Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A5C3EF06

Protein Details
Accession A0A5C3EF06    Localization Confidence High Confidence Score 18.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
324-346VGPAKLKQIRRKKTDPQPQKVASHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
110-112KKA
330-337KQIRRKKT
553-557PKGRG
Subcellular Location(s) nucl 26.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013860  AreA_GATA  
IPR039355  Transcription_factor_GATA  
IPR000679  Znf_GATA  
IPR013088  Znf_NHR/GATA  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF08550  DUF1752  
PF00320  GATA  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00344  GATA_ZN_FINGER_1  
PS50114  GATA_ZN_FINGER_2  
CDD cd00202  ZnF_GATA  
Amino Acid Sequences MAPLLLKVKGNKSFSPFSNLHDEDSLLRTWRVCTKVAAHLEQGQRLENLSWRLWYLHDLMVENDDVKSRRDFKKLSKSTGEKLDRDKGRAIGELTAPPFRKTDSGEALRKKAVERQKLRALAVARLQGKFRNGGGGGKQSMKDMQYTFALDPSVNFKQTTVGNKDASKEYAQTQRQNGPVGTTNKFPLNLSPQASSTNDTRSDAMELSADSHFDTSMVDTGATFDQIMASAGLGDMSNASGGYRLEDIEAAERDLLLNHHIDLNAPLDSLLAGLGNMEDVQMDLADFGLPVSDLPNFNAPFDQTLADMSAPQASSSTGPIRQQVGPAKLKQIRRKKTDPQPQKVASELARKKAEELRNIRKLTEQTQRTHIQNSSRPESKEPSPDGSVGSNWSANVTSSNGDAQPDWLNSATSLFGVNQGPSQSLPEGAHLPLSGYGSIANAQNSINNLHIDTSVSTIQGGVMQPPPFGARGTSVSVPTTPLLAPEAGPFQGADRPVDSLSAPSSPTLRPALANIGRSGSSPGPSTSASASKAAIKRHSTDGSLTGADGLPKPKGRGRRSIAGSIAFTAINPDLNKKPDGLPAGSSTPSASFASGSGHPTQAQCTNCGATSTPLWRRDPNDLLLCNACGLYLKLHKTPRPKSLKNHHSHSHSGHITPSATPGGASAPGSRAGSPSRAGSPGAEDMMSCFNCGTYTTPLWRKDDAGHTVCNACGLYLKLHNEHRPVTMRADVIKKRSRYDEKRGRASAANSRRTSPQPQSAPSSAGAESSEPMVVDKPARAKSNSVTFQLQPSNAGETNVAATSISAPGSAVLPGSSWPSLGTPGGGVRVGETNIAHQLNDAFATAVNRFSTGVPMQQQQQQQASASPASAAGSGTTADSTPNTAASSTSGPSQQFGWSPWLQPQPPTSAAPPSSAATTASSTTSPPIPIPGQQTDIQTLSAAFSAHPALAYAVHQAAEKFPAFFAQNPLGATASVAAAAGIHNPFGAAFAGNPAAGTGGTNNPNSNNAAAPGNAAETETQNLDIAGVGTPSNLGQGHDSVMMMDLATPTSTGDNNDNNSSSRPETSSNRNSSVVGAGAGNTASANGRDTASEFGRNMPVQSTVNGNNNSGARAGVDLGEGGTPQAGSWW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.56
3 0.49
4 0.45
5 0.5
6 0.46
7 0.42
8 0.37
9 0.35
10 0.3
11 0.32
12 0.3
13 0.22
14 0.22
15 0.2
16 0.23
17 0.29
18 0.29
19 0.29
20 0.31
21 0.33
22 0.41
23 0.47
24 0.47
25 0.43
26 0.47
27 0.5
28 0.5
29 0.46
30 0.39
31 0.33
32 0.32
33 0.3
34 0.27
35 0.28
36 0.24
37 0.24
38 0.24
39 0.24
40 0.23
41 0.25
42 0.23
43 0.22
44 0.23
45 0.23
46 0.22
47 0.23
48 0.23
49 0.2
50 0.17
51 0.19
52 0.17
53 0.19
54 0.25
55 0.31
56 0.36
57 0.44
58 0.5
59 0.56
60 0.66
61 0.72
62 0.73
63 0.75
64 0.75
65 0.73
66 0.78
67 0.75
68 0.69
69 0.68
70 0.69
71 0.64
72 0.62
73 0.59
74 0.53
75 0.48
76 0.46
77 0.41
78 0.35
79 0.32
80 0.33
81 0.32
82 0.35
83 0.34
84 0.31
85 0.31
86 0.29
87 0.29
88 0.29
89 0.34
90 0.36
91 0.43
92 0.51
93 0.56
94 0.59
95 0.58
96 0.55
97 0.5
98 0.49
99 0.5
100 0.52
101 0.53
102 0.57
103 0.64
104 0.67
105 0.65
106 0.62
107 0.55
108 0.49
109 0.47
110 0.46
111 0.41
112 0.37
113 0.39
114 0.37
115 0.38
116 0.35
117 0.3
118 0.3
119 0.27
120 0.29
121 0.31
122 0.34
123 0.34
124 0.35
125 0.35
126 0.31
127 0.33
128 0.3
129 0.3
130 0.24
131 0.24
132 0.22
133 0.25
134 0.24
135 0.21
136 0.21
137 0.17
138 0.17
139 0.21
140 0.23
141 0.21
142 0.21
143 0.19
144 0.23
145 0.27
146 0.34
147 0.34
148 0.35
149 0.37
150 0.39
151 0.42
152 0.41
153 0.4
154 0.34
155 0.3
156 0.3
157 0.36
158 0.41
159 0.44
160 0.46
161 0.5
162 0.51
163 0.53
164 0.47
165 0.42
166 0.43
167 0.41
168 0.38
169 0.34
170 0.34
171 0.33
172 0.33
173 0.3
174 0.28
175 0.29
176 0.33
177 0.33
178 0.32
179 0.3
180 0.33
181 0.34
182 0.31
183 0.26
184 0.26
185 0.25
186 0.25
187 0.25
188 0.22
189 0.23
190 0.21
191 0.19
192 0.14
193 0.13
194 0.14
195 0.13
196 0.12
197 0.1
198 0.1
199 0.09
200 0.08
201 0.08
202 0.07
203 0.08
204 0.08
205 0.08
206 0.07
207 0.1
208 0.1
209 0.1
210 0.09
211 0.07
212 0.07
213 0.07
214 0.08
215 0.06
216 0.05
217 0.05
218 0.04
219 0.05
220 0.05
221 0.04
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.05
228 0.05
229 0.07
230 0.07
231 0.08
232 0.08
233 0.09
234 0.1
235 0.12
236 0.13
237 0.12
238 0.11
239 0.11
240 0.11
241 0.11
242 0.11
243 0.08
244 0.09
245 0.08
246 0.1
247 0.1
248 0.11
249 0.11
250 0.12
251 0.11
252 0.1
253 0.09
254 0.08
255 0.08
256 0.07
257 0.06
258 0.04
259 0.03
260 0.03
261 0.03
262 0.03
263 0.03
264 0.03
265 0.03
266 0.03
267 0.03
268 0.03
269 0.03
270 0.03
271 0.03
272 0.04
273 0.03
274 0.03
275 0.03
276 0.03
277 0.03
278 0.05
279 0.07
280 0.07
281 0.09
282 0.15
283 0.16
284 0.16
285 0.17
286 0.17
287 0.16
288 0.17
289 0.16
290 0.1
291 0.1
292 0.11
293 0.1
294 0.09
295 0.08
296 0.09
297 0.09
298 0.09
299 0.08
300 0.08
301 0.09
302 0.11
303 0.14
304 0.14
305 0.16
306 0.19
307 0.22
308 0.22
309 0.27
310 0.3
311 0.35
312 0.37
313 0.37
314 0.43
315 0.46
316 0.53
317 0.57
318 0.61
319 0.64
320 0.67
321 0.74
322 0.75
323 0.8
324 0.83
325 0.84
326 0.82
327 0.83
328 0.78
329 0.71
330 0.63
331 0.56
332 0.49
333 0.48
334 0.43
335 0.41
336 0.4
337 0.38
338 0.4
339 0.45
340 0.46
341 0.45
342 0.5
343 0.53
344 0.59
345 0.59
346 0.57
347 0.53
348 0.5
349 0.48
350 0.48
351 0.44
352 0.38
353 0.44
354 0.48
355 0.46
356 0.47
357 0.43
358 0.41
359 0.41
360 0.45
361 0.45
362 0.45
363 0.45
364 0.44
365 0.46
366 0.43
367 0.45
368 0.41
369 0.39
370 0.36
371 0.35
372 0.32
373 0.29
374 0.25
375 0.19
376 0.17
377 0.13
378 0.11
379 0.11
380 0.1
381 0.09
382 0.1
383 0.09
384 0.08
385 0.08
386 0.1
387 0.1
388 0.1
389 0.1
390 0.11
391 0.12
392 0.12
393 0.12
394 0.11
395 0.11
396 0.1
397 0.11
398 0.09
399 0.07
400 0.07
401 0.06
402 0.08
403 0.09
404 0.09
405 0.1
406 0.1
407 0.1
408 0.1
409 0.11
410 0.09
411 0.1
412 0.1
413 0.1
414 0.12
415 0.11
416 0.11
417 0.1
418 0.1
419 0.09
420 0.1
421 0.08
422 0.06
423 0.06
424 0.06
425 0.08
426 0.09
427 0.08
428 0.08
429 0.08
430 0.09
431 0.1
432 0.1
433 0.1
434 0.1
435 0.1
436 0.09
437 0.1
438 0.09
439 0.09
440 0.1
441 0.09
442 0.09
443 0.08
444 0.07
445 0.07
446 0.08
447 0.08
448 0.08
449 0.11
450 0.11
451 0.11
452 0.11
453 0.12
454 0.11
455 0.11
456 0.1
457 0.08
458 0.1
459 0.13
460 0.14
461 0.13
462 0.13
463 0.13
464 0.14
465 0.12
466 0.11
467 0.09
468 0.08
469 0.08
470 0.08
471 0.08
472 0.08
473 0.09
474 0.08
475 0.08
476 0.07
477 0.07
478 0.09
479 0.09
480 0.09
481 0.08
482 0.09
483 0.09
484 0.1
485 0.09
486 0.08
487 0.08
488 0.09
489 0.08
490 0.08
491 0.1
492 0.09
493 0.12
494 0.12
495 0.12
496 0.11
497 0.12
498 0.19
499 0.19
500 0.2
501 0.18
502 0.18
503 0.17
504 0.17
505 0.19
506 0.12
507 0.11
508 0.11
509 0.11
510 0.12
511 0.12
512 0.13
513 0.11
514 0.13
515 0.13
516 0.13
517 0.13
518 0.16
519 0.19
520 0.21
521 0.24
522 0.24
523 0.25
524 0.29
525 0.3
526 0.26
527 0.24
528 0.23
529 0.2
530 0.18
531 0.15
532 0.11
533 0.1
534 0.1
535 0.09
536 0.09
537 0.09
538 0.1
539 0.12
540 0.15
541 0.24
542 0.27
543 0.35
544 0.39
545 0.45
546 0.48
547 0.5
548 0.48
549 0.4
550 0.37
551 0.28
552 0.24
553 0.15
554 0.12
555 0.09
556 0.08
557 0.08
558 0.08
559 0.1
560 0.12
561 0.14
562 0.15
563 0.15
564 0.16
565 0.18
566 0.2
567 0.18
568 0.17
569 0.17
570 0.18
571 0.17
572 0.16
573 0.13
574 0.11
575 0.12
576 0.11
577 0.09
578 0.07
579 0.07
580 0.1
581 0.1
582 0.12
583 0.11
584 0.12
585 0.12
586 0.12
587 0.14
588 0.17
589 0.16
590 0.16
591 0.16
592 0.16
593 0.15
594 0.16
595 0.14
596 0.11
597 0.12
598 0.16
599 0.21
600 0.24
601 0.26
602 0.29
603 0.31
604 0.35
605 0.36
606 0.35
607 0.34
608 0.3
609 0.29
610 0.27
611 0.25
612 0.19
613 0.16
614 0.11
615 0.07
616 0.07
617 0.08
618 0.12
619 0.14
620 0.19
621 0.24
622 0.28
623 0.37
624 0.42
625 0.5
626 0.55
627 0.58
628 0.63
629 0.69
630 0.76
631 0.73
632 0.75
633 0.7
634 0.66
635 0.64
636 0.57
637 0.53
638 0.44
639 0.38
640 0.32
641 0.28
642 0.23
643 0.19
644 0.18
645 0.11
646 0.1
647 0.09
648 0.08
649 0.08
650 0.08
651 0.08
652 0.07
653 0.07
654 0.09
655 0.1
656 0.1
657 0.11
658 0.11
659 0.12
660 0.13
661 0.14
662 0.13
663 0.14
664 0.14
665 0.13
666 0.14
667 0.13
668 0.12
669 0.11
670 0.09
671 0.09
672 0.13
673 0.13
674 0.11
675 0.09
676 0.09
677 0.09
678 0.1
679 0.11
680 0.11
681 0.13
682 0.19
683 0.26
684 0.29
685 0.32
686 0.32
687 0.31
688 0.31
689 0.35
690 0.36
691 0.32
692 0.3
693 0.28
694 0.27
695 0.26
696 0.23
697 0.17
698 0.1
699 0.09
700 0.09
701 0.1
702 0.13
703 0.15
704 0.18
705 0.23
706 0.27
707 0.29
708 0.3
709 0.32
710 0.33
711 0.32
712 0.31
713 0.29
714 0.26
715 0.27
716 0.33
717 0.33
718 0.36
719 0.41
720 0.41
721 0.41
722 0.49
723 0.55
724 0.55
725 0.63
726 0.66
727 0.67
728 0.74
729 0.72
730 0.66
731 0.6
732 0.56
733 0.54
734 0.53
735 0.54
736 0.46
737 0.47
738 0.48
739 0.48
740 0.51
741 0.47
742 0.46
743 0.42
744 0.44
745 0.48
746 0.45
747 0.43
748 0.37
749 0.34
750 0.25
751 0.21
752 0.18
753 0.12
754 0.11
755 0.1
756 0.09
757 0.07
758 0.07
759 0.07
760 0.08
761 0.08
762 0.1
763 0.15
764 0.19
765 0.23
766 0.24
767 0.26
768 0.29
769 0.38
770 0.39
771 0.37
772 0.36
773 0.33
774 0.36
775 0.37
776 0.32
777 0.25
778 0.22
779 0.23
780 0.2
781 0.2
782 0.16
783 0.13
784 0.14
785 0.12
786 0.11
787 0.06
788 0.06
789 0.07
790 0.07
791 0.07
792 0.05
793 0.05
794 0.06
795 0.06
796 0.06
797 0.05
798 0.05
799 0.05
800 0.06
801 0.08
802 0.08
803 0.07
804 0.08
805 0.08
806 0.1
807 0.1
808 0.09
809 0.08
810 0.08
811 0.09
812 0.09
813 0.08
814 0.08
815 0.1
816 0.1
817 0.1
818 0.1
819 0.1
820 0.15
821 0.15
822 0.14
823 0.13
824 0.13
825 0.12
826 0.12
827 0.11
828 0.06
829 0.07
830 0.09
831 0.09
832 0.1
833 0.1
834 0.1
835 0.11
836 0.11
837 0.14
838 0.13
839 0.17
840 0.18
841 0.2
842 0.23
843 0.28
844 0.31
845 0.31
846 0.33
847 0.3
848 0.28
849 0.27
850 0.27
851 0.21
852 0.18
853 0.14
854 0.12
855 0.11
856 0.11
857 0.09
858 0.06
859 0.06
860 0.06
861 0.07
862 0.07
863 0.06
864 0.06
865 0.07
866 0.09
867 0.08
868 0.09
869 0.09
870 0.09
871 0.09
872 0.11
873 0.13
874 0.11
875 0.13
876 0.16
877 0.15
878 0.16
879 0.17
880 0.17
881 0.16
882 0.17
883 0.22
884 0.2
885 0.21
886 0.27
887 0.33
888 0.32
889 0.34
890 0.35
891 0.34
892 0.35
893 0.37
894 0.32
895 0.31
896 0.31
897 0.3
898 0.29
899 0.25
900 0.23
901 0.21
902 0.2
903 0.15
904 0.16
905 0.14
906 0.14
907 0.13
908 0.13
909 0.14
910 0.15
911 0.15
912 0.13
913 0.17
914 0.17
915 0.2
916 0.25
917 0.26
918 0.28
919 0.3
920 0.32
921 0.31
922 0.3
923 0.26
924 0.21
925 0.18
926 0.15
927 0.13
928 0.11
929 0.08
930 0.08
931 0.09
932 0.09
933 0.08
934 0.08
935 0.08
936 0.08
937 0.09
938 0.1
939 0.1
940 0.1
941 0.11
942 0.11
943 0.12
944 0.15
945 0.15
946 0.13
947 0.13
948 0.15
949 0.17
950 0.18
951 0.22
952 0.22
953 0.23
954 0.23
955 0.24
956 0.21
957 0.19
958 0.17
959 0.13
960 0.09
961 0.07
962 0.07
963 0.05
964 0.05
965 0.05
966 0.08
967 0.07
968 0.07
969 0.07
970 0.07
971 0.07
972 0.08
973 0.08
974 0.06
975 0.06
976 0.08
977 0.09
978 0.09
979 0.09
980 0.08
981 0.08
982 0.07
983 0.07
984 0.08
985 0.13
986 0.17
987 0.18
988 0.2
989 0.21
990 0.23
991 0.25
992 0.24
993 0.19
994 0.17
995 0.17
996 0.16
997 0.16
998 0.14
999 0.13
1000 0.12
1001 0.11
1002 0.11
1003 0.11
1004 0.13
1005 0.12
1006 0.12
1007 0.11
1008 0.11
1009 0.11
1010 0.1
1011 0.09
1012 0.07
1013 0.07
1014 0.06
1015 0.06
1016 0.07
1017 0.07
1018 0.09
1019 0.09
1020 0.09
1021 0.11
1022 0.12
1023 0.14
1024 0.14
1025 0.14
1026 0.12
1027 0.12
1028 0.11
1029 0.09
1030 0.09
1031 0.07
1032 0.07
1033 0.07
1034 0.07
1035 0.07
1036 0.09
1037 0.1
1038 0.12
1039 0.17
1040 0.22
1041 0.25
1042 0.29
1043 0.3
1044 0.3
1045 0.32
1046 0.34
1047 0.31
1048 0.29
1049 0.28
1050 0.3
1051 0.35
1052 0.43
1053 0.51
1054 0.53
1055 0.54
1056 0.52
1057 0.5
1058 0.46
1059 0.42
1060 0.32
1061 0.23
1062 0.17
1063 0.13
1064 0.13
1065 0.12
1066 0.1
1067 0.08
1068 0.08
1069 0.08
1070 0.08
1071 0.1
1072 0.1
1073 0.11
1074 0.12
1075 0.13
1076 0.18
1077 0.2
1078 0.23
1079 0.22
1080 0.24
1081 0.3
1082 0.3
1083 0.3
1084 0.26
1085 0.27
1086 0.24
1087 0.25
1088 0.28
1089 0.27
1090 0.34
1091 0.35
1092 0.35
1093 0.35
1094 0.35
1095 0.34
1096 0.28
1097 0.23
1098 0.16
1099 0.15
1100 0.15
1101 0.1
1102 0.1
1103 0.09
1104 0.09
1105 0.09
1106 0.08
1107 0.07
1108 0.07
1109 0.06