Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5M9K0Q5

Protein Details
Accession A0A5M9K0Q5    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
18-41SRSNAAMPAKSRKRPQSRASTTSVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
15-32IKRSRSNAAMPAKSRKRP
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003150  DNA-bd_RFX  
IPR039779  RFX-like  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF02257  RFX_DNA_binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51526  RFX_DBD  
Amino Acid Sequences MEIMDQHPPGEKIPIKRSRSNAAMPAKSRKRPQSRASTTSVHSGLAQPVLEQQYMDPAQWYEHNSNPQHSNIPQLSAEDMVMHSAPQLQNPRHYDMESSLNGVSNHTMQTYHPEIPYKPENGRQSVPMDGYAQNYGEGDNQIIEGRSDEQDEVDSLAGTAGTTKKPSRSSAANELEMRQLFHSNKHRTLQEVAAELLLNERGPQSERQRQVFAMLWINKVCDKGTGSVPRGRVYANYVSRCGTEKVTVLNPASFGKLVRVLFPGLKTRRLGVRGESKYHYVNFSLRDDQPQLHETQTHQPITNFNDASFAQSFNITSQMQNSMDKYQIDRAPFPSPAIPQETEHRRQRSEGFIRPHSLYTHPVVTKLADLECTTKTPQVLHFAPLGEPSLQEYGAILLPKIQQFLPTGTDPDSALALSALYRSHCTSLIEQVRFCKEKTFFHLFTAFQGTLTMPVQKLFADKALAPWINQCDIIMYQNMMRVVAPLTLQVVPKVVLDTLRNISDRLVKHIQSSFHGQPVHVIEAKVGPATTFASLLDKELRVNLTAHAAANMLSNPYNRDTMYEDFITMVNVRKVAESVPTRGMDDVVNLLITELRDLLDPSEVSWELERQTPFGEMAARMGRQRQASVHADPTTENVLDRWVNMLLSLTAKFPYATHAEIVWCVQKIGTAVMRDLTIAQGKSFGAWWVTKCWIDEMIAFMAEQGGFMQRETIQSGMGDMSQNPAASRRNSQQGGRYSSGSDDFLARGVNGERSAGPRPMDHARDAAMNAAAGHDDSGIGMRTPEDEFAMGKFGFTQDDVHASMESNPLHTMSQGSLS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.58
3 0.64
4 0.68
5 0.68
6 0.7
7 0.68
8 0.67
9 0.67
10 0.67
11 0.65
12 0.71
13 0.71
14 0.73
15 0.75
16 0.77
17 0.78
18 0.8
19 0.84
20 0.85
21 0.85
22 0.83
23 0.8
24 0.75
25 0.66
26 0.64
27 0.55
28 0.44
29 0.36
30 0.32
31 0.29
32 0.25
33 0.23
34 0.16
35 0.21
36 0.23
37 0.22
38 0.19
39 0.17
40 0.23
41 0.23
42 0.23
43 0.19
44 0.17
45 0.19
46 0.22
47 0.28
48 0.24
49 0.29
50 0.38
51 0.39
52 0.44
53 0.45
54 0.45
55 0.45
56 0.41
57 0.44
58 0.37
59 0.37
60 0.32
61 0.3
62 0.29
63 0.24
64 0.23
65 0.15
66 0.14
67 0.12
68 0.11
69 0.1
70 0.09
71 0.14
72 0.14
73 0.19
74 0.28
75 0.29
76 0.37
77 0.42
78 0.47
79 0.44
80 0.44
81 0.41
82 0.36
83 0.4
84 0.32
85 0.3
86 0.25
87 0.26
88 0.25
89 0.23
90 0.22
91 0.17
92 0.17
93 0.15
94 0.15
95 0.12
96 0.19
97 0.23
98 0.25
99 0.25
100 0.28
101 0.28
102 0.35
103 0.4
104 0.38
105 0.37
106 0.42
107 0.46
108 0.48
109 0.49
110 0.46
111 0.43
112 0.42
113 0.38
114 0.32
115 0.29
116 0.24
117 0.24
118 0.22
119 0.2
120 0.16
121 0.15
122 0.14
123 0.13
124 0.12
125 0.11
126 0.09
127 0.09
128 0.1
129 0.1
130 0.1
131 0.09
132 0.11
133 0.11
134 0.13
135 0.13
136 0.12
137 0.13
138 0.13
139 0.13
140 0.1
141 0.09
142 0.08
143 0.07
144 0.07
145 0.06
146 0.08
147 0.09
148 0.1
149 0.14
150 0.17
151 0.23
152 0.26
153 0.3
154 0.33
155 0.37
156 0.43
157 0.49
158 0.52
159 0.52
160 0.5
161 0.48
162 0.47
163 0.41
164 0.35
165 0.26
166 0.27
167 0.22
168 0.29
169 0.38
170 0.4
171 0.45
172 0.49
173 0.49
174 0.46
175 0.49
176 0.45
177 0.38
178 0.33
179 0.28
180 0.23
181 0.22
182 0.18
183 0.15
184 0.12
185 0.08
186 0.07
187 0.07
188 0.08
189 0.1
190 0.17
191 0.25
192 0.33
193 0.39
194 0.43
195 0.45
196 0.44
197 0.45
198 0.41
199 0.36
200 0.35
201 0.31
202 0.3
203 0.28
204 0.29
205 0.26
206 0.25
207 0.22
208 0.16
209 0.16
210 0.16
211 0.23
212 0.29
213 0.31
214 0.35
215 0.37
216 0.35
217 0.34
218 0.32
219 0.26
220 0.24
221 0.29
222 0.32
223 0.32
224 0.32
225 0.32
226 0.33
227 0.34
228 0.31
229 0.24
230 0.19
231 0.18
232 0.2
233 0.21
234 0.23
235 0.21
236 0.2
237 0.19
238 0.18
239 0.18
240 0.15
241 0.13
242 0.11
243 0.15
244 0.15
245 0.15
246 0.16
247 0.16
248 0.18
249 0.2
250 0.27
251 0.25
252 0.29
253 0.28
254 0.29
255 0.32
256 0.33
257 0.33
258 0.3
259 0.38
260 0.38
261 0.42
262 0.41
263 0.39
264 0.39
265 0.38
266 0.33
267 0.25
268 0.24
269 0.23
270 0.24
271 0.26
272 0.25
273 0.27
274 0.27
275 0.26
276 0.27
277 0.25
278 0.23
279 0.19
280 0.2
281 0.19
282 0.25
283 0.3
284 0.29
285 0.28
286 0.27
287 0.3
288 0.33
289 0.36
290 0.28
291 0.22
292 0.23
293 0.22
294 0.25
295 0.22
296 0.18
297 0.12
298 0.12
299 0.13
300 0.1
301 0.14
302 0.1
303 0.1
304 0.11
305 0.14
306 0.14
307 0.16
308 0.17
309 0.15
310 0.17
311 0.18
312 0.18
313 0.2
314 0.22
315 0.23
316 0.23
317 0.24
318 0.25
319 0.25
320 0.25
321 0.21
322 0.19
323 0.19
324 0.22
325 0.2
326 0.18
327 0.25
328 0.31
329 0.36
330 0.42
331 0.44
332 0.4
333 0.42
334 0.43
335 0.45
336 0.45
337 0.45
338 0.43
339 0.43
340 0.45
341 0.44
342 0.42
343 0.34
344 0.29
345 0.25
346 0.21
347 0.24
348 0.2
349 0.2
350 0.19
351 0.18
352 0.17
353 0.15
354 0.13
355 0.09
356 0.09
357 0.11
358 0.11
359 0.12
360 0.13
361 0.13
362 0.13
363 0.13
364 0.14
365 0.18
366 0.19
367 0.18
368 0.19
369 0.18
370 0.17
371 0.17
372 0.16
373 0.1
374 0.09
375 0.09
376 0.08
377 0.08
378 0.07
379 0.07
380 0.06
381 0.08
382 0.08
383 0.06
384 0.07
385 0.09
386 0.09
387 0.11
388 0.1
389 0.1
390 0.11
391 0.13
392 0.14
393 0.12
394 0.13
395 0.13
396 0.14
397 0.12
398 0.11
399 0.1
400 0.07
401 0.07
402 0.05
403 0.04
404 0.03
405 0.04
406 0.04
407 0.04
408 0.06
409 0.07
410 0.08
411 0.09
412 0.1
413 0.11
414 0.18
415 0.24
416 0.25
417 0.24
418 0.26
419 0.3
420 0.3
421 0.29
422 0.27
423 0.23
424 0.25
425 0.32
426 0.37
427 0.33
428 0.34
429 0.37
430 0.31
431 0.3
432 0.32
433 0.24
434 0.16
435 0.16
436 0.13
437 0.12
438 0.12
439 0.12
440 0.08
441 0.08
442 0.09
443 0.09
444 0.1
445 0.08
446 0.09
447 0.09
448 0.09
449 0.1
450 0.15
451 0.15
452 0.14
453 0.16
454 0.17
455 0.16
456 0.16
457 0.14
458 0.1
459 0.1
460 0.11
461 0.09
462 0.08
463 0.08
464 0.1
465 0.1
466 0.09
467 0.08
468 0.08
469 0.08
470 0.08
471 0.08
472 0.06
473 0.08
474 0.1
475 0.1
476 0.09
477 0.09
478 0.09
479 0.09
480 0.09
481 0.08
482 0.08
483 0.09
484 0.12
485 0.13
486 0.15
487 0.15
488 0.15
489 0.16
490 0.2
491 0.2
492 0.24
493 0.26
494 0.25
495 0.28
496 0.31
497 0.31
498 0.27
499 0.34
500 0.28
501 0.28
502 0.28
503 0.24
504 0.24
505 0.25
506 0.26
507 0.2
508 0.19
509 0.15
510 0.15
511 0.16
512 0.13
513 0.1
514 0.07
515 0.07
516 0.08
517 0.08
518 0.07
519 0.07
520 0.09
521 0.09
522 0.1
523 0.12
524 0.11
525 0.11
526 0.13
527 0.13
528 0.12
529 0.13
530 0.12
531 0.12
532 0.13
533 0.13
534 0.11
535 0.11
536 0.1
537 0.1
538 0.09
539 0.08
540 0.08
541 0.09
542 0.11
543 0.13
544 0.14
545 0.13
546 0.15
547 0.18
548 0.19
549 0.22
550 0.2
551 0.19
552 0.18
553 0.18
554 0.17
555 0.14
556 0.14
557 0.11
558 0.12
559 0.12
560 0.11
561 0.12
562 0.12
563 0.18
564 0.17
565 0.2
566 0.23
567 0.23
568 0.24
569 0.24
570 0.24
571 0.17
572 0.15
573 0.13
574 0.09
575 0.08
576 0.07
577 0.07
578 0.07
579 0.07
580 0.06
581 0.05
582 0.06
583 0.06
584 0.07
585 0.07
586 0.08
587 0.08
588 0.08
589 0.12
590 0.12
591 0.13
592 0.13
593 0.14
594 0.13
595 0.18
596 0.18
597 0.15
598 0.16
599 0.16
600 0.15
601 0.15
602 0.16
603 0.11
604 0.14
605 0.16
606 0.16
607 0.17
608 0.2
609 0.23
610 0.22
611 0.24
612 0.22
613 0.26
614 0.3
615 0.32
616 0.35
617 0.31
618 0.31
619 0.29
620 0.3
621 0.26
622 0.21
623 0.18
624 0.12
625 0.15
626 0.14
627 0.14
628 0.14
629 0.12
630 0.11
631 0.11
632 0.12
633 0.09
634 0.11
635 0.11
636 0.1
637 0.1
638 0.1
639 0.11
640 0.1
641 0.13
642 0.14
643 0.15
644 0.15
645 0.16
646 0.16
647 0.17
648 0.19
649 0.17
650 0.14
651 0.13
652 0.12
653 0.12
654 0.12
655 0.15
656 0.17
657 0.15
658 0.15
659 0.16
660 0.16
661 0.15
662 0.15
663 0.14
664 0.15
665 0.14
666 0.14
667 0.14
668 0.14
669 0.15
670 0.15
671 0.14
672 0.12
673 0.14
674 0.16
675 0.18
676 0.22
677 0.23
678 0.23
679 0.24
680 0.22
681 0.21
682 0.2
683 0.19
684 0.17
685 0.15
686 0.14
687 0.12
688 0.12
689 0.11
690 0.1
691 0.07
692 0.09
693 0.09
694 0.09
695 0.11
696 0.11
697 0.13
698 0.15
699 0.15
700 0.12
701 0.12
702 0.13
703 0.12
704 0.12
705 0.11
706 0.1
707 0.12
708 0.13
709 0.14
710 0.13
711 0.17
712 0.21
713 0.23
714 0.29
715 0.32
716 0.4
717 0.44
718 0.47
719 0.51
720 0.55
721 0.59
722 0.56
723 0.51
724 0.43
725 0.42
726 0.4
727 0.33
728 0.26
729 0.19
730 0.17
731 0.16
732 0.16
733 0.12
734 0.13
735 0.13
736 0.16
737 0.15
738 0.16
739 0.17
740 0.2
741 0.25
742 0.26
743 0.26
744 0.24
745 0.28
746 0.35
747 0.37
748 0.35
749 0.33
750 0.3
751 0.32
752 0.31
753 0.28
754 0.21
755 0.17
756 0.15
757 0.13
758 0.12
759 0.09
760 0.09
761 0.07
762 0.06
763 0.06
764 0.07
765 0.08
766 0.08
767 0.08
768 0.08
769 0.1
770 0.11
771 0.12
772 0.12
773 0.12
774 0.13
775 0.13
776 0.18
777 0.15
778 0.14
779 0.14
780 0.14
781 0.14
782 0.14
783 0.16
784 0.13
785 0.17
786 0.19
787 0.19
788 0.19
789 0.18
790 0.19
791 0.22
792 0.21
793 0.19
794 0.18
795 0.18
796 0.18
797 0.18
798 0.18