Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5M9JHX9

Protein Details
Accession A0A5M9JHX9    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
179-198DGYRSRRYDEREQRNRQREDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
164-172RRKREGGRR
Subcellular Location(s) nucl 11.5, cyto_nucl 11.5, cyto 10.5, cysk 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019416  NCBP3  
Gene Ontology GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0000340  F:RNA 7-methylguanosine cap binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF10309  NCBP3  
Amino Acid Sequences MATDMDIDMDIDVGVIEELPVPDMVDIELIPDQPSGIPRSPHTEKVHIRGLDNLTTGDVKKFAQHYFPTGHIERVEWIDDSSLNLVYSNNEVAGEALRQFSTQELPEDISQLPILQCLNAKPFPDNEKISLQVRLAVVGDRKQRGARERSRFYLFNPEHDPAERRKREGGRRYRDRDDDGYRSRRYDEREQRNRQREDAEAGFDASLYDDDEAALATRSGRIHRRSGSGSSGSDFRERTDNRRGSGLRELFPDRGVNDGRLRDRSASPIRNEERARDYNRRRGNTAAAENRSKAQAIKARFRREISTTKELFPSKLSSTHHRSGVLDATDETADLFANRMPVPFMDGSSDVRPSNKRSLAERITSEQPQGFSIRGTAKPASTSGFSIKGLASETSATTMKELFPARAGGGNSGKELFAERLVGRGGRRQKAEDLFH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.04
2 0.04
3 0.04
4 0.06
5 0.06
6 0.07
7 0.07
8 0.08
9 0.08
10 0.08
11 0.08
12 0.07
13 0.07
14 0.08
15 0.09
16 0.09
17 0.1
18 0.1
19 0.1
20 0.11
21 0.14
22 0.18
23 0.2
24 0.23
25 0.24
26 0.33
27 0.38
28 0.45
29 0.48
30 0.52
31 0.54
32 0.58
33 0.64
34 0.58
35 0.54
36 0.52
37 0.5
38 0.43
39 0.38
40 0.32
41 0.25
42 0.25
43 0.25
44 0.2
45 0.17
46 0.15
47 0.19
48 0.22
49 0.23
50 0.27
51 0.29
52 0.32
53 0.33
54 0.36
55 0.38
56 0.35
57 0.36
58 0.3
59 0.29
60 0.26
61 0.25
62 0.24
63 0.18
64 0.16
65 0.15
66 0.14
67 0.14
68 0.14
69 0.12
70 0.1
71 0.1
72 0.1
73 0.1
74 0.12
75 0.11
76 0.09
77 0.09
78 0.09
79 0.09
80 0.09
81 0.09
82 0.08
83 0.09
84 0.09
85 0.09
86 0.09
87 0.1
88 0.12
89 0.12
90 0.13
91 0.13
92 0.16
93 0.16
94 0.18
95 0.17
96 0.15
97 0.14
98 0.13
99 0.12
100 0.11
101 0.11
102 0.09
103 0.1
104 0.11
105 0.17
106 0.18
107 0.19
108 0.19
109 0.23
110 0.28
111 0.33
112 0.33
113 0.31
114 0.31
115 0.33
116 0.33
117 0.32
118 0.26
119 0.24
120 0.21
121 0.19
122 0.17
123 0.16
124 0.17
125 0.19
126 0.25
127 0.23
128 0.25
129 0.27
130 0.31
131 0.37
132 0.44
133 0.48
134 0.52
135 0.56
136 0.59
137 0.61
138 0.58
139 0.51
140 0.53
141 0.44
142 0.39
143 0.39
144 0.35
145 0.32
146 0.33
147 0.34
148 0.3
149 0.4
150 0.38
151 0.35
152 0.42
153 0.49
154 0.57
155 0.64
156 0.67
157 0.67
158 0.75
159 0.79
160 0.78
161 0.74
162 0.69
163 0.65
164 0.6
165 0.57
166 0.54
167 0.54
168 0.49
169 0.47
170 0.44
171 0.42
172 0.42
173 0.45
174 0.48
175 0.52
176 0.62
177 0.7
178 0.78
179 0.83
180 0.79
181 0.71
182 0.63
183 0.54
184 0.48
185 0.39
186 0.31
187 0.22
188 0.2
189 0.17
190 0.14
191 0.12
192 0.07
193 0.06
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.03
203 0.03
204 0.05
205 0.06
206 0.09
207 0.16
208 0.19
209 0.23
210 0.25
211 0.29
212 0.3
213 0.32
214 0.32
215 0.29
216 0.26
217 0.22
218 0.22
219 0.2
220 0.2
221 0.18
222 0.15
223 0.21
224 0.22
225 0.27
226 0.35
227 0.36
228 0.35
229 0.41
230 0.4
231 0.35
232 0.43
233 0.4
234 0.32
235 0.32
236 0.34
237 0.28
238 0.29
239 0.26
240 0.18
241 0.18
242 0.18
243 0.17
244 0.18
245 0.21
246 0.23
247 0.24
248 0.25
249 0.24
250 0.24
251 0.29
252 0.34
253 0.35
254 0.35
255 0.42
256 0.43
257 0.47
258 0.47
259 0.44
260 0.43
261 0.44
262 0.48
263 0.5
264 0.54
265 0.56
266 0.64
267 0.63
268 0.58
269 0.54
270 0.54
271 0.5
272 0.51
273 0.49
274 0.46
275 0.45
276 0.44
277 0.42
278 0.37
279 0.31
280 0.24
281 0.23
282 0.24
283 0.27
284 0.36
285 0.43
286 0.49
287 0.53
288 0.54
289 0.52
290 0.52
291 0.54
292 0.52
293 0.53
294 0.48
295 0.46
296 0.49
297 0.46
298 0.42
299 0.36
300 0.32
301 0.25
302 0.28
303 0.29
304 0.32
305 0.39
306 0.43
307 0.43
308 0.41
309 0.4
310 0.37
311 0.39
312 0.31
313 0.24
314 0.19
315 0.18
316 0.17
317 0.15
318 0.13
319 0.08
320 0.07
321 0.06
322 0.06
323 0.05
324 0.09
325 0.09
326 0.09
327 0.1
328 0.1
329 0.15
330 0.14
331 0.14
332 0.14
333 0.15
334 0.18
335 0.2
336 0.22
337 0.18
338 0.22
339 0.26
340 0.28
341 0.36
342 0.38
343 0.39
344 0.41
345 0.5
346 0.52
347 0.54
348 0.52
349 0.48
350 0.48
351 0.47
352 0.46
353 0.38
354 0.33
355 0.29
356 0.27
357 0.23
358 0.18
359 0.2
360 0.22
361 0.21
362 0.25
363 0.25
364 0.25
365 0.26
366 0.27
367 0.26
368 0.22
369 0.24
370 0.22
371 0.23
372 0.22
373 0.22
374 0.21
375 0.19
376 0.19
377 0.17
378 0.15
379 0.13
380 0.13
381 0.15
382 0.16
383 0.15
384 0.14
385 0.15
386 0.14
387 0.19
388 0.2
389 0.18
390 0.19
391 0.2
392 0.21
393 0.24
394 0.24
395 0.24
396 0.27
397 0.27
398 0.27
399 0.26
400 0.25
401 0.21
402 0.23
403 0.19
404 0.15
405 0.19
406 0.17
407 0.18
408 0.21
409 0.23
410 0.23
411 0.3
412 0.38
413 0.41
414 0.45
415 0.47
416 0.53