Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5M9JU02

Protein Details
Accession A0A5M9JU02    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-28MDPSKPDPLRIKQKPKLKAAPKEIKMDPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
12-20KQKPKLKAA
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 11.5, cyto 3.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006569  CID_dom  
IPR042326  Ctk3  
IPR024637  Ctk3_C  
IPR024638  Ctk3_N  
IPR008942  ENTH_VHS  
Gene Ontology GO:0070692  C:CTDK-1 complex  
GO:0032786  P:positive regulation of DNA-templated transcription, elongation  
Pfam View protein in Pfam  
PF12243  CTK3  
PF12350  CTK3_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51391  CID  
Amino Acid Sequences MDPSKPDPLRIKQKPKLKAAPKEIKMDPFEVRIRFTQYLQHLNATVTSANKTAQYALKYRDMDEDLHSCILEQLEKNSMNNRANIMYFIEILCDMASKEGHDDYVRMIQRDILRVVDAVAPEDGSGAANVKVVRKVLQGLQQKSFLLAQTVTEIEECLKERDTQPDVLMSSPPAETQANGNGTSQHATPKPAKPNEERHKRLREHIWAVPAEVPDAEFDKLWDETSELGDDDMDLYEEEAMERKEAGREWREEQVQRSRHEG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.83
2 0.84
3 0.85
4 0.84
5 0.83
6 0.83
7 0.86
8 0.82
9 0.81
10 0.74
11 0.71
12 0.64
13 0.58
14 0.49
15 0.44
16 0.45
17 0.39
18 0.38
19 0.34
20 0.37
21 0.35
22 0.34
23 0.35
24 0.35
25 0.42
26 0.4
27 0.39
28 0.34
29 0.32
30 0.32
31 0.26
32 0.22
33 0.15
34 0.15
35 0.14
36 0.14
37 0.15
38 0.15
39 0.16
40 0.19
41 0.21
42 0.24
43 0.27
44 0.33
45 0.33
46 0.34
47 0.35
48 0.33
49 0.31
50 0.3
51 0.28
52 0.23
53 0.23
54 0.21
55 0.16
56 0.15
57 0.14
58 0.13
59 0.11
60 0.11
61 0.16
62 0.17
63 0.18
64 0.21
65 0.27
66 0.27
67 0.28
68 0.28
69 0.24
70 0.24
71 0.23
72 0.21
73 0.15
74 0.13
75 0.11
76 0.1
77 0.08
78 0.08
79 0.07
80 0.06
81 0.05
82 0.05
83 0.06
84 0.05
85 0.07
86 0.07
87 0.08
88 0.08
89 0.08
90 0.09
91 0.16
92 0.17
93 0.16
94 0.16
95 0.19
96 0.2
97 0.22
98 0.21
99 0.15
100 0.14
101 0.13
102 0.14
103 0.12
104 0.1
105 0.08
106 0.07
107 0.07
108 0.06
109 0.06
110 0.05
111 0.04
112 0.04
113 0.04
114 0.04
115 0.06
116 0.07
117 0.07
118 0.08
119 0.09
120 0.1
121 0.1
122 0.11
123 0.12
124 0.2
125 0.26
126 0.28
127 0.3
128 0.31
129 0.3
130 0.29
131 0.27
132 0.19
133 0.13
134 0.1
135 0.08
136 0.08
137 0.08
138 0.08
139 0.07
140 0.07
141 0.06
142 0.08
143 0.09
144 0.09
145 0.1
146 0.11
147 0.13
148 0.19
149 0.21
150 0.21
151 0.2
152 0.21
153 0.2
154 0.19
155 0.18
156 0.13
157 0.11
158 0.1
159 0.1
160 0.1
161 0.09
162 0.09
163 0.1
164 0.15
165 0.16
166 0.16
167 0.17
168 0.15
169 0.16
170 0.17
171 0.16
172 0.16
173 0.15
174 0.19
175 0.24
176 0.31
177 0.39
178 0.43
179 0.49
180 0.51
181 0.61
182 0.68
183 0.73
184 0.72
185 0.72
186 0.77
187 0.74
188 0.75
189 0.72
190 0.7
191 0.66
192 0.63
193 0.6
194 0.51
195 0.49
196 0.44
197 0.35
198 0.27
199 0.2
200 0.17
201 0.12
202 0.13
203 0.12
204 0.09
205 0.1
206 0.12
207 0.12
208 0.13
209 0.12
210 0.11
211 0.11
212 0.13
213 0.14
214 0.11
215 0.11
216 0.1
217 0.09
218 0.09
219 0.08
220 0.07
221 0.06
222 0.06
223 0.06
224 0.06
225 0.07
226 0.09
227 0.09
228 0.1
229 0.1
230 0.11
231 0.14
232 0.18
233 0.26
234 0.29
235 0.34
236 0.37
237 0.45
238 0.51
239 0.52
240 0.56
241 0.58
242 0.58