Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3ED19

Protein Details
Accession A0A5C3ED19    Localization Confidence High Confidence Score 16.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
116-142DDPDAAIIRKKKKKRHHSPDEPSSARHBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
124-132RKKKKKRHH
179-189RAGKKKAPRKR
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003746  F:translation elongation factor activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MADEEQPQQHEMPPQSPPQEQSDAAPVDSEQPTTSTHEDTQADAAQDTAAPAGELAGSIDAAPPTHPDHLTTVVRGEDTAEAAASTAAIFDEDDDEDQTDLPSFRKRDARHANNADDPDAAIIRKKKKKRHHSPDEPSSARHDVEREMEPEEEEDPYANMTEAEVRRAKTDRMIDEALRAGKKKAPRKRAGEDDLDLLADEEVATLRREMVHAADDDEEANRLKKPATNKLKLLPKVVATLQKNHLQQSILDNNLLEGVKRWLEPLPDKSLPALNIQHQFFKILERMTIDTISLKMSGLGKVVVFYSMCSRVEPSIKRSAEHLIEIWSRPVLKRSSSYRDRHVASAEWNPDAYGQRAAPAFAGQVADNGRRNVGIPQAVTAGFRVAPQSTAGQRSDSSHEARMANHKRLNQFKSRLKEAKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.41
3 0.43
4 0.43
5 0.42
6 0.43
7 0.4
8 0.38
9 0.39
10 0.35
11 0.32
12 0.29
13 0.23
14 0.24
15 0.24
16 0.23
17 0.15
18 0.15
19 0.17
20 0.22
21 0.24
22 0.22
23 0.23
24 0.28
25 0.28
26 0.29
27 0.3
28 0.28
29 0.26
30 0.22
31 0.21
32 0.15
33 0.14
34 0.13
35 0.09
36 0.06
37 0.05
38 0.05
39 0.05
40 0.05
41 0.05
42 0.05
43 0.05
44 0.05
45 0.05
46 0.06
47 0.06
48 0.07
49 0.07
50 0.09
51 0.12
52 0.16
53 0.16
54 0.17
55 0.2
56 0.26
57 0.28
58 0.26
59 0.25
60 0.22
61 0.22
62 0.2
63 0.18
64 0.13
65 0.12
66 0.11
67 0.09
68 0.08
69 0.08
70 0.07
71 0.06
72 0.05
73 0.04
74 0.03
75 0.04
76 0.04
77 0.04
78 0.06
79 0.07
80 0.07
81 0.08
82 0.09
83 0.09
84 0.09
85 0.09
86 0.09
87 0.09
88 0.1
89 0.16
90 0.17
91 0.22
92 0.3
93 0.31
94 0.41
95 0.51
96 0.57
97 0.62
98 0.67
99 0.67
100 0.64
101 0.64
102 0.54
103 0.43
104 0.34
105 0.25
106 0.19
107 0.14
108 0.13
109 0.19
110 0.27
111 0.36
112 0.45
113 0.53
114 0.63
115 0.75
116 0.82
117 0.87
118 0.88
119 0.91
120 0.92
121 0.93
122 0.91
123 0.81
124 0.71
125 0.65
126 0.56
127 0.45
128 0.36
129 0.28
130 0.21
131 0.23
132 0.24
133 0.19
134 0.19
135 0.19
136 0.18
137 0.17
138 0.16
139 0.13
140 0.1
141 0.09
142 0.07
143 0.07
144 0.07
145 0.06
146 0.05
147 0.05
148 0.11
149 0.11
150 0.15
151 0.17
152 0.18
153 0.2
154 0.22
155 0.23
156 0.22
157 0.27
158 0.25
159 0.27
160 0.29
161 0.26
162 0.26
163 0.28
164 0.26
165 0.22
166 0.21
167 0.17
168 0.18
169 0.26
170 0.34
171 0.4
172 0.47
173 0.55
174 0.61
175 0.67
176 0.72
177 0.7
178 0.65
179 0.57
180 0.48
181 0.4
182 0.32
183 0.25
184 0.16
185 0.11
186 0.06
187 0.05
188 0.03
189 0.03
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.05
195 0.05
196 0.06
197 0.06
198 0.07
199 0.07
200 0.08
201 0.09
202 0.09
203 0.09
204 0.08
205 0.08
206 0.07
207 0.08
208 0.07
209 0.08
210 0.08
211 0.11
212 0.16
213 0.26
214 0.35
215 0.39
216 0.41
217 0.48
218 0.56
219 0.55
220 0.53
221 0.44
222 0.35
223 0.33
224 0.32
225 0.32
226 0.26
227 0.29
228 0.29
229 0.34
230 0.34
231 0.33
232 0.32
233 0.26
234 0.25
235 0.27
236 0.28
237 0.23
238 0.21
239 0.2
240 0.18
241 0.19
242 0.18
243 0.11
244 0.08
245 0.09
246 0.1
247 0.1
248 0.11
249 0.11
250 0.15
251 0.19
252 0.23
253 0.28
254 0.28
255 0.28
256 0.28
257 0.29
258 0.27
259 0.26
260 0.25
261 0.22
262 0.27
263 0.28
264 0.29
265 0.27
266 0.27
267 0.23
268 0.23
269 0.21
270 0.16
271 0.16
272 0.16
273 0.17
274 0.17
275 0.17
276 0.15
277 0.13
278 0.13
279 0.12
280 0.1
281 0.09
282 0.09
283 0.1
284 0.1
285 0.1
286 0.1
287 0.09
288 0.1
289 0.1
290 0.09
291 0.08
292 0.08
293 0.11
294 0.14
295 0.14
296 0.15
297 0.16
298 0.18
299 0.25
300 0.28
301 0.3
302 0.36
303 0.36
304 0.36
305 0.37
306 0.4
307 0.35
308 0.33
309 0.28
310 0.24
311 0.26
312 0.26
313 0.25
314 0.21
315 0.2
316 0.19
317 0.24
318 0.22
319 0.23
320 0.28
321 0.35
322 0.43
323 0.51
324 0.55
325 0.58
326 0.62
327 0.62
328 0.58
329 0.53
330 0.45
331 0.41
332 0.43
333 0.38
334 0.31
335 0.29
336 0.26
337 0.26
338 0.26
339 0.23
340 0.19
341 0.16
342 0.19
343 0.19
344 0.19
345 0.17
346 0.15
347 0.14
348 0.12
349 0.13
350 0.09
351 0.12
352 0.15
353 0.2
354 0.22
355 0.23
356 0.22
357 0.22
358 0.23
359 0.22
360 0.25
361 0.23
362 0.2
363 0.21
364 0.23
365 0.23
366 0.22
367 0.2
368 0.16
369 0.12
370 0.13
371 0.14
372 0.12
373 0.12
374 0.14
375 0.19
376 0.22
377 0.26
378 0.27
379 0.27
380 0.27
381 0.3
382 0.34
383 0.34
384 0.34
385 0.33
386 0.37
387 0.36
388 0.38
389 0.45
390 0.48
391 0.52
392 0.53
393 0.55
394 0.59
395 0.68
396 0.71
397 0.71
398 0.73
399 0.73
400 0.75
401 0.79