Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3EP06

Protein Details
Accession A0A5C3EP06    Localization Confidence High Confidence Score 16.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
109-135GVAPRAKMNQQRSRRFRAAKEAREKHEHydrophilic
409-431DDIFRRRKEDEDRRENNKKRREEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
120-133RSRRFRAAKEAREK
414-435RRKEDEDRRENNKKRREEMQKR
933-935RGR
1172-1188AHHRGGGRGGRGGRGGR
Subcellular Location(s) cyto 9.5, mito 9, cyto_nucl 9, nucl 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR017151  Xrn2/3/4  
IPR001878  Znf_CCHC  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006353  P:DNA-templated transcription termination  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MGVPALFRWLSKKYPRIVSSVQEQDPKTAPGPDGTVITLPLDTSTPNPNGEEFDCLYLDMNGIVHPCTHPEGKPAPETEEEMMVEVFAYTERVVNMVRPRRLLMMAIDGVAPRAKMNQQRSRRFRAAKEAREKHEEKEAALAEWKAKGLPVTDDALESKKAWDSNAITPGTPFMDLLAASLRFWVAQKINTDPGWKDIQVIISDASVPGEGEHKIMEHIRRQRSHPEHDPNTKHVIYGLDADLIMLSLATHEPYFKVLREDVFASDNKPKTCNLCGQPGHFAASCKGTAKKKSGEHDEIAPTPPEKKPFIFLDVATLREYLEVELNIPQLPFAFDLERAIDDWVFLIFFVGNDFLPHLPSLEIRDGAIDTLLRIWKKELPAMGGYLTNHGKVELGRAQLILNGLASEEDDIFRRRKEDEDRRENNKKRREEMQKRREAELDEGNFGNGSMVQVMSKKRPAHETEKPAFNGVSAQDAREKANSNNKSYDPRKKAVVLGGDNNQVVRDRNAARQANMDAAEALKAELMGGSATKKEEDNAVAEPPVKKVKTDSGAEATSSTAEKHENGEDAEAVKAEDENGNGGAPEAEADPDADADADDDDDDDDDENDDEGNEDVDPVTTVKKRTVNADGTVDYEDTVKMWEPGYRERYYKEKFGVDLSDTDFRRQVVKSYIEGLCWVLAYYYQGVPSWQWYYPFHFSPFAADFEDLESLDIKFELGAPFKPFEQLMGVLPADSRASIPEAFHPLMTESDSDIIDFYPSEFEIDMNGKKMAWQGVALLPFIDEKRLLDALKDKYPLLSEDEVRRNGFGNNTLFVGSESRLYEFLCEEIYAKKPSAEEAKPAPVPVNPALSGGITGYVKPDPVCVPGSTFNSPLTSQDLHDIHNDRSISVLYDFPEQKTPHRSVLLKGLKPPKRTLTPAEIDWVKRGSPDTRGRGRGRGGYGGPGRDFHRNHNNNSNHNNNHYGGEQGHSNPNFRNNHNNNNGGGGGGSGYGSHNGYGGGYQQDYPQYNQSSGGGGYGAYGGYGSGGYGGQAQAAAAYGGYGGYGAAAASSYPSGGGYDPYAGYGAGYGGGYGGGNSSSYAPQSAPKGPRDDRYAAYTQPNTHVGGASRGGRHANAPPNPAYAGLPSLGGPSPAPAHAPTPYGGYGAPYGGSGYGNGGAYGGGGGYSAPPPPAHHRGGGRGGRGGRGGRGGANNNASYGGHGGAYGSFY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.61
3 0.64
4 0.64
5 0.61
6 0.61
7 0.62
8 0.59
9 0.56
10 0.54
11 0.51
12 0.49
13 0.47
14 0.4
15 0.34
16 0.31
17 0.26
18 0.28
19 0.25
20 0.24
21 0.22
22 0.2
23 0.17
24 0.17
25 0.15
26 0.12
27 0.11
28 0.1
29 0.1
30 0.12
31 0.18
32 0.19
33 0.21
34 0.22
35 0.23
36 0.26
37 0.26
38 0.29
39 0.24
40 0.24
41 0.22
42 0.21
43 0.21
44 0.17
45 0.16
46 0.11
47 0.1
48 0.09
49 0.09
50 0.09
51 0.1
52 0.1
53 0.13
54 0.17
55 0.2
56 0.2
57 0.27
58 0.33
59 0.36
60 0.41
61 0.4
62 0.4
63 0.39
64 0.42
65 0.36
66 0.33
67 0.28
68 0.24
69 0.22
70 0.17
71 0.14
72 0.1
73 0.09
74 0.06
75 0.07
76 0.06
77 0.08
78 0.08
79 0.1
80 0.1
81 0.16
82 0.25
83 0.33
84 0.37
85 0.38
86 0.4
87 0.42
88 0.42
89 0.39
90 0.32
91 0.29
92 0.26
93 0.24
94 0.23
95 0.19
96 0.19
97 0.18
98 0.16
99 0.1
100 0.13
101 0.19
102 0.26
103 0.37
104 0.46
105 0.55
106 0.66
107 0.74
108 0.8
109 0.83
110 0.82
111 0.77
112 0.79
113 0.79
114 0.78
115 0.81
116 0.8
117 0.76
118 0.79
119 0.75
120 0.67
121 0.66
122 0.57
123 0.46
124 0.45
125 0.4
126 0.32
127 0.33
128 0.32
129 0.24
130 0.24
131 0.23
132 0.16
133 0.16
134 0.15
135 0.14
136 0.16
137 0.17
138 0.18
139 0.18
140 0.19
141 0.2
142 0.21
143 0.21
144 0.19
145 0.18
146 0.18
147 0.19
148 0.18
149 0.23
150 0.25
151 0.3
152 0.36
153 0.35
154 0.32
155 0.31
156 0.32
157 0.27
158 0.23
159 0.16
160 0.1
161 0.1
162 0.09
163 0.1
164 0.12
165 0.11
166 0.11
167 0.11
168 0.11
169 0.1
170 0.11
171 0.16
172 0.15
173 0.19
174 0.22
175 0.26
176 0.31
177 0.31
178 0.35
179 0.3
180 0.31
181 0.32
182 0.29
183 0.27
184 0.24
185 0.25
186 0.22
187 0.22
188 0.19
189 0.14
190 0.15
191 0.12
192 0.11
193 0.08
194 0.07
195 0.06
196 0.08
197 0.08
198 0.08
199 0.08
200 0.08
201 0.1
202 0.15
203 0.19
204 0.26
205 0.34
206 0.43
207 0.47
208 0.5
209 0.59
210 0.62
211 0.66
212 0.68
213 0.7
214 0.7
215 0.76
216 0.76
217 0.7
218 0.7
219 0.61
220 0.51
221 0.42
222 0.35
223 0.26
224 0.25
225 0.21
226 0.14
227 0.14
228 0.13
229 0.11
230 0.1
231 0.08
232 0.04
233 0.03
234 0.04
235 0.04
236 0.05
237 0.05
238 0.06
239 0.07
240 0.1
241 0.12
242 0.13
243 0.16
244 0.17
245 0.18
246 0.21
247 0.22
248 0.21
249 0.22
250 0.21
251 0.21
252 0.27
253 0.31
254 0.29
255 0.29
256 0.29
257 0.31
258 0.35
259 0.4
260 0.35
261 0.41
262 0.42
263 0.43
264 0.47
265 0.43
266 0.42
267 0.35
268 0.32
269 0.25
270 0.24
271 0.23
272 0.2
273 0.26
274 0.29
275 0.33
276 0.39
277 0.44
278 0.48
279 0.54
280 0.61
281 0.6
282 0.56
283 0.56
284 0.53
285 0.48
286 0.44
287 0.38
288 0.29
289 0.27
290 0.27
291 0.26
292 0.25
293 0.24
294 0.27
295 0.28
296 0.32
297 0.3
298 0.27
299 0.31
300 0.3
301 0.3
302 0.26
303 0.23
304 0.18
305 0.16
306 0.17
307 0.09
308 0.1
309 0.09
310 0.09
311 0.1
312 0.11
313 0.12
314 0.11
315 0.1
316 0.08
317 0.09
318 0.09
319 0.09
320 0.09
321 0.09
322 0.1
323 0.11
324 0.11
325 0.11
326 0.11
327 0.1
328 0.08
329 0.08
330 0.07
331 0.06
332 0.05
333 0.05
334 0.04
335 0.04
336 0.05
337 0.06
338 0.05
339 0.06
340 0.07
341 0.07
342 0.08
343 0.08
344 0.08
345 0.08
346 0.09
347 0.12
348 0.13
349 0.13
350 0.12
351 0.13
352 0.12
353 0.12
354 0.11
355 0.07
356 0.06
357 0.08
358 0.12
359 0.11
360 0.11
361 0.14
362 0.17
363 0.19
364 0.21
365 0.2
366 0.2
367 0.21
368 0.21
369 0.2
370 0.18
371 0.17
372 0.18
373 0.17
374 0.15
375 0.14
376 0.13
377 0.13
378 0.11
379 0.15
380 0.15
381 0.15
382 0.15
383 0.16
384 0.16
385 0.16
386 0.17
387 0.12
388 0.08
389 0.06
390 0.06
391 0.05
392 0.06
393 0.05
394 0.05
395 0.05
396 0.07
397 0.1
398 0.11
399 0.12
400 0.14
401 0.15
402 0.2
403 0.3
404 0.39
405 0.47
406 0.57
407 0.63
408 0.71
409 0.8
410 0.83
411 0.82
412 0.8
413 0.76
414 0.7
415 0.72
416 0.74
417 0.75
418 0.78
419 0.79
420 0.79
421 0.76
422 0.74
423 0.67
424 0.58
425 0.51
426 0.47
427 0.38
428 0.31
429 0.27
430 0.25
431 0.21
432 0.19
433 0.15
434 0.07
435 0.06
436 0.04
437 0.04
438 0.05
439 0.08
440 0.1
441 0.13
442 0.19
443 0.21
444 0.23
445 0.29
446 0.34
447 0.39
448 0.46
449 0.52
450 0.52
451 0.55
452 0.54
453 0.49
454 0.43
455 0.35
456 0.28
457 0.19
458 0.19
459 0.14
460 0.14
461 0.16
462 0.17
463 0.18
464 0.19
465 0.21
466 0.19
467 0.29
468 0.32
469 0.32
470 0.35
471 0.36
472 0.42
473 0.47
474 0.54
475 0.5
476 0.48
477 0.48
478 0.46
479 0.46
480 0.42
481 0.41
482 0.33
483 0.3
484 0.31
485 0.3
486 0.28
487 0.25
488 0.22
489 0.17
490 0.15
491 0.12
492 0.14
493 0.14
494 0.18
495 0.27
496 0.28
497 0.28
498 0.29
499 0.29
500 0.26
501 0.24
502 0.21
503 0.12
504 0.11
505 0.1
506 0.08
507 0.07
508 0.05
509 0.04
510 0.03
511 0.03
512 0.03
513 0.03
514 0.03
515 0.04
516 0.05
517 0.05
518 0.06
519 0.06
520 0.07
521 0.08
522 0.09
523 0.1
524 0.11
525 0.11
526 0.11
527 0.13
528 0.13
529 0.14
530 0.18
531 0.17
532 0.16
533 0.17
534 0.22
535 0.25
536 0.26
537 0.26
538 0.24
539 0.24
540 0.24
541 0.23
542 0.17
543 0.13
544 0.12
545 0.09
546 0.07
547 0.07
548 0.08
549 0.09
550 0.1
551 0.1
552 0.1
553 0.1
554 0.09
555 0.09
556 0.09
557 0.07
558 0.06
559 0.05
560 0.05
561 0.05
562 0.05
563 0.05
564 0.05
565 0.05
566 0.05
567 0.05
568 0.05
569 0.04
570 0.04
571 0.04
572 0.04
573 0.04
574 0.04
575 0.04
576 0.04
577 0.04
578 0.04
579 0.03
580 0.03
581 0.03
582 0.03
583 0.03
584 0.03
585 0.03
586 0.03
587 0.03
588 0.04
589 0.03
590 0.04
591 0.04
592 0.04
593 0.04
594 0.04
595 0.04
596 0.04
597 0.04
598 0.04
599 0.04
600 0.04
601 0.04
602 0.04
603 0.04
604 0.04
605 0.07
606 0.08
607 0.1
608 0.13
609 0.17
610 0.18
611 0.22
612 0.27
613 0.28
614 0.28
615 0.29
616 0.26
617 0.24
618 0.23
619 0.2
620 0.14
621 0.11
622 0.09
623 0.07
624 0.07
625 0.06
626 0.06
627 0.06
628 0.08
629 0.1
630 0.16
631 0.21
632 0.23
633 0.24
634 0.25
635 0.33
636 0.34
637 0.36
638 0.33
639 0.29
640 0.28
641 0.28
642 0.28
643 0.21
644 0.2
645 0.18
646 0.21
647 0.19
648 0.2
649 0.19
650 0.18
651 0.19
652 0.18
653 0.18
654 0.18
655 0.2
656 0.2
657 0.23
658 0.23
659 0.21
660 0.21
661 0.18
662 0.13
663 0.11
664 0.1
665 0.05
666 0.04
667 0.05
668 0.06
669 0.06
670 0.07
671 0.07
672 0.07
673 0.07
674 0.1
675 0.12
676 0.11
677 0.13
678 0.14
679 0.19
680 0.23
681 0.24
682 0.23
683 0.22
684 0.22
685 0.23
686 0.23
687 0.19
688 0.17
689 0.15
690 0.13
691 0.13
692 0.14
693 0.1
694 0.08
695 0.07
696 0.06
697 0.06
698 0.06
699 0.05
700 0.04
701 0.05
702 0.07
703 0.07
704 0.09
705 0.11
706 0.12
707 0.12
708 0.13
709 0.12
710 0.11
711 0.11
712 0.1
713 0.09
714 0.11
715 0.1
716 0.09
717 0.09
718 0.09
719 0.08
720 0.07
721 0.06
722 0.05
723 0.07
724 0.08
725 0.09
726 0.1
727 0.15
728 0.16
729 0.15
730 0.15
731 0.14
732 0.14
733 0.14
734 0.12
735 0.08
736 0.09
737 0.09
738 0.08
739 0.08
740 0.07
741 0.07
742 0.06
743 0.06
744 0.05
745 0.05
746 0.06
747 0.06
748 0.06
749 0.07
750 0.1
751 0.11
752 0.12
753 0.12
754 0.11
755 0.12
756 0.14
757 0.14
758 0.11
759 0.11
760 0.11
761 0.13
762 0.14
763 0.13
764 0.11
765 0.1
766 0.11
767 0.1
768 0.1
769 0.07
770 0.07
771 0.1
772 0.12
773 0.11
774 0.12
775 0.18
776 0.22
777 0.25
778 0.26
779 0.24
780 0.23
781 0.24
782 0.23
783 0.22
784 0.2
785 0.19
786 0.25
787 0.31
788 0.33
789 0.32
790 0.31
791 0.27
792 0.26
793 0.24
794 0.22
795 0.19
796 0.17
797 0.17
798 0.17
799 0.16
800 0.15
801 0.15
802 0.1
803 0.11
804 0.11
805 0.11
806 0.11
807 0.11
808 0.12
809 0.1
810 0.1
811 0.08
812 0.08
813 0.08
814 0.1
815 0.13
816 0.15
817 0.15
818 0.16
819 0.15
820 0.18
821 0.25
822 0.24
823 0.25
824 0.26
825 0.32
826 0.31
827 0.31
828 0.29
829 0.22
830 0.26
831 0.23
832 0.22
833 0.17
834 0.17
835 0.17
836 0.16
837 0.15
838 0.11
839 0.11
840 0.08
841 0.07
842 0.09
843 0.09
844 0.09
845 0.09
846 0.11
847 0.1
848 0.13
849 0.15
850 0.14
851 0.16
852 0.2
853 0.25
854 0.25
855 0.25
856 0.23
857 0.23
858 0.23
859 0.21
860 0.21
861 0.18
862 0.16
863 0.22
864 0.22
865 0.21
866 0.26
867 0.28
868 0.24
869 0.27
870 0.27
871 0.2
872 0.2
873 0.19
874 0.15
875 0.14
876 0.15
877 0.11
878 0.18
879 0.19
880 0.2
881 0.26
882 0.26
883 0.3
884 0.35
885 0.37
886 0.35
887 0.39
888 0.4
889 0.35
890 0.45
891 0.49
892 0.44
893 0.49
894 0.54
895 0.55
896 0.57
897 0.6
898 0.57
899 0.54
900 0.56
901 0.55
902 0.53
903 0.51
904 0.48
905 0.49
906 0.45
907 0.4
908 0.38
909 0.33
910 0.24
911 0.22
912 0.24
913 0.2
914 0.25
915 0.33
916 0.39
917 0.45
918 0.54
919 0.55
920 0.58
921 0.6
922 0.57
923 0.51
924 0.47
925 0.4
926 0.4
927 0.4
928 0.38
929 0.35
930 0.31
931 0.31
932 0.34
933 0.35
934 0.35
935 0.43
936 0.45
937 0.5
938 0.58
939 0.61
940 0.61
941 0.67
942 0.68
943 0.6
944 0.59
945 0.58
946 0.49
947 0.45
948 0.37
949 0.32
950 0.24
951 0.21
952 0.2
953 0.18
954 0.25
955 0.24
956 0.26
957 0.26
958 0.33
959 0.37
960 0.37
961 0.46
962 0.44
963 0.53
964 0.58
965 0.59
966 0.51
967 0.48
968 0.45
969 0.34
970 0.28
971 0.17
972 0.11
973 0.07
974 0.07
975 0.05
976 0.05
977 0.07
978 0.08
979 0.07
980 0.07
981 0.07
982 0.08
983 0.07
984 0.09
985 0.1
986 0.1
987 0.11
988 0.13
989 0.18
990 0.2
991 0.23
992 0.27
993 0.27
994 0.27
995 0.28
996 0.26
997 0.22
998 0.2
999 0.18
1000 0.12
1001 0.09
1002 0.09
1003 0.08
1004 0.07
1005 0.05
1006 0.04
1007 0.04
1008 0.04
1009 0.04
1010 0.03
1011 0.04
1012 0.04
1013 0.04
1014 0.06
1015 0.06
1016 0.06
1017 0.06
1018 0.06
1019 0.05
1020 0.06
1021 0.05
1022 0.04
1023 0.04
1024 0.03
1025 0.03
1026 0.03
1027 0.03
1028 0.03
1029 0.03
1030 0.03
1031 0.03
1032 0.03
1033 0.03
1034 0.03
1035 0.04
1036 0.04
1037 0.04
1038 0.05
1039 0.05
1040 0.06
1041 0.07
1042 0.08
1043 0.08
1044 0.1
1045 0.1
1046 0.11
1047 0.11
1048 0.1
1049 0.09
1050 0.08
1051 0.07
1052 0.06
1053 0.06
1054 0.05
1055 0.05
1056 0.05
1057 0.05
1058 0.04
1059 0.05
1060 0.04
1061 0.05
1062 0.06
1063 0.08
1064 0.09
1065 0.09
1066 0.11
1067 0.11
1068 0.15
1069 0.19
1070 0.27
1071 0.31
1072 0.35
1073 0.43
1074 0.46
1075 0.52
1076 0.56
1077 0.56
1078 0.5
1079 0.51
1080 0.5
1081 0.45
1082 0.49
1083 0.46
1084 0.42
1085 0.42
1086 0.41
1087 0.36
1088 0.34
1089 0.32
1090 0.25
1091 0.25
1092 0.26
1093 0.26
1094 0.25
1095 0.25
1096 0.26
1097 0.25
1098 0.27
1099 0.31
1100 0.36
1101 0.37
1102 0.4
1103 0.4
1104 0.41
1105 0.4
1106 0.38
1107 0.32
1108 0.24
1109 0.21
1110 0.16
1111 0.15
1112 0.12
1113 0.14
1114 0.13
1115 0.13
1116 0.11
1117 0.12
1118 0.13
1119 0.13
1120 0.16
1121 0.14
1122 0.17
1123 0.18
1124 0.2
1125 0.18
1126 0.2
1127 0.2
1128 0.19
1129 0.17
1130 0.17
1131 0.16
1132 0.15
1133 0.14
1134 0.1
1135 0.1
1136 0.1
1137 0.1
1138 0.08
1139 0.09
1140 0.11
1141 0.11
1142 0.11
1143 0.1
1144 0.09
1145 0.09
1146 0.08
1147 0.06
1148 0.04
1149 0.03
1150 0.04
1151 0.05
1152 0.07
1153 0.08
1154 0.09
1155 0.1
1156 0.15
1157 0.24
1158 0.31
1159 0.33
1160 0.38
1161 0.41
1162 0.47
1163 0.56
1164 0.57
1165 0.51
1166 0.51
1167 0.49
1168 0.46
1169 0.46
1170 0.41
1171 0.34
1172 0.33
1173 0.31
1174 0.29
1175 0.34
1176 0.35
1177 0.37
1178 0.41
1179 0.38
1180 0.35
1181 0.35
1182 0.3
1183 0.25
1184 0.22
1185 0.17
1186 0.11
1187 0.11
1188 0.11