Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3DWJ6

Protein Details
Accession A0A5C3DWJ6    Localization Confidence High Confidence Score 21.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
373-395AAARLQKRRLKRKELSTGKPRRPBasic
486-507NGEPVRRKKRRINPLRKAHTVSBasic
879-909VIRRRLGKKAGGKAGKKRRNTTRKNSTSTPAHydrophilic
939-958PPSIGSRKSTRSTRNRAASVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
138-140RRP
362-394KAARAAKRRLQAAARLQKRRLKRKELSTGKPRR
491-501RRKKRRINPLR
881-902RRRLGKKAGGKAGKKRRNTTRK
Subcellular Location(s) mito 14, nucl 11
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR001005  SANT/Myb  
IPR039467  TFIIIB_B''_Myb  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PF15963  Myb_DNA-bind_7  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
CDD cd00084  HMG-box_SF  
cd00167  SANT  
Amino Acid Sequences MSSRIEKGGARFKPSIVPRRSAGGATSAAGASSSSSATSQPTSQQPAGSSSGPPPTSSQRQARPPSVRSKAPIVAAPLATTSAAAVSQPTATPSRSQSYAFNVSPSVISKAGPPAATRTGITAEGPSASGAKAKPVFRRPSVSKPRPGSRASLTPAPQFSYPATAMQIGASAQPSGSSNAVEAPAATTESLDDDAELTELSARSIAPPSIGGSRSARNANAGSIRTGAGRSTASTSESATATVVDKASQPDPFQAPQRPARTRGATTAQSDVLSAIKESASQQEANANMRPQKRAPPASSAADASTLDANENTAAAASSTKGKGREMTDVDHASRARSTPQSIKPGSQAAPEPAREETEEEKAARAAKRRLQAAARLQKRRLKRKELSTGKPRRPLSAYLLFVNSVRADRQAQNPEMSLTQLTSEIAAEWRDLDPAQRTKWEAEASLNRQQYDSALESWKLAHPDGVSLGPEDESDMETTSEIDDNGEPVRRKKRRINPLRKAHTVSDDEEEYRKQMYEEGPQLAASRPDPSNVTMADISTVEYKKGRAGPRTFEADRVYKRLVNDRRAAARSAVLGEHVLGEKENNLSPSPAPAAARVVRTTNGAPVEVDAEEVLDGEEEEVGDQTGDDDDDASEPETDADGTTDGEGGASSSRRARNKREASVAGTDVSFNENRFAVQTRIVDGKIVIDETSLFANYGNGEDDRDNMEVVDEREGDRFVNASTYSRKLARNRKWSADETAKFYHSLQQWGTDFEMIARLFPGRDRVMIKKKFNVEERSNAKLVDEALRNSVPVNLEAYAQAIGVDLSGPPPEIKADLQDIEALTANATDAAIKKREGTAPIGGKRGERSDAEDNDNDDDGYEYEEVVEIDDDGNEQVIRRRLGKKAGGKAGKKRRNTTRKNSTSTPAPPAPQPAATSSSSNAVDQDAAEGTGRAGGPPSIGSRKSTRSTRNRAASVNNSSREAPGDGMEVEEIVSEL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.59
3 0.54
4 0.55
5 0.5
6 0.53
7 0.54
8 0.46
9 0.38
10 0.32
11 0.28
12 0.24
13 0.24
14 0.18
15 0.15
16 0.14
17 0.13
18 0.09
19 0.09
20 0.08
21 0.08
22 0.08
23 0.1
24 0.12
25 0.15
26 0.16
27 0.2
28 0.26
29 0.33
30 0.34
31 0.36
32 0.34
33 0.36
34 0.38
35 0.34
36 0.3
37 0.27
38 0.33
39 0.31
40 0.31
41 0.3
42 0.35
43 0.42
44 0.48
45 0.53
46 0.54
47 0.63
48 0.7
49 0.76
50 0.76
51 0.74
52 0.76
53 0.74
54 0.72
55 0.66
56 0.65
57 0.59
58 0.54
59 0.5
60 0.45
61 0.42
62 0.36
63 0.32
64 0.26
65 0.22
66 0.19
67 0.16
68 0.11
69 0.07
70 0.07
71 0.06
72 0.07
73 0.07
74 0.08
75 0.08
76 0.11
77 0.14
78 0.15
79 0.19
80 0.22
81 0.26
82 0.28
83 0.29
84 0.29
85 0.34
86 0.41
87 0.37
88 0.34
89 0.3
90 0.29
91 0.29
92 0.27
93 0.23
94 0.16
95 0.16
96 0.17
97 0.21
98 0.24
99 0.23
100 0.22
101 0.24
102 0.27
103 0.29
104 0.26
105 0.23
106 0.22
107 0.22
108 0.22
109 0.17
110 0.14
111 0.13
112 0.13
113 0.12
114 0.1
115 0.09
116 0.12
117 0.12
118 0.18
119 0.23
120 0.28
121 0.36
122 0.45
123 0.52
124 0.53
125 0.62
126 0.62
127 0.67
128 0.74
129 0.74
130 0.74
131 0.75
132 0.78
133 0.76
134 0.72
135 0.66
136 0.61
137 0.6
138 0.55
139 0.54
140 0.49
141 0.48
142 0.47
143 0.44
144 0.38
145 0.33
146 0.28
147 0.26
148 0.24
149 0.2
150 0.2
151 0.18
152 0.17
153 0.15
154 0.15
155 0.1
156 0.11
157 0.1
158 0.08
159 0.07
160 0.08
161 0.09
162 0.11
163 0.11
164 0.1
165 0.09
166 0.11
167 0.12
168 0.11
169 0.1
170 0.09
171 0.08
172 0.09
173 0.09
174 0.07
175 0.07
176 0.08
177 0.09
178 0.08
179 0.07
180 0.07
181 0.07
182 0.08
183 0.07
184 0.06
185 0.07
186 0.07
187 0.07
188 0.07
189 0.07
190 0.08
191 0.11
192 0.11
193 0.09
194 0.1
195 0.12
196 0.15
197 0.16
198 0.18
199 0.19
200 0.21
201 0.25
202 0.27
203 0.25
204 0.25
205 0.25
206 0.25
207 0.27
208 0.25
209 0.22
210 0.21
211 0.21
212 0.18
213 0.18
214 0.14
215 0.12
216 0.11
217 0.11
218 0.13
219 0.14
220 0.15
221 0.15
222 0.16
223 0.16
224 0.15
225 0.14
226 0.11
227 0.11
228 0.1
229 0.11
230 0.1
231 0.09
232 0.1
233 0.13
234 0.15
235 0.16
236 0.16
237 0.19
238 0.22
239 0.24
240 0.28
241 0.31
242 0.35
243 0.41
244 0.49
245 0.49
246 0.5
247 0.55
248 0.54
249 0.5
250 0.5
251 0.48
252 0.43
253 0.41
254 0.39
255 0.33
256 0.28
257 0.26
258 0.21
259 0.16
260 0.12
261 0.1
262 0.08
263 0.06
264 0.07
265 0.08
266 0.11
267 0.13
268 0.13
269 0.13
270 0.16
271 0.18
272 0.2
273 0.22
274 0.21
275 0.25
276 0.28
277 0.31
278 0.3
279 0.37
280 0.43
281 0.48
282 0.47
283 0.48
284 0.5
285 0.49
286 0.48
287 0.4
288 0.31
289 0.25
290 0.23
291 0.17
292 0.13
293 0.1
294 0.09
295 0.08
296 0.08
297 0.07
298 0.07
299 0.05
300 0.04
301 0.04
302 0.04
303 0.04
304 0.05
305 0.08
306 0.1
307 0.13
308 0.14
309 0.15
310 0.19
311 0.21
312 0.27
313 0.26
314 0.28
315 0.3
316 0.32
317 0.32
318 0.31
319 0.29
320 0.23
321 0.21
322 0.19
323 0.18
324 0.18
325 0.21
326 0.26
327 0.32
328 0.39
329 0.4
330 0.4
331 0.39
332 0.41
333 0.37
334 0.32
335 0.27
336 0.23
337 0.25
338 0.24
339 0.23
340 0.2
341 0.2
342 0.18
343 0.2
344 0.18
345 0.18
346 0.19
347 0.18
348 0.18
349 0.18
350 0.22
351 0.21
352 0.25
353 0.27
354 0.31
355 0.35
356 0.37
357 0.39
358 0.38
359 0.42
360 0.46
361 0.5
362 0.53
363 0.54
364 0.57
365 0.59
366 0.66
367 0.7
368 0.69
369 0.69
370 0.69
371 0.72
372 0.78
373 0.81
374 0.81
375 0.81
376 0.82
377 0.79
378 0.79
379 0.71
380 0.64
381 0.58
382 0.52
383 0.48
384 0.46
385 0.4
386 0.34
387 0.33
388 0.3
389 0.26
390 0.24
391 0.17
392 0.1
393 0.09
394 0.1
395 0.12
396 0.15
397 0.21
398 0.26
399 0.27
400 0.27
401 0.27
402 0.26
403 0.23
404 0.21
405 0.15
406 0.09
407 0.08
408 0.07
409 0.07
410 0.06
411 0.06
412 0.05
413 0.06
414 0.06
415 0.05
416 0.06
417 0.06
418 0.07
419 0.07
420 0.08
421 0.13
422 0.16
423 0.17
424 0.18
425 0.19
426 0.19
427 0.22
428 0.21
429 0.17
430 0.18
431 0.23
432 0.26
433 0.32
434 0.33
435 0.3
436 0.29
437 0.28
438 0.24
439 0.22
440 0.18
441 0.13
442 0.13
443 0.13
444 0.13
445 0.14
446 0.15
447 0.13
448 0.11
449 0.11
450 0.09
451 0.09
452 0.1
453 0.1
454 0.08
455 0.07
456 0.08
457 0.06
458 0.06
459 0.06
460 0.05
461 0.05
462 0.05
463 0.06
464 0.06
465 0.05
466 0.06
467 0.06
468 0.06
469 0.05
470 0.06
471 0.05
472 0.06
473 0.07
474 0.1
475 0.1
476 0.15
477 0.26
478 0.3
479 0.36
480 0.45
481 0.54
482 0.62
483 0.72
484 0.79
485 0.79
486 0.85
487 0.86
488 0.8
489 0.75
490 0.65
491 0.59
492 0.5
493 0.41
494 0.33
495 0.27
496 0.23
497 0.21
498 0.19
499 0.15
500 0.13
501 0.11
502 0.09
503 0.11
504 0.11
505 0.15
506 0.18
507 0.18
508 0.18
509 0.18
510 0.19
511 0.17
512 0.16
513 0.11
514 0.12
515 0.11
516 0.11
517 0.12
518 0.13
519 0.14
520 0.13
521 0.15
522 0.11
523 0.11
524 0.11
525 0.1
526 0.09
527 0.11
528 0.11
529 0.1
530 0.1
531 0.11
532 0.13
533 0.19
534 0.23
535 0.27
536 0.3
537 0.34
538 0.37
539 0.44
540 0.41
541 0.38
542 0.37
543 0.35
544 0.34
545 0.33
546 0.32
547 0.27
548 0.28
549 0.35
550 0.38
551 0.38
552 0.41
553 0.41
554 0.44
555 0.44
556 0.44
557 0.35
558 0.29
559 0.24
560 0.2
561 0.16
562 0.11
563 0.09
564 0.08
565 0.08
566 0.07
567 0.06
568 0.05
569 0.05
570 0.06
571 0.07
572 0.08
573 0.09
574 0.09
575 0.1
576 0.1
577 0.12
578 0.12
579 0.12
580 0.11
581 0.11
582 0.14
583 0.15
584 0.17
585 0.16
586 0.16
587 0.16
588 0.17
589 0.17
590 0.17
591 0.15
592 0.14
593 0.13
594 0.12
595 0.13
596 0.1
597 0.1
598 0.06
599 0.06
600 0.05
601 0.05
602 0.05
603 0.03
604 0.03
605 0.03
606 0.03
607 0.03
608 0.03
609 0.03
610 0.03
611 0.03
612 0.03
613 0.03
614 0.04
615 0.04
616 0.03
617 0.04
618 0.04
619 0.05
620 0.05
621 0.06
622 0.06
623 0.06
624 0.06
625 0.06
626 0.06
627 0.06
628 0.06
629 0.05
630 0.05
631 0.05
632 0.05
633 0.05
634 0.05
635 0.04
636 0.04
637 0.05
638 0.05
639 0.07
640 0.12
641 0.18
642 0.25
643 0.31
644 0.39
645 0.49
646 0.57
647 0.61
648 0.63
649 0.6
650 0.57
651 0.55
652 0.48
653 0.37
654 0.29
655 0.24
656 0.17
657 0.17
658 0.14
659 0.11
660 0.11
661 0.1
662 0.1
663 0.12
664 0.14
665 0.13
666 0.16
667 0.16
668 0.17
669 0.19
670 0.19
671 0.18
672 0.16
673 0.15
674 0.12
675 0.12
676 0.09
677 0.07
678 0.07
679 0.07
680 0.08
681 0.07
682 0.06
683 0.06
684 0.07
685 0.07
686 0.07
687 0.08
688 0.07
689 0.09
690 0.09
691 0.11
692 0.13
693 0.13
694 0.12
695 0.1
696 0.11
697 0.11
698 0.12
699 0.13
700 0.11
701 0.12
702 0.13
703 0.13
704 0.13
705 0.11
706 0.11
707 0.08
708 0.1
709 0.1
710 0.12
711 0.16
712 0.18
713 0.21
714 0.25
715 0.31
716 0.38
717 0.48
718 0.55
719 0.61
720 0.65
721 0.7
722 0.71
723 0.69
724 0.68
725 0.67
726 0.6
727 0.55
728 0.52
729 0.46
730 0.41
731 0.38
732 0.37
733 0.29
734 0.31
735 0.25
736 0.27
737 0.27
738 0.28
739 0.29
740 0.22
741 0.2
742 0.15
743 0.2
744 0.14
745 0.13
746 0.12
747 0.11
748 0.11
749 0.12
750 0.18
751 0.14
752 0.18
753 0.22
754 0.3
755 0.4
756 0.49
757 0.53
758 0.54
759 0.6
760 0.63
761 0.67
762 0.67
763 0.62
764 0.63
765 0.63
766 0.62
767 0.56
768 0.48
769 0.41
770 0.33
771 0.3
772 0.27
773 0.24
774 0.2
775 0.23
776 0.23
777 0.23
778 0.22
779 0.23
780 0.17
781 0.15
782 0.15
783 0.12
784 0.12
785 0.12
786 0.13
787 0.11
788 0.09
789 0.08
790 0.06
791 0.06
792 0.05
793 0.05
794 0.04
795 0.05
796 0.05
797 0.06
798 0.06
799 0.07
800 0.08
801 0.1
802 0.1
803 0.12
804 0.16
805 0.16
806 0.17
807 0.18
808 0.17
809 0.16
810 0.17
811 0.14
812 0.1
813 0.09
814 0.08
815 0.06
816 0.06
817 0.06
818 0.09
819 0.13
820 0.16
821 0.16
822 0.18
823 0.22
824 0.26
825 0.27
826 0.29
827 0.33
828 0.39
829 0.42
830 0.45
831 0.42
832 0.4
833 0.41
834 0.4
835 0.36
836 0.29
837 0.32
838 0.36
839 0.39
840 0.43
841 0.41
842 0.4
843 0.39
844 0.38
845 0.31
846 0.22
847 0.19
848 0.14
849 0.14
850 0.12
851 0.09
852 0.09
853 0.09
854 0.09
855 0.09
856 0.09
857 0.06
858 0.06
859 0.07
860 0.07
861 0.07
862 0.08
863 0.07
864 0.08
865 0.13
866 0.18
867 0.21
868 0.27
869 0.32
870 0.37
871 0.46
872 0.54
873 0.57
874 0.61
875 0.69
876 0.71
877 0.74
878 0.79
879 0.82
880 0.81
881 0.81
882 0.81
883 0.83
884 0.84
885 0.87
886 0.88
887 0.88
888 0.89
889 0.88
890 0.83
891 0.78
892 0.76
893 0.71
894 0.68
895 0.62
896 0.55
897 0.5
898 0.51
899 0.48
900 0.42
901 0.38
902 0.33
903 0.32
904 0.32
905 0.31
906 0.26
907 0.28
908 0.27
909 0.25
910 0.22
911 0.19
912 0.18
913 0.15
914 0.16
915 0.11
916 0.11
917 0.11
918 0.1
919 0.09
920 0.12
921 0.12
922 0.1
923 0.11
924 0.1
925 0.11
926 0.13
927 0.19
928 0.22
929 0.24
930 0.28
931 0.33
932 0.4
933 0.47
934 0.54
935 0.59
936 0.63
937 0.72
938 0.77
939 0.81
940 0.79
941 0.76
942 0.75
943 0.73
944 0.73
945 0.71
946 0.64
947 0.57
948 0.54
949 0.5
950 0.45
951 0.38
952 0.29
953 0.21
954 0.2
955 0.17
956 0.17
957 0.16
958 0.13
959 0.11