Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A5C3DUA5

Protein Details
Accession A0A5C3DUA5    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
310-331NDSNRHFNKKLKRFYDKQTQEIHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 14, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013260  mRNA_splic_SYF2  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF08231  SYF2  
Amino Acid Sequences MPPRRTRATKKADDHQDTPDEVKVVESCSTAPLSATDEKQQETTSSDASTMTATRSKGKSRAARHQPLLSETAAPSSSEAVSSNPEAAEPSSPPPSSSSSKPTITMEDRQARLSALRAKMASSTKANRKAILSEQSRSRTIASELKSSSASRKIQKAEQILEERDLRESGQDVERYRNMHYSLEDSEAWDAKIEEKERRKDRGPGDFGDAAERAYQRQVRMLKPDVAAYRQSKSESEALKANSPASSALIKVKGKGKDETQSDELHYGTHKPSDDAIDRVVNHLNHQRQIIQNRSRRRHDDPDAEVNYINDSNRHFNKKLKRFYDKQTQEIRENLERGTAL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.76
2 0.72
3 0.67
4 0.59
5 0.53
6 0.46
7 0.36
8 0.28
9 0.27
10 0.21
11 0.19
12 0.18
13 0.16
14 0.14
15 0.15
16 0.16
17 0.14
18 0.14
19 0.12
20 0.16
21 0.19
22 0.21
23 0.25
24 0.27
25 0.28
26 0.29
27 0.29
28 0.25
29 0.24
30 0.24
31 0.2
32 0.17
33 0.16
34 0.15
35 0.15
36 0.15
37 0.13
38 0.13
39 0.15
40 0.16
41 0.23
42 0.27
43 0.32
44 0.37
45 0.45
46 0.51
47 0.56
48 0.65
49 0.69
50 0.73
51 0.73
52 0.72
53 0.65
54 0.6
55 0.54
56 0.44
57 0.36
58 0.26
59 0.24
60 0.19
61 0.17
62 0.14
63 0.13
64 0.12
65 0.1
66 0.11
67 0.09
68 0.12
69 0.12
70 0.13
71 0.11
72 0.11
73 0.11
74 0.11
75 0.12
76 0.11
77 0.14
78 0.17
79 0.17
80 0.18
81 0.2
82 0.24
83 0.26
84 0.28
85 0.31
86 0.31
87 0.33
88 0.34
89 0.33
90 0.34
91 0.34
92 0.36
93 0.38
94 0.4
95 0.4
96 0.39
97 0.38
98 0.32
99 0.29
100 0.28
101 0.26
102 0.21
103 0.22
104 0.21
105 0.21
106 0.25
107 0.26
108 0.25
109 0.24
110 0.3
111 0.35
112 0.44
113 0.45
114 0.42
115 0.42
116 0.41
117 0.41
118 0.43
119 0.38
120 0.32
121 0.37
122 0.39
123 0.39
124 0.36
125 0.32
126 0.25
127 0.24
128 0.26
129 0.23
130 0.24
131 0.23
132 0.24
133 0.24
134 0.23
135 0.23
136 0.24
137 0.27
138 0.27
139 0.32
140 0.33
141 0.35
142 0.4
143 0.41
144 0.37
145 0.37
146 0.36
147 0.32
148 0.31
149 0.29
150 0.24
151 0.21
152 0.18
153 0.13
154 0.1
155 0.1
156 0.09
157 0.11
158 0.14
159 0.14
160 0.17
161 0.19
162 0.2
163 0.2
164 0.21
165 0.2
166 0.18
167 0.18
168 0.17
169 0.17
170 0.18
171 0.17
172 0.14
173 0.14
174 0.14
175 0.13
176 0.1
177 0.09
178 0.08
179 0.12
180 0.14
181 0.2
182 0.27
183 0.36
184 0.41
185 0.46
186 0.47
187 0.52
188 0.55
189 0.58
190 0.55
191 0.48
192 0.48
193 0.44
194 0.41
195 0.35
196 0.3
197 0.2
198 0.18
199 0.16
200 0.11
201 0.14
202 0.16
203 0.15
204 0.21
205 0.25
206 0.26
207 0.32
208 0.35
209 0.36
210 0.34
211 0.38
212 0.33
213 0.31
214 0.34
215 0.3
216 0.28
217 0.26
218 0.27
219 0.23
220 0.24
221 0.28
222 0.24
223 0.24
224 0.27
225 0.27
226 0.28
227 0.29
228 0.26
229 0.2
230 0.19
231 0.17
232 0.14
233 0.13
234 0.11
235 0.14
236 0.19
237 0.2
238 0.23
239 0.29
240 0.32
241 0.35
242 0.37
243 0.38
244 0.4
245 0.43
246 0.45
247 0.42
248 0.38
249 0.37
250 0.34
251 0.3
252 0.23
253 0.21
254 0.17
255 0.16
256 0.18
257 0.17
258 0.17
259 0.19
260 0.24
261 0.26
262 0.24
263 0.25
264 0.26
265 0.25
266 0.27
267 0.3
268 0.25
269 0.27
270 0.33
271 0.35
272 0.34
273 0.35
274 0.38
275 0.4
276 0.48
277 0.53
278 0.54
279 0.57
280 0.65
281 0.72
282 0.76
283 0.76
284 0.76
285 0.76
286 0.76
287 0.77
288 0.74
289 0.75
290 0.69
291 0.64
292 0.56
293 0.46
294 0.4
295 0.33
296 0.26
297 0.19
298 0.2
299 0.26
300 0.33
301 0.41
302 0.41
303 0.48
304 0.59
305 0.66
306 0.73
307 0.74
308 0.76
309 0.76
310 0.81
311 0.84
312 0.8
313 0.8
314 0.79
315 0.76
316 0.71
317 0.69
318 0.67
319 0.63
320 0.57
321 0.48