Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3DQH9

Protein Details
Accession A0A5C3DQH9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
23-57TTPRRKTKVKAPATPKTPRTPKTPKTPKVPKTTTIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
26-51RRKTKVKAPATPKTPRTPKTPKTPKV
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 11.5, cyto 4.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016032  Sig_transdc_resp-reg_C-effctor  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Amino Acid Sequences MSATPPPSNLPSDTSGATSLDPTTPRRKTKVKAPATPKTPRTPKTPKTPKVPKTTTIPKLEGNDRTEDDPRVVSITKTEEGPMTESAPQGENIFSTRTSPIPSSPRKLTPALQKTILALKMRGMSTKEVAVRINQNYKTVWAYINKTTKRKAEANADDAMKSEEMSDADKREAALVLKLAGCTTKDIAAQLDMNYKTLWAFFNQHQKAAGLPNVTRDPDL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.24
3 0.22
4 0.2
5 0.17
6 0.15
7 0.16
8 0.17
9 0.21
10 0.29
11 0.36
12 0.42
13 0.49
14 0.56
15 0.58
16 0.66
17 0.71
18 0.71
19 0.73
20 0.76
21 0.77
22 0.77
23 0.81
24 0.76
25 0.76
26 0.75
27 0.69
28 0.7
29 0.71
30 0.71
31 0.73
32 0.79
33 0.76
34 0.78
35 0.85
36 0.83
37 0.83
38 0.8
39 0.73
40 0.71
41 0.74
42 0.71
43 0.66
44 0.6
45 0.54
46 0.54
47 0.55
48 0.52
49 0.44
50 0.4
51 0.36
52 0.36
53 0.35
54 0.31
55 0.26
56 0.21
57 0.18
58 0.17
59 0.15
60 0.12
61 0.12
62 0.15
63 0.14
64 0.14
65 0.15
66 0.13
67 0.13
68 0.16
69 0.15
70 0.13
71 0.13
72 0.12
73 0.13
74 0.13
75 0.12
76 0.1
77 0.09
78 0.08
79 0.08
80 0.09
81 0.08
82 0.09
83 0.1
84 0.1
85 0.12
86 0.12
87 0.15
88 0.22
89 0.26
90 0.29
91 0.31
92 0.34
93 0.35
94 0.37
95 0.37
96 0.39
97 0.42
98 0.39
99 0.37
100 0.34
101 0.31
102 0.32
103 0.31
104 0.22
105 0.16
106 0.15
107 0.17
108 0.17
109 0.18
110 0.16
111 0.15
112 0.15
113 0.18
114 0.18
115 0.16
116 0.16
117 0.17
118 0.2
119 0.22
120 0.28
121 0.26
122 0.26
123 0.25
124 0.27
125 0.26
126 0.22
127 0.21
128 0.18
129 0.21
130 0.27
131 0.35
132 0.39
133 0.42
134 0.46
135 0.48
136 0.5
137 0.51
138 0.49
139 0.5
140 0.5
141 0.49
142 0.49
143 0.45
144 0.39
145 0.35
146 0.31
147 0.21
148 0.15
149 0.12
150 0.09
151 0.09
152 0.12
153 0.13
154 0.14
155 0.14
156 0.15
157 0.15
158 0.14
159 0.15
160 0.13
161 0.12
162 0.11
163 0.12
164 0.12
165 0.12
166 0.12
167 0.11
168 0.11
169 0.12
170 0.13
171 0.13
172 0.13
173 0.14
174 0.15
175 0.16
176 0.17
177 0.16
178 0.22
179 0.2
180 0.21
181 0.2
182 0.19
183 0.17
184 0.17
185 0.17
186 0.13
187 0.18
188 0.22
189 0.34
190 0.35
191 0.37
192 0.37
193 0.36
194 0.35
195 0.35
196 0.33
197 0.27
198 0.26
199 0.31
200 0.34