Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3EFD4

Protein Details
Accession A0A5C3EFD4    Localization Confidence Low Confidence Score 8.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
190-213SSSGKDQKDRSSRRKENVFKPHVSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 10, mito 6, cyto 5.5
Family & Domain DBs
Pfam View protein in Pfam  
PF13563  2_5_RNA_ligase2  
Amino Acid Sequences MQTSATAQAPTSAASQDLVGVLVILIKPSNKQDKQRYDQLQQLRRKHDQAFSRWLPHITLIPPFTLANPSKIEDSNSILDELIKIHELKLSQIAEAALQVCAKHETHSLLIDQVSTFPLRKYTNVHLRPFPTNFQDKSTRGSWQAVNGSSSQDKDADHSSRRIVGLQTELADAVTPLLRPSANTTSGDGSSSGKDQKDRSSRRKENVFKPHVSVGQSTSSKATWQLCRSAEKVLSGDSKAGEQSHGLLCDIDSVQLMIKQKGQEGPYHIHKQLLLSQR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.12
3 0.1
4 0.1
5 0.09
6 0.07
7 0.06
8 0.05
9 0.07
10 0.07
11 0.06
12 0.07
13 0.08
14 0.11
15 0.18
16 0.29
17 0.33
18 0.43
19 0.53
20 0.63
21 0.69
22 0.77
23 0.77
24 0.72
25 0.73
26 0.74
27 0.72
28 0.71
29 0.72
30 0.7
31 0.69
32 0.7
33 0.67
34 0.64
35 0.63
36 0.61
37 0.62
38 0.59
39 0.58
40 0.54
41 0.5
42 0.44
43 0.38
44 0.34
45 0.26
46 0.26
47 0.22
48 0.2
49 0.2
50 0.19
51 0.18
52 0.22
53 0.21
54 0.2
55 0.21
56 0.22
57 0.23
58 0.24
59 0.25
60 0.2
61 0.23
62 0.22
63 0.21
64 0.2
65 0.17
66 0.16
67 0.14
68 0.13
69 0.1
70 0.09
71 0.08
72 0.08
73 0.1
74 0.1
75 0.11
76 0.15
77 0.15
78 0.13
79 0.14
80 0.14
81 0.12
82 0.12
83 0.12
84 0.07
85 0.07
86 0.07
87 0.07
88 0.09
89 0.09
90 0.09
91 0.11
92 0.12
93 0.13
94 0.14
95 0.14
96 0.13
97 0.12
98 0.11
99 0.1
100 0.08
101 0.08
102 0.08
103 0.08
104 0.07
105 0.11
106 0.12
107 0.14
108 0.18
109 0.25
110 0.35
111 0.4
112 0.43
113 0.43
114 0.45
115 0.48
116 0.45
117 0.4
118 0.34
119 0.34
120 0.31
121 0.32
122 0.34
123 0.31
124 0.33
125 0.31
126 0.29
127 0.25
128 0.27
129 0.23
130 0.21
131 0.23
132 0.2
133 0.19
134 0.18
135 0.18
136 0.16
137 0.16
138 0.13
139 0.11
140 0.1
141 0.11
142 0.15
143 0.17
144 0.18
145 0.19
146 0.2
147 0.21
148 0.21
149 0.21
150 0.17
151 0.15
152 0.15
153 0.14
154 0.13
155 0.11
156 0.11
157 0.09
158 0.09
159 0.07
160 0.06
161 0.05
162 0.04
163 0.04
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.12
168 0.16
169 0.17
170 0.18
171 0.2
172 0.21
173 0.21
174 0.22
175 0.17
176 0.14
177 0.13
178 0.15
179 0.17
180 0.16
181 0.19
182 0.21
183 0.29
184 0.38
185 0.47
186 0.54
187 0.62
188 0.68
189 0.73
190 0.82
191 0.82
192 0.81
193 0.83
194 0.8
195 0.72
196 0.68
197 0.63
198 0.56
199 0.5
200 0.41
201 0.33
202 0.33
203 0.31
204 0.28
205 0.26
206 0.22
207 0.21
208 0.24
209 0.27
210 0.27
211 0.29
212 0.35
213 0.36
214 0.4
215 0.4
216 0.42
217 0.37
218 0.33
219 0.31
220 0.28
221 0.29
222 0.25
223 0.25
224 0.2
225 0.2
226 0.19
227 0.19
228 0.15
229 0.13
230 0.15
231 0.16
232 0.17
233 0.16
234 0.14
235 0.14
236 0.16
237 0.16
238 0.13
239 0.1
240 0.09
241 0.1
242 0.13
243 0.16
244 0.15
245 0.19
246 0.2
247 0.24
248 0.29
249 0.3
250 0.32
251 0.34
252 0.4
253 0.45
254 0.51
255 0.48
256 0.45
257 0.44
258 0.43