17
692 0.15
693 0.15
694 0.13
695 0.16
696 0.2
697 0.21
698 0.25
699 0.25
700 0.26
701 0.26
702 0.26
703 0.25
704 0.21
705 0.17
706 0.13
707 0.08
708 0.09
709 0.09
710 0.09
711 0.1
712 0.1
713 0.12
714 0.12
715 0.13
716 0.16
717 0.19
718 0.22
719 0.27
720 0.3
721 0.38
722 0.41
723 0.41
724 0.41
725 0.38
726 0.38
727 0.36
728 0.33
729 0.27
730 0.25
731 0.25
732 0.26
733 0.26
734 0.23
735 0.18
736 0.16
737 0.13
738 0.16
739 0.2
740 0.2
741 0.22
742 0.23
743 0.3
744 0.33
745 0.36
746 0.36
747 0.4
748 0.42
749 0.45
750 0.46
751 0.45
752 0.52
753 0.51
754 0.49
755 0.45
756 0.41
757 0.41
758 0.41
759 0.35
760 0.28
761 0.28
762 0.27
763 0.25
764 0.25
765 0.19
766 0.21
767 0.22
768 0.23
769 0.25
770 0.3
771 0.31
772 0.31
773 0.31
774 0.25
775 0.28
776 0.27
777 0.24
778 0.17
779 0.14
780 0.14
781 0.15
782 0.15
783 0.13
784 0.12
785 0.12
786 0.12
787 0.14
788 0.15
789 0.15
790 0.19
791 0.25
792 0.29
793 0.32
794 0.33
795 0.33
796 0.32
797 0.33
798 0.41
799 0.45
800 0.51
801 0.55
802 0.61
803 0.64
804 0.72
805 0.78
806 0.76
807 0.75
808 0.76
809 0.73
810 0.68
811 0.69
812 0.64
813 0.64
814 0.61
815 0.52
816 0.44
817 0.43
818 0.41
819 0.36
820 0.31
821 0.29
822 0.29
823 0.32
824 0.3
825 0.27
826 0.29
827 0.29
828 0.31
829 0.26
830 0.23
831 0.2
832 0.19
833 0.17
834 0.14
835 0.14
836 0.12
837 0.12
838 0.1
839 0.12
840 0.12
841 0.14
842 0.15
843 0.19
844 0.21
845 0.21
846 0.24
847 0.22
848 0.26
849 0.28
850 0.31
851 0.34
852 0.35
853 0.4
854 0.45
855 0.53
856 0.59
857 0.65
858 0.71
859 0.76
860 0.82
861 0.85
862 0.87
863 0.89