Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5M9JJN9

Protein Details
Accession A0A5M9JJN9    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-33MDSIKDSKKERKEKKEKKESKKRKSSAITEQSTBasic
48-74DEITTSESKKKRSKKEKKEGKEEPIEABasic
328-366EDEVTTKTKKAKKPKTKTRKWWKRYGKDGSKNPNERHPRBasic
385-404RVPGERRERPVKKVEYRSSYBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-24SKKERKEKKEKKESKKRK
56-68KKKRSKKEKKEGK
93-121RRLKKGKPLPPSKSGAESSPEPEAKKKAE
334-370KTKKAKKPKTKTRKWWKRYGKDGSKNPNERHPREERE
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MDSIKDSKKERKEKKEKKESKKRKSSAITEQSTSTESMDIDTEMKGIDEITTSESKKKRSKKEKKEGKEEPIEALEEAEAEATPPETHEEALRRLKKGKPLPPSKSGAESSPEPEAKKKAEVEKRSGHGVWIGNLPWSVSKEELRNWLVEFSDLTEENITRIHMPGPNDGKPANKVEKKFGKPVHNKGFAYVDFTTEEQVKMAVELSEQLLTGRRLLIKDNKSFEGRPEKKEAVVDGKPPSKKIFVGNLRFDATEEILKEHFEKCGAIEKIHVATFEDSGKCKGYAWVVFEDVSAAQSAVKGWVHIEEELSDDESSSSSDSDSNSDSEDEVTTKTKKAKKPKTKTRKWWKRYGKDGSKNPNERHPREERESGARVGANDEPVVPRVPGERRERPVKKVEYRSSYAPRLTGGIVESKGKKTTF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.93
2 0.95
3 0.95
4 0.95
5 0.96
6 0.96
7 0.96
8 0.96
9 0.91
10 0.9
11 0.89
12 0.86
13 0.85
14 0.85
15 0.78
16 0.69
17 0.65
18 0.57
19 0.49
20 0.41
21 0.31
22 0.21
23 0.16
24 0.15
25 0.14
26 0.13
27 0.12
28 0.11
29 0.11
30 0.09
31 0.09
32 0.08
33 0.07
34 0.07
35 0.06
36 0.07
37 0.11
38 0.16
39 0.17
40 0.26
41 0.3
42 0.38
43 0.47
44 0.56
45 0.62
46 0.7
47 0.79
48 0.83
49 0.9
50 0.92
51 0.93
52 0.95
53 0.93
54 0.91
55 0.88
56 0.79
57 0.71
58 0.61
59 0.52
60 0.41
61 0.33
62 0.23
63 0.14
64 0.12
65 0.08
66 0.06
67 0.05
68 0.05
69 0.06
70 0.06
71 0.06
72 0.1
73 0.1
74 0.11
75 0.14
76 0.17
77 0.23
78 0.33
79 0.37
80 0.37
81 0.42
82 0.46
83 0.52
84 0.58
85 0.59
86 0.6
87 0.66
88 0.69
89 0.71
90 0.72
91 0.64
92 0.6
93 0.54
94 0.45
95 0.39
96 0.35
97 0.3
98 0.31
99 0.31
100 0.27
101 0.3
102 0.32
103 0.3
104 0.32
105 0.35
106 0.38
107 0.45
108 0.5
109 0.53
110 0.56
111 0.56
112 0.56
113 0.51
114 0.42
115 0.37
116 0.33
117 0.27
118 0.22
119 0.2
120 0.16
121 0.16
122 0.16
123 0.13
124 0.13
125 0.13
126 0.12
127 0.15
128 0.16
129 0.19
130 0.25
131 0.25
132 0.24
133 0.24
134 0.23
135 0.2
136 0.18
137 0.15
138 0.11
139 0.12
140 0.11
141 0.11
142 0.11
143 0.11
144 0.11
145 0.11
146 0.1
147 0.08
148 0.08
149 0.1
150 0.11
151 0.13
152 0.2
153 0.24
154 0.25
155 0.27
156 0.27
157 0.26
158 0.26
159 0.3
160 0.33
161 0.32
162 0.32
163 0.39
164 0.48
165 0.5
166 0.55
167 0.56
168 0.58
169 0.61
170 0.7
171 0.7
172 0.68
173 0.64
174 0.58
175 0.55
176 0.44
177 0.41
178 0.32
179 0.23
180 0.17
181 0.17
182 0.17
183 0.14
184 0.13
185 0.08
186 0.08
187 0.07
188 0.06
189 0.06
190 0.05
191 0.04
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.07
198 0.07
199 0.08
200 0.08
201 0.09
202 0.09
203 0.13
204 0.21
205 0.25
206 0.3
207 0.33
208 0.34
209 0.35
210 0.35
211 0.37
212 0.4
213 0.38
214 0.37
215 0.4
216 0.39
217 0.37
218 0.38
219 0.35
220 0.3
221 0.28
222 0.28
223 0.26
224 0.31
225 0.31
226 0.32
227 0.32
228 0.27
229 0.27
230 0.27
231 0.31
232 0.34
233 0.4
234 0.42
235 0.42
236 0.41
237 0.4
238 0.36
239 0.28
240 0.21
241 0.15
242 0.13
243 0.12
244 0.11
245 0.11
246 0.13
247 0.12
248 0.11
249 0.1
250 0.1
251 0.09
252 0.18
253 0.18
254 0.17
255 0.17
256 0.19
257 0.2
258 0.21
259 0.2
260 0.13
261 0.13
262 0.14
263 0.16
264 0.15
265 0.14
266 0.16
267 0.17
268 0.16
269 0.15
270 0.16
271 0.17
272 0.18
273 0.2
274 0.2
275 0.2
276 0.2
277 0.19
278 0.18
279 0.14
280 0.11
281 0.08
282 0.06
283 0.05
284 0.05
285 0.06
286 0.07
287 0.07
288 0.07
289 0.07
290 0.1
291 0.11
292 0.11
293 0.11
294 0.09
295 0.11
296 0.12
297 0.13
298 0.11
299 0.1
300 0.1
301 0.09
302 0.09
303 0.08
304 0.08
305 0.06
306 0.08
307 0.08
308 0.1
309 0.12
310 0.12
311 0.13
312 0.13
313 0.13
314 0.12
315 0.13
316 0.12
317 0.12
318 0.15
319 0.16
320 0.19
321 0.27
322 0.34
323 0.41
324 0.52
325 0.61
326 0.69
327 0.78
328 0.86
329 0.89
330 0.92
331 0.96
332 0.96
333 0.96
334 0.93
335 0.93
336 0.92
337 0.91
338 0.91
339 0.91
340 0.9
341 0.89
342 0.9
343 0.9
344 0.9
345 0.88
346 0.81
347 0.8
348 0.8
349 0.74
350 0.72
351 0.7
352 0.68
353 0.67
354 0.69
355 0.64
356 0.62
357 0.61
358 0.54
359 0.49
360 0.41
361 0.34
362 0.32
363 0.29
364 0.23
365 0.19
366 0.19
367 0.18
368 0.18
369 0.19
370 0.16
371 0.15
372 0.19
373 0.25
374 0.32
375 0.39
376 0.47
377 0.53
378 0.64
379 0.68
380 0.7
381 0.74
382 0.76
383 0.77
384 0.78
385 0.8
386 0.77
387 0.77
388 0.78
389 0.76
390 0.73
391 0.65
392 0.56
393 0.47
394 0.42
395 0.37
396 0.3
397 0.24
398 0.23
399 0.22
400 0.28
401 0.3
402 0.32