Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3DNW1

Protein Details
Accession A0A5C3DNW1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
262-293ASESREESKEKKDKKRKVKSEDDKKSKKSKKEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
269-293SKEKKDKKRKVKSEDDKKSKKSKKE
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 13.333, mito_nucl 11.999, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013240  DNA-dir_RNA_pol1_su_RPA34  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0006360  P:transcription by RNA polymerase I  
Pfam View protein in Pfam  
PF08208  RNA_polI_A34  
Amino Acid Sequences MSKRSRSDSESSSSSSSSSGSSVEAQTASVSTSKLPASRNLSNIGYRPPRGFEAVSFASSSPFLQKKLTASKEQQLWAVRIPAGLSPSQLDGIVIDIPRDTFDLTSASKPLGSIEVPTSSSSIVDRYNFYASSSSAVKGKSKKAQSSADSQLIAMASENASKEDENVASDQGAASELESLKLLVPAGDGKEDGKLVLAPVKVSRCLHLTIASPAETTKAEKVKETSNRFEEKKLPQQPWHLLKGNFKPAGSRNAATETEEAASESREESKEKKDKKRKVKSEDDKKSKKSKKE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.27
3 0.23
4 0.18
5 0.15
6 0.12
7 0.11
8 0.14
9 0.14
10 0.15
11 0.14
12 0.13
13 0.13
14 0.12
15 0.12
16 0.1
17 0.1
18 0.09
19 0.12
20 0.14
21 0.17
22 0.19
23 0.25
24 0.31
25 0.35
26 0.37
27 0.39
28 0.4
29 0.4
30 0.4
31 0.42
32 0.41
33 0.39
34 0.38
35 0.36
36 0.36
37 0.36
38 0.35
39 0.27
40 0.28
41 0.27
42 0.26
43 0.24
44 0.21
45 0.19
46 0.18
47 0.18
48 0.17
49 0.18
50 0.18
51 0.19
52 0.21
53 0.26
54 0.35
55 0.39
56 0.4
57 0.42
58 0.48
59 0.51
60 0.5
61 0.49
62 0.42
63 0.39
64 0.34
65 0.32
66 0.25
67 0.2
68 0.19
69 0.16
70 0.15
71 0.13
72 0.12
73 0.1
74 0.11
75 0.11
76 0.1
77 0.09
78 0.07
79 0.08
80 0.09
81 0.08
82 0.07
83 0.07
84 0.07
85 0.08
86 0.08
87 0.08
88 0.06
89 0.06
90 0.09
91 0.1
92 0.11
93 0.11
94 0.11
95 0.11
96 0.11
97 0.1
98 0.1
99 0.08
100 0.08
101 0.09
102 0.1
103 0.11
104 0.12
105 0.12
106 0.1
107 0.1
108 0.09
109 0.09
110 0.09
111 0.09
112 0.1
113 0.12
114 0.13
115 0.13
116 0.14
117 0.13
118 0.12
119 0.13
120 0.13
121 0.11
122 0.12
123 0.13
124 0.16
125 0.19
126 0.24
127 0.29
128 0.33
129 0.36
130 0.39
131 0.44
132 0.42
133 0.45
134 0.44
135 0.39
136 0.34
137 0.3
138 0.25
139 0.2
140 0.17
141 0.11
142 0.07
143 0.04
144 0.05
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.06
149 0.07
150 0.08
151 0.08
152 0.08
153 0.09
154 0.09
155 0.08
156 0.08
157 0.07
158 0.05
159 0.06
160 0.05
161 0.04
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.06
168 0.07
169 0.07
170 0.05
171 0.05
172 0.06
173 0.07
174 0.07
175 0.07
176 0.07
177 0.08
178 0.08
179 0.08
180 0.07
181 0.06
182 0.06
183 0.1
184 0.1
185 0.1
186 0.13
187 0.15
188 0.18
189 0.19
190 0.2
191 0.19
192 0.2
193 0.21
194 0.2
195 0.2
196 0.19
197 0.21
198 0.19
199 0.17
200 0.15
201 0.16
202 0.14
203 0.14
204 0.17
205 0.2
206 0.2
207 0.23
208 0.25
209 0.32
210 0.41
211 0.45
212 0.47
213 0.49
214 0.56
215 0.55
216 0.57
217 0.56
218 0.55
219 0.59
220 0.59
221 0.58
222 0.57
223 0.63
224 0.68
225 0.67
226 0.66
227 0.63
228 0.58
229 0.61
230 0.63
231 0.64
232 0.57
233 0.51
234 0.49
235 0.46
236 0.51
237 0.48
238 0.41
239 0.34
240 0.36
241 0.37
242 0.34
243 0.32
244 0.25
245 0.2
246 0.2
247 0.18
248 0.13
249 0.13
250 0.11
251 0.11
252 0.14
253 0.15
254 0.18
255 0.21
256 0.31
257 0.41
258 0.5
259 0.6
260 0.67
261 0.76
262 0.84
263 0.91
264 0.91
265 0.91
266 0.93
267 0.93
268 0.93
269 0.94
270 0.94
271 0.93
272 0.91
273 0.92