Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5M9J8U8

Protein Details
Accession A0A5M9J8U8    Localization Confidence High Confidence Score 15.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
6-46TVAEASPKKHKSKSEKKHKSTDSEKKRKRENGEEGHRSKKHBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
12-48PKKHKSKSEKKHKSTDSEKKRKRENGEEGHRSKKHRS
313-313K
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 11.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
Amino Acid Sequences MPSQSTVAEASPKKHKSKSEKKHKSTDSEKKRKRENGEEGHRSKKHRSDKAVTTSSSIEAPAEVSPFHLQTSSLFLPLAPVSQKFPLEGLCAEHLSPLILTYYPPFNGVILSYSNPRFAERAFGNDGDSTLLQNLDEYAVSWAWVTAEFLLFKPEKGAWLEGYINLQNEGHLGLVCWNLFNASIERARLPKEWKWVGVAEQENDAEAEGGATYAADGVGYYVDGEGKKIEGTVKFRVKEIESNHDKERGFLTIDGTMLDDEAEMRLLETEQDKIGSRDSAGRRLGGAKALGATSLGVTVEPSAMEVDTGKKHKRRD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.62
3 0.65
4 0.73
5 0.79
6 0.81
7 0.85
8 0.87
9 0.91
10 0.89
11 0.87
12 0.87
13 0.87
14 0.87
15 0.87
16 0.87
17 0.86
18 0.89
19 0.88
20 0.86
21 0.85
22 0.84
23 0.84
24 0.86
25 0.87
26 0.82
27 0.83
28 0.79
29 0.73
30 0.71
31 0.69
32 0.69
33 0.68
34 0.71
35 0.7
36 0.74
37 0.79
38 0.77
39 0.68
40 0.61
41 0.53
42 0.45
43 0.37
44 0.28
45 0.18
46 0.12
47 0.13
48 0.1
49 0.09
50 0.08
51 0.1
52 0.11
53 0.12
54 0.12
55 0.11
56 0.11
57 0.11
58 0.18
59 0.16
60 0.15
61 0.15
62 0.14
63 0.16
64 0.16
65 0.17
66 0.11
67 0.11
68 0.13
69 0.16
70 0.17
71 0.15
72 0.16
73 0.15
74 0.15
75 0.15
76 0.15
77 0.14
78 0.15
79 0.14
80 0.14
81 0.12
82 0.1
83 0.1
84 0.07
85 0.06
86 0.05
87 0.06
88 0.07
89 0.1
90 0.09
91 0.1
92 0.1
93 0.1
94 0.1
95 0.1
96 0.09
97 0.09
98 0.1
99 0.13
100 0.13
101 0.15
102 0.15
103 0.16
104 0.15
105 0.14
106 0.19
107 0.16
108 0.2
109 0.2
110 0.2
111 0.21
112 0.2
113 0.2
114 0.15
115 0.14
116 0.1
117 0.08
118 0.07
119 0.06
120 0.06
121 0.06
122 0.05
123 0.04
124 0.04
125 0.05
126 0.05
127 0.05
128 0.05
129 0.05
130 0.05
131 0.05
132 0.05
133 0.04
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.09
138 0.09
139 0.09
140 0.1
141 0.1
142 0.11
143 0.12
144 0.13
145 0.09
146 0.11
147 0.12
148 0.11
149 0.13
150 0.12
151 0.11
152 0.1
153 0.1
154 0.08
155 0.07
156 0.07
157 0.05
158 0.04
159 0.04
160 0.05
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.05
165 0.05
166 0.06
167 0.07
168 0.06
169 0.08
170 0.09
171 0.1
172 0.12
173 0.13
174 0.15
175 0.18
176 0.22
177 0.24
178 0.31
179 0.33
180 0.32
181 0.33
182 0.32
183 0.3
184 0.31
185 0.3
186 0.22
187 0.21
188 0.2
189 0.18
190 0.17
191 0.15
192 0.08
193 0.06
194 0.05
195 0.03
196 0.03
197 0.03
198 0.03
199 0.03
200 0.03
201 0.03
202 0.02
203 0.02
204 0.02
205 0.03
206 0.03
207 0.03
208 0.03
209 0.05
210 0.05
211 0.06
212 0.06
213 0.07
214 0.07
215 0.08
216 0.11
217 0.14
218 0.19
219 0.27
220 0.34
221 0.34
222 0.35
223 0.38
224 0.37
225 0.39
226 0.39
227 0.41
228 0.41
229 0.44
230 0.46
231 0.48
232 0.45
233 0.41
234 0.38
235 0.3
236 0.25
237 0.21
238 0.21
239 0.17
240 0.17
241 0.15
242 0.14
243 0.12
244 0.1
245 0.09
246 0.06
247 0.05
248 0.05
249 0.06
250 0.05
251 0.05
252 0.06
253 0.06
254 0.08
255 0.09
256 0.1
257 0.11
258 0.12
259 0.14
260 0.14
261 0.17
262 0.15
263 0.16
264 0.23
265 0.26
266 0.32
267 0.32
268 0.32
269 0.31
270 0.33
271 0.33
272 0.28
273 0.25
274 0.19
275 0.18
276 0.17
277 0.16
278 0.13
279 0.12
280 0.08
281 0.08
282 0.07
283 0.06
284 0.06
285 0.07
286 0.07
287 0.06
288 0.07
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.08
293 0.12
294 0.19
295 0.26
296 0.35