FuNGI

H1VXT4

Protein Details

Accession

H1VXT4

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
389-421	PDVMLVKKHYPNRRKHRNRNWKLKRMNKDEGEL	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
397-414	HYPNRRKHRNRNWKLKRM

Subcellular Location(s)

cyto 13.5, cyto_nucl 13, nucl 11.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039768 Nmd3 IPR007064 Nmd3_N
Gene Ontology	GO:0005829 C:cytosol GO:0005634 C:nucleus GO:0070180 F:large ribosomal subunit rRNA binding GO:0043023 F:ribosomal large subunit binding GO:0015031 P:protein transport GO:0000055 P:ribosomal large subunit export from nucleus
KEGG	chig:CH63R_04901 -
Pfam	View protein in Pfam PF04981 NMD3

Amino Acid Sequences

MSMHATILCCNCGAPIDGTTAAGALCYDCIKLTVDISQGVQREATLNFCRDCDRWLLPPSSWVVAAPESRELLALCLKKLKGLNKIRIIDASFVWTEPHSRRVKVKITIQDEVQTGVLLQQAFEAIYIVAYQQCPDCAKSYTANVWRASVQVRQKVLHKRTFLFLEQLIMKHGAHRDTLNIKEAKDGIDFFFSARNQAEKFCDFLNSVVPCKAKKSQELISQDVHTSTKSFKFTFSVELVPICRDDLVAMPIKLAKASGNISPLVICHKIGTSVYLLDPNTLQTADISAAIYWRAPFYSLADVKQFVEFIVMDIEPTNITKGKWRLAEVQVARASDLGVNDKTYFARTHLGNLLHAGDSVLGYMLTGTNFNNEEFDAIEASGVYASTIPDVMLVKKHYPNRRKHRNRNWKLKRMNKDEGELLPKKADQDRMNEDYEQFLRDVEEDDELRATMALYKAQQAAKVDPDAMSIAETEDGDGVPGVDMDELLDDMDELQIKE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.14
2	0.14
3	0.16
4	0.17
5	0.17
6	0.16
7	0.15
8	0.12
9	0.1
10	0.09
11	0.06
12	0.06
13	0.07
14	0.07
15	0.07
16	0.09
17	0.11
18	0.12
19	0.13
20	0.15
21	0.16
22	0.17
23	0.19
24	0.22
25	0.21
26	0.21
27	0.2
28	0.17
29	0.17
30	0.17
31	0.21
32	0.22
33	0.25
34	0.25
35	0.26
36	0.3
37	0.28
38	0.3
39	0.3
40	0.29
41	0.31
42	0.36
43	0.38
44	0.34
45	0.38
46	0.38
47	0.33
48	0.3
49	0.23
50	0.2
51	0.2
52	0.21
53	0.19
54	0.18
55	0.18
56	0.18
57	0.18
58	0.16
59	0.14
60	0.2
61	0.19
62	0.18
63	0.24
64	0.24
65	0.28
66	0.33
67	0.37
68	0.41
69	0.49
70	0.57
71	0.6
72	0.62
73	0.59
74	0.58
75	0.53
76	0.45
77	0.36
78	0.3
79	0.22
80	0.19
81	0.19
82	0.16
83	0.19
84	0.19
85	0.28
86	0.28
87	0.31
88	0.37
89	0.43
90	0.51
91	0.53
92	0.58
93	0.59
94	0.6
95	0.6
96	0.55
97	0.51
98	0.44
99	0.38
100	0.3
101	0.2
102	0.14
103	0.12
104	0.13
105	0.09
106	0.08
107	0.07
108	0.07
109	0.07
110	0.07
111	0.07
112	0.04
113	0.04
114	0.05
115	0.05
116	0.06
117	0.07
118	0.07
119	0.07
120	0.09
121	0.11
122	0.13
123	0.15
124	0.15
125	0.18
126	0.19
127	0.22
128	0.28
129	0.33
130	0.37
131	0.35
132	0.34
133	0.32
134	0.32
135	0.31
136	0.29
137	0.29
138	0.3
139	0.32
140	0.33
141	0.4
142	0.48
143	0.53
144	0.54
145	0.51
146	0.47
147	0.48
148	0.5
149	0.44
150	0.37
151	0.3
152	0.26
153	0.24
154	0.22
155	0.2
156	0.17
157	0.16
158	0.16
159	0.18
160	0.16
161	0.16
162	0.16
163	0.18
164	0.21
165	0.23
166	0.27
167	0.26
168	0.25
169	0.26
170	0.26
171	0.23
172	0.2
173	0.19
174	0.13
175	0.13
176	0.13
177	0.11
178	0.14
179	0.13
180	0.14
181	0.14
182	0.15
183	0.14
184	0.16
185	0.19
186	0.16
187	0.17
188	0.15
189	0.16
190	0.14
191	0.14
192	0.18
193	0.16
194	0.17
195	0.18
196	0.19
197	0.18
198	0.21
199	0.27
200	0.25
201	0.28
202	0.32
203	0.35
204	0.41
205	0.46
206	0.45
207	0.41
208	0.39
209	0.34
210	0.3
211	0.24
212	0.17
213	0.13
214	0.13
215	0.14
216	0.16
217	0.16
218	0.16
219	0.18
220	0.19
221	0.21
222	0.2
223	0.18
224	0.15
225	0.15
226	0.15
227	0.14
228	0.13
229	0.09
230	0.07
231	0.06
232	0.06
233	0.06
234	0.08
235	0.1
236	0.09
237	0.09
238	0.1
239	0.1
240	0.1
241	0.09
242	0.07
243	0.07
244	0.08
245	0.1
246	0.11
247	0.11
248	0.11
249	0.11
250	0.1
251	0.12
252	0.11
253	0.1
254	0.08
255	0.08
256	0.09
257	0.09
258	0.1
259	0.08
260	0.08
261	0.08
262	0.1
263	0.1
264	0.1
265	0.1
266	0.09
267	0.09
268	0.08
269	0.08
270	0.05
271	0.06
272	0.06
273	0.06
274	0.06
275	0.05
276	0.05
277	0.06
278	0.06
279	0.06
280	0.05
281	0.05
282	0.06
283	0.06
284	0.08
285	0.15
286	0.16
287	0.17
288	0.18
289	0.19
290	0.19
291	0.19
292	0.17
293	0.1
294	0.1
295	0.08
296	0.07
297	0.08
298	0.07
299	0.07
300	0.07
301	0.08
302	0.07
303	0.07
304	0.08
305	0.07
306	0.08
307	0.14
308	0.17
309	0.22
310	0.24
311	0.27
312	0.32
313	0.34
314	0.42
315	0.36
316	0.4
317	0.37
318	0.34
319	0.32
320	0.25
321	0.23
322	0.16
323	0.16
324	0.13
325	0.11
326	0.12
327	0.12
328	0.13
329	0.13
330	0.14
331	0.14
332	0.12
333	0.17
334	0.16
335	0.19
336	0.24
337	0.24
338	0.22
339	0.23
340	0.22
341	0.18
342	0.17
343	0.13
344	0.08
345	0.07
346	0.07
347	0.06
348	0.04
349	0.04
350	0.04
351	0.04
352	0.04
353	0.05
354	0.06
355	0.08
356	0.1
357	0.1
358	0.11
359	0.1
360	0.1
361	0.1
362	0.1
363	0.08
364	0.07
365	0.07
366	0.06
367	0.06
368	0.06
369	0.05
370	0.05
371	0.04
372	0.04
373	0.05
374	0.05
375	0.05
376	0.06
377	0.08
378	0.09
379	0.12
380	0.16
381	0.2
382	0.27
383	0.35
384	0.44
385	0.52
386	0.62
387	0.69
388	0.78
389	0.84
390	0.89
391	0.92
392	0.94
393	0.95
394	0.96
395	0.96
396	0.95
397	0.94
398	0.93
399	0.92
400	0.9
401	0.89
402	0.81
403	0.75
404	0.69
405	0.63
406	0.62
407	0.54
408	0.46
409	0.39
410	0.36
411	0.36
412	0.36
413	0.39
414	0.34
415	0.39
416	0.45
417	0.47
418	0.49
419	0.47
420	0.42
421	0.39
422	0.37
423	0.3
424	0.23
425	0.18
426	0.16
427	0.15
428	0.17
429	0.13
430	0.16
431	0.14
432	0.15
433	0.16
434	0.15
435	0.14
436	0.12
437	0.11
438	0.11
439	0.11
440	0.13
441	0.14
442	0.18
443	0.22
444	0.24
445	0.27
446	0.26
447	0.29
448	0.3
449	0.31
450	0.29
451	0.24
452	0.24
453	0.22
454	0.19
455	0.16
456	0.11
457	0.1
458	0.1
459	0.1
460	0.09
461	0.09
462	0.08
463	0.08
464	0.08
465	0.07
466	0.06
467	0.06
468	0.06
469	0.05
470	0.05
471	0.05
472	0.06
473	0.06
474	0.06
475	0.05
476	0.05
477	0.05
478	0.07

H1VXT4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer