Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A5C3EF04

Protein Details
Accession A0A5C3EF04    Localization Confidence Low Confidence Score 9.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MGRKKIKIQPIKEDRNRSVTHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 13.333, cyto 5, cyto_mito 4.499
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR033896  MADS_MEF2-like  
IPR002100  TF_MADSbox  
IPR036879  TF_MADSbox_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046983  F:protein dimerization activity  
GO:0000977  F:RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
GO:0045944  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF00319  SRF-TF  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50066  MADS_BOX_2  
CDD cd00265  MADS_MEF2_like  
Amino Acid Sequences MGRKKIKIQPIKEDRNRSVTYLKRKAGLFKKAHELAVLTDSQVAVIVFGHNGKLAEFCSTDIDLLLLRYTEYEGAAERKGPQNYLNLDKDSDDNDDGDNDNDDNDNASGDGPDDDFTGHSGSNSGGGSGSNGRSAGRVSGTKRKAEPPSPPRNNKLNGSNAQALGAFGMPNGLMGMGASSTAKQTINAAIRQKSQNRTAASMALPGQMPGQGVFDPLSFGQSFMPAAAMPPHSMVGAPAGNMAAMVGNNNMMGQGAPSANPTRAEAIASMSIPMPTNDRVPIFVSPATPGFGFTPGGTVTTPGGRRFSFSDVLTRGSSGSMMQRPVTANSLLGPTFFQNGAFSLSASPQPAFNSISPSMSPQPPQDPSLSAATAAAAFAAKGAMERDAASLRSGVGASPTPFPDLRSNAHLMSRPASTGVQRSVAPTYGQVTYASAAAAAVGDANNLASPAHIVRPFTASGNLEAPSTSTHLVPPVAGFQGSLGAHGLHANTASPAPHPGVPNTFNANAFVGADLKPSATPLGSQASSATPELVQARNTAAPGAGLAASASRSSISTDEETPPGNGNALNTLIPDSGKLDASWLSLGQGMDQKSAQAMSGQANLVQPVPINATQTLGSVPFDLSFPAQPTQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.81
2 0.8
3 0.75
4 0.67
5 0.66
6 0.63
7 0.65
8 0.65
9 0.63
10 0.6
11 0.6
12 0.66
13 0.66
14 0.68
15 0.63
16 0.59
17 0.65
18 0.63
19 0.62
20 0.53
21 0.45
22 0.37
23 0.34
24 0.29
25 0.2
26 0.17
27 0.16
28 0.15
29 0.14
30 0.11
31 0.07
32 0.07
33 0.07
34 0.07
35 0.08
36 0.09
37 0.09
38 0.1
39 0.1
40 0.11
41 0.11
42 0.13
43 0.13
44 0.14
45 0.16
46 0.16
47 0.16
48 0.15
49 0.15
50 0.12
51 0.12
52 0.12
53 0.08
54 0.07
55 0.08
56 0.09
57 0.09
58 0.09
59 0.09
60 0.11
61 0.14
62 0.15
63 0.16
64 0.19
65 0.25
66 0.26
67 0.28
68 0.28
69 0.33
70 0.37
71 0.43
72 0.44
73 0.38
74 0.38
75 0.37
76 0.36
77 0.31
78 0.3
79 0.23
80 0.2
81 0.18
82 0.19
83 0.18
84 0.17
85 0.17
86 0.12
87 0.12
88 0.12
89 0.11
90 0.11
91 0.1
92 0.1
93 0.08
94 0.08
95 0.08
96 0.08
97 0.09
98 0.07
99 0.08
100 0.08
101 0.08
102 0.08
103 0.09
104 0.1
105 0.09
106 0.08
107 0.09
108 0.08
109 0.1
110 0.1
111 0.09
112 0.08
113 0.08
114 0.1
115 0.13
116 0.13
117 0.12
118 0.12
119 0.12
120 0.13
121 0.14
122 0.14
123 0.14
124 0.18
125 0.22
126 0.32
127 0.36
128 0.41
129 0.44
130 0.49
131 0.54
132 0.55
133 0.6
134 0.61
135 0.68
136 0.73
137 0.76
138 0.75
139 0.76
140 0.75
141 0.7
142 0.67
143 0.64
144 0.57
145 0.56
146 0.53
147 0.44
148 0.4
149 0.34
150 0.27
151 0.19
152 0.15
153 0.09
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.03
161 0.03
162 0.03
163 0.03
164 0.03
165 0.04
166 0.04
167 0.05
168 0.07
169 0.07
170 0.07
171 0.09
172 0.15
173 0.18
174 0.23
175 0.28
176 0.29
177 0.34
178 0.41
179 0.46
180 0.45
181 0.47
182 0.49
183 0.46
184 0.46
185 0.42
186 0.38
187 0.32
188 0.29
189 0.24
190 0.19
191 0.17
192 0.14
193 0.13
194 0.11
195 0.11
196 0.08
197 0.09
198 0.07
199 0.08
200 0.08
201 0.08
202 0.08
203 0.08
204 0.1
205 0.09
206 0.09
207 0.09
208 0.09
209 0.09
210 0.07
211 0.08
212 0.05
213 0.06
214 0.08
215 0.08
216 0.08
217 0.09
218 0.09
219 0.08
220 0.08
221 0.08
222 0.08
223 0.08
224 0.07
225 0.07
226 0.06
227 0.06
228 0.06
229 0.06
230 0.04
231 0.03
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.04
238 0.04
239 0.04
240 0.03
241 0.05
242 0.05
243 0.05
244 0.07
245 0.09
246 0.1
247 0.1
248 0.11
249 0.11
250 0.11
251 0.12
252 0.1
253 0.11
254 0.11
255 0.1
256 0.1
257 0.08
258 0.08
259 0.08
260 0.08
261 0.09
262 0.09
263 0.1
264 0.11
265 0.11
266 0.12
267 0.13
268 0.14
269 0.13
270 0.13
271 0.12
272 0.12
273 0.12
274 0.12
275 0.1
276 0.1
277 0.09
278 0.09
279 0.09
280 0.08
281 0.08
282 0.07
283 0.08
284 0.07
285 0.07
286 0.07
287 0.1
288 0.12
289 0.12
290 0.14
291 0.13
292 0.15
293 0.17
294 0.2
295 0.19
296 0.18
297 0.21
298 0.2
299 0.22
300 0.21
301 0.19
302 0.16
303 0.12
304 0.12
305 0.08
306 0.11
307 0.11
308 0.12
309 0.12
310 0.13
311 0.14
312 0.15
313 0.16
314 0.13
315 0.1
316 0.1
317 0.11
318 0.1
319 0.09
320 0.09
321 0.07
322 0.08
323 0.08
324 0.08
325 0.07
326 0.07
327 0.09
328 0.09
329 0.09
330 0.08
331 0.09
332 0.1
333 0.1
334 0.1
335 0.08
336 0.09
337 0.11
338 0.12
339 0.12
340 0.16
341 0.16
342 0.17
343 0.16
344 0.18
345 0.2
346 0.19
347 0.2
348 0.17
349 0.21
350 0.22
351 0.23
352 0.21
353 0.19
354 0.2
355 0.21
356 0.19
357 0.15
358 0.13
359 0.11
360 0.1
361 0.08
362 0.06
363 0.03
364 0.03
365 0.03
366 0.03
367 0.03
368 0.03
369 0.04
370 0.04
371 0.05
372 0.06
373 0.07
374 0.08
375 0.09
376 0.09
377 0.09
378 0.08
379 0.08
380 0.08
381 0.06
382 0.07
383 0.08
384 0.09
385 0.11
386 0.12
387 0.14
388 0.14
389 0.17
390 0.2
391 0.21
392 0.22
393 0.24
394 0.26
395 0.25
396 0.27
397 0.27
398 0.24
399 0.23
400 0.21
401 0.17
402 0.16
403 0.16
404 0.16
405 0.16
406 0.17
407 0.17
408 0.16
409 0.18
410 0.18
411 0.18
412 0.16
413 0.14
414 0.15
415 0.13
416 0.13
417 0.12
418 0.11
419 0.1
420 0.1
421 0.09
422 0.06
423 0.06
424 0.05
425 0.04
426 0.03
427 0.03
428 0.03
429 0.03
430 0.03
431 0.03
432 0.03
433 0.04
434 0.04
435 0.03
436 0.04
437 0.06
438 0.1
439 0.11
440 0.12
441 0.13
442 0.16
443 0.17
444 0.17
445 0.2
446 0.16
447 0.17
448 0.18
449 0.18
450 0.15
451 0.14
452 0.14
453 0.11
454 0.13
455 0.12
456 0.1
457 0.1
458 0.12
459 0.12
460 0.12
461 0.11
462 0.11
463 0.11
464 0.1
465 0.09
466 0.08
467 0.12
468 0.12
469 0.12
470 0.1
471 0.09
472 0.09
473 0.1
474 0.1
475 0.06
476 0.07
477 0.07
478 0.07
479 0.08
480 0.08
481 0.08
482 0.1
483 0.12
484 0.15
485 0.17
486 0.19
487 0.24
488 0.25
489 0.28
490 0.3
491 0.3
492 0.27
493 0.27
494 0.25
495 0.2
496 0.18
497 0.15
498 0.12
499 0.1
500 0.11
501 0.1
502 0.09
503 0.09
504 0.1
505 0.1
506 0.08
507 0.09
508 0.1
509 0.16
510 0.15
511 0.15
512 0.16
513 0.16
514 0.18
515 0.18
516 0.16
517 0.11
518 0.13
519 0.17
520 0.17
521 0.17
522 0.15
523 0.18
524 0.19
525 0.19
526 0.17
527 0.13
528 0.11
529 0.11
530 0.11
531 0.08
532 0.06
533 0.06
534 0.06
535 0.07
536 0.07
537 0.07
538 0.06
539 0.06
540 0.09
541 0.1
542 0.13
543 0.16
544 0.19
545 0.22
546 0.23
547 0.24
548 0.24
549 0.25
550 0.21
551 0.19
552 0.17
553 0.15
554 0.15
555 0.15
556 0.14
557 0.12
558 0.14
559 0.13
560 0.13
561 0.13
562 0.12
563 0.12
564 0.13
565 0.12
566 0.12
567 0.13
568 0.14
569 0.14
570 0.13
571 0.12
572 0.14
573 0.14
574 0.14
575 0.19
576 0.18
577 0.19
578 0.19
579 0.19
580 0.17
581 0.18
582 0.15
583 0.12
584 0.13
585 0.14
586 0.17
587 0.17
588 0.18
589 0.19
590 0.2
591 0.19
592 0.17
593 0.14
594 0.12
595 0.17
596 0.17
597 0.19
598 0.18
599 0.19
600 0.19
601 0.19
602 0.19
603 0.15
604 0.15
605 0.13
606 0.13
607 0.12
608 0.12
609 0.13
610 0.14
611 0.15