FuNGI

A0A5C3E870

Protein Details

Accession

A0A5C3E870

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
309-335	SDSDGGKKKKNNKKRVKKERKEDGSDD	Basic
347-393	VSSGKRKRSSSKSSSRKKSKSSKRSSQRSKSRSRSRSRSRSRAASSS	Hydrophilic
408-439	SSSDHGHRRRSSSKKNNKKKKRSSNGKSSSAA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
314-329	GKKKKNNKKRVKKERK
350-388	GKRKRSSSKSSSRKKSKSSKRSSQRSKSRSRSRSRSRSR
414-434	HRRRSSSKKNNKKKKRSSNGK

Subcellular Location(s)

nucl 17, mito_nucl 12.833, cyto_nucl 10.333, mito 7.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007832 RNA_pol_Rpc34 IPR016049 RNA_pol_Rpc34-like IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf IPR036390 WH_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05158 RNA_pol_Rpc34

Amino Acid Sequences

MPSARASSSLAAAAGSKLTKLESALYRAAQSAPGGVITQDQISEQFKHEQLDEQLQAINGLLKKSLFTAQTLNGSIQFAATAKAEASMMGKLDENETMVYSHIKDARNEGIWTKQLKARTGLHQTIINRCLKSLEQKQLVKAVKSVKYPTRKIYMLFGLTPSIELSGGPWYTDNELDTGFINELSMACLNYIRSKSFPKNGQSRALFPTSHTSQLPSASAVHSYLRSSGLTETELQVEHVVSLLDILVYDEQIEKIPVLPFSFGGGGINGFNQDDDDYSDSGSASSGSGSDSDSDSGSDSESSAEETGSDSDGGKKKKNNKKRVKKERKEDGSDDDEDSQDDDDGPVSSGKRKRSSSKSSSRKKSKSSKRSSQRSKSRSRSRSRSRSRAASSSEESGSESEASSASSSSSDHGHRRRSSSKKNNKKKKRSSNGKSSSAASRSSGFGGGGDIVPFVYRAVRPHSVKVGWTETPCGHCPVFDFCDDTGPVNAETCQYYGGKEDELGRKLTNGWIDTVAYDDDEDEEEEDEGEGDKDEAD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.13
2	0.12
3	0.11
4	0.1
5	0.11
6	0.12
7	0.13
8	0.18
9	0.2
10	0.25
11	0.28
12	0.29
13	0.29
14	0.3
15	0.29
16	0.25
17	0.21
18	0.17
19	0.14
20	0.13
21	0.12
22	0.11
23	0.12
24	0.11
25	0.11
26	0.1
27	0.1
28	0.12
29	0.16
30	0.18
31	0.19
32	0.24
33	0.25
34	0.27
35	0.28
36	0.3
37	0.31
38	0.36
39	0.34
40	0.29
41	0.29
42	0.26
43	0.26
44	0.2
45	0.21
46	0.15
47	0.14
48	0.15
49	0.13
50	0.14
51	0.16
52	0.2
53	0.17
54	0.17
55	0.21
56	0.23
57	0.27
58	0.28
59	0.27
60	0.24
61	0.23
62	0.21
63	0.17
64	0.14
65	0.1
66	0.1
67	0.09
68	0.09
69	0.08
70	0.09
71	0.09
72	0.08
73	0.1
74	0.09
75	0.09
76	0.1
77	0.11
78	0.1
79	0.12
80	0.12
81	0.11
82	0.11
83	0.11
84	0.1
85	0.1
86	0.11
87	0.11
88	0.15
89	0.19
90	0.21
91	0.22
92	0.26
93	0.3
94	0.31
95	0.32
96	0.29
97	0.29
98	0.32
99	0.33
100	0.32
101	0.31
102	0.32
103	0.34
104	0.37
105	0.37
106	0.39
107	0.46
108	0.45
109	0.44
110	0.44
111	0.44
112	0.46
113	0.47
114	0.44
115	0.35
116	0.33
117	0.33
118	0.3
119	0.37
120	0.38
121	0.42
122	0.45
123	0.47
124	0.49
125	0.55
126	0.56
127	0.48
128	0.44
129	0.43
130	0.39
131	0.4
132	0.45
133	0.44
134	0.5
135	0.53
136	0.54
137	0.53
138	0.5
139	0.47
140	0.46
141	0.43
142	0.36
143	0.33
144	0.28
145	0.23
146	0.21
147	0.2
148	0.15
149	0.1
150	0.07
151	0.06
152	0.06
153	0.09
154	0.09
155	0.09
156	0.09
157	0.1
158	0.11
159	0.12
160	0.11
161	0.09
162	0.09
163	0.09
164	0.09
165	0.09
166	0.08
167	0.07
168	0.07
169	0.06
170	0.06
171	0.07
172	0.07
173	0.06
174	0.06
175	0.07
176	0.07
177	0.12
178	0.13
179	0.13
180	0.15
181	0.22
182	0.27
183	0.34
184	0.4
185	0.44
186	0.51
187	0.54
188	0.59
189	0.54
190	0.53
191	0.5
192	0.46
193	0.38
194	0.3
195	0.33
196	0.27
197	0.28
198	0.24
199	0.22
200	0.2
201	0.22
202	0.21
203	0.15
204	0.13
205	0.11
206	0.12
207	0.11
208	0.11
209	0.1
210	0.1
211	0.1
212	0.1
213	0.1
214	0.1
215	0.1
216	0.1
217	0.1
218	0.11
219	0.1
220	0.1
221	0.1
222	0.09
223	0.09
224	0.08
225	0.07
226	0.06
227	0.05
228	0.04
229	0.04
230	0.03
231	0.03
232	0.03
233	0.03
234	0.03
235	0.03
236	0.04
237	0.04
238	0.04
239	0.05
240	0.05
241	0.05
242	0.06
243	0.07
244	0.07
245	0.08
246	0.08
247	0.08
248	0.08
249	0.09
250	0.07
251	0.06
252	0.06
253	0.06
254	0.05
255	0.05
256	0.04
257	0.04
258	0.04
259	0.04
260	0.04
261	0.04
262	0.05
263	0.07
264	0.07
265	0.07
266	0.07
267	0.07
268	0.07
269	0.07
270	0.06
271	0.04
272	0.04
273	0.04
274	0.04
275	0.04
276	0.05
277	0.06
278	0.06
279	0.06
280	0.07
281	0.07
282	0.07
283	0.07
284	0.07
285	0.06
286	0.06
287	0.06
288	0.06
289	0.06
290	0.06
291	0.06
292	0.05
293	0.06
294	0.06
295	0.06
296	0.07
297	0.06
298	0.11
299	0.17
300	0.2
301	0.23
302	0.29
303	0.39
304	0.49
305	0.59
306	0.65
307	0.71
308	0.8
309	0.87
310	0.93
311	0.94
312	0.94
313	0.94
314	0.94
315	0.91
316	0.87
317	0.78
318	0.73
319	0.66
320	0.58
321	0.49
322	0.39
323	0.3
324	0.23
325	0.21
326	0.15
327	0.1
328	0.08
329	0.06
330	0.06
331	0.06
332	0.07
333	0.07
334	0.08
335	0.15
336	0.19
337	0.25
338	0.32
339	0.36
340	0.44
341	0.52
342	0.61
343	0.64
344	0.71
345	0.75
346	0.79
347	0.85
348	0.87
349	0.85
350	0.85
351	0.85
352	0.86
353	0.86
354	0.86
355	0.86
356	0.86
357	0.9
358	0.91
359	0.91
360	0.91
361	0.89
362	0.89
363	0.89
364	0.9
365	0.88
366	0.88
367	0.88
368	0.88
369	0.9
370	0.9
371	0.9
372	0.86
373	0.85
374	0.8
375	0.76
376	0.7
377	0.65
378	0.57
379	0.51
380	0.44
381	0.35
382	0.31
383	0.24
384	0.21
385	0.15
386	0.12
387	0.09
388	0.08
389	0.08
390	0.08
391	0.07
392	0.07
393	0.07
394	0.07
395	0.08
396	0.11
397	0.15
398	0.23
399	0.29
400	0.38
401	0.41
402	0.48
403	0.57
404	0.64
405	0.71
406	0.74
407	0.79
408	0.81
409	0.88
410	0.92
411	0.94
412	0.95
413	0.95
414	0.95
415	0.96
416	0.96
417	0.94
418	0.95
419	0.92
420	0.88
421	0.79
422	0.71
423	0.67
424	0.58
425	0.5
426	0.4
427	0.33
428	0.27
429	0.26
430	0.23
431	0.16
432	0.14
433	0.13
434	0.12
435	0.11
436	0.09
437	0.08
438	0.07
439	0.07
440	0.07
441	0.06
442	0.08
443	0.09
444	0.12
445	0.19
446	0.27
447	0.3
448	0.35
449	0.41
450	0.4
451	0.41
452	0.43
453	0.42
454	0.38
455	0.37
456	0.37
457	0.33
458	0.37
459	0.37
460	0.36
461	0.3
462	0.26
463	0.27
464	0.29
465	0.29
466	0.25
467	0.26
468	0.22
469	0.27
470	0.28
471	0.27
472	0.22
473	0.21
474	0.2
475	0.18
476	0.18
477	0.15
478	0.15
479	0.14
480	0.15
481	0.13
482	0.14
483	0.16
484	0.17
485	0.16
486	0.17
487	0.24
488	0.29
489	0.31
490	0.33
491	0.3
492	0.3
493	0.3
494	0.33
495	0.31
496	0.25
497	0.25
498	0.24
499	0.24
500	0.23
501	0.23
502	0.19
503	0.14
504	0.13
505	0.11
506	0.11
507	0.11
508	0.12
509	0.1
510	0.11
511	0.1
512	0.11
513	0.1
514	0.09
515	0.09
516	0.09
517	0.08

A0A5C3E870

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer