Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A5C3EFD4

Protein Details
Accession A0A5C3EFD4   
Localization Confidence Low
Confidence Score 8.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
190-213SSSGKDQKDRSSRRKENVFKPHVSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto 5.5, cyto_nucl 10, mito 6, nucl 13.5
Family & Domain DBs
Pfam View protein in Pfam  
PF13563  2_5_RNA_ligase2  
Amino Acid Sequences MQTSATAQAPTSAASQDLVGVLVILIKPSNKQDKQRYDQLQQLRRKHDQAFSRWLPHITLIPPFTLANPSKIEDSNSILDELIKIHELKLSQIAEAALQVCAKHETHSLLIDQVSTFPLRKYTNVHLRPFPTNFQDKSTRGSWQAVNGSSSQDKDADHSSRRIVGLQTELADAVTPLLRPSANTTSGDGSSSGKDQKDRSSRRKENVFKPHVSVGQSTSSKATWQLCRSAEKVLSGDSKAGEQSHGLLCDIDSVQLMIKQKGQEGPYHIHKQLLLSQR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.12
3 0.1
4 0.1
5 0.09
6 0.07
7 0.06
8 0.05
9 0.07
10 0.07
11 0.06
12 0.07
13 0.08
14 0.11
15 0.18
16 0.29
17 0.33
18 0.43
19 0.53
20 0.63
21 0.69
22 0.77
23 0.77
24 0.72
25 0.73
26 0.74
27 0.72
28 0.71
29 0.72
30 0.7
31 0.69
32 0.7
33 0.67
34 0.64
35 0.63
36 0.61
37 0.62
38 0.59
39 0.58
40 0.54
41 0.5
42 0.44
43 0.38
44 0.34
45 0.26
46 0.26
47 0.22
48 0.2
49 0.2
50 0.19
51 0.18
52 0.22
53 0.21
54 0.2
55 0.21
56 0.22
57 0.23
58 0.24
59 0.25
60 0.2
61 0.23
62 0.22
63 0.21
64 0.2
65 0.17
66 0.16
67 0.14
68 0.13
69 0.1
70 0.09
71 0.08
72 0.08
73 0.1
74 0.1
75 0.11
76 0.15
77 0.15
78 0.13
79 0.14
80 0.14
81 0.12
82 0.12
83 0.12
84 0.07
85 0.07
86 0.07
87 0.07
88 0.09
89 0.09
90 0.09
91 0.11
92 0.12
93 0.13
94 0.14
95 0.14
96 0.13
97 0.12
98 0.11
99 0.1
100 0.08
101 0.08
102 0.08
103 0.08
104 0.07
105 0.11
106 0.12
107 0.14
108 0.18
109 0.25
110 0.35
111 0.4
112 0.43
113 0.43
114 0.45
115 0.48
116 0.45
117 0.4
118 0.34
119 0.34
120 0.31
121 0.32
122 0.34
123 0.31
124 0.33
125 0.31
126 0.29
127 0.25
128 0.27
129 0.23
130 0.21
131 0.23
132 0.2
133 0.19
134 0.18
135 0.18
136 0.16
137 0.16
138 0.13
139 0.11
140 0.1
141 0.11
142 0.15
143 0.17
144 0.18
145 0.19
146 0.2
147 0.21
148 0.21
149 0.21
150 0.17
151 0.15
152 0.15
153 0.14
154 0.13
155 0.11
156 0.11
157 0.09
158 0.09
159 0.07
160 0.06
161 0.05
162 0.04
163 0.04
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.12
168 0.16
169 0.17
170 0.18
171 0.2
172 0.21
173 0.21
174 0.22
175 0.17
176 0.14
177 0.13
178 0.15
179 0.17
180 0.16
181 0.19
182 0.21
183 0.29
184 0.38
185 0.47
186 0.54
187 0.62
188 0.68
189 0.73
190 0.82
191 0.82
192 0.81
193 0.83
194 0.8
195 0.72
196 0.68
197 0.63
198 0.56
199 0.5
200 0.41
201 0.33
202 0.33
203 0.31
204 0.28
205 0.26
206 0.22
207 0.21
208 0.24
209 0.27
210 0.27
211 0.29
212 0.35
213 0.36
214 0.4
215 0.4
216 0.42
217 0.37
218 0.33
219 0.31
220 0.28
221 0.29
222 0.25
223 0.25
224 0.2
225 0.2
226 0.19
227 0.19
228 0.15
229 0.13
230 0.15
231 0.16
232 0.17
233 0.16
234 0.14
235 0.14
236 0.16
237 0.16
238 0.13
239 0.1
240 0.09
241 0.1
242 0.13
243 0.16
244 0.15
245 0.19
246 0.2
247 0.24
248 0.29
249 0.3
250 0.32
251 0.34
252 0.4
253 0.45
254 0.51
255 0.48
256 0.45
257 0.44
258 0.43