Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1VXZ4

Protein Details
Accession H1VXZ4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
243-266EAGRSSGKGKKRKVKTSISPSELLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
244-257AGRSSGKGKKRKVK
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 10, cysk 6, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006575  RWD-domain  
IPR016135  UBQ-conjugating_enzyme/RWD  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
IPR017907  Znf_RING_CS  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF05773  RWD  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50908  RWD  
PS00518  ZF_RING_1  
PS50089  ZF_RING_2  
CDD cd23134  RING-HC_ITT1-like  
Amino Acid Sequences MDDDSDDPRQDELGSLQAIFPEIQPDDRRPYCFTIELPVHPAKPVTVTFPAAANAEDAAAAQLLPGAEPRVDSHELSHLPAVVVRIDLPEGYPSEKPPNVSISTSPPWLTRDVTKKLEGDGQRLWEEMGRDMVVFTYIDHIQQASDDVFGMVDGNGTLEIDPSHKIAILDYDIEATRASFEKETFDCGICLDPKKGSVCHKMLDCGHIFCIQCLQEFYDNAITEGDLATVRCLAPNCSKERAEAGRSSGKGKKRKVKTSISPSELLQMGLSQET
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.15
3 0.14
4 0.14
5 0.15
6 0.14
7 0.13
8 0.13
9 0.13
10 0.18
11 0.21
12 0.25
13 0.33
14 0.36
15 0.4
16 0.39
17 0.43
18 0.42
19 0.41
20 0.37
21 0.36
22 0.36
23 0.35
24 0.36
25 0.35
26 0.32
27 0.3
28 0.3
29 0.22
30 0.22
31 0.21
32 0.19
33 0.19
34 0.21
35 0.21
36 0.21
37 0.22
38 0.19
39 0.18
40 0.14
41 0.11
42 0.09
43 0.08
44 0.07
45 0.06
46 0.05
47 0.04
48 0.04
49 0.05
50 0.04
51 0.05
52 0.05
53 0.06
54 0.06
55 0.07
56 0.08
57 0.13
58 0.15
59 0.16
60 0.16
61 0.21
62 0.22
63 0.22
64 0.22
65 0.17
66 0.14
67 0.15
68 0.15
69 0.09
70 0.09
71 0.07
72 0.07
73 0.07
74 0.07
75 0.07
76 0.07
77 0.08
78 0.1
79 0.11
80 0.13
81 0.19
82 0.2
83 0.21
84 0.21
85 0.25
86 0.24
87 0.25
88 0.24
89 0.24
90 0.25
91 0.25
92 0.24
93 0.21
94 0.21
95 0.21
96 0.21
97 0.21
98 0.26
99 0.3
100 0.33
101 0.34
102 0.33
103 0.32
104 0.37
105 0.32
106 0.29
107 0.25
108 0.25
109 0.22
110 0.22
111 0.21
112 0.16
113 0.15
114 0.11
115 0.11
116 0.08
117 0.07
118 0.07
119 0.07
120 0.06
121 0.05
122 0.05
123 0.06
124 0.06
125 0.07
126 0.07
127 0.07
128 0.06
129 0.06
130 0.07
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.05
138 0.03
139 0.03
140 0.03
141 0.03
142 0.03
143 0.03
144 0.03
145 0.03
146 0.04
147 0.05
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.07
152 0.07
153 0.07
154 0.08
155 0.08
156 0.08
157 0.08
158 0.09
159 0.08
160 0.09
161 0.08
162 0.07
163 0.07
164 0.07
165 0.09
166 0.08
167 0.09
168 0.12
169 0.13
170 0.17
171 0.18
172 0.17
173 0.16
174 0.16
175 0.18
176 0.17
177 0.19
178 0.16
179 0.15
180 0.18
181 0.2
182 0.24
183 0.28
184 0.33
185 0.34
186 0.36
187 0.37
188 0.39
189 0.38
190 0.39
191 0.34
192 0.27
193 0.26
194 0.27
195 0.25
196 0.2
197 0.24
198 0.19
199 0.18
200 0.18
201 0.2
202 0.19
203 0.19
204 0.22
205 0.23
206 0.22
207 0.22
208 0.21
209 0.17
210 0.14
211 0.14
212 0.11
213 0.07
214 0.07
215 0.07
216 0.08
217 0.08
218 0.1
219 0.11
220 0.15
221 0.23
222 0.29
223 0.33
224 0.38
225 0.39
226 0.38
227 0.45
228 0.47
229 0.43
230 0.4
231 0.41
232 0.43
233 0.44
234 0.48
235 0.47
236 0.5
237 0.54
238 0.61
239 0.65
240 0.67
241 0.76
242 0.79
243 0.83
244 0.85
245 0.87
246 0.88
247 0.83
248 0.75
249 0.65
250 0.61
251 0.51
252 0.41
253 0.3
254 0.21