FuNGI

A0A5C3DQR0

Protein Details

Accession

A0A5C3DQR0

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
54-81	NRERAAQNRAQKQKEKEKERKSGDDKSG	Basic
96-122	SGGGAKQQQQKKQHQPKREPVHKPAAE	Hydrophilic
383-405	GVEGKVKSKKSNKDKAKDKGQVV	Hydrophilic
409-437	EEAAAKAAKREKKKRKGKEKPTDNPNAGE	Basic
440-461	EGNTAKKQAKQQQQQLPPPKAS	Hydrophilic
471-505	QPPDPTGKGQTKPKPRPPRRKAPPKDKTNNSTPSQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
62-75	RAQKQKEKEKERKS
105-127	QKKQHQPKREPVHKPAAERQGKP
339-370	LKMAKLGSAAAAKKAKKAEKAAARAAAKGLVK
386-402	GKVKSKKSNKDKAKDKG
411-430	AAAKAAKREKKKRKGKEKPT
477-496	GKGQTKPKPRPPRRKAPPKD

Subcellular Location(s)

nucl 20, cyto_nucl 13.333, mito_nucl 10.833, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR039722 Upf3 IPR005120 UPF3_dom
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF03467 Smg4_UPF3
CDD	cd12455 RRM_like_Smg4_UPF3

Amino Acid Sequences

MSQQPQPQPQPEAGSSAPGPAATEAQTRNVRHQQSHRTHQQDKAADNRVKAQQNRERAAQNRAQKQKEKEKERKSGDDKSGQVKSQDDAAKPTPASGGGAKQQQQKKQHQPKREPVHKPAAERQGKPSANFKSKVVVRRLPPNLPEEVFWRAVSPWIRNVVDCQVVNSAASARGGDEGEASTSTVVQNAVTPTVDYKKFVAGKQKSDANKQNKHARAYLRFLDAESLVTFHKAFDGHIFRDSQGKESVAIVEFAPYQKVILTASGNRGRRTKPDPKQGTIEKDADYMAFVERLNKPVDEVKSERDVLASLWDPEHKERARIEAAEKGKSTPLLEHLRALKMAKLGSAAAAKKAKKAEKAAARAAAKGLVKGSGSNATPMVGVGVEGKVKSKKSNKDKAKDKGQVVTAEEEAAAKAAKREKKKRKGKEKPTDNPNAGEKSEGNTAKKQAKQQQQQLPPPKASANKNAEPAAQPPDPTGKGQTKPKPRPPRRKAPPKDKTNNSTPSQSTKIQILKRES

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.36
2	0.31
3	0.29
4	0.25
5	0.19
6	0.19
7	0.15
8	0.16
9	0.14
10	0.19
11	0.18
12	0.26
13	0.33
14	0.34
15	0.42
16	0.49
17	0.52
18	0.55
19	0.63
20	0.66
21	0.68
22	0.77
23	0.78
24	0.78
25	0.78
26	0.77
27	0.76
28	0.72
29	0.67
30	0.66
31	0.65
32	0.6
33	0.56
34	0.57
35	0.56
36	0.58
37	0.58
38	0.6
39	0.58
40	0.64
41	0.67
42	0.65
43	0.65
44	0.61
45	0.64
46	0.61
47	0.62
48	0.63
49	0.68
50	0.7
51	0.71
52	0.76
53	0.79
54	0.81
55	0.83
56	0.84
57	0.84
58	0.87
59	0.86
60	0.87
61	0.83
62	0.82
63	0.79
64	0.77
65	0.71
66	0.68
67	0.66
68	0.57
69	0.53
70	0.44
71	0.37
72	0.37
73	0.38
74	0.32
75	0.33
76	0.33
77	0.35
78	0.33
79	0.33
80	0.26
81	0.21
82	0.22
83	0.18
84	0.19
85	0.19
86	0.25
87	0.3
88	0.38
89	0.44
90	0.49
91	0.56
92	0.63
93	0.7
94	0.75
95	0.78
96	0.8
97	0.84
98	0.87
99	0.89
100	0.89
101	0.85
102	0.82
103	0.85
104	0.78
105	0.73
106	0.71
107	0.71
108	0.68
109	0.62
110	0.6
111	0.59
112	0.58
113	0.54
114	0.54
115	0.52
116	0.52
117	0.52
118	0.46
119	0.45
120	0.48
121	0.54
122	0.53
123	0.5
124	0.47
125	0.55
126	0.6
127	0.56
128	0.53
129	0.49
130	0.45
131	0.39
132	0.36
133	0.3
134	0.29
135	0.25
136	0.22
137	0.2
138	0.16
139	0.2
140	0.22
141	0.21
142	0.21
143	0.25
144	0.26
145	0.25
146	0.27
147	0.26
148	0.27
149	0.25
150	0.23
151	0.18
152	0.18
153	0.17
154	0.15
155	0.12
156	0.09
157	0.09
158	0.07
159	0.06
160	0.07
161	0.08
162	0.07
163	0.07
164	0.06
165	0.07
166	0.07
167	0.07
168	0.06
169	0.06
170	0.06
171	0.06
172	0.06
173	0.05
174	0.07
175	0.07
176	0.08
177	0.08
178	0.08
179	0.09
180	0.14
181	0.15
182	0.14
183	0.14
184	0.19
185	0.22
186	0.25
187	0.33
188	0.33
189	0.37
190	0.4
191	0.45
192	0.42
193	0.48
194	0.55
195	0.54
196	0.57
197	0.59
198	0.65
199	0.63
200	0.63
201	0.6
202	0.58
203	0.53
204	0.51
205	0.47
206	0.4
207	0.35
208	0.32
209	0.29
210	0.22
211	0.18
212	0.12
213	0.11
214	0.08
215	0.08
216	0.08
217	0.07
218	0.08
219	0.07
220	0.07
221	0.12
222	0.15
223	0.15
224	0.17
225	0.18
226	0.17
227	0.23
228	0.23
229	0.2
230	0.18
231	0.17
232	0.16
233	0.16
234	0.16
235	0.11
236	0.11
237	0.09
238	0.08
239	0.08
240	0.07
241	0.07
242	0.06
243	0.06
244	0.05
245	0.06
246	0.05
247	0.06
248	0.07
249	0.08
250	0.15
251	0.2
252	0.23
253	0.24
254	0.28
255	0.28
256	0.32
257	0.39
258	0.43
259	0.46
260	0.55
261	0.58
262	0.58
263	0.63
264	0.62
265	0.6
266	0.54
267	0.48
268	0.37
269	0.32
270	0.29
271	0.22
272	0.18
273	0.13
274	0.08
275	0.07
276	0.06
277	0.1
278	0.11
279	0.13
280	0.14
281	0.14
282	0.15
283	0.19
284	0.2
285	0.21
286	0.22
287	0.23
288	0.25
289	0.26
290	0.25
291	0.2
292	0.19
293	0.14
294	0.15
295	0.12
296	0.09
297	0.1
298	0.11
299	0.13
300	0.14
301	0.21
302	0.19
303	0.22
304	0.22
305	0.27
306	0.28
307	0.27
308	0.28
309	0.28
310	0.3
311	0.29
312	0.29
313	0.25
314	0.24
315	0.23
316	0.22
317	0.16
318	0.2
319	0.23
320	0.23
321	0.26
322	0.27
323	0.27
324	0.28
325	0.27
326	0.23
327	0.18
328	0.18
329	0.15
330	0.13
331	0.12
332	0.12
333	0.16
334	0.14
335	0.17
336	0.23
337	0.23
338	0.27
339	0.33
340	0.36
341	0.38
342	0.43
343	0.46
344	0.49
345	0.54
346	0.54
347	0.55
348	0.51
349	0.46
350	0.41
351	0.37
352	0.29
353	0.24
354	0.19
355	0.14
356	0.13
357	0.13
358	0.14
359	0.14
360	0.14
361	0.14
362	0.14
363	0.13
364	0.12
365	0.12
366	0.1
367	0.06
368	0.06
369	0.06
370	0.06
371	0.07
372	0.07
373	0.11
374	0.15
375	0.17
376	0.25
377	0.33
378	0.42
379	0.52
380	0.62
381	0.69
382	0.76
383	0.84
384	0.85
385	0.87
386	0.85
387	0.78
388	0.73
389	0.67
390	0.61
391	0.53
392	0.47
393	0.36
394	0.28
395	0.25
396	0.19
397	0.14
398	0.11
399	0.09
400	0.06
401	0.1
402	0.17
403	0.25
404	0.35
405	0.46
406	0.57
407	0.67
408	0.78
409	0.85
410	0.89
411	0.93
412	0.94
413	0.95
414	0.95
415	0.94
416	0.93
417	0.92
418	0.83
419	0.77
420	0.71
421	0.64
422	0.53
423	0.46
424	0.37
425	0.3
426	0.35
427	0.35
428	0.33
429	0.34
430	0.4
431	0.45
432	0.49
433	0.55
434	0.56
435	0.63
436	0.69
437	0.74
438	0.77
439	0.79
440	0.85
441	0.86
442	0.82
443	0.74
444	0.67
445	0.63
446	0.6
447	0.56
448	0.57
449	0.55
450	0.54
451	0.56
452	0.55
453	0.52
454	0.47
455	0.44
456	0.41
457	0.34
458	0.29
459	0.27
460	0.32
461	0.31
462	0.31
463	0.36
464	0.36
465	0.41
466	0.51
467	0.58
468	0.62
469	0.71
470	0.8
471	0.84
472	0.87
473	0.92
474	0.92
475	0.94
476	0.94
477	0.95
478	0.95
479	0.95
480	0.94
481	0.94
482	0.95
483	0.93
484	0.9
485	0.88
486	0.86
487	0.79
488	0.76
489	0.69
490	0.65
491	0.61
492	0.57
493	0.5
494	0.49
495	0.53
496	0.51

A0A5C3DQR0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer