Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5M9JYD7

Protein Details
Accession A0A5M9JYD7    Localization Confidence High Confidence Score 16.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
438-459SPEMNKKKQKMMKSPPNAPPDFHydrophilic
584-604NTSPNASNKRRRPSTVKAEEEHydrophilic
611-633AKNNVKPSPRITKRQKGNPGLITHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029005  LIM-bd/SEUSS  
Pfam View protein in Pfam  
PF01803  LIM_bind  
Amino Acid Sequences MSSLQHTQSHSPYPVGLQHQGVPQGHMAGMPQIRVSKVNQVRRNVPTATANDEHSSTIITTTNVTTTSSSKATFVLMQQQYSGGMPNGMPMNIHGMNPNQMNAQFAMRHNTPGLARPVNLPQHLAQQQQIAQDNVNQQAHQQNQNHQMIMAMQQQNAQNHGPNGQPGHPQMTPSKYNNFNSISSSSNNSNSSSSTINNKQQAQINHAQAQAQAQAQAQAQAQAQAAAASQQQNQNQSQVQNQPPHSTTTGSTPTTAAAAKQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQTEQQQQQQQQHAAAMLQQQQQAARQGDKLKGQCLMRLALFSDHLSGFCKVTKPLSAYMANGSSRKELKKELPLNGHYIESQTSSFVYWFDNGSHLVANGTLRAHFDGEQKLELLEFVTVNHEEYVPRSMALEAARPLHNWGKEWKSMNTGPDGKPSPEMNKKKQKMMKSPPNAPPDFDLPETKLKVNFGITPAVFRYLELVEVLGQMNPLFNFSHSNPTLSPYGALDSYVAQVTSGANGGQQNPSGPRTPAMSNFPIGASPAAAHLQLPEGSPHMGGSPAQAPGMQLNQSQHGTTSSGPSANTSPNASNKRRRPSTVKAEEEGQVNGAAKNNVKPSPRITKRQKGNPGLIT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.36
3 0.35
4 0.3
5 0.32
6 0.35
7 0.4
8 0.38
9 0.34
10 0.29
11 0.27
12 0.25
13 0.21
14 0.18
15 0.18
16 0.18
17 0.17
18 0.18
19 0.19
20 0.2
21 0.23
22 0.24
23 0.29
24 0.36
25 0.46
26 0.51
27 0.55
28 0.62
29 0.65
30 0.68
31 0.59
32 0.54
33 0.5
34 0.46
35 0.46
36 0.4
37 0.38
38 0.35
39 0.34
40 0.31
41 0.24
42 0.22
43 0.15
44 0.15
45 0.13
46 0.12
47 0.12
48 0.13
49 0.14
50 0.13
51 0.14
52 0.14
53 0.15
54 0.19
55 0.19
56 0.19
57 0.18
58 0.18
59 0.19
60 0.19
61 0.19
62 0.26
63 0.26
64 0.25
65 0.25
66 0.25
67 0.24
68 0.22
69 0.22
70 0.12
71 0.11
72 0.1
73 0.13
74 0.14
75 0.13
76 0.13
77 0.11
78 0.17
79 0.17
80 0.18
81 0.17
82 0.17
83 0.22
84 0.23
85 0.24
86 0.19
87 0.19
88 0.2
89 0.19
90 0.2
91 0.19
92 0.19
93 0.25
94 0.24
95 0.26
96 0.24
97 0.26
98 0.24
99 0.26
100 0.32
101 0.27
102 0.27
103 0.28
104 0.34
105 0.37
106 0.37
107 0.34
108 0.28
109 0.35
110 0.38
111 0.37
112 0.31
113 0.3
114 0.31
115 0.33
116 0.35
117 0.27
118 0.24
119 0.26
120 0.28
121 0.31
122 0.29
123 0.24
124 0.24
125 0.29
126 0.34
127 0.38
128 0.38
129 0.39
130 0.48
131 0.5
132 0.48
133 0.41
134 0.36
135 0.29
136 0.29
137 0.3
138 0.23
139 0.21
140 0.24
141 0.28
142 0.29
143 0.31
144 0.28
145 0.23
146 0.21
147 0.24
148 0.21
149 0.2
150 0.22
151 0.21
152 0.24
153 0.23
154 0.27
155 0.25
156 0.26
157 0.28
158 0.31
159 0.34
160 0.34
161 0.39
162 0.41
163 0.43
164 0.46
165 0.45
166 0.4
167 0.38
168 0.37
169 0.32
170 0.27
171 0.29
172 0.25
173 0.26
174 0.26
175 0.24
176 0.22
177 0.21
178 0.21
179 0.19
180 0.18
181 0.22
182 0.27
183 0.31
184 0.36
185 0.37
186 0.38
187 0.42
188 0.42
189 0.42
190 0.43
191 0.41
192 0.39
193 0.38
194 0.35
195 0.3
196 0.3
197 0.25
198 0.18
199 0.15
200 0.11
201 0.13
202 0.13
203 0.15
204 0.13
205 0.13
206 0.13
207 0.14
208 0.13
209 0.12
210 0.11
211 0.09
212 0.09
213 0.07
214 0.09
215 0.09
216 0.12
217 0.15
218 0.18
219 0.22
220 0.22
221 0.24
222 0.25
223 0.25
224 0.27
225 0.3
226 0.33
227 0.36
228 0.37
229 0.37
230 0.36
231 0.38
232 0.34
233 0.28
234 0.23
235 0.22
236 0.25
237 0.22
238 0.22
239 0.19
240 0.18
241 0.17
242 0.17
243 0.12
244 0.12
245 0.16
246 0.2
247 0.25
248 0.3
249 0.34
250 0.41
251 0.48
252 0.52
253 0.56
254 0.59
255 0.6
256 0.62
257 0.64
258 0.64
259 0.63
260 0.62
261 0.6
262 0.6
263 0.6
264 0.6
265 0.58
266 0.52
267 0.48
268 0.46
269 0.45
270 0.46
271 0.42
272 0.41
273 0.41
274 0.45
275 0.48
276 0.46
277 0.42
278 0.34
279 0.31
280 0.26
281 0.21
282 0.17
283 0.15
284 0.16
285 0.17
286 0.18
287 0.18
288 0.18
289 0.19
290 0.23
291 0.21
292 0.17
293 0.17
294 0.19
295 0.22
296 0.26
297 0.26
298 0.22
299 0.25
300 0.24
301 0.23
302 0.21
303 0.2
304 0.15
305 0.14
306 0.14
307 0.1
308 0.11
309 0.09
310 0.09
311 0.08
312 0.08
313 0.1
314 0.1
315 0.1
316 0.1
317 0.11
318 0.1
319 0.11
320 0.14
321 0.14
322 0.15
323 0.19
324 0.18
325 0.18
326 0.19
327 0.2
328 0.19
329 0.18
330 0.17
331 0.16
332 0.19
333 0.19
334 0.2
335 0.21
336 0.25
337 0.34
338 0.38
339 0.41
340 0.44
341 0.44
342 0.45
343 0.42
344 0.38
345 0.28
346 0.24
347 0.19
348 0.13
349 0.12
350 0.09
351 0.08
352 0.08
353 0.08
354 0.07
355 0.08
356 0.07
357 0.08
358 0.08
359 0.09
360 0.09
361 0.1
362 0.09
363 0.08
364 0.07
365 0.07
366 0.07
367 0.07
368 0.07
369 0.06
370 0.07
371 0.08
372 0.09
373 0.1
374 0.13
375 0.16
376 0.17
377 0.17
378 0.16
379 0.15
380 0.14
381 0.12
382 0.09
383 0.07
384 0.05
385 0.05
386 0.07
387 0.08
388 0.08
389 0.09
390 0.09
391 0.08
392 0.1
393 0.12
394 0.1
395 0.1
396 0.1
397 0.09
398 0.11
399 0.12
400 0.13
401 0.12
402 0.15
403 0.15
404 0.15
405 0.19
406 0.21
407 0.22
408 0.21
409 0.26
410 0.27
411 0.32
412 0.35
413 0.33
414 0.35
415 0.36
416 0.36
417 0.37
418 0.38
419 0.34
420 0.37
421 0.38
422 0.33
423 0.34
424 0.34
425 0.36
426 0.4
427 0.47
428 0.51
429 0.59
430 0.62
431 0.68
432 0.72
433 0.73
434 0.74
435 0.77
436 0.77
437 0.75
438 0.8
439 0.79
440 0.81
441 0.73
442 0.63
443 0.55
444 0.49
445 0.44
446 0.36
447 0.3
448 0.25
449 0.3
450 0.31
451 0.3
452 0.27
453 0.25
454 0.25
455 0.24
456 0.23
457 0.19
458 0.22
459 0.2
460 0.21
461 0.21
462 0.22
463 0.2
464 0.18
465 0.19
466 0.13
467 0.14
468 0.12
469 0.11
470 0.08
471 0.09
472 0.1
473 0.07
474 0.07
475 0.07
476 0.08
477 0.07
478 0.09
479 0.08
480 0.08
481 0.13
482 0.14
483 0.24
484 0.23
485 0.26
486 0.24
487 0.28
488 0.28
489 0.24
490 0.23
491 0.15
492 0.16
493 0.14
494 0.14
495 0.11
496 0.1
497 0.11
498 0.11
499 0.1
500 0.07
501 0.08
502 0.08
503 0.08
504 0.08
505 0.06
506 0.08
507 0.1
508 0.12
509 0.13
510 0.13
511 0.15
512 0.18
513 0.21
514 0.22
515 0.21
516 0.21
517 0.23
518 0.26
519 0.28
520 0.31
521 0.31
522 0.29
523 0.29
524 0.28
525 0.25
526 0.22
527 0.18
528 0.12
529 0.09
530 0.1
531 0.1
532 0.1
533 0.09
534 0.09
535 0.11
536 0.11
537 0.12
538 0.11
539 0.12
540 0.13
541 0.13
542 0.13
543 0.11
544 0.11
545 0.1
546 0.12
547 0.13
548 0.13
549 0.13
550 0.13
551 0.13
552 0.15
553 0.18
554 0.17
555 0.17
556 0.19
557 0.23
558 0.25
559 0.24
560 0.22
561 0.21
562 0.21
563 0.19
564 0.22
565 0.2
566 0.2
567 0.2
568 0.22
569 0.24
570 0.25
571 0.27
572 0.26
573 0.27
574 0.35
575 0.44
576 0.5
577 0.57
578 0.62
579 0.71
580 0.74
581 0.78
582 0.77
583 0.79
584 0.81
585 0.82
586 0.79
587 0.71
588 0.67
589 0.63
590 0.57
591 0.47
592 0.37
593 0.28
594 0.23
595 0.21
596 0.21
597 0.21
598 0.21
599 0.26
600 0.31
601 0.34
602 0.37
603 0.4
604 0.44
605 0.52
606 0.58
607 0.64
608 0.68
609 0.73
610 0.8
611 0.86
612 0.89
613 0.87