FuNGI

A0A5C3E6P3

Protein Details

Accession

A0A5C3E6P3

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
85-112	TTQFIPPLKLNRKNPPRLKLPRPNPGDP	Hydrophilic
164-187	GGSARPPKSKLFKKKVREIHKAAD	Basic
769-788	LVQHFRKRLKSEPHIKDQLS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
167-185	ARPPKSKLFKKKVREIHKA
565-577	REKKEKEAAKTKG

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 12.5, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MPPVKSEPNVKSENGRANAAAASQRARPAIGNPRSSLKAEEDKKDLPPPPPTTYRDIPLLSTNCGQWLTHLMKFAHHTRVDPNDTTQFIPPLKLNRKNPPRLKLPRPNPGDPITDKYNRPMMGKDGQPLTWPGPDDDLQRIEEVIRKEVAAKGPGADQNLIAPGGSARPPKSKLFKKKVREIHKAADSARKTMKEEHFPWVLEDFETSEEWESIRTPIPTGARALQDHIDELKAKKNGVGSSSSNNNTDANGDVKMQDSKPAIKGEDGIKQETGTSASSSSSTSHAPWIGKLEGDSSSEASSLHVLFVFDERDAGGFKVVPVSRMYKFLQKPKHSTMTNEQVEQEYQKYQKTKEMDRWALRNKPIAAGSSSVTKQEDSAAWRNWPQVNQLSLPTGMSFGAGRRRNLMAVHGGELLRGEDDDDGNAGRRRKREDSPGAGYDELDYEEEFADDEEIHDPEADVVDDEEAKELEERLKREMARANNMGDDDEAADEASAPEDEDQILTGSGKQMMKIMRALAKREGNEAYEKDDDGRNPYATDDSDEDEEESYVANPEKAIQLAREEREKKEKEAAKTKGKSTGTPGTGSGSNTPTDRVEKKPVVLGGSQTQQQSRPGAGHASLAQRATSPTRGASKIGSKQVSRSSSPSLARSVSPGRAESPPLPSETSNSAGIGGSSGLKRRADSPATLVTPSSSSSTAATSVNRPEAKRAKTGATSSRAASPGTSSPPASKRGSRAGSPTAAPRTPANAVEAEIIQLIREGKIANTSELVQHFRKRLKSEPHIKDQLSAAVRKVAVMDKSTNRLKLKDGF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.5
2	0.48
3	0.4
4	0.38
5	0.37
6	0.33
7	0.28
8	0.22
9	0.21
10	0.22
11	0.25
12	0.24
13	0.25
14	0.24
15	0.28
16	0.36
17	0.41
18	0.43
19	0.43
20	0.48
21	0.5
22	0.5
23	0.46
24	0.42
25	0.44
26	0.46
27	0.49
28	0.49
29	0.49
30	0.52
31	0.56
32	0.54
33	0.5
34	0.53
35	0.53
36	0.54
37	0.58
38	0.58
39	0.58
40	0.58
41	0.56
42	0.52
43	0.47
44	0.42
45	0.43
46	0.41
47	0.37
48	0.35
49	0.31
50	0.28
51	0.28
52	0.25
53	0.18
54	0.24
55	0.25
56	0.25
57	0.3
58	0.28
59	0.31
60	0.36
61	0.4
62	0.41
63	0.38
64	0.38
65	0.38
66	0.47
67	0.49
68	0.46
69	0.46
70	0.43
71	0.43
72	0.43
73	0.39
74	0.36
75	0.3
76	0.31
77	0.29
78	0.34
79	0.42
80	0.49
81	0.55
82	0.61
83	0.7
84	0.79
85	0.84
86	0.82
87	0.83
88	0.83
89	0.86
90	0.86
91	0.85
92	0.84
93	0.83
94	0.8
95	0.75
96	0.69
97	0.65
98	0.57
99	0.54
100	0.51
101	0.5
102	0.46
103	0.45
104	0.48
105	0.43
106	0.41
107	0.38
108	0.36
109	0.37
110	0.39
111	0.39
112	0.36
113	0.34
114	0.33
115	0.34
116	0.31
117	0.27
118	0.25
119	0.2
120	0.22
121	0.23
122	0.25
123	0.26
124	0.25
125	0.23
126	0.22
127	0.22
128	0.19
129	0.21
130	0.21
131	0.19
132	0.18
133	0.17
134	0.18
135	0.22
136	0.25
137	0.23
138	0.21
139	0.19
140	0.23
141	0.25
142	0.26
143	0.22
144	0.18
145	0.17
146	0.18
147	0.16
148	0.12
149	0.09
150	0.08
151	0.09
152	0.13
153	0.16
154	0.18
155	0.24
156	0.28
157	0.35
158	0.45
159	0.53
160	0.61
161	0.67
162	0.74
163	0.78
164	0.84
165	0.87
166	0.87
167	0.86
168	0.82
169	0.8
170	0.76
171	0.71
172	0.64
173	0.63
174	0.54
175	0.5
176	0.48
177	0.42
178	0.38
179	0.43
180	0.47
181	0.47
182	0.48
183	0.48
184	0.47
185	0.45
186	0.43
187	0.36
188	0.3
189	0.21
190	0.19
191	0.14
192	0.12
193	0.12
194	0.11
195	0.1
196	0.1
197	0.1
198	0.1
199	0.1
200	0.1
201	0.12
202	0.12
203	0.12
204	0.15
205	0.17
206	0.18
207	0.2
208	0.21
209	0.22
210	0.22
211	0.24
212	0.22
213	0.21
214	0.2
215	0.19
216	0.17
217	0.16
218	0.17
219	0.21
220	0.21
221	0.2
222	0.21
223	0.24
224	0.24
225	0.24
226	0.27
227	0.23
228	0.26
229	0.32
230	0.32
231	0.29
232	0.29
233	0.27
234	0.22
235	0.21
236	0.18
237	0.13
238	0.12
239	0.11
240	0.1
241	0.12
242	0.14
243	0.14
244	0.17
245	0.17
246	0.19
247	0.22
248	0.24
249	0.24
250	0.21
251	0.24
252	0.22
253	0.27
254	0.26
255	0.25
256	0.22
257	0.22
258	0.21
259	0.19
260	0.17
261	0.11
262	0.1
263	0.08
264	0.09
265	0.09
266	0.1
267	0.1
268	0.1
269	0.11
270	0.11
271	0.13
272	0.15
273	0.15
274	0.15
275	0.18
276	0.16
277	0.15
278	0.15
279	0.14
280	0.12
281	0.13
282	0.13
283	0.11
284	0.1
285	0.1
286	0.1
287	0.09
288	0.09
289	0.08
290	0.07
291	0.07
292	0.06
293	0.07
294	0.08
295	0.08
296	0.07
297	0.07
298	0.06
299	0.06
300	0.07
301	0.07
302	0.06
303	0.06
304	0.06
305	0.11
306	0.11
307	0.12
308	0.13
309	0.17
310	0.17
311	0.21
312	0.23
313	0.26
314	0.31
315	0.38
316	0.45
317	0.48
318	0.53
319	0.56
320	0.62
321	0.54
322	0.54
323	0.53
324	0.54
325	0.5
326	0.44
327	0.39
328	0.32
329	0.32
330	0.28
331	0.22
332	0.15
333	0.15
334	0.18
335	0.2
336	0.2
337	0.25
338	0.29
339	0.32
340	0.38
341	0.45
342	0.49
343	0.5
344	0.55
345	0.56
346	0.57
347	0.54
348	0.51
349	0.42
350	0.37
351	0.34
352	0.29
353	0.24
354	0.19
355	0.17
356	0.16
357	0.16
358	0.14
359	0.14
360	0.13
361	0.12
362	0.12
363	0.13
364	0.14
365	0.2
366	0.2
367	0.21
368	0.22
369	0.26
370	0.26
371	0.25
372	0.23
373	0.22
374	0.22
375	0.22
376	0.21
377	0.19
378	0.17
379	0.16
380	0.13
381	0.09
382	0.07
383	0.07
384	0.06
385	0.06
386	0.14
387	0.17
388	0.17
389	0.19
390	0.2
391	0.21
392	0.21
393	0.21
394	0.17
395	0.15
396	0.16
397	0.15
398	0.14
399	0.13
400	0.13
401	0.11
402	0.07
403	0.06
404	0.05
405	0.04
406	0.04
407	0.04
408	0.05
409	0.05
410	0.07
411	0.1
412	0.13
413	0.16
414	0.2
415	0.26
416	0.3
417	0.35
418	0.42
419	0.47
420	0.5
421	0.52
422	0.51
423	0.47
424	0.42
425	0.38
426	0.28
427	0.21
428	0.14
429	0.09
430	0.07
431	0.06
432	0.06
433	0.05
434	0.05
435	0.05
436	0.05
437	0.04
438	0.05
439	0.06
440	0.06
441	0.06
442	0.06
443	0.06
444	0.05
445	0.06
446	0.05
447	0.04
448	0.04
449	0.04
450	0.04
451	0.04
452	0.05
453	0.04
454	0.05
455	0.05
456	0.05
457	0.1
458	0.13
459	0.14
460	0.17
461	0.21
462	0.21
463	0.25
464	0.3
465	0.3
466	0.33
467	0.34
468	0.32
469	0.29
470	0.29
471	0.26
472	0.2
473	0.16
474	0.1
475	0.07
476	0.06
477	0.05
478	0.05
479	0.04
480	0.04
481	0.04
482	0.04
483	0.04
484	0.04
485	0.05
486	0.05
487	0.05
488	0.05
489	0.05
490	0.05
491	0.05
492	0.05
493	0.06
494	0.1
495	0.1
496	0.1
497	0.13
498	0.14
499	0.16
500	0.17
501	0.19
502	0.21
503	0.23
504	0.25
505	0.28
506	0.31
507	0.3
508	0.33
509	0.31
510	0.27
511	0.29
512	0.27
513	0.25
514	0.22
515	0.21
516	0.19
517	0.21
518	0.19
519	0.2
520	0.22
521	0.18
522	0.18
523	0.18
524	0.18
525	0.16
526	0.18
527	0.14
528	0.14
529	0.14
530	0.14
531	0.14
532	0.13
533	0.12
534	0.1
535	0.08
536	0.07
537	0.08
538	0.08
539	0.07
540	0.07
541	0.08
542	0.09
543	0.09
544	0.1
545	0.09
546	0.14
547	0.19
548	0.22
549	0.29
550	0.32
551	0.35
552	0.44
553	0.46
554	0.44
555	0.48
556	0.52
557	0.51
558	0.58
559	0.62
560	0.62
561	0.64
562	0.63
563	0.63
564	0.58
565	0.52
566	0.49
567	0.49
568	0.41
569	0.37
570	0.35
571	0.3
572	0.3
573	0.3
574	0.26
575	0.19
576	0.18
577	0.17
578	0.18
579	0.17
580	0.21
581	0.24
582	0.26
583	0.33
584	0.34
585	0.35
586	0.37
587	0.37
588	0.34
589	0.31
590	0.29
591	0.24
592	0.25
593	0.27
594	0.25
595	0.24
596	0.24
597	0.26
598	0.25
599	0.22
600	0.2
601	0.18
602	0.19
603	0.18
604	0.18
605	0.18
606	0.2
607	0.21
608	0.2
609	0.19
610	0.17
611	0.19
612	0.2
613	0.2
614	0.18
615	0.19
616	0.24
617	0.25
618	0.26
619	0.27
620	0.32
621	0.36
622	0.42
623	0.44
624	0.39
625	0.43
626	0.49
627	0.5
628	0.45
629	0.42
630	0.4
631	0.42
632	0.44
633	0.42
634	0.37
635	0.34
636	0.32
637	0.33
638	0.31
639	0.29
640	0.29
641	0.27
642	0.27
643	0.28
644	0.32
645	0.29
646	0.31
647	0.28
648	0.28
649	0.29
650	0.26
651	0.27
652	0.27
653	0.27
654	0.22
655	0.21
656	0.19
657	0.17
658	0.16
659	0.13
660	0.1
661	0.1
662	0.1
663	0.14
664	0.17
665	0.18
666	0.2
667	0.22
668	0.29
669	0.3
670	0.3
671	0.32
672	0.35
673	0.36
674	0.36
675	0.32
676	0.26
677	0.24
678	0.23
679	0.21
680	0.14
681	0.13
682	0.13
683	0.14
684	0.15
685	0.16
686	0.17
687	0.18
688	0.22
689	0.29
690	0.32
691	0.32
692	0.4
693	0.46
694	0.49
695	0.52
696	0.51
697	0.49
698	0.5
699	0.55
700	0.54
701	0.51
702	0.49
703	0.44
704	0.45
705	0.41
706	0.36
707	0.3
708	0.26
709	0.24
710	0.27
711	0.28
712	0.24
713	0.3
714	0.33
715	0.38
716	0.4
717	0.41
718	0.41
719	0.48
720	0.52
721	0.49
722	0.51
723	0.52
724	0.5
725	0.47
726	0.49
727	0.46
728	0.42
729	0.4
730	0.36
731	0.35
732	0.34
733	0.33
734	0.29
735	0.23
736	0.23
737	0.23
738	0.21
739	0.17
740	0.15
741	0.14
742	0.11
743	0.12
744	0.12
745	0.1
746	0.11
747	0.11
748	0.1
749	0.17
750	0.19
751	0.19
752	0.2
753	0.2
754	0.24
755	0.27
756	0.32
757	0.3
758	0.35
759	0.41
760	0.46
761	0.52
762	0.53
763	0.59
764	0.64
765	0.7
766	0.74
767	0.76
768	0.8
769	0.81
770	0.76
771	0.7
772	0.62
773	0.59
774	0.53
775	0.47
776	0.38
777	0.35
778	0.34
779	0.31
780	0.31
781	0.28
782	0.26
783	0.28
784	0.34
785	0.34
786	0.42
787	0.48
788	0.53
789	0.51
790	0.5

A0A5C3E6P3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer