Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5M9K6V5

Protein Details
Accession A0A5M9K6V5    Localization Confidence High Confidence Score 17.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
168-190SSGNESSRKKHKKKHVGSSQPTGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
92-105KRKLGKSVRKALTK
144-165RPKHTDPLKKSKSLKRPGSPNL
170-182GNESSRKKHKKKH
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008851  TFIIF-alpha  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0032968  P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
Amino Acid Sequences MNRLFTVKTESASFKGSSRNETRDIDELDFDADDLFQDDDELATVEPDRDEDAKDAQERIKQDQRSANLFGEADEENGRERFHQREQEEEAKRKLGKSVRKALTKREKNYIYDSDSSNPYAFFRCRSKNCNRISSKGNNTPSGRPKHTDPLKKSKSLKRPGSPNLSESSGNESSRKKHKKKHVGSSQPTGTSTPIPGQTQRKSSIVKMSVNPSELSRISSSPPNPQGHTSDGEATGGEMSDGAGGKKKKITLRIGGSPTTSRPGSPAPGKSVSRAGSPAQTAESATPSGSGAITPKEIIAALPSTGISIGQLLGHFRGRVGDAEGQTTKTEFMAMIKRNTKYGADKLLRPKI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.33
3 0.34
4 0.39
5 0.42
6 0.46
7 0.47
8 0.49
9 0.51
10 0.49
11 0.5
12 0.43
13 0.37
14 0.32
15 0.27
16 0.24
17 0.2
18 0.14
19 0.1
20 0.08
21 0.08
22 0.08
23 0.06
24 0.07
25 0.06
26 0.06
27 0.07
28 0.07
29 0.06
30 0.06
31 0.07
32 0.07
33 0.07
34 0.08
35 0.11
36 0.11
37 0.13
38 0.14
39 0.17
40 0.21
41 0.23
42 0.25
43 0.25
44 0.29
45 0.3
46 0.36
47 0.41
48 0.39
49 0.43
50 0.47
51 0.49
52 0.5
53 0.51
54 0.44
55 0.38
56 0.36
57 0.29
58 0.25
59 0.2
60 0.16
61 0.13
62 0.13
63 0.13
64 0.13
65 0.14
66 0.13
67 0.16
68 0.2
69 0.26
70 0.34
71 0.33
72 0.39
73 0.45
74 0.53
75 0.57
76 0.58
77 0.53
78 0.51
79 0.51
80 0.46
81 0.46
82 0.43
83 0.45
84 0.48
85 0.56
86 0.58
87 0.65
88 0.67
89 0.71
90 0.75
91 0.75
92 0.7
93 0.69
94 0.66
95 0.6
96 0.64
97 0.59
98 0.52
99 0.46
100 0.44
101 0.37
102 0.35
103 0.33
104 0.27
105 0.22
106 0.18
107 0.19
108 0.18
109 0.19
110 0.24
111 0.3
112 0.35
113 0.43
114 0.51
115 0.57
116 0.62
117 0.68
118 0.65
119 0.61
120 0.63
121 0.63
122 0.63
123 0.62
124 0.6
125 0.56
126 0.55
127 0.57
128 0.58
129 0.56
130 0.51
131 0.45
132 0.45
133 0.49
134 0.54
135 0.57
136 0.55
137 0.59
138 0.61
139 0.66
140 0.7
141 0.69
142 0.7
143 0.72
144 0.73
145 0.68
146 0.72
147 0.72
148 0.73
149 0.65
150 0.57
151 0.49
152 0.43
153 0.37
154 0.29
155 0.29
156 0.23
157 0.21
158 0.23
159 0.22
160 0.24
161 0.35
162 0.44
163 0.44
164 0.5
165 0.61
166 0.69
167 0.76
168 0.82
169 0.82
170 0.83
171 0.81
172 0.79
173 0.72
174 0.61
175 0.53
176 0.43
177 0.34
178 0.24
179 0.19
180 0.14
181 0.14
182 0.14
183 0.18
184 0.24
185 0.26
186 0.3
187 0.32
188 0.33
189 0.33
190 0.34
191 0.36
192 0.34
193 0.34
194 0.32
195 0.35
196 0.33
197 0.33
198 0.31
199 0.24
200 0.23
201 0.2
202 0.2
203 0.16
204 0.15
205 0.16
206 0.21
207 0.22
208 0.26
209 0.33
210 0.33
211 0.33
212 0.35
213 0.35
214 0.33
215 0.33
216 0.27
217 0.22
218 0.2
219 0.18
220 0.16
221 0.13
222 0.1
223 0.08
224 0.06
225 0.04
226 0.03
227 0.04
228 0.05
229 0.05
230 0.1
231 0.11
232 0.14
233 0.17
234 0.21
235 0.25
236 0.33
237 0.39
238 0.42
239 0.48
240 0.54
241 0.55
242 0.51
243 0.49
244 0.43
245 0.38
246 0.34
247 0.28
248 0.2
249 0.19
250 0.2
251 0.24
252 0.29
253 0.3
254 0.31
255 0.38
256 0.38
257 0.38
258 0.41
259 0.36
260 0.32
261 0.32
262 0.28
263 0.25
264 0.25
265 0.24
266 0.19
267 0.18
268 0.17
269 0.16
270 0.16
271 0.13
272 0.12
273 0.11
274 0.1
275 0.1
276 0.09
277 0.09
278 0.09
279 0.1
280 0.11
281 0.11
282 0.1
283 0.1
284 0.1
285 0.1
286 0.1
287 0.1
288 0.09
289 0.09
290 0.09
291 0.09
292 0.09
293 0.08
294 0.06
295 0.06
296 0.06
297 0.06
298 0.07
299 0.09
300 0.11
301 0.14
302 0.13
303 0.13
304 0.15
305 0.15
306 0.16
307 0.19
308 0.23
309 0.22
310 0.27
311 0.29
312 0.28
313 0.27
314 0.27
315 0.23
316 0.16
317 0.16
318 0.11
319 0.15
320 0.22
321 0.26
322 0.34
323 0.41
324 0.42
325 0.44
326 0.46
327 0.47
328 0.45
329 0.47
330 0.49
331 0.47
332 0.54