Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

Q8STM0

Protein Details
Accession Q8STM0    Localization Confidence Low Confidence Score 8.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
556-576PDDIRKVNVRNLKRPGRKMWGHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 11.5, mito 10, cyto_nucl 8.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040458  Vid27  
IPR013863  VID27_C  
IPR040768  Vid27_PH  
Pfam View protein in Pfam  
PF08553  VID27  
PF17747  VID27_PH  
Amino Acid Sequences MVLGRIKKMLSGVKMKSLVGDLWSGGEVLMDGCSASASEDELSFVSKKGKMAFKLHEIVSAEHDNKALWFVHKQKKYLFTSNKPLDLLCKSMIPFIRKTRTLYSKNGVYSRYNTATGRFEEAKEHVKVVIVEDEVFLIRIETRDDVIHFEEIRTETQYYMDQKNTTFVWSVMEDGVFHTFSLRFLDNLDFLEFLSKYIGCLYRNVNNEKKGNEEAERYFEKMEIENYNPDESEHEEEVEEYESCDDDELENHFGEADEKNKHLVVGDEMAFITRGKSVGVFRNTEDGLEFKANIKDVLDDDIEKIITHDNSSSLIYLDGGERDKLHKLDVERGEVVETWDLKRDVNDYFDSQKLVDTGSLVGLSDYSVFRIDPRARSKVVESKDYKTKNKFNCGMATSSGHVVAAGRGGDLRLYDRIDKRAKSLLPGFGDEIKHIDVTSNGKHIICTCKNYLMLTTVPGDYRQPVGRDKPVPKRLQLKPEHLAHINEEIDFTPAKFSTDASENSIITSTGSYVVKWNLDDVLNGKLYSYQLAKCSDLVVADNFEFGEDSNVIVTMPDDIRKVNVRNLKRPGRKMWG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.47
3 0.43
4 0.39
5 0.33
6 0.25
7 0.24
8 0.16
9 0.15
10 0.15
11 0.13
12 0.11
13 0.09
14 0.08
15 0.06
16 0.06
17 0.05
18 0.05
19 0.04
20 0.05
21 0.05
22 0.05
23 0.05
24 0.06
25 0.08
26 0.08
27 0.09
28 0.09
29 0.12
30 0.12
31 0.13
32 0.17
33 0.19
34 0.22
35 0.28
36 0.35
37 0.39
38 0.46
39 0.5
40 0.52
41 0.56
42 0.53
43 0.51
44 0.46
45 0.41
46 0.39
47 0.4
48 0.33
49 0.29
50 0.28
51 0.24
52 0.21
53 0.23
54 0.19
55 0.15
56 0.21
57 0.3
58 0.4
59 0.45
60 0.49
61 0.52
62 0.6
63 0.64
64 0.68
65 0.67
66 0.65
67 0.71
68 0.73
69 0.7
70 0.62
71 0.55
72 0.5
73 0.43
74 0.38
75 0.29
76 0.26
77 0.23
78 0.27
79 0.32
80 0.31
81 0.35
82 0.4
83 0.47
84 0.47
85 0.51
86 0.55
87 0.6
88 0.61
89 0.62
90 0.6
91 0.58
92 0.6
93 0.59
94 0.53
95 0.47
96 0.46
97 0.45
98 0.42
99 0.39
100 0.34
101 0.34
102 0.35
103 0.33
104 0.35
105 0.3
106 0.27
107 0.28
108 0.31
109 0.33
110 0.3
111 0.29
112 0.23
113 0.23
114 0.23
115 0.21
116 0.21
117 0.15
118 0.14
119 0.13
120 0.13
121 0.12
122 0.12
123 0.09
124 0.06
125 0.06
126 0.07
127 0.08
128 0.09
129 0.1
130 0.11
131 0.11
132 0.14
133 0.15
134 0.18
135 0.16
136 0.16
137 0.18
138 0.18
139 0.19
140 0.18
141 0.17
142 0.14
143 0.15
144 0.2
145 0.21
146 0.23
147 0.25
148 0.24
149 0.24
150 0.26
151 0.25
152 0.23
153 0.19
154 0.15
155 0.15
156 0.14
157 0.14
158 0.12
159 0.12
160 0.1
161 0.1
162 0.12
163 0.09
164 0.09
165 0.09
166 0.09
167 0.09
168 0.12
169 0.12
170 0.1
171 0.12
172 0.13
173 0.13
174 0.14
175 0.14
176 0.1
177 0.1
178 0.13
179 0.11
180 0.1
181 0.11
182 0.09
183 0.09
184 0.12
185 0.15
186 0.13
187 0.16
188 0.19
189 0.23
190 0.29
191 0.36
192 0.38
193 0.41
194 0.44
195 0.42
196 0.43
197 0.39
198 0.37
199 0.33
200 0.31
201 0.27
202 0.29
203 0.29
204 0.26
205 0.23
206 0.21
207 0.2
208 0.17
209 0.18
210 0.16
211 0.16
212 0.18
213 0.19
214 0.19
215 0.18
216 0.17
217 0.15
218 0.15
219 0.18
220 0.15
221 0.14
222 0.13
223 0.13
224 0.14
225 0.14
226 0.11
227 0.07
228 0.07
229 0.06
230 0.06
231 0.06
232 0.06
233 0.04
234 0.06
235 0.08
236 0.09
237 0.09
238 0.09
239 0.09
240 0.08
241 0.1
242 0.09
243 0.11
244 0.11
245 0.11
246 0.12
247 0.12
248 0.12
249 0.11
250 0.11
251 0.09
252 0.1
253 0.1
254 0.1
255 0.09
256 0.09
257 0.1
258 0.09
259 0.08
260 0.05
261 0.05
262 0.05
263 0.06
264 0.09
265 0.15
266 0.18
267 0.19
268 0.19
269 0.22
270 0.22
271 0.21
272 0.18
273 0.12
274 0.11
275 0.11
276 0.1
277 0.09
278 0.1
279 0.1
280 0.1
281 0.1
282 0.08
283 0.09
284 0.1
285 0.09
286 0.08
287 0.09
288 0.09
289 0.09
290 0.08
291 0.08
292 0.08
293 0.07
294 0.08
295 0.07
296 0.07
297 0.08
298 0.09
299 0.09
300 0.07
301 0.07
302 0.06
303 0.06
304 0.06
305 0.07
306 0.07
307 0.07
308 0.08
309 0.1
310 0.12
311 0.12
312 0.12
313 0.14
314 0.15
315 0.23
316 0.24
317 0.26
318 0.24
319 0.24
320 0.23
321 0.21
322 0.2
323 0.14
324 0.13
325 0.1
326 0.13
327 0.13
328 0.12
329 0.13
330 0.14
331 0.13
332 0.15
333 0.17
334 0.16
335 0.18
336 0.19
337 0.19
338 0.17
339 0.16
340 0.13
341 0.12
342 0.1
343 0.07
344 0.07
345 0.06
346 0.06
347 0.06
348 0.05
349 0.05
350 0.05
351 0.05
352 0.05
353 0.05
354 0.06
355 0.06
356 0.07
357 0.14
358 0.17
359 0.23
360 0.29
361 0.33
362 0.34
363 0.36
364 0.4
365 0.4
366 0.4
367 0.42
368 0.4
369 0.41
370 0.49
371 0.54
372 0.56
373 0.57
374 0.62
375 0.6
376 0.66
377 0.66
378 0.61
379 0.6
380 0.55
381 0.49
382 0.42
383 0.37
384 0.29
385 0.24
386 0.21
387 0.15
388 0.12
389 0.1
390 0.08
391 0.08
392 0.06
393 0.06
394 0.06
395 0.06
396 0.06
397 0.07
398 0.08
399 0.09
400 0.12
401 0.18
402 0.21
403 0.28
404 0.34
405 0.35
406 0.36
407 0.41
408 0.4
409 0.4
410 0.42
411 0.4
412 0.36
413 0.37
414 0.35
415 0.32
416 0.32
417 0.26
418 0.24
419 0.18
420 0.16
421 0.14
422 0.13
423 0.11
424 0.15
425 0.17
426 0.18
427 0.19
428 0.19
429 0.2
430 0.22
431 0.29
432 0.29
433 0.32
434 0.32
435 0.34
436 0.35
437 0.35
438 0.34
439 0.27
440 0.24
441 0.2
442 0.2
443 0.17
444 0.16
445 0.16
446 0.16
447 0.15
448 0.18
449 0.2
450 0.21
451 0.26
452 0.31
453 0.38
454 0.45
455 0.52
456 0.59
457 0.65
458 0.68
459 0.69
460 0.73
461 0.72
462 0.74
463 0.74
464 0.71
465 0.69
466 0.69
467 0.68
468 0.61
469 0.55
470 0.47
471 0.45
472 0.37
473 0.29
474 0.25
475 0.2
476 0.18
477 0.17
478 0.15
479 0.13
480 0.12
481 0.14
482 0.13
483 0.13
484 0.15
485 0.2
486 0.22
487 0.24
488 0.27
489 0.25
490 0.25
491 0.26
492 0.21
493 0.17
494 0.16
495 0.11
496 0.12
497 0.12
498 0.12
499 0.15
500 0.18
501 0.19
502 0.19
503 0.2
504 0.18
505 0.18
506 0.19
507 0.17
508 0.2
509 0.19
510 0.19
511 0.18
512 0.17
513 0.17
514 0.2
515 0.22
516 0.2
517 0.22
518 0.26
519 0.27
520 0.25
521 0.26
522 0.23
523 0.2
524 0.2
525 0.17
526 0.17
527 0.16
528 0.16
529 0.15
530 0.14
531 0.13
532 0.11
533 0.13
534 0.09
535 0.1
536 0.1
537 0.1
538 0.09
539 0.09
540 0.09
541 0.1
542 0.11
543 0.13
544 0.14
545 0.15
546 0.2
547 0.27
548 0.3
549 0.35
550 0.42
551 0.48
552 0.57
553 0.67
554 0.73
555 0.76
556 0.81