Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3EHL8

Protein Details
Accession A0A5C3EHL8    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
999-1019DELERKAARADEKKRRQQGGSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
1010-1014EKKRR
1025-1034GGKKSKGKRR
Subcellular Location(s) cyto 12.5cyto_nucl 12.5, nucl 11.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029149  Creatin/AminoP/Spt16_NTD  
IPR036005  Creatinase/aminopeptidase-like  
IPR029148  FACT-Spt16_Nlobe  
IPR013953  FACT_Spt16  
IPR000994  Pept_M24  
IPR011993  PH-like_dom_sf  
IPR013719  RTT106/SPT16-like_middle_dom  
IPR040258  Spt16  
Gene Ontology GO:0035101  C:FACT complex  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006260  P:DNA replication  
Pfam View protein in Pfam  
PF14826  FACT-Spt16_Nlob  
PF00557  Peptidase_M24  
PF08512  Rtt106  
PF08644  SPT16  
Amino Acid Sequences MSEQIQIDAGAFQRRVNKLLSAWKDGGADFDQLADVDSLLVVMGGQNDDLIYSKTTAIHSWLLGYEFPSTVILFSKKAVTFVTSASKAVHLEALKKGNASFDINILKRSKDEASNRAIWDDLIAKIEAEGSKVGCLPKDKPVGKFADEWQSVFEKAQNSKDFKMIDVSASLSAVWAAKDEEEIKAIKYASRMSSAVMSGYFENEMSTILDEGRKVTHEQLSERIEGRLDDNKMWKKVKGLEGADLSLADWCYTPIVQSGGEYDLKTSAVSTAKRLQGADGNGGVVIASMGIKYRNYCSNIGRTYLIDPHNSQQKMYAFLHELQTELADKHLRAGATCKDIYAKAVEIVRAKDDKLVQSFVKNIGFGIGLEFRDSAYVLSGKNNRTLKRDMVINLSVGFQDLDDPNHKGEVYSLLLIDTLRINEDGAATFLTDRVRGTNDMAFFFKDDEEEEEVEDRRSPVKADGKVTPGGKVLRNKNRGAALDDTAAEKMKSHQKELAKQKQEDGLARFAGEDGEGNASNEKVFKKFESYKRENLLPTKVADLKIMVDHRAQSIILPIYGYAVPFHVNTLKNISKSDEGEYTYLRLNFVTPGQIAGKKEDVPFDDPDATFVRSMSYRSTDSQRFTELYREITELRKSATKREAEEKELADVVEQDKLILSKSRTYTLPEVFPRPAMEGKRVPGDLTIHQNGLRFSSPLRPDQKIDLLFSNMKHLFFQPCDKELIVIVHVHLKSPIMIGKRKAKDIQFYREASDVQFDETGNRKRKYRSGDEDEIELEQEERRRRSQLNKEFKVFAERIAEASEGRVSVDVPYRELGFSGVPFRTNVLLQPTTDCLVHLTDPPFLVITLTDVEIVHLERVQFGLQSFDMVFVFSDFSRAPMHITSIPTTSLDDVKQWLDSVDICVTEGAVNLNWGAIMKTVNEDPYDFFVEGGWGFLQSGSDDEGSDESESGSEFGSDMDDGQEETDEESDSGSDFGDSAEDESGSEGFEDESDEGEDWDELERKAARADEKKRRQQGGSDDEDDGGKKSKGKRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.32
3 0.33
4 0.34
5 0.33
6 0.43
7 0.46
8 0.45
9 0.44
10 0.44
11 0.43
12 0.39
13 0.38
14 0.3
15 0.26
16 0.18
17 0.17
18 0.15
19 0.13
20 0.15
21 0.11
22 0.08
23 0.07
24 0.06
25 0.06
26 0.05
27 0.05
28 0.04
29 0.04
30 0.05
31 0.06
32 0.06
33 0.06
34 0.06
35 0.07
36 0.08
37 0.09
38 0.1
39 0.11
40 0.12
41 0.15
42 0.16
43 0.17
44 0.2
45 0.21
46 0.19
47 0.19
48 0.19
49 0.18
50 0.18
51 0.18
52 0.16
53 0.14
54 0.14
55 0.14
56 0.12
57 0.12
58 0.15
59 0.16
60 0.15
61 0.16
62 0.22
63 0.22
64 0.23
65 0.23
66 0.22
67 0.21
68 0.24
69 0.3
70 0.25
71 0.25
72 0.25
73 0.25
74 0.23
75 0.23
76 0.25
77 0.18
78 0.21
79 0.27
80 0.3
81 0.3
82 0.3
83 0.3
84 0.27
85 0.29
86 0.29
87 0.23
88 0.24
89 0.31
90 0.31
91 0.36
92 0.35
93 0.33
94 0.3
95 0.34
96 0.32
97 0.33
98 0.39
99 0.41
100 0.46
101 0.51
102 0.51
103 0.47
104 0.43
105 0.35
106 0.29
107 0.25
108 0.19
109 0.15
110 0.14
111 0.13
112 0.12
113 0.16
114 0.13
115 0.13
116 0.13
117 0.11
118 0.12
119 0.15
120 0.16
121 0.16
122 0.2
123 0.21
124 0.29
125 0.38
126 0.41
127 0.42
128 0.48
129 0.5
130 0.49
131 0.5
132 0.46
133 0.46
134 0.43
135 0.4
136 0.36
137 0.33
138 0.31
139 0.28
140 0.27
141 0.22
142 0.25
143 0.33
144 0.38
145 0.4
146 0.41
147 0.46
148 0.43
149 0.38
150 0.39
151 0.31
152 0.25
153 0.21
154 0.21
155 0.17
156 0.16
157 0.15
158 0.1
159 0.09
160 0.09
161 0.08
162 0.07
163 0.07
164 0.07
165 0.1
166 0.11
167 0.11
168 0.13
169 0.13
170 0.13
171 0.16
172 0.16
173 0.15
174 0.17
175 0.2
176 0.2
177 0.23
178 0.23
179 0.21
180 0.23
181 0.21
182 0.2
183 0.16
184 0.15
185 0.11
186 0.12
187 0.12
188 0.09
189 0.09
190 0.08
191 0.09
192 0.08
193 0.08
194 0.07
195 0.08
196 0.09
197 0.09
198 0.1
199 0.11
200 0.12
201 0.13
202 0.17
203 0.21
204 0.22
205 0.24
206 0.3
207 0.33
208 0.34
209 0.33
210 0.3
211 0.26
212 0.24
213 0.25
214 0.25
215 0.23
216 0.24
217 0.32
218 0.38
219 0.44
220 0.46
221 0.44
222 0.42
223 0.47
224 0.51
225 0.5
226 0.45
227 0.44
228 0.43
229 0.42
230 0.37
231 0.3
232 0.23
233 0.16
234 0.14
235 0.09
236 0.07
237 0.07
238 0.07
239 0.07
240 0.08
241 0.08
242 0.09
243 0.08
244 0.09
245 0.1
246 0.12
247 0.14
248 0.13
249 0.13
250 0.12
251 0.12
252 0.12
253 0.1
254 0.11
255 0.14
256 0.14
257 0.18
258 0.24
259 0.27
260 0.29
261 0.29
262 0.27
263 0.28
264 0.29
265 0.27
266 0.21
267 0.18
268 0.16
269 0.15
270 0.13
271 0.08
272 0.06
273 0.03
274 0.03
275 0.03
276 0.04
277 0.05
278 0.06
279 0.08
280 0.11
281 0.17
282 0.21
283 0.24
284 0.28
285 0.35
286 0.36
287 0.37
288 0.35
289 0.3
290 0.29
291 0.32
292 0.3
293 0.25
294 0.25
295 0.28
296 0.35
297 0.34
298 0.31
299 0.3
300 0.29
301 0.32
302 0.31
303 0.29
304 0.24
305 0.26
306 0.29
307 0.23
308 0.22
309 0.16
310 0.16
311 0.14
312 0.11
313 0.12
314 0.1
315 0.1
316 0.12
317 0.14
318 0.13
319 0.13
320 0.17
321 0.18
322 0.22
323 0.22
324 0.2
325 0.2
326 0.2
327 0.21
328 0.18
329 0.15
330 0.13
331 0.14
332 0.16
333 0.17
334 0.18
335 0.2
336 0.19
337 0.19
338 0.2
339 0.21
340 0.22
341 0.22
342 0.25
343 0.22
344 0.22
345 0.24
346 0.24
347 0.22
348 0.18
349 0.16
350 0.13
351 0.13
352 0.11
353 0.11
354 0.1
355 0.09
356 0.1
357 0.1
358 0.09
359 0.09
360 0.09
361 0.07
362 0.06
363 0.08
364 0.08
365 0.13
366 0.18
367 0.19
368 0.26
369 0.31
370 0.32
371 0.36
372 0.39
373 0.37
374 0.35
375 0.37
376 0.32
377 0.32
378 0.3
379 0.26
380 0.23
381 0.2
382 0.17
383 0.13
384 0.12
385 0.06
386 0.08
387 0.08
388 0.09
389 0.11
390 0.12
391 0.12
392 0.13
393 0.13
394 0.11
395 0.11
396 0.12
397 0.11
398 0.1
399 0.1
400 0.09
401 0.09
402 0.09
403 0.09
404 0.07
405 0.05
406 0.06
407 0.06
408 0.06
409 0.06
410 0.06
411 0.06
412 0.06
413 0.06
414 0.05
415 0.05
416 0.06
417 0.07
418 0.07
419 0.07
420 0.07
421 0.09
422 0.1
423 0.12
424 0.14
425 0.14
426 0.15
427 0.16
428 0.15
429 0.14
430 0.13
431 0.11
432 0.09
433 0.08
434 0.1
435 0.11
436 0.11
437 0.11
438 0.12
439 0.13
440 0.13
441 0.13
442 0.1
443 0.09
444 0.1
445 0.1
446 0.15
447 0.21
448 0.24
449 0.26
450 0.28
451 0.3
452 0.34
453 0.33
454 0.28
455 0.24
456 0.23
457 0.24
458 0.29
459 0.35
460 0.4
461 0.45
462 0.45
463 0.46
464 0.47
465 0.44
466 0.4
467 0.33
468 0.26
469 0.21
470 0.21
471 0.18
472 0.15
473 0.14
474 0.1
475 0.08
476 0.1
477 0.17
478 0.18
479 0.19
480 0.24
481 0.28
482 0.37
483 0.47
484 0.53
485 0.53
486 0.52
487 0.52
488 0.51
489 0.49
490 0.44
491 0.36
492 0.28
493 0.21
494 0.2
495 0.18
496 0.14
497 0.12
498 0.08
499 0.06
500 0.04
501 0.06
502 0.06
503 0.06
504 0.06
505 0.06
506 0.06
507 0.08
508 0.09
509 0.08
510 0.1
511 0.1
512 0.17
513 0.25
514 0.33
515 0.4
516 0.45
517 0.5
518 0.52
519 0.54
520 0.5
521 0.46
522 0.42
523 0.33
524 0.28
525 0.26
526 0.25
527 0.22
528 0.19
529 0.17
530 0.13
531 0.15
532 0.15
533 0.13
534 0.11
535 0.12
536 0.12
537 0.12
538 0.11
539 0.08
540 0.1
541 0.09
542 0.08
543 0.07
544 0.07
545 0.08
546 0.08
547 0.08
548 0.06
549 0.06
550 0.07
551 0.07
552 0.08
553 0.11
554 0.11
555 0.12
556 0.18
557 0.2
558 0.2
559 0.21
560 0.23
561 0.2
562 0.21
563 0.23
564 0.19
565 0.17
566 0.18
567 0.17
568 0.16
569 0.16
570 0.15
571 0.13
572 0.11
573 0.1
574 0.1
575 0.1
576 0.1
577 0.08
578 0.09
579 0.11
580 0.14
581 0.14
582 0.15
583 0.16
584 0.17
585 0.18
586 0.18
587 0.19
588 0.2
589 0.2
590 0.2
591 0.21
592 0.19
593 0.2
594 0.2
595 0.18
596 0.15
597 0.14
598 0.13
599 0.11
600 0.12
601 0.12
602 0.13
603 0.14
604 0.16
605 0.22
606 0.25
607 0.27
608 0.28
609 0.28
610 0.26
611 0.25
612 0.28
613 0.23
614 0.21
615 0.2
616 0.2
617 0.19
618 0.22
619 0.23
620 0.18
621 0.19
622 0.22
623 0.21
624 0.26
625 0.32
626 0.32
627 0.33
628 0.41
629 0.43
630 0.42
631 0.45
632 0.39
633 0.34
634 0.31
635 0.27
636 0.18
637 0.16
638 0.12
639 0.1
640 0.09
641 0.08
642 0.07
643 0.08
644 0.09
645 0.11
646 0.12
647 0.16
648 0.17
649 0.2
650 0.21
651 0.25
652 0.29
653 0.28
654 0.33
655 0.31
656 0.33
657 0.31
658 0.31
659 0.27
660 0.25
661 0.27
662 0.22
663 0.25
664 0.24
665 0.26
666 0.28
667 0.28
668 0.25
669 0.23
670 0.24
671 0.21
672 0.25
673 0.25
674 0.22
675 0.23
676 0.25
677 0.23
678 0.22
679 0.2
680 0.14
681 0.13
682 0.2
683 0.22
684 0.28
685 0.33
686 0.33
687 0.34
688 0.37
689 0.43
690 0.36
691 0.36
692 0.3
693 0.29
694 0.28
695 0.26
696 0.3
697 0.25
698 0.24
699 0.23
700 0.23
701 0.23
702 0.23
703 0.3
704 0.26
705 0.26
706 0.28
707 0.27
708 0.25
709 0.23
710 0.22
711 0.16
712 0.13
713 0.12
714 0.16
715 0.16
716 0.15
717 0.15
718 0.13
719 0.13
720 0.13
721 0.17
722 0.15
723 0.2
724 0.25
725 0.35
726 0.38
727 0.43
728 0.47
729 0.47
730 0.52
731 0.55
732 0.57
733 0.55
734 0.53
735 0.5
736 0.46
737 0.43
738 0.34
739 0.3
740 0.22
741 0.17
742 0.16
743 0.14
744 0.16
745 0.22
746 0.3
747 0.36
748 0.38
749 0.41
750 0.45
751 0.51
752 0.56
753 0.59
754 0.61
755 0.61
756 0.66
757 0.63
758 0.6
759 0.54
760 0.46
761 0.36
762 0.26
763 0.18
764 0.12
765 0.16
766 0.21
767 0.23
768 0.26
769 0.3
770 0.35
771 0.45
772 0.53
773 0.59
774 0.64
775 0.67
776 0.68
777 0.66
778 0.62
779 0.6
780 0.49
781 0.41
782 0.34
783 0.28
784 0.25
785 0.24
786 0.24
787 0.16
788 0.17
789 0.15
790 0.1
791 0.1
792 0.09
793 0.08
794 0.1
795 0.16
796 0.15
797 0.16
798 0.17
799 0.18
800 0.17
801 0.17
802 0.16
803 0.11
804 0.11
805 0.14
806 0.14
807 0.14
808 0.14
809 0.15
810 0.16
811 0.15
812 0.16
813 0.19
814 0.2
815 0.19
816 0.21
817 0.22
818 0.22
819 0.22
820 0.19
821 0.14
822 0.14
823 0.15
824 0.18
825 0.17
826 0.17
827 0.18
828 0.18
829 0.17
830 0.15
831 0.14
832 0.09
833 0.09
834 0.09
835 0.09
836 0.09
837 0.08
838 0.09
839 0.1
840 0.1
841 0.09
842 0.09
843 0.09
844 0.09
845 0.1
846 0.1
847 0.1
848 0.09
849 0.12
850 0.1
851 0.12
852 0.12
853 0.12
854 0.12
855 0.11
856 0.11
857 0.08
858 0.1
859 0.08
860 0.1
861 0.09
862 0.11
863 0.12
864 0.12
865 0.14
866 0.14
867 0.18
868 0.19
869 0.22
870 0.22
871 0.22
872 0.23
873 0.21
874 0.22
875 0.2
876 0.19
877 0.17
878 0.16
879 0.17
880 0.17
881 0.17
882 0.16
883 0.14
884 0.13
885 0.13
886 0.14
887 0.13
888 0.12
889 0.12
890 0.12
891 0.12
892 0.11
893 0.11
894 0.09
895 0.08
896 0.08
897 0.07
898 0.08
899 0.07
900 0.07
901 0.07
902 0.06
903 0.07
904 0.07
905 0.1
906 0.12
907 0.14
908 0.15
909 0.16
910 0.17
911 0.2
912 0.24
913 0.21
914 0.19
915 0.17
916 0.18
917 0.16
918 0.15
919 0.11
920 0.08
921 0.08
922 0.08
923 0.08
924 0.07
925 0.08
926 0.09
927 0.09
928 0.09
929 0.1
930 0.11
931 0.12
932 0.12
933 0.11
934 0.09
935 0.09
936 0.09
937 0.09
938 0.08
939 0.07
940 0.06
941 0.06
942 0.07
943 0.07
944 0.07
945 0.08
946 0.08
947 0.08
948 0.08
949 0.09
950 0.08
951 0.09
952 0.09
953 0.09
954 0.09
955 0.09
956 0.09
957 0.09
958 0.09
959 0.07
960 0.07
961 0.06
962 0.06
963 0.06
964 0.07
965 0.08
966 0.08
967 0.08
968 0.08
969 0.09
970 0.09
971 0.09
972 0.08
973 0.07
974 0.07
975 0.07
976 0.09
977 0.08
978 0.09
979 0.1
980 0.11
981 0.11
982 0.11
983 0.11
984 0.09
985 0.13
986 0.14
987 0.13
988 0.17
989 0.19
990 0.19
991 0.22
992 0.26
993 0.32
994 0.39
995 0.5
996 0.56
997 0.66
998 0.75
999 0.82
1000 0.84
1001 0.79
1002 0.77
1003 0.77
1004 0.75
1005 0.72
1006 0.65
1007 0.57
1008 0.5
1009 0.48
1010 0.41
1011 0.33
1012 0.28
1013 0.22
1014 0.24