Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3DZ09

Protein Details
Accession A0A5C3DZ09    Localization Confidence High Confidence Score 27
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
171-193ASVQPAKDKKKPGRPRKDAAAAQHydrophilic
362-382AAPIPSPKKRGRPPKNAATATHydrophilic
400-423SSPVAAPAKKRGRPKKNVDPAAANHydrophilic
454-475AAPSSSGKKRGRPPKEKTEGEEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
135-142AKKRGRPS
176-217AKDKKKPGRPRKDAAAAQPAGVPPAPVAPAAKKRGRPPKDAA
239-245KKRGRPS
275-308PKKRGRPFKNATAAAAAPVAPVGPPAKKRGRPSK
366-376PSPKKRGRPPK
405-415APAKKRGRPKK
460-486GKKRGRPPKEKTEGEEVVKRPRGRPKK
517-526KKGRGRPKKN
Subcellular Location(s) nucl 26
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR000637  HMGI/Y_DNA-bd_CS  
IPR001510  Znf_PARP  
IPR036957  Znf_PARP_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF02178  AT_hook  
PF00645  zf-PARP  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00354  HMGI_Y  
PS50064  ZF_PARP_2  
Amino Acid Sequences MPYHIGYATSNRAGCKGPKPCAGTKILKGELRLGTLVEIQGSQSFSYRHFGCITPKIIRNIQEKDGITDPADLSGYEDLIPEDQARVARAFAEGHVASEDIPDSARYAAADDADKIAAEAAVLPPTSSASSEKSAKKRGRPSKASLEAAAAAAAAETSYQPAPVATAPNGASVQPAKDKKKPGRPRKDAAAAQPAGVPPAPVAPAAKKRGRPPKDAAAAPAAPAASVVPQPEAAALPQKKRGRPSKASLEAAAAANAAPAPTAPVAPSASAQASPKKRGRPFKNATAAAAAPVAPVGPPAKKRGRPSKASLEAAAVAAAGNASSPAARPPSNIASNGPDLPIGLTFGVFANNASPPPGWAPAAPIPSPKKRGRPPKNAATATQPSASAVPPSPPAPMGPSSPVAAPAKKRGRPKKNVDPAAANAASLSQVTTPPLPRTPMPLQLPVQASPSVVAAPSSSGKKRGRPPKEKTEGEEVVKRPRGRPKKVDAAAASASVPVQQPVSVAHAGQTDSAAPTKKGRGRPKKNT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.41
3 0.44
4 0.46
5 0.52
6 0.58
7 0.61
8 0.63
9 0.66
10 0.63
11 0.62
12 0.63
13 0.62
14 0.58
15 0.54
16 0.55
17 0.49
18 0.44
19 0.38
20 0.29
21 0.24
22 0.23
23 0.22
24 0.16
25 0.13
26 0.11
27 0.13
28 0.14
29 0.13
30 0.13
31 0.14
32 0.15
33 0.22
34 0.22
35 0.23
36 0.24
37 0.26
38 0.31
39 0.37
40 0.41
41 0.41
42 0.45
43 0.48
44 0.51
45 0.56
46 0.57
47 0.55
48 0.53
49 0.53
50 0.49
51 0.47
52 0.45
53 0.39
54 0.32
55 0.3
56 0.26
57 0.19
58 0.19
59 0.14
60 0.14
61 0.13
62 0.12
63 0.1
64 0.1
65 0.09
66 0.09
67 0.1
68 0.09
69 0.09
70 0.1
71 0.11
72 0.12
73 0.12
74 0.12
75 0.12
76 0.13
77 0.13
78 0.11
79 0.17
80 0.15
81 0.15
82 0.15
83 0.14
84 0.13
85 0.13
86 0.13
87 0.07
88 0.07
89 0.07
90 0.07
91 0.08
92 0.08
93 0.07
94 0.08
95 0.09
96 0.1
97 0.11
98 0.1
99 0.11
100 0.11
101 0.11
102 0.09
103 0.09
104 0.07
105 0.06
106 0.06
107 0.05
108 0.07
109 0.07
110 0.07
111 0.07
112 0.08
113 0.09
114 0.09
115 0.1
116 0.12
117 0.17
118 0.24
119 0.31
120 0.37
121 0.46
122 0.51
123 0.58
124 0.65
125 0.72
126 0.75
127 0.75
128 0.76
129 0.77
130 0.78
131 0.72
132 0.62
133 0.53
134 0.43
135 0.36
136 0.28
137 0.17
138 0.09
139 0.07
140 0.05
141 0.03
142 0.03
143 0.03
144 0.05
145 0.05
146 0.05
147 0.05
148 0.06
149 0.07
150 0.08
151 0.11
152 0.09
153 0.12
154 0.13
155 0.14
156 0.15
157 0.14
158 0.14
159 0.12
160 0.14
161 0.18
162 0.25
163 0.29
164 0.34
165 0.44
166 0.51
167 0.61
168 0.7
169 0.74
170 0.79
171 0.82
172 0.82
173 0.81
174 0.81
175 0.74
176 0.69
177 0.67
178 0.55
179 0.48
180 0.43
181 0.34
182 0.26
183 0.22
184 0.17
185 0.07
186 0.08
187 0.08
188 0.07
189 0.08
190 0.11
191 0.18
192 0.24
193 0.29
194 0.32
195 0.41
196 0.51
197 0.55
198 0.58
199 0.57
200 0.6
201 0.61
202 0.58
203 0.51
204 0.45
205 0.4
206 0.33
207 0.28
208 0.19
209 0.12
210 0.11
211 0.09
212 0.05
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.07
219 0.07
220 0.06
221 0.13
222 0.15
223 0.17
224 0.25
225 0.3
226 0.33
227 0.4
228 0.49
229 0.5
230 0.54
231 0.59
232 0.61
233 0.65
234 0.64
235 0.57
236 0.5
237 0.43
238 0.36
239 0.29
240 0.18
241 0.1
242 0.08
243 0.07
244 0.04
245 0.03
246 0.02
247 0.04
248 0.04
249 0.04
250 0.04
251 0.06
252 0.06
253 0.07
254 0.07
255 0.07
256 0.07
257 0.08
258 0.1
259 0.15
260 0.18
261 0.25
262 0.29
263 0.36
264 0.43
265 0.52
266 0.58
267 0.62
268 0.65
269 0.68
270 0.72
271 0.64
272 0.58
273 0.5
274 0.43
275 0.32
276 0.26
277 0.17
278 0.08
279 0.07
280 0.06
281 0.03
282 0.04
283 0.05
284 0.08
285 0.1
286 0.17
287 0.25
288 0.3
289 0.38
290 0.48
291 0.54
292 0.58
293 0.64
294 0.68
295 0.68
296 0.65
297 0.58
298 0.48
299 0.41
300 0.35
301 0.27
302 0.16
303 0.08
304 0.05
305 0.05
306 0.03
307 0.02
308 0.02
309 0.02
310 0.03
311 0.03
312 0.05
313 0.08
314 0.09
315 0.1
316 0.14
317 0.2
318 0.22
319 0.23
320 0.23
321 0.23
322 0.25
323 0.25
324 0.21
325 0.15
326 0.13
327 0.12
328 0.11
329 0.08
330 0.06
331 0.05
332 0.05
333 0.05
334 0.06
335 0.06
336 0.06
337 0.06
338 0.07
339 0.07
340 0.08
341 0.08
342 0.08
343 0.1
344 0.12
345 0.11
346 0.11
347 0.15
348 0.18
349 0.22
350 0.21
351 0.26
352 0.3
353 0.36
354 0.44
355 0.45
356 0.5
357 0.56
358 0.67
359 0.71
360 0.76
361 0.79
362 0.81
363 0.85
364 0.78
365 0.71
366 0.67
367 0.61
368 0.53
369 0.45
370 0.35
371 0.26
372 0.25
373 0.23
374 0.17
375 0.13
376 0.13
377 0.14
378 0.15
379 0.15
380 0.14
381 0.14
382 0.15
383 0.17
384 0.17
385 0.18
386 0.18
387 0.18
388 0.18
389 0.22
390 0.22
391 0.24
392 0.25
393 0.32
394 0.4
395 0.44
396 0.55
397 0.61
398 0.69
399 0.76
400 0.82
401 0.84
402 0.85
403 0.87
404 0.81
405 0.75
406 0.67
407 0.65
408 0.55
409 0.43
410 0.32
411 0.25
412 0.2
413 0.15
414 0.13
415 0.06
416 0.07
417 0.09
418 0.13
419 0.16
420 0.19
421 0.22
422 0.25
423 0.25
424 0.32
425 0.34
426 0.39
427 0.4
428 0.43
429 0.42
430 0.45
431 0.47
432 0.4
433 0.39
434 0.3
435 0.26
436 0.2
437 0.19
438 0.14
439 0.11
440 0.1
441 0.07
442 0.09
443 0.13
444 0.18
445 0.2
446 0.28
447 0.33
448 0.41
449 0.51
450 0.59
451 0.67
452 0.72
453 0.78
454 0.81
455 0.86
456 0.83
457 0.79
458 0.78
459 0.73
460 0.68
461 0.67
462 0.59
463 0.58
464 0.61
465 0.58
466 0.55
467 0.6
468 0.65
469 0.67
470 0.73
471 0.73
472 0.76
473 0.77
474 0.79
475 0.7
476 0.66
477 0.57
478 0.49
479 0.4
480 0.29
481 0.25
482 0.19
483 0.17
484 0.12
485 0.11
486 0.1
487 0.1
488 0.12
489 0.17
490 0.16
491 0.15
492 0.16
493 0.18
494 0.18
495 0.18
496 0.17
497 0.13
498 0.14
499 0.19
500 0.19
501 0.19
502 0.24
503 0.33
504 0.39
505 0.48
506 0.57
507 0.65