Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A5C3DRL4

Protein Details
Accession A0A5C3DRL4    Localization Confidence High Confidence Score 18.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
79-100TPEQTPAKRKPGRTRKSEAVTPHydrophilic
158-178EEVPVKRKPGRPRKSAPAVVAHydrophilic
359-386SALAKMRNLRRKKDKQRRRDARPGKSLSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
86-93KRKPGRTR
163-171KRKPGRPRK
254-254K
256-256R
363-383KMRNLRRKKDKQRRRDARPGK
Subcellular Location(s) cyto 10.5, cyto_nucl 8, nucl 4.5, extr 4, plas 3, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025856  HeH/LEM_domain  
IPR044780  Heh2/Src1  
IPR041885  MAN1_winged_helix_dom  
IPR018996  MSC  
Gene Ontology GO:0005637  C:nuclear inner membrane  
GO:0003682  F:chromatin binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF12949  HeH  
PF09402  MSC  
CDD cd12935  LEM_like  
Amino Acid Sequences MVERDDYMREGFDPNSLTMPQLRSILVEHGIPFSSAARKGDLVDHFNESVLPKTASLRKKESTIVASSSGIIDMRDEVTPEQTPAKRKPGRTRKSEAVTPAPAVTSTTRTPRKSAAASTTAKTTRTPARKKSSLANQLATSTESEAEPEVPEPKVEEEEVPVKRKPGRPRKSAPAVVAAPVEASEPEDNASPRRVSFGPTTSPPASSSRKAGRLSYGGKSDDDGTFSDSNPFQSGSESSPAHGVAAKAAASAKKTRRKTTDGTSSLRKKSSNPSLAAESPPKAAQQSSPGLTGTLRNYMDQAVAATTPPRIVSRLTGTTAADSTGGHAADDEATKVAATDAGAEADEDDFDVDAFMSPSALAKMRNLRRKKDKQRRRDARPGKSLSDYLVSSVYTLILVGVFAWTVWYARETRALGFCDTNSDTNAIVEDRRLTALAYAQANNETVEDMTLLPTRLQPTCTPCPAHADCAYGKVLGCSSDDWVLQPNLRSHIPLANWFLPLSTTAPRCYPDTQKLVLASELAQAISHMLADFKGEIVCGTQKTHATVRSLPKKVLGAEGNLTYAIAETAVKRSMSATRDARVDEDYFEQIWYMALFELTDPRSNIIRTPVSINGTISEGVGETQYFLAAKQPALSLSCRSRLALKGWVLRARLYFFLLLSAISGFLYLRYRLASARAETAKVALLVQAALERLQEQEYLHGRDPVLHPDDFVPLSHLRDHILAGEHKAKARNRLWRKVAKVVEENSNVRTRQAQKKGEWLRVWQWVGVEGWKGYEGTPGRVGDVGDASGFPVA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.22
3 0.21
4 0.21
5 0.23
6 0.25
7 0.24
8 0.24
9 0.23
10 0.21
11 0.22
12 0.24
13 0.21
14 0.2
15 0.19
16 0.19
17 0.19
18 0.18
19 0.17
20 0.16
21 0.19
22 0.21
23 0.21
24 0.22
25 0.22
26 0.24
27 0.3
28 0.33
29 0.32
30 0.31
31 0.34
32 0.32
33 0.31
34 0.31
35 0.26
36 0.23
37 0.23
38 0.21
39 0.17
40 0.23
41 0.31
42 0.37
43 0.43
44 0.47
45 0.47
46 0.5
47 0.54
48 0.54
49 0.51
50 0.47
51 0.43
52 0.38
53 0.35
54 0.32
55 0.28
56 0.22
57 0.17
58 0.13
59 0.11
60 0.1
61 0.11
62 0.1
63 0.12
64 0.12
65 0.15
66 0.16
67 0.18
68 0.24
69 0.26
70 0.33
71 0.38
72 0.48
73 0.52
74 0.59
75 0.69
76 0.73
77 0.78
78 0.8
79 0.82
80 0.8
81 0.81
82 0.78
83 0.73
84 0.69
85 0.63
86 0.56
87 0.48
88 0.38
89 0.31
90 0.28
91 0.23
92 0.2
93 0.2
94 0.28
95 0.35
96 0.37
97 0.41
98 0.43
99 0.48
100 0.48
101 0.49
102 0.47
103 0.47
104 0.48
105 0.46
106 0.49
107 0.44
108 0.41
109 0.36
110 0.35
111 0.37
112 0.44
113 0.51
114 0.54
115 0.62
116 0.66
117 0.69
118 0.72
119 0.73
120 0.73
121 0.7
122 0.64
123 0.55
124 0.5
125 0.48
126 0.4
127 0.31
128 0.21
129 0.17
130 0.12
131 0.12
132 0.12
133 0.11
134 0.11
135 0.11
136 0.12
137 0.12
138 0.12
139 0.13
140 0.14
141 0.15
142 0.15
143 0.14
144 0.16
145 0.23
146 0.28
147 0.3
148 0.3
149 0.32
150 0.38
151 0.45
152 0.52
153 0.55
154 0.61
155 0.66
156 0.73
157 0.79
158 0.82
159 0.8
160 0.72
161 0.68
162 0.59
163 0.51
164 0.43
165 0.33
166 0.23
167 0.18
168 0.16
169 0.08
170 0.09
171 0.08
172 0.08
173 0.09
174 0.11
175 0.12
176 0.14
177 0.17
178 0.16
179 0.15
180 0.19
181 0.19
182 0.21
183 0.24
184 0.26
185 0.28
186 0.29
187 0.36
188 0.32
189 0.33
190 0.31
191 0.33
192 0.34
193 0.31
194 0.36
195 0.36
196 0.42
197 0.43
198 0.42
199 0.41
200 0.42
201 0.44
202 0.41
203 0.39
204 0.33
205 0.32
206 0.31
207 0.29
208 0.23
209 0.2
210 0.17
211 0.17
212 0.16
213 0.16
214 0.19
215 0.17
216 0.18
217 0.17
218 0.17
219 0.13
220 0.13
221 0.15
222 0.14
223 0.18
224 0.17
225 0.16
226 0.17
227 0.17
228 0.15
229 0.15
230 0.12
231 0.08
232 0.09
233 0.09
234 0.08
235 0.09
236 0.1
237 0.11
238 0.19
239 0.27
240 0.35
241 0.41
242 0.48
243 0.53
244 0.58
245 0.61
246 0.63
247 0.65
248 0.62
249 0.61
250 0.62
251 0.63
252 0.62
253 0.59
254 0.51
255 0.44
256 0.48
257 0.53
258 0.51
259 0.46
260 0.44
261 0.46
262 0.46
263 0.46
264 0.4
265 0.31
266 0.25
267 0.23
268 0.21
269 0.17
270 0.16
271 0.14
272 0.16
273 0.19
274 0.19
275 0.19
276 0.19
277 0.18
278 0.18
279 0.19
280 0.16
281 0.17
282 0.16
283 0.15
284 0.16
285 0.16
286 0.16
287 0.13
288 0.12
289 0.07
290 0.06
291 0.07
292 0.06
293 0.06
294 0.06
295 0.07
296 0.07
297 0.08
298 0.08
299 0.11
300 0.15
301 0.17
302 0.18
303 0.19
304 0.18
305 0.18
306 0.17
307 0.15
308 0.11
309 0.08
310 0.08
311 0.08
312 0.08
313 0.07
314 0.07
315 0.07
316 0.07
317 0.08
318 0.07
319 0.05
320 0.05
321 0.05
322 0.05
323 0.05
324 0.04
325 0.04
326 0.04
327 0.04
328 0.05
329 0.05
330 0.05
331 0.05
332 0.04
333 0.04
334 0.03
335 0.03
336 0.03
337 0.03
338 0.03
339 0.03
340 0.03
341 0.04
342 0.03
343 0.03
344 0.03
345 0.04
346 0.05
347 0.06
348 0.06
349 0.08
350 0.17
351 0.25
352 0.34
353 0.39
354 0.47
355 0.57
356 0.67
357 0.76
358 0.79
359 0.82
360 0.84
361 0.9
362 0.92
363 0.9
364 0.9
365 0.89
366 0.87
367 0.86
368 0.79
369 0.7
370 0.62
371 0.53
372 0.43
373 0.36
374 0.26
375 0.17
376 0.14
377 0.11
378 0.09
379 0.08
380 0.07
381 0.05
382 0.05
383 0.04
384 0.03
385 0.03
386 0.02
387 0.02
388 0.02
389 0.02
390 0.02
391 0.03
392 0.03
393 0.03
394 0.05
395 0.06
396 0.06
397 0.1
398 0.11
399 0.12
400 0.15
401 0.16
402 0.17
403 0.16
404 0.15
405 0.16
406 0.16
407 0.15
408 0.13
409 0.13
410 0.11
411 0.11
412 0.11
413 0.08
414 0.07
415 0.07
416 0.07
417 0.07
418 0.07
419 0.07
420 0.07
421 0.07
422 0.08
423 0.11
424 0.11
425 0.11
426 0.11
427 0.12
428 0.12
429 0.12
430 0.1
431 0.08
432 0.06
433 0.05
434 0.06
435 0.05
436 0.06
437 0.07
438 0.07
439 0.07
440 0.09
441 0.11
442 0.11
443 0.13
444 0.15
445 0.21
446 0.26
447 0.29
448 0.28
449 0.27
450 0.34
451 0.33
452 0.34
453 0.28
454 0.26
455 0.23
456 0.24
457 0.24
458 0.17
459 0.16
460 0.12
461 0.11
462 0.09
463 0.1
464 0.08
465 0.08
466 0.1
467 0.1
468 0.1
469 0.12
470 0.12
471 0.13
472 0.15
473 0.15
474 0.17
475 0.17
476 0.17
477 0.16
478 0.19
479 0.18
480 0.2
481 0.23
482 0.21
483 0.22
484 0.21
485 0.19
486 0.16
487 0.16
488 0.14
489 0.13
490 0.14
491 0.14
492 0.16
493 0.18
494 0.21
495 0.23
496 0.27
497 0.3
498 0.34
499 0.34
500 0.34
501 0.34
502 0.31
503 0.28
504 0.22
505 0.16
506 0.12
507 0.11
508 0.09
509 0.08
510 0.07
511 0.07
512 0.06
513 0.06
514 0.04
515 0.04
516 0.04
517 0.05
518 0.05
519 0.05
520 0.05
521 0.05
522 0.05
523 0.06
524 0.08
525 0.09
526 0.1
527 0.13
528 0.14
529 0.17
530 0.21
531 0.22
532 0.24
533 0.29
534 0.38
535 0.45
536 0.46
537 0.44
538 0.43
539 0.42
540 0.4
541 0.39
542 0.31
543 0.23
544 0.23
545 0.23
546 0.21
547 0.18
548 0.17
549 0.11
550 0.09
551 0.07
552 0.05
553 0.05
554 0.05
555 0.08
556 0.1
557 0.1
558 0.1
559 0.12
560 0.17
561 0.18
562 0.25
563 0.26
564 0.27
565 0.29
566 0.3
567 0.3
568 0.27
569 0.26
570 0.2
571 0.2
572 0.19
573 0.17
574 0.16
575 0.15
576 0.12
577 0.11
578 0.09
579 0.07
580 0.05
581 0.05
582 0.05
583 0.05
584 0.1
585 0.11
586 0.14
587 0.13
588 0.15
589 0.18
590 0.18
591 0.2
592 0.22
593 0.22
594 0.21
595 0.25
596 0.27
597 0.27
598 0.28
599 0.27
600 0.21
601 0.21
602 0.19
603 0.15
604 0.12
605 0.09
606 0.08
607 0.08
608 0.07
609 0.06
610 0.06
611 0.06
612 0.06
613 0.06
614 0.1
615 0.12
616 0.12
617 0.12
618 0.13
619 0.14
620 0.16
621 0.18
622 0.19
623 0.22
624 0.26
625 0.26
626 0.26
627 0.29
628 0.31
629 0.32
630 0.34
631 0.36
632 0.38
633 0.43
634 0.46
635 0.44
636 0.43
637 0.41
638 0.37
639 0.32
640 0.28
641 0.23
642 0.18
643 0.18
644 0.16
645 0.13
646 0.1
647 0.09
648 0.07
649 0.06
650 0.06
651 0.05
652 0.07
653 0.1
654 0.1
655 0.1
656 0.11
657 0.13
658 0.13
659 0.18
660 0.21
661 0.2
662 0.27
663 0.28
664 0.28
665 0.27
666 0.28
667 0.25
668 0.2
669 0.18
670 0.12
671 0.1
672 0.09
673 0.09
674 0.09
675 0.08
676 0.08
677 0.08
678 0.08
679 0.08
680 0.1
681 0.11
682 0.1
683 0.17
684 0.22
685 0.27
686 0.28
687 0.3
688 0.29
689 0.33
690 0.34
691 0.35
692 0.34
693 0.29
694 0.29
695 0.27
696 0.31
697 0.26
698 0.24
699 0.2
700 0.18
701 0.21
702 0.22
703 0.21
704 0.19
705 0.2
706 0.2
707 0.18
708 0.21
709 0.21
710 0.23
711 0.29
712 0.3
713 0.33
714 0.4
715 0.41
716 0.46
717 0.52
718 0.57
719 0.61
720 0.69
721 0.75
722 0.77
723 0.79
724 0.79
725 0.78
726 0.75
727 0.73
728 0.66
729 0.66
730 0.63
731 0.59
732 0.54
733 0.54
734 0.46
735 0.4
736 0.44
737 0.44
738 0.48
739 0.56
740 0.59
741 0.57
742 0.67
743 0.74
744 0.75
745 0.7
746 0.66
747 0.63
748 0.63
749 0.61
750 0.52
751 0.44
752 0.37
753 0.35
754 0.31
755 0.27
756 0.18
757 0.18
758 0.17
759 0.17
760 0.15
761 0.21
762 0.21
763 0.22
764 0.28
765 0.27
766 0.27
767 0.28
768 0.28
769 0.22
770 0.22
771 0.18
772 0.13
773 0.13