Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3EME8

Protein Details
Accession A0A5C3EME8    Localization Confidence High Confidence Score 16.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
109-135GVAPRAKMNQQRSRRFRAAKEAREKHEHydrophilic
409-431DEIFRRRKEDEDRRENNKKRREEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
120-133RSRRFRAAKEAREK
414-435RRKEDEDRRENNKKRREEMQKR
919-925RGRGRGR
1187-1198SGRGGRGGRGGR
Subcellular Location(s) cyto 10.5, cyto_nucl 9.5, mito 8, nucl 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR017151  Xrn2/3/4  
IPR001878  Znf_CCHC  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006353  P:DNA-templated transcription termination  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MGVPALFRWLSKKYPRIVSSVQEQDPRTAPGPDGSVITLPLDTSTPNPNGEEFDCLYLDMNGIVHPCTHPEGKPAPETEEEMMVEVFAYTERVVNMVRPRRLLMMAIDGVAPRAKMNQQRSRRFRAAKEAREKHEEKEAALAEWKAKGLPVTDDALESKKAWDSNAITPGTPFMDLLAASLRFWVAQKINTDPGWKDIQVIISDASVPGEGEHKIMEHIRRQRSHPEHDPNTKHVIYGLDADLIMLSLATHEPYFKVLREDVFASDNKPKTCNLCGQPGHFAASCKGTAKNKSGEHDEIAPTPPEKKPFIFLDVATLREYLEVELNIPQLPFAFDLERAIDDWVFLIFFVGNDFLPHLPSLEIRDGAIDTLLRIWKKELPAMGGYLTNHGKVELGRAQLILNGLASEEDEIFRRRKEDEDRRENNKKRREEMQKRREAELDEGNFGNGSMVQVMSKKRPAHETEKPAFNGVSAQDAREKANSNNKSYDPRKKAVVLGGDNNQVVRDRNAARQANMDAAEALKAELMGGAATKKEEEEDAAAEPPVKKVKTESGAEAASSTAEKQENGEDAEAVEAEDENVEADAEADADADEDENDDEGNEDVDPVTTVKKRTVNADGTVDYEDTVKMWEPGYRERYYKEKFGVDLSDTDFRRQVVKSYIEGLCWVLAYYYQGVPSWQWYYPFHFSPFAADFEDLESLDIKFELGAPFKPFEQLMGVLPADSRASIPEAFHPLMTESDSDIIDFYPSEFEIDMNGKKMAWQGVALLPFIDERRLLDALKDKYPLLSEDEVRRNGFGNNTLFVGSESRLYEFFCEEIYAKKPSAEGAKPAPVPVNPALSGGITGYVKPDPVCVPGSTFNSPLTSQDLHDIHNDRSISVLYDFPEQKTPHRSVLLKGLKPPKRTLTPAEIDWVKRGSPDTRGRGRGRGGFGGPGRDFHRNNNNNNNNNNNNNQYGGEHGHSNPNFRNNHNNNGGGGGGYGSHNGYGGGYQQDYQQYNQSSGGGGYGGYGGYGSGGYGGQPQAAAAAAYGGSGGGGGYGGYGGYGAAAASSYSAGGGYDPYAGYGGGGGGGYGGGYGGGNSSSYAPQGAPKGPRDDRYAAYTQPSTHIGGGGGSRGGRHANAPPNPAYAGLPSLGGPPPAPAHAPAPYGGYGSPYGGSGSGSGSSYGNGGPYGGGGGYGALPPPTHHRGSGRGGRGGRGGRGGANNNASYGGHGGAYGSFY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.61
3 0.64
4 0.64
5 0.61
6 0.61
7 0.62
8 0.59
9 0.56
10 0.54
11 0.51
12 0.49
13 0.48
14 0.41
15 0.34
16 0.3
17 0.26
18 0.28
19 0.24
20 0.24
21 0.2
22 0.19
23 0.18
24 0.17
25 0.14
26 0.11
27 0.11
28 0.1
29 0.1
30 0.12
31 0.18
32 0.19
33 0.21
34 0.22
35 0.23
36 0.26
37 0.26
38 0.29
39 0.24
40 0.24
41 0.22
42 0.21
43 0.21
44 0.17
45 0.16
46 0.11
47 0.1
48 0.09
49 0.09
50 0.09
51 0.1
52 0.1
53 0.13
54 0.17
55 0.2
56 0.2
57 0.27
58 0.33
59 0.36
60 0.41
61 0.4
62 0.4
63 0.39
64 0.42
65 0.36
66 0.33
67 0.28
68 0.24
69 0.22
70 0.17
71 0.14
72 0.1
73 0.09
74 0.06
75 0.07
76 0.06
77 0.08
78 0.08
79 0.1
80 0.1
81 0.16
82 0.25
83 0.33
84 0.37
85 0.38
86 0.4
87 0.42
88 0.42
89 0.39
90 0.32
91 0.29
92 0.26
93 0.24
94 0.23
95 0.19
96 0.19
97 0.18
98 0.16
99 0.1
100 0.13
101 0.19
102 0.26
103 0.37
104 0.46
105 0.55
106 0.66
107 0.74
108 0.8
109 0.83
110 0.82
111 0.77
112 0.79
113 0.79
114 0.78
115 0.81
116 0.8
117 0.76
118 0.79
119 0.75
120 0.67
121 0.66
122 0.57
123 0.46
124 0.45
125 0.4
126 0.32
127 0.33
128 0.32
129 0.24
130 0.24
131 0.23
132 0.16
133 0.16
134 0.16
135 0.14
136 0.16
137 0.17
138 0.18
139 0.18
140 0.19
141 0.2
142 0.21
143 0.21
144 0.19
145 0.18
146 0.18
147 0.19
148 0.18
149 0.23
150 0.25
151 0.3
152 0.36
153 0.35
154 0.32
155 0.31
156 0.32
157 0.27
158 0.23
159 0.16
160 0.1
161 0.1
162 0.09
163 0.1
164 0.12
165 0.11
166 0.11
167 0.11
168 0.11
169 0.1
170 0.11
171 0.16
172 0.15
173 0.19
174 0.22
175 0.26
176 0.31
177 0.32
178 0.35
179 0.3
180 0.31
181 0.32
182 0.29
183 0.27
184 0.24
185 0.25
186 0.22
187 0.22
188 0.19
189 0.14
190 0.15
191 0.12
192 0.11
193 0.08
194 0.07
195 0.06
196 0.08
197 0.08
198 0.08
199 0.08
200 0.08
201 0.11
202 0.15
203 0.19
204 0.26
205 0.34
206 0.43
207 0.47
208 0.5
209 0.59
210 0.62
211 0.67
212 0.68
213 0.7
214 0.7
215 0.76
216 0.76
217 0.7
218 0.7
219 0.61
220 0.51
221 0.42
222 0.35
223 0.26
224 0.25
225 0.21
226 0.14
227 0.14
228 0.13
229 0.11
230 0.1
231 0.08
232 0.04
233 0.03
234 0.04
235 0.04
236 0.05
237 0.05
238 0.06
239 0.07
240 0.1
241 0.13
242 0.13
243 0.16
244 0.17
245 0.19
246 0.21
247 0.22
248 0.21
249 0.22
250 0.21
251 0.21
252 0.27
253 0.31
254 0.29
255 0.29
256 0.29
257 0.31
258 0.35
259 0.4
260 0.36
261 0.41
262 0.42
263 0.44
264 0.47
265 0.43
266 0.42
267 0.35
268 0.32
269 0.25
270 0.24
271 0.23
272 0.19
273 0.24
274 0.26
275 0.3
276 0.35
277 0.41
278 0.41
279 0.44
280 0.49
281 0.46
282 0.43
283 0.41
284 0.37
285 0.32
286 0.3
287 0.27
288 0.22
289 0.23
290 0.23
291 0.24
292 0.25
293 0.24
294 0.27
295 0.28
296 0.32
297 0.3
298 0.28
299 0.31
300 0.3
301 0.3
302 0.26
303 0.23
304 0.18
305 0.17
306 0.17
307 0.1
308 0.1
309 0.09
310 0.09
311 0.1
312 0.11
313 0.12
314 0.11
315 0.1
316 0.08
317 0.09
318 0.09
319 0.09
320 0.09
321 0.09
322 0.1
323 0.11
324 0.11
325 0.11
326 0.11
327 0.1
328 0.08
329 0.08
330 0.07
331 0.06
332 0.05
333 0.05
334 0.04
335 0.04
336 0.05
337 0.06
338 0.05
339 0.06
340 0.07
341 0.07
342 0.08
343 0.08
344 0.08
345 0.08
346 0.09
347 0.12
348 0.13
349 0.13
350 0.12
351 0.13
352 0.12
353 0.12
354 0.11
355 0.07
356 0.06
357 0.08
358 0.12
359 0.11
360 0.11
361 0.14
362 0.17
363 0.19
364 0.22
365 0.2
366 0.2
367 0.21
368 0.22
369 0.2
370 0.18
371 0.17
372 0.18
373 0.18
374 0.15
375 0.14
376 0.13
377 0.13
378 0.11
379 0.16
380 0.15
381 0.15
382 0.15
383 0.16
384 0.16
385 0.16
386 0.17
387 0.12
388 0.08
389 0.07
390 0.06
391 0.06
392 0.06
393 0.05
394 0.05
395 0.05
396 0.07
397 0.1
398 0.12
399 0.12
400 0.14
401 0.15
402 0.2
403 0.3
404 0.39
405 0.47
406 0.57
407 0.63
408 0.71
409 0.8
410 0.83
411 0.82
412 0.8
413 0.76
414 0.7
415 0.72
416 0.75
417 0.75
418 0.78
419 0.79
420 0.79
421 0.76
422 0.74
423 0.67
424 0.58
425 0.51
426 0.47
427 0.38
428 0.31
429 0.27
430 0.25
431 0.22
432 0.19
433 0.15
434 0.07
435 0.06
436 0.04
437 0.04
438 0.05
439 0.08
440 0.1
441 0.13
442 0.19
443 0.21
444 0.23
445 0.29
446 0.34
447 0.4
448 0.46
449 0.52
450 0.52
451 0.56
452 0.54
453 0.49
454 0.43
455 0.35
456 0.28
457 0.19
458 0.2
459 0.14
460 0.14
461 0.16
462 0.18
463 0.19
464 0.19
465 0.21
466 0.19
467 0.29
468 0.32
469 0.32
470 0.35
471 0.36
472 0.43
473 0.47
474 0.54
475 0.5
476 0.49
477 0.48
478 0.46
479 0.46
480 0.42
481 0.41
482 0.33
483 0.31
484 0.31
485 0.3
486 0.28
487 0.25
488 0.22
489 0.17
490 0.15
491 0.12
492 0.15
493 0.15
494 0.19
495 0.27
496 0.28
497 0.28
498 0.29
499 0.29
500 0.26
501 0.25
502 0.21
503 0.13
504 0.11
505 0.1
506 0.08
507 0.07
508 0.05
509 0.04
510 0.03
511 0.03
512 0.03
513 0.03
514 0.03
515 0.03
516 0.04
517 0.04
518 0.04
519 0.04
520 0.05
521 0.05
522 0.05
523 0.06
524 0.07
525 0.08
526 0.08
527 0.09
528 0.1
529 0.1
530 0.11
531 0.14
532 0.13
533 0.12
534 0.14
535 0.2
536 0.23
537 0.24
538 0.24
539 0.23
540 0.23
541 0.23
542 0.21
543 0.15
544 0.11
545 0.09
546 0.07
547 0.07
548 0.07
549 0.07
550 0.07
551 0.09
552 0.1
553 0.11
554 0.11
555 0.08
556 0.08
557 0.08
558 0.07
559 0.05
560 0.04
561 0.03
562 0.03
563 0.03
564 0.03
565 0.03
566 0.03
567 0.03
568 0.02
569 0.03
570 0.03
571 0.03
572 0.03
573 0.03
574 0.03
575 0.03
576 0.03
577 0.03
578 0.03
579 0.03
580 0.03
581 0.03
582 0.03
583 0.03
584 0.04
585 0.04
586 0.04
587 0.04
588 0.04
589 0.04
590 0.04
591 0.04
592 0.04
593 0.07
594 0.08
595 0.09
596 0.13
597 0.17
598 0.18
599 0.21
600 0.27
601 0.27
602 0.27
603 0.29
604 0.25
605 0.23
606 0.23
607 0.19
608 0.14
609 0.11
610 0.09
611 0.06
612 0.07
613 0.06
614 0.06
615 0.06
616 0.08
617 0.09
618 0.15
619 0.21
620 0.22
621 0.23
622 0.25
623 0.33
624 0.34
625 0.36
626 0.33
627 0.29
628 0.28
629 0.28
630 0.28
631 0.2
632 0.19
633 0.17
634 0.2
635 0.19
636 0.19
637 0.19
638 0.17
639 0.19
640 0.18
641 0.18
642 0.17
643 0.19
644 0.19
645 0.23
646 0.23
647 0.2
648 0.21
649 0.18
650 0.13
651 0.1
652 0.09
653 0.05
654 0.04
655 0.05
656 0.06
657 0.06
658 0.06
659 0.07
660 0.07
661 0.07
662 0.1
663 0.11
664 0.1
665 0.12
666 0.14
667 0.19
668 0.22
669 0.24
670 0.23
671 0.22
672 0.21
673 0.23
674 0.23
675 0.19
676 0.16
677 0.15
678 0.13
679 0.13
680 0.13
681 0.09
682 0.08
683 0.07
684 0.06
685 0.06
686 0.06
687 0.05
688 0.04
689 0.05
690 0.06
691 0.07
692 0.09
693 0.11
694 0.12
695 0.12
696 0.13
697 0.12
698 0.11
699 0.11
700 0.1
701 0.09
702 0.1
703 0.1
704 0.09
705 0.09
706 0.09
707 0.07
708 0.07
709 0.06
710 0.05
711 0.07
712 0.08
713 0.08
714 0.1
715 0.15
716 0.15
717 0.15
718 0.15
719 0.13
720 0.13
721 0.14
722 0.12
723 0.07
724 0.09
725 0.09
726 0.08
727 0.08
728 0.07
729 0.06
730 0.06
731 0.06
732 0.05
733 0.05
734 0.06
735 0.06
736 0.06
737 0.07
738 0.1
739 0.11
740 0.11
741 0.12
742 0.11
743 0.11
744 0.14
745 0.13
746 0.11
747 0.1
748 0.1
749 0.13
750 0.14
751 0.13
752 0.11
753 0.09
754 0.1
755 0.1
756 0.09
757 0.07
758 0.06
759 0.1
760 0.11
761 0.11
762 0.13
763 0.2
764 0.22
765 0.25
766 0.25
767 0.22
768 0.22
769 0.23
770 0.21
771 0.19
772 0.18
773 0.19
774 0.25
775 0.3
776 0.32
777 0.31
778 0.31
779 0.27
780 0.25
781 0.24
782 0.22
783 0.18
784 0.17
785 0.17
786 0.16
787 0.16
788 0.15
789 0.15
790 0.1
791 0.11
792 0.1
793 0.11
794 0.11
795 0.11
796 0.12
797 0.11
798 0.11
799 0.08
800 0.09
801 0.08
802 0.11
803 0.14
804 0.15
805 0.15
806 0.15
807 0.15
808 0.17
809 0.23
810 0.21
811 0.23
812 0.24
813 0.29
814 0.29
815 0.3
816 0.29
817 0.23
818 0.26
819 0.24
820 0.23
821 0.17
822 0.18
823 0.17
824 0.15
825 0.15
826 0.1
827 0.1
828 0.07
829 0.07
830 0.08
831 0.08
832 0.09
833 0.09
834 0.11
835 0.1
836 0.13
837 0.15
838 0.13
839 0.16
840 0.2
841 0.24
842 0.24
843 0.24
844 0.22
845 0.22
846 0.22
847 0.21
848 0.21
849 0.17
850 0.16
851 0.21
852 0.21
853 0.21
854 0.26
855 0.27
856 0.23
857 0.27
858 0.26
859 0.2
860 0.2
861 0.19
862 0.15
863 0.13
864 0.14
865 0.11
866 0.18
867 0.19
868 0.19
869 0.26
870 0.25
871 0.29
872 0.34
873 0.36
874 0.34
875 0.39
876 0.39
877 0.34
878 0.44
879 0.48
880 0.43
881 0.48
882 0.53
883 0.54
884 0.56
885 0.59
886 0.56
887 0.53
888 0.56
889 0.54
890 0.52
891 0.5
892 0.47
893 0.48
894 0.44
895 0.39
896 0.37
897 0.32
898 0.24
899 0.21
900 0.23
901 0.19
902 0.25
903 0.33
904 0.38
905 0.45
906 0.53
907 0.55
908 0.57
909 0.6
910 0.57
911 0.52
912 0.48
913 0.41
914 0.38
915 0.37
916 0.38
917 0.33
918 0.3
919 0.3
920 0.34
921 0.34
922 0.35
923 0.45
924 0.45
925 0.53
926 0.61
927 0.67
928 0.66
929 0.71
930 0.72
931 0.66
932 0.64
933 0.61
934 0.54
935 0.46
936 0.4
937 0.35
938 0.28
939 0.25
940 0.23
941 0.2
942 0.19
943 0.19
944 0.27
945 0.27
946 0.31
947 0.31
948 0.36
949 0.37
950 0.38
951 0.48
952 0.43
953 0.52
954 0.52
955 0.5
956 0.42
957 0.4
958 0.37
959 0.26
960 0.21
961 0.12
962 0.08
963 0.07
964 0.07
965 0.06
966 0.06
967 0.06
968 0.06
969 0.06
970 0.06
971 0.08
972 0.09
973 0.09
974 0.1
975 0.13
976 0.19
977 0.2
978 0.22
979 0.26
980 0.25
981 0.27
982 0.27
983 0.25
984 0.19
985 0.18
986 0.16
987 0.1
988 0.08
989 0.07
990 0.06
991 0.05
992 0.05
993 0.04
994 0.04
995 0.04
996 0.04
997 0.03
998 0.04
999 0.04
1000 0.04
1001 0.07
1002 0.08
1003 0.08
1004 0.08
1005 0.08
1006 0.07
1007 0.08
1008 0.07
1009 0.04
1010 0.05
1011 0.04
1012 0.04
1013 0.04
1014 0.04
1015 0.03
1016 0.03
1017 0.03
1018 0.02
1019 0.02
1020 0.02
1021 0.02
1022 0.03
1023 0.03
1024 0.03
1025 0.03
1026 0.03
1027 0.03
1028 0.03
1029 0.03
1030 0.03
1031 0.03
1032 0.03
1033 0.03
1034 0.04
1035 0.04
1036 0.04
1037 0.04
1038 0.04
1039 0.04
1040 0.05
1041 0.06
1042 0.07
1043 0.07
1044 0.07
1045 0.08
1046 0.07
1047 0.07
1048 0.07
1049 0.06
1050 0.05
1051 0.05
1052 0.04
1053 0.03
1054 0.03
1055 0.03
1056 0.03
1057 0.03
1058 0.03
1059 0.03
1060 0.03
1061 0.04
1062 0.04
1063 0.04
1064 0.05
1065 0.08
1066 0.08
1067 0.09
1068 0.1
1069 0.1
1070 0.13
1071 0.18
1072 0.23
1073 0.27
1074 0.31
1075 0.4
1076 0.44
1077 0.48
1078 0.51
1079 0.51
1080 0.48
1081 0.49
1082 0.48
1083 0.41
1084 0.42
1085 0.4
1086 0.34
1087 0.32
1088 0.32
1089 0.28
1090 0.25
1091 0.23
1092 0.18
1093 0.17
1094 0.17
1095 0.14
1096 0.13
1097 0.11
1098 0.11
1099 0.12
1100 0.13
1101 0.13
1102 0.16
1103 0.22
1104 0.3
1105 0.35
1106 0.4
1107 0.4
1108 0.4
1109 0.4
1110 0.38
1111 0.31
1112 0.24
1113 0.2
1114 0.16
1115 0.14
1116 0.12
1117 0.15
1118 0.15
1119 0.15
1120 0.13
1121 0.14
1122 0.15
1123 0.16
1124 0.17
1125 0.16
1126 0.18
1127 0.21
1128 0.22
1129 0.2
1130 0.22
1131 0.21
1132 0.2
1133 0.18
1134 0.18
1135 0.16
1136 0.15
1137 0.15
1138 0.12
1139 0.12
1140 0.11
1141 0.11
1142 0.09
1143 0.1
1144 0.1
1145 0.1
1146 0.11
1147 0.11
1148 0.11
1149 0.12
1150 0.11
1151 0.11
1152 0.09
1153 0.09
1154 0.08
1155 0.07
1156 0.08
1157 0.07
1158 0.06
1159 0.05
1160 0.06
1161 0.06
1162 0.07
1163 0.08
1164 0.07
1165 0.08
1166 0.1
1167 0.18
1168 0.23
1169 0.25
1170 0.28
1171 0.31
1172 0.37
1173 0.46
1174 0.54
1175 0.52
1176 0.54
1177 0.53
1178 0.52
1179 0.55
1180 0.52
1181 0.45
1182 0.4
1183 0.35
1184 0.32
1185 0.37
1186 0.39
1187 0.38
1188 0.41
1189 0.38
1190 0.35
1191 0.35
1192 0.3
1193 0.25
1194 0.22
1195 0.17
1196 0.11
1197 0.11
1198 0.11