Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3E4V5

Protein Details
Accession A0A5C3E4V5    Localization Confidence Low Confidence Score 9.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
51-70LSSADPSSRRKRKLPPLEVDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12.333, cyto 5, cyto_mito 4.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027521  Usb1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0016829  F:lyase activity  
GO:0004518  F:nuclease activity  
GO:0034477  P:U6 snRNA 3'-end processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF09749  HVSL  
Amino Acid Sequences MSGALSSLSQYADSDTDGDPANDTGQVSPTSESARGTGQDRIGTNDTQAILSSADPSSRRKRKLPPLEVDSLLPADQCGPPASSHTLAVRGTKKVTRGDWLCYCFVEVPVERSLSKLIQESHDYVRTQIGSEYGLQDLRVAESSPDDSQGVSCSTTKTERLHISLTRPFTVRSYEREEYIKVAAAELRRLKSIVGSFAFSFSRFAYLSNDDGSRHFMVLEVGSGREKFHTVSTALSAELRREFRAKSYYEEARFHTSTACLTSTAERSSTEIGGALGPRFSKIVADTEAKWGAQLRKSPPNWATRIGIQVANRITYVDL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.12
3 0.14
4 0.15
5 0.15
6 0.14
7 0.14
8 0.14
9 0.13
10 0.13
11 0.12
12 0.13
13 0.14
14 0.14
15 0.15
16 0.15
17 0.17
18 0.17
19 0.17
20 0.16
21 0.18
22 0.19
23 0.2
24 0.23
25 0.23
26 0.26
27 0.26
28 0.31
29 0.31
30 0.29
31 0.28
32 0.26
33 0.24
34 0.2
35 0.19
36 0.14
37 0.12
38 0.11
39 0.13
40 0.1
41 0.12
42 0.14
43 0.21
44 0.31
45 0.39
46 0.45
47 0.5
48 0.6
49 0.68
50 0.77
51 0.8
52 0.79
53 0.77
54 0.76
55 0.7
56 0.6
57 0.51
58 0.4
59 0.31
60 0.21
61 0.14
62 0.11
63 0.1
64 0.1
65 0.1
66 0.1
67 0.1
68 0.14
69 0.18
70 0.17
71 0.18
72 0.18
73 0.2
74 0.2
75 0.26
76 0.25
77 0.24
78 0.26
79 0.27
80 0.31
81 0.32
82 0.33
83 0.35
84 0.34
85 0.39
86 0.41
87 0.42
88 0.39
89 0.34
90 0.33
91 0.26
92 0.24
93 0.21
94 0.16
95 0.16
96 0.16
97 0.18
98 0.16
99 0.16
100 0.17
101 0.14
102 0.15
103 0.15
104 0.14
105 0.16
106 0.19
107 0.21
108 0.23
109 0.26
110 0.24
111 0.22
112 0.23
113 0.2
114 0.18
115 0.15
116 0.12
117 0.09
118 0.1
119 0.1
120 0.09
121 0.09
122 0.08
123 0.09
124 0.08
125 0.08
126 0.07
127 0.07
128 0.06
129 0.07
130 0.09
131 0.08
132 0.09
133 0.08
134 0.08
135 0.08
136 0.09
137 0.09
138 0.08
139 0.08
140 0.08
141 0.09
142 0.11
143 0.14
144 0.14
145 0.19
146 0.19
147 0.21
148 0.24
149 0.24
150 0.27
151 0.28
152 0.29
153 0.25
154 0.24
155 0.22
156 0.2
157 0.24
158 0.21
159 0.21
160 0.27
161 0.27
162 0.28
163 0.29
164 0.29
165 0.25
166 0.24
167 0.22
168 0.13
169 0.13
170 0.13
171 0.12
172 0.16
173 0.18
174 0.18
175 0.17
176 0.17
177 0.17
178 0.18
179 0.18
180 0.17
181 0.15
182 0.16
183 0.15
184 0.17
185 0.17
186 0.15
187 0.15
188 0.11
189 0.12
190 0.1
191 0.11
192 0.13
193 0.15
194 0.16
195 0.17
196 0.17
197 0.16
198 0.16
199 0.2
200 0.17
201 0.15
202 0.13
203 0.12
204 0.12
205 0.11
206 0.12
207 0.08
208 0.08
209 0.09
210 0.09
211 0.1
212 0.1
213 0.1
214 0.1
215 0.11
216 0.13
217 0.12
218 0.13
219 0.15
220 0.14
221 0.14
222 0.15
223 0.14
224 0.14
225 0.18
226 0.19
227 0.19
228 0.21
229 0.22
230 0.24
231 0.3
232 0.29
233 0.3
234 0.35
235 0.41
236 0.43
237 0.46
238 0.45
239 0.46
240 0.45
241 0.39
242 0.34
243 0.27
244 0.24
245 0.23
246 0.2
247 0.13
248 0.14
249 0.17
250 0.19
251 0.2
252 0.19
253 0.17
254 0.19
255 0.21
256 0.2
257 0.16
258 0.14
259 0.12
260 0.13
261 0.14
262 0.12
263 0.11
264 0.11
265 0.12
266 0.12
267 0.11
268 0.11
269 0.12
270 0.15
271 0.18
272 0.21
273 0.22
274 0.27
275 0.29
276 0.27
277 0.27
278 0.28
279 0.3
280 0.32
281 0.37
282 0.38
283 0.47
284 0.49
285 0.57
286 0.57
287 0.6
288 0.59
289 0.57
290 0.54
291 0.48
292 0.52
293 0.46
294 0.44
295 0.36
296 0.39
297 0.36
298 0.33
299 0.29