Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1V868

Protein Details
Accession H1V868    Localization Confidence High Confidence Score 21.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
369-396EALKNKDDSKKKKERRKENEKKQRDIVRBasic
740-775RAYNARPIKKVREAKARKKFKAAQRLEKLKKKSDMLHydrophilic
790-814IAKMMAKAGKVKRRPKPTLVVARGSHydrophilic
832-851VDSRMKKDLRAQKRLAKKRKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-14HGKGRLDK
19-20AK
377-391SKKKKERRKENEKKQ
588-628REEPSRKKIKTAKEADAKKAKDDKTKAREDKKAAKEEVRKK
734-771AIREKMRAYNARPIKKVREAKARKKFKAAQRLEKLKKK
792-851KMMAKAGKVKRRPKPTLVVARGSNRGIQGRPKGVKGRYTIVDSRMKKDLRAQKRLAKKRK
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 10.5, mito 7, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002877  RNA_MeTrfase_FtsJ_dom  
IPR015507  rRNA-MeTfrase_E  
IPR012920  rRNA_MeTfrase_SPB1-like_C  
IPR024576  rRNA_MeTfrase_Spb1_DUF3381  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
IPR028589  SPB1-like  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030687  C:preribosome, large subunit precursor  
GO:0070039  F:rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase activity  
GO:0008650  F:rRNA (uridine-2'-O-)-methyltransferase activity  
GO:0000466  P:maturation of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000463  P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
KEGG chig:CH63R_04374  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF11861  DUF3381  
PF01728  FtsJ  
PF07780  Spb1_C  
Amino Acid Sequences MAIQKKHGKGRLDKWYRLAKEKGYRARAAFKLIQLNKKYGFLEKSKVVVDLCAAPGSWCQVAAETCPVGALIVGVDLSPIKPIPKVITFQSDITTDKCRATIRSHLKTWKADCVLHDGAPNVGTAWNQDSFNQAELVLQSMKLATEFLVEGGTFVTKVFRSKDYNPLLWVFNQLFTKVEATKPPSSRNVSAEIFVVCKGYKAPKRIDPRFLDPRAVFAELKDATPNNEAKVYNPEVKKRKREGYEEGDYTQFKVVSASEFIHSVDPIAILGQTNQLSFDQPPNGDVALAALDKLPETTDEIRRNCADLKVLGRKEFKQLLKWRLKVREIFGFPTKKTVQEKKSLQDQVGEEVAEVESMDEELRIQQELEALKNKDDSKKKKERRKENEKKQRDIVRMQLNMVAPMDIGMEQAGPLGPDAMFALKTADKAGGINKIARGKMAILKESEKKAEEAGIVYSDSESDVEEDRLERELDGMYDQFRERKAAADAKWRAKRAREEHEDGEWEGVSGGEQSDSDEDMEVDSDSSDDEDEEEEDGISRPLVTDLDSTAENGNLSKRATAFFGQDIFKDIDIGDVDDEAWGVDDKPREEPSRKKIKTAKEADAKKAKDDKTKAREDKKAAKEEVRKKAADGFDSDSESGDDAGFEVVKNQEEDWENQEKRRPDGRLDIDIITAEAMTLAHQLATGEKTKHDLVDEGFNKYALKDRDGLPDWFIDDETKHDKQQKPITKAAAAAIREKMRAYNARPIKKVREAKARKKFKAAQRLEKLKKKSDMLANEESMTEKEKAESIAKMMAKAGKVKRRPKPTLVVARGSNRGIQGRPKGVKGRYTIVDSRMKKDLRAQKRLAKKRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.74
2 0.77
3 0.74
4 0.73
5 0.7
6 0.68
7 0.69
8 0.73
9 0.75
10 0.72
11 0.73
12 0.69
13 0.72
14 0.65
15 0.63
16 0.58
17 0.54
18 0.57
19 0.57
20 0.62
21 0.57
22 0.6
23 0.55
24 0.54
25 0.51
26 0.47
27 0.47
28 0.43
29 0.46
30 0.43
31 0.44
32 0.41
33 0.42
34 0.35
35 0.29
36 0.26
37 0.23
38 0.21
39 0.18
40 0.17
41 0.15
42 0.16
43 0.18
44 0.16
45 0.13
46 0.11
47 0.14
48 0.15
49 0.16
50 0.2
51 0.16
52 0.16
53 0.16
54 0.15
55 0.12
56 0.11
57 0.08
58 0.04
59 0.04
60 0.04
61 0.04
62 0.04
63 0.05
64 0.05
65 0.07
66 0.08
67 0.09
68 0.1
69 0.13
70 0.18
71 0.22
72 0.25
73 0.27
74 0.34
75 0.35
76 0.35
77 0.35
78 0.32
79 0.29
80 0.29
81 0.3
82 0.25
83 0.24
84 0.25
85 0.25
86 0.27
87 0.3
88 0.38
89 0.44
90 0.49
91 0.55
92 0.6
93 0.65
94 0.69
95 0.67
96 0.66
97 0.6
98 0.54
99 0.49
100 0.49
101 0.45
102 0.39
103 0.37
104 0.28
105 0.25
106 0.22
107 0.21
108 0.13
109 0.11
110 0.1
111 0.1
112 0.13
113 0.14
114 0.14
115 0.15
116 0.18
117 0.18
118 0.19
119 0.18
120 0.14
121 0.13
122 0.13
123 0.15
124 0.12
125 0.1
126 0.1
127 0.09
128 0.09
129 0.08
130 0.09
131 0.06
132 0.07
133 0.07
134 0.07
135 0.07
136 0.07
137 0.07
138 0.07
139 0.08
140 0.06
141 0.06
142 0.08
143 0.08
144 0.12
145 0.15
146 0.2
147 0.26
148 0.3
149 0.4
150 0.44
151 0.46
152 0.45
153 0.45
154 0.42
155 0.36
156 0.37
157 0.28
158 0.26
159 0.24
160 0.22
161 0.2
162 0.19
163 0.22
164 0.18
165 0.2
166 0.22
167 0.27
168 0.34
169 0.37
170 0.4
171 0.45
172 0.49
173 0.51
174 0.47
175 0.47
176 0.41
177 0.38
178 0.35
179 0.28
180 0.23
181 0.19
182 0.18
183 0.11
184 0.11
185 0.12
186 0.2
187 0.25
188 0.3
189 0.36
190 0.43
191 0.54
192 0.6
193 0.67
194 0.64
195 0.67
196 0.7
197 0.66
198 0.65
199 0.54
200 0.52
201 0.45
202 0.42
203 0.34
204 0.24
205 0.29
206 0.22
207 0.23
208 0.21
209 0.19
210 0.18
211 0.22
212 0.24
213 0.18
214 0.22
215 0.21
216 0.2
217 0.27
218 0.29
219 0.32
220 0.35
221 0.42
222 0.48
223 0.57
224 0.65
225 0.66
226 0.7
227 0.69
228 0.72
229 0.72
230 0.7
231 0.69
232 0.62
233 0.56
234 0.5
235 0.44
236 0.38
237 0.32
238 0.23
239 0.15
240 0.14
241 0.12
242 0.11
243 0.12
244 0.12
245 0.11
246 0.11
247 0.12
248 0.12
249 0.11
250 0.1
251 0.09
252 0.07
253 0.06
254 0.06
255 0.06
256 0.05
257 0.05
258 0.08
259 0.08
260 0.08
261 0.1
262 0.1
263 0.11
264 0.12
265 0.15
266 0.15
267 0.14
268 0.15
269 0.15
270 0.15
271 0.13
272 0.11
273 0.09
274 0.07
275 0.07
276 0.06
277 0.05
278 0.05
279 0.05
280 0.06
281 0.05
282 0.05
283 0.09
284 0.13
285 0.2
286 0.27
287 0.28
288 0.32
289 0.32
290 0.34
291 0.31
292 0.28
293 0.23
294 0.19
295 0.24
296 0.29
297 0.31
298 0.34
299 0.36
300 0.36
301 0.4
302 0.45
303 0.41
304 0.41
305 0.47
306 0.52
307 0.58
308 0.62
309 0.63
310 0.62
311 0.65
312 0.6
313 0.55
314 0.53
315 0.47
316 0.45
317 0.45
318 0.42
319 0.37
320 0.4
321 0.37
322 0.35
323 0.4
324 0.45
325 0.42
326 0.48
327 0.52
328 0.5
329 0.58
330 0.55
331 0.48
332 0.44
333 0.4
334 0.33
335 0.29
336 0.25
337 0.15
338 0.13
339 0.13
340 0.08
341 0.07
342 0.04
343 0.03
344 0.04
345 0.04
346 0.03
347 0.03
348 0.04
349 0.05
350 0.05
351 0.05
352 0.05
353 0.08
354 0.09
355 0.11
356 0.16
357 0.16
358 0.16
359 0.2
360 0.22
361 0.27
362 0.35
363 0.41
364 0.46
365 0.57
366 0.65
367 0.72
368 0.8
369 0.83
370 0.85
371 0.89
372 0.9
373 0.9
374 0.92
375 0.9
376 0.86
377 0.82
378 0.79
379 0.72
380 0.64
381 0.6
382 0.57
383 0.49
384 0.45
385 0.4
386 0.32
387 0.28
388 0.25
389 0.17
390 0.09
391 0.08
392 0.08
393 0.04
394 0.04
395 0.03
396 0.03
397 0.03
398 0.03
399 0.03
400 0.03
401 0.03
402 0.03
403 0.03
404 0.03
405 0.04
406 0.04
407 0.04
408 0.04
409 0.06
410 0.06
411 0.06
412 0.07
413 0.07
414 0.06
415 0.07
416 0.09
417 0.1
418 0.11
419 0.12
420 0.14
421 0.17
422 0.17
423 0.16
424 0.15
425 0.13
426 0.17
427 0.18
428 0.17
429 0.15
430 0.19
431 0.23
432 0.24
433 0.24
434 0.2
435 0.19
436 0.18
437 0.17
438 0.14
439 0.11
440 0.1
441 0.09
442 0.08
443 0.07
444 0.07
445 0.06
446 0.05
447 0.05
448 0.04
449 0.05
450 0.06
451 0.06
452 0.06
453 0.07
454 0.07
455 0.09
456 0.09
457 0.07
458 0.07
459 0.07
460 0.07
461 0.07
462 0.07
463 0.07
464 0.08
465 0.09
466 0.1
467 0.1
468 0.12
469 0.11
470 0.13
471 0.16
472 0.21
473 0.22
474 0.3
475 0.36
476 0.43
477 0.48
478 0.5
479 0.49
480 0.48
481 0.56
482 0.53
483 0.56
484 0.55
485 0.55
486 0.54
487 0.53
488 0.49
489 0.41
490 0.34
491 0.24
492 0.17
493 0.11
494 0.08
495 0.06
496 0.04
497 0.04
498 0.04
499 0.04
500 0.04
501 0.05
502 0.06
503 0.06
504 0.06
505 0.06
506 0.06
507 0.06
508 0.05
509 0.05
510 0.04
511 0.04
512 0.04
513 0.04
514 0.04
515 0.04
516 0.04
517 0.05
518 0.05
519 0.06
520 0.06
521 0.05
522 0.06
523 0.07
524 0.06
525 0.06
526 0.05
527 0.05
528 0.05
529 0.05
530 0.06
531 0.06
532 0.06
533 0.08
534 0.08
535 0.09
536 0.09
537 0.09
538 0.08
539 0.08
540 0.09
541 0.1
542 0.1
543 0.1
544 0.1
545 0.11
546 0.14
547 0.15
548 0.15
549 0.15
550 0.18
551 0.17
552 0.17
553 0.19
554 0.18
555 0.16
556 0.14
557 0.13
558 0.11
559 0.1
560 0.11
561 0.08
562 0.07
563 0.07
564 0.06
565 0.06
566 0.04
567 0.04
568 0.04
569 0.05
570 0.07
571 0.1
572 0.11
573 0.15
574 0.19
575 0.24
576 0.29
577 0.37
578 0.44
579 0.54
580 0.53
581 0.58
582 0.62
583 0.66
584 0.71
585 0.7
586 0.69
587 0.67
588 0.71
589 0.72
590 0.73
591 0.64
592 0.61
593 0.62
594 0.57
595 0.57
596 0.59
597 0.61
598 0.61
599 0.7
600 0.73
601 0.73
602 0.76
603 0.75
604 0.78
605 0.76
606 0.76
607 0.69
608 0.69
609 0.71
610 0.72
611 0.75
612 0.7
613 0.62
614 0.54
615 0.57
616 0.52
617 0.44
618 0.38
619 0.32
620 0.28
621 0.31
622 0.3
623 0.23
624 0.2
625 0.18
626 0.15
627 0.1
628 0.08
629 0.06
630 0.06
631 0.06
632 0.05
633 0.07
634 0.08
635 0.09
636 0.1
637 0.1
638 0.14
639 0.16
640 0.19
641 0.23
642 0.31
643 0.31
644 0.34
645 0.4
646 0.38
647 0.42
648 0.47
649 0.45
650 0.4
651 0.48
652 0.51
653 0.5
654 0.5
655 0.45
656 0.38
657 0.35
658 0.3
659 0.2
660 0.14
661 0.08
662 0.05
663 0.04
664 0.04
665 0.05
666 0.05
667 0.05
668 0.05
669 0.06
670 0.07
671 0.1
672 0.14
673 0.14
674 0.15
675 0.19
676 0.2
677 0.21
678 0.2
679 0.2
680 0.18
681 0.27
682 0.28
683 0.28
684 0.28
685 0.27
686 0.26
687 0.24
688 0.29
689 0.22
690 0.23
691 0.22
692 0.24
693 0.33
694 0.36
695 0.37
696 0.31
697 0.3
698 0.28
699 0.26
700 0.23
701 0.16
702 0.13
703 0.17
704 0.23
705 0.24
706 0.28
707 0.37
708 0.41
709 0.49
710 0.59
711 0.63
712 0.63
713 0.67
714 0.66
715 0.59
716 0.56
717 0.51
718 0.47
719 0.38
720 0.36
721 0.35
722 0.33
723 0.32
724 0.31
725 0.28
726 0.3
727 0.36
728 0.36
729 0.41
730 0.48
731 0.55
732 0.6
733 0.64
734 0.65
735 0.68
736 0.73
737 0.71
738 0.73
739 0.76
740 0.81
741 0.85
742 0.88
743 0.83
744 0.84
745 0.84
746 0.82
747 0.83
748 0.82
749 0.82
750 0.82
751 0.88
752 0.88
753 0.88
754 0.85
755 0.83
756 0.81
757 0.74
758 0.71
759 0.69
760 0.67
761 0.66
762 0.65
763 0.58
764 0.51
765 0.47
766 0.41
767 0.33
768 0.29
769 0.23
770 0.17
771 0.16
772 0.17
773 0.2
774 0.21
775 0.22
776 0.2
777 0.26
778 0.26
779 0.26
780 0.27
781 0.28
782 0.27
783 0.35
784 0.41
785 0.44
786 0.53
787 0.62
788 0.68
789 0.75
790 0.81
791 0.8
792 0.82
793 0.82
794 0.84
795 0.8
796 0.78
797 0.73
798 0.71
799 0.68
800 0.59
801 0.52
802 0.45
803 0.43
804 0.4
805 0.42
806 0.45
807 0.5
808 0.53
809 0.56
810 0.6
811 0.61
812 0.64
813 0.61
814 0.59
815 0.54
816 0.57
817 0.55
818 0.54
819 0.58
820 0.55
821 0.54
822 0.56
823 0.53
824 0.48
825 0.53
826 0.57
827 0.58
828 0.64
829 0.68
830 0.68
831 0.78