Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1VC74

Protein Details
Accession H1VC74    Localization Confidence High Confidence Score 19.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
33-55GGGSAPRRRERERQENPRDSVRKBasic
77-96DTRRGPAPRRRRDEPEQRDFBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
17-49KTDGPRSRRGGGGGGGGGGSAPRRRERERQENP
85-85R
235-294SGNRSRSPIPRRRGAGGGGRRPGGRREGGGRDGGRDGGRDGGRDQEGERGGRSGREGRTR
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 15.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025715  FoP_C  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12418  RRM_Aly_REF_like  
Amino Acid Sequences MADKLDRSLDEILGEKKTDGPRSRRGGGGGGGGGGSAPRRRERERQENPRDSVRKSFRDEPRNLDSEWVHDRFEEHDTRRGPAPRRRRDEPEQRDFNSAKIRVENIHYELTPEDLEELFNRIGPVAKLDLKYDRAGRSEGIAFVTMESREDALEAVKEFDGANANGQPIRLSIMPGGPGPRSRNPFDSAVMPGRPLAERISVPGGRSRSMSPGRKYDVDEAASRGIDRYVPGNRSGNRSRSPIPRRRGAGGGGRRPGGRREGGGRDGGRDGGRDGGRDQEGERGGRSGREGRTRKTQEELDAEMADYFGGGNAGETAPQPNGGATAAAATPAVPATDDIDMIE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.2
3 0.24
4 0.3
5 0.38
6 0.43
7 0.47
8 0.54
9 0.61
10 0.64
11 0.6
12 0.56
13 0.51
14 0.44
15 0.4
16 0.31
17 0.24
18 0.2
19 0.16
20 0.14
21 0.11
22 0.11
23 0.12
24 0.16
25 0.22
26 0.29
27 0.35
28 0.46
29 0.56
30 0.64
31 0.72
32 0.79
33 0.83
34 0.86
35 0.84
36 0.84
37 0.79
38 0.71
39 0.7
40 0.68
41 0.64
42 0.62
43 0.67
44 0.66
45 0.72
46 0.72
47 0.69
48 0.67
49 0.63
50 0.56
51 0.51
52 0.41
53 0.37
54 0.39
55 0.34
56 0.27
57 0.24
58 0.25
59 0.23
60 0.28
61 0.3
62 0.26
63 0.32
64 0.33
65 0.35
66 0.41
67 0.45
68 0.48
69 0.5
70 0.58
71 0.61
72 0.68
73 0.72
74 0.74
75 0.77
76 0.8
77 0.8
78 0.8
79 0.77
80 0.71
81 0.71
82 0.63
83 0.57
84 0.54
85 0.46
86 0.38
87 0.32
88 0.31
89 0.27
90 0.3
91 0.3
92 0.25
93 0.25
94 0.23
95 0.22
96 0.2
97 0.2
98 0.16
99 0.12
100 0.1
101 0.08
102 0.09
103 0.08
104 0.11
105 0.09
106 0.1
107 0.1
108 0.09
109 0.1
110 0.09
111 0.11
112 0.11
113 0.14
114 0.14
115 0.16
116 0.19
117 0.2
118 0.23
119 0.25
120 0.24
121 0.22
122 0.23
123 0.21
124 0.2
125 0.19
126 0.17
127 0.14
128 0.12
129 0.1
130 0.1
131 0.1
132 0.08
133 0.08
134 0.07
135 0.07
136 0.06
137 0.06
138 0.06
139 0.05
140 0.06
141 0.06
142 0.07
143 0.06
144 0.07
145 0.06
146 0.07
147 0.09
148 0.08
149 0.09
150 0.08
151 0.09
152 0.09
153 0.09
154 0.08
155 0.06
156 0.08
157 0.07
158 0.07
159 0.07
160 0.08
161 0.08
162 0.09
163 0.1
164 0.09
165 0.12
166 0.15
167 0.2
168 0.24
169 0.26
170 0.28
171 0.3
172 0.31
173 0.3
174 0.27
175 0.25
176 0.24
177 0.21
178 0.18
179 0.15
180 0.15
181 0.14
182 0.13
183 0.11
184 0.1
185 0.1
186 0.12
187 0.16
188 0.16
189 0.16
190 0.2
191 0.2
192 0.19
193 0.2
194 0.2
195 0.22
196 0.3
197 0.36
198 0.36
199 0.4
200 0.43
201 0.44
202 0.46
203 0.43
204 0.39
205 0.34
206 0.31
207 0.27
208 0.25
209 0.23
210 0.2
211 0.15
212 0.11
213 0.1
214 0.09
215 0.11
216 0.15
217 0.17
218 0.2
219 0.26
220 0.28
221 0.35
222 0.4
223 0.42
224 0.41
225 0.45
226 0.47
227 0.51
228 0.59
229 0.61
230 0.62
231 0.63
232 0.63
233 0.62
234 0.58
235 0.53
236 0.52
237 0.52
238 0.52
239 0.48
240 0.46
241 0.44
242 0.43
243 0.42
244 0.38
245 0.31
246 0.27
247 0.3
248 0.33
249 0.35
250 0.39
251 0.36
252 0.33
253 0.32
254 0.31
255 0.26
256 0.21
257 0.19
258 0.2
259 0.2
260 0.19
261 0.19
262 0.22
263 0.22
264 0.22
265 0.22
266 0.22
267 0.24
268 0.24
269 0.24
270 0.21
271 0.2
272 0.21
273 0.24
274 0.25
275 0.28
276 0.37
277 0.42
278 0.45
279 0.55
280 0.6
281 0.59
282 0.59
283 0.57
284 0.53
285 0.53
286 0.52
287 0.44
288 0.38
289 0.35
290 0.29
291 0.24
292 0.17
293 0.12
294 0.08
295 0.05
296 0.04
297 0.04
298 0.04
299 0.05
300 0.06
301 0.06
302 0.07
303 0.1
304 0.1
305 0.11
306 0.11
307 0.1
308 0.11
309 0.1
310 0.1
311 0.07
312 0.09
313 0.08
314 0.08
315 0.08
316 0.07
317 0.07
318 0.07
319 0.07
320 0.06
321 0.07
322 0.09
323 0.1