Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1VC16

Protein Details
Accession H1VC16    Localization Confidence High Confidence Score 18.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
322-368HDAARKKQLSRKKPETRAPRHLTAGLTAERHRRRKKHEQPALPEASSHydrophilic
402-434ATQVRDKSEKRRKCGRPVHHRRRHEREALHTRSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
326-358RKKQLSRKKPETRAPRHLTAGLTAERHRRRKKH
409-425SEKRRKCGRPVHHRRRH
465-470RERGRR
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 12.5, cyto 7, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031348  Helo-like_N  
KEGG chig:CH63R_05044  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF17111  Helo_like_N  
Amino Acid Sequences MDPLTIVTAAASLAGAVLKASFKIKETVDAYDDAPQNVADIAEEVHAVQIALRQVESVVLQDPQAIERLNLEDVFAVAVNGCHATLLSISKEYEDLFLRSDWRAKIKVLWKDGEMTRLLGRLDRKKATLTLLTQTLNLRSTQDIKALLVQNQSTLNAAKQDLKEPASYYADFRPTSPSSLDNCNEARTPRVRDSVLSTTEFDFDYDLINTKTYRRALQRYAAASQGVDPSPGQETESLPEFPLPLDPLLEEEDGTGDRAGSPSESLTFQSRLSRATTLQPGSEGVAFANPPATPPKEPTVRTVRSEVNEPRADQPATTLEIHDAARKKQLSRKKPETRAPRHLTAGLTAERHRRRKKHEQPALPEASSSPQMSEDALWHRDGAESASSCPATADTTPGMTFATQVRDKSEKRRKCGRPVHHRRRHEREALHTRSSETSSAALGSVDSVTDALEQLGLPKSRAFGRERGRRKQTV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.04
2 0.04
3 0.04
4 0.05
5 0.06
6 0.08
7 0.11
8 0.12
9 0.14
10 0.19
11 0.2
12 0.27
13 0.29
14 0.31
15 0.31
16 0.32
17 0.31
18 0.33
19 0.34
20 0.27
21 0.25
22 0.21
23 0.19
24 0.17
25 0.16
26 0.08
27 0.07
28 0.07
29 0.07
30 0.08
31 0.07
32 0.07
33 0.07
34 0.07
35 0.06
36 0.09
37 0.1
38 0.11
39 0.11
40 0.11
41 0.11
42 0.12
43 0.12
44 0.1
45 0.1
46 0.09
47 0.1
48 0.11
49 0.12
50 0.11
51 0.14
52 0.13
53 0.11
54 0.13
55 0.15
56 0.15
57 0.15
58 0.14
59 0.12
60 0.11
61 0.12
62 0.1
63 0.07
64 0.05
65 0.05
66 0.06
67 0.06
68 0.06
69 0.05
70 0.05
71 0.05
72 0.07
73 0.09
74 0.1
75 0.11
76 0.12
77 0.12
78 0.13
79 0.13
80 0.15
81 0.15
82 0.14
83 0.14
84 0.15
85 0.17
86 0.18
87 0.23
88 0.23
89 0.26
90 0.27
91 0.27
92 0.34
93 0.39
94 0.45
95 0.46
96 0.45
97 0.41
98 0.45
99 0.45
100 0.41
101 0.34
102 0.28
103 0.23
104 0.23
105 0.22
106 0.19
107 0.26
108 0.3
109 0.36
110 0.37
111 0.37
112 0.38
113 0.4
114 0.4
115 0.38
116 0.33
117 0.3
118 0.3
119 0.29
120 0.29
121 0.28
122 0.25
123 0.21
124 0.19
125 0.17
126 0.15
127 0.19
128 0.18
129 0.2
130 0.18
131 0.18
132 0.23
133 0.24
134 0.25
135 0.23
136 0.22
137 0.21
138 0.21
139 0.2
140 0.16
141 0.14
142 0.12
143 0.12
144 0.13
145 0.16
146 0.16
147 0.2
148 0.22
149 0.23
150 0.23
151 0.22
152 0.25
153 0.23
154 0.23
155 0.22
156 0.22
157 0.25
158 0.24
159 0.23
160 0.26
161 0.24
162 0.25
163 0.24
164 0.24
165 0.22
166 0.28
167 0.28
168 0.26
169 0.25
170 0.25
171 0.25
172 0.22
173 0.24
174 0.23
175 0.27
176 0.27
177 0.3
178 0.29
179 0.28
180 0.34
181 0.34
182 0.32
183 0.29
184 0.26
185 0.23
186 0.23
187 0.22
188 0.16
189 0.12
190 0.09
191 0.08
192 0.07
193 0.08
194 0.07
195 0.08
196 0.09
197 0.1
198 0.14
199 0.15
200 0.2
201 0.24
202 0.29
203 0.32
204 0.37
205 0.41
206 0.38
207 0.38
208 0.34
209 0.28
210 0.23
211 0.2
212 0.17
213 0.12
214 0.1
215 0.08
216 0.08
217 0.09
218 0.09
219 0.09
220 0.08
221 0.08
222 0.09
223 0.11
224 0.11
225 0.1
226 0.1
227 0.09
228 0.08
229 0.09
230 0.08
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.07
235 0.08
236 0.08
237 0.07
238 0.06
239 0.07
240 0.07
241 0.08
242 0.06
243 0.04
244 0.04
245 0.05
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.05
250 0.06
251 0.07
252 0.08
253 0.1
254 0.11
255 0.12
256 0.15
257 0.16
258 0.16
259 0.17
260 0.18
261 0.17
262 0.2
263 0.24
264 0.22
265 0.21
266 0.2
267 0.18
268 0.18
269 0.17
270 0.12
271 0.07
272 0.07
273 0.07
274 0.06
275 0.07
276 0.06
277 0.07
278 0.1
279 0.13
280 0.13
281 0.17
282 0.23
283 0.28
284 0.29
285 0.34
286 0.4
287 0.41
288 0.42
289 0.43
290 0.42
291 0.37
292 0.43
293 0.41
294 0.4
295 0.38
296 0.37
297 0.36
298 0.36
299 0.34
300 0.27
301 0.25
302 0.19
303 0.2
304 0.19
305 0.17
306 0.13
307 0.15
308 0.15
309 0.18
310 0.19
311 0.17
312 0.24
313 0.26
314 0.29
315 0.34
316 0.44
317 0.49
318 0.57
319 0.67
320 0.7
321 0.77
322 0.83
323 0.87
324 0.86
325 0.87
326 0.84
327 0.77
328 0.7
329 0.63
330 0.55
331 0.46
332 0.4
333 0.32
334 0.27
335 0.26
336 0.32
337 0.38
338 0.47
339 0.54
340 0.58
341 0.65
342 0.74
343 0.82
344 0.84
345 0.86
346 0.85
347 0.84
348 0.85
349 0.82
350 0.7
351 0.59
352 0.49
353 0.41
354 0.35
355 0.27
356 0.18
357 0.13
358 0.14
359 0.14
360 0.14
361 0.15
362 0.17
363 0.18
364 0.18
365 0.17
366 0.17
367 0.17
368 0.17
369 0.15
370 0.14
371 0.14
372 0.15
373 0.18
374 0.18
375 0.17
376 0.17
377 0.15
378 0.13
379 0.13
380 0.14
381 0.12
382 0.14
383 0.14
384 0.14
385 0.14
386 0.11
387 0.13
388 0.12
389 0.19
390 0.2
391 0.21
392 0.26
393 0.33
394 0.37
395 0.47
396 0.55
397 0.56
398 0.62
399 0.72
400 0.75
401 0.79
402 0.85
403 0.85
404 0.86
405 0.89
406 0.92
407 0.92
408 0.93
409 0.93
410 0.92
411 0.91
412 0.88
413 0.83
414 0.83
415 0.83
416 0.8
417 0.75
418 0.66
419 0.59
420 0.53
421 0.5
422 0.4
423 0.31
424 0.25
425 0.2
426 0.19
427 0.17
428 0.13
429 0.1
430 0.1
431 0.08
432 0.07
433 0.06
434 0.06
435 0.06
436 0.06
437 0.07
438 0.06
439 0.06
440 0.06
441 0.09
442 0.15
443 0.16
444 0.17
445 0.18
446 0.2
447 0.24
448 0.3
449 0.32
450 0.35
451 0.45
452 0.54
453 0.63
454 0.71