Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5M9K4D8

Protein Details
Accession A0A5M9K4D8    Localization Confidence High Confidence Score 19.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
362-388PSPPPKVKTPINKQKTKRRASTPNPLNHydrophilic
426-464ATYSPPPKRPQSPPKPPNPQSPPAKKKGKLGKLGGKRAPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
193-203GRKVDRKKASE
374-379KQKTKR
432-466PKRPQSPPKPPNPQSPPAKKKGKLGKLGGKRAPSP
482-500ATKPRPRRGMLGRIGGKKK
570-597ERADKKRETLKRELEAKSKAPVKKKRKF
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 12.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015381  XLF_N  
IPR038051  XRCC4-like_N_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF09302  XLF  
CDD cd22285  HD_XLF_N  
Amino Acid Sequences MSWKPLDLSSSAGAQLPPFLISSEFNHNSYLVRLTDLTNTWAEGIDRDAIIARSREENPSIDPSEDDDQLSIFLDKIKLGLAREKDTSLSLHVGVNVGSDPLPPLLLRVKVPLPGGLKDLEWQYRLKPQSPEDTAETLVIPSLVALQEERQGIEKLVKLLEEKDVVIQKLVDTLENQGTDLGTIFHQAAGRSGRKVDRKKASEKVRGLKTFDLDDWRSGAGFDNAGDTWDLLNNVFGGGDMNINISPTNDLGRKAQRCGWWDRVHGKTVGTSENLVANSPKDLPNRDTKQQTISSEDDFQVQSTPPHLSKSRPVPDISMDDSTDDDEDDDLNVPSQRSRIPDSLPISQVRAPSPDRTPTPSPSPPPKVKTPINKQKTKRRASTPNPLNLNADDTTEDDDEPILKNSHSTKILDNDVDDNDTMDDDATYSPPPKRPQSPPKPPNPQSPPAKKKGKLGKLGGKRAPSPELEREPDLEPEAEPEATKPRPRRGMLGRIGGKKKETTATPEIEAQSSMSPKKKLGAIDGKKAVVGDVSQVEDTPGEKTRGRGREQKMVEEEETKEKTPRESSQERADKKRETLKRELEAKSKAPVKKKRKF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.18
3 0.14
4 0.13
5 0.12
6 0.12
7 0.12
8 0.13
9 0.17
10 0.25
11 0.28
12 0.28
13 0.29
14 0.28
15 0.28
16 0.27
17 0.27
18 0.18
19 0.18
20 0.18
21 0.18
22 0.23
23 0.23
24 0.24
25 0.21
26 0.21
27 0.19
28 0.18
29 0.17
30 0.13
31 0.14
32 0.13
33 0.12
34 0.12
35 0.14
36 0.14
37 0.17
38 0.18
39 0.17
40 0.2
41 0.23
42 0.27
43 0.28
44 0.29
45 0.29
46 0.35
47 0.35
48 0.31
49 0.29
50 0.29
51 0.3
52 0.29
53 0.25
54 0.19
55 0.16
56 0.16
57 0.16
58 0.12
59 0.09
60 0.1
61 0.11
62 0.1
63 0.11
64 0.13
65 0.14
66 0.16
67 0.22
68 0.24
69 0.28
70 0.3
71 0.31
72 0.29
73 0.29
74 0.28
75 0.23
76 0.21
77 0.18
78 0.17
79 0.17
80 0.16
81 0.14
82 0.14
83 0.11
84 0.09
85 0.08
86 0.07
87 0.08
88 0.08
89 0.08
90 0.07
91 0.1
92 0.13
93 0.15
94 0.16
95 0.19
96 0.2
97 0.23
98 0.24
99 0.27
100 0.26
101 0.25
102 0.26
103 0.23
104 0.21
105 0.21
106 0.24
107 0.22
108 0.21
109 0.21
110 0.22
111 0.29
112 0.32
113 0.35
114 0.36
115 0.37
116 0.45
117 0.47
118 0.48
119 0.44
120 0.43
121 0.38
122 0.33
123 0.29
124 0.2
125 0.16
126 0.12
127 0.08
128 0.05
129 0.06
130 0.05
131 0.05
132 0.06
133 0.07
134 0.11
135 0.12
136 0.12
137 0.13
138 0.14
139 0.14
140 0.17
141 0.18
142 0.16
143 0.17
144 0.17
145 0.16
146 0.16
147 0.18
148 0.16
149 0.15
150 0.17
151 0.2
152 0.19
153 0.19
154 0.17
155 0.14
156 0.16
157 0.16
158 0.13
159 0.1
160 0.13
161 0.15
162 0.15
163 0.15
164 0.12
165 0.12
166 0.11
167 0.11
168 0.08
169 0.05
170 0.06
171 0.06
172 0.08
173 0.09
174 0.09
175 0.12
176 0.16
177 0.18
178 0.18
179 0.22
180 0.27
181 0.35
182 0.42
183 0.48
184 0.53
185 0.58
186 0.64
187 0.7
188 0.73
189 0.73
190 0.74
191 0.73
192 0.72
193 0.69
194 0.65
195 0.58
196 0.5
197 0.42
198 0.36
199 0.34
200 0.26
201 0.24
202 0.21
203 0.19
204 0.17
205 0.15
206 0.15
207 0.09
208 0.08
209 0.08
210 0.08
211 0.08
212 0.08
213 0.08
214 0.07
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.06
219 0.06
220 0.05
221 0.05
222 0.05
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.05
229 0.05
230 0.06
231 0.06
232 0.05
233 0.06
234 0.06
235 0.09
236 0.09
237 0.1
238 0.14
239 0.22
240 0.24
241 0.26
242 0.3
243 0.32
244 0.35
245 0.4
246 0.44
247 0.4
248 0.43
249 0.47
250 0.45
251 0.43
252 0.4
253 0.34
254 0.28
255 0.25
256 0.22
257 0.16
258 0.14
259 0.12
260 0.14
261 0.14
262 0.12
263 0.1
264 0.09
265 0.09
266 0.11
267 0.14
268 0.13
269 0.16
270 0.18
271 0.28
272 0.32
273 0.36
274 0.38
275 0.35
276 0.38
277 0.39
278 0.38
279 0.33
280 0.3
281 0.27
282 0.26
283 0.25
284 0.21
285 0.18
286 0.16
287 0.13
288 0.11
289 0.09
290 0.09
291 0.11
292 0.1
293 0.13
294 0.14
295 0.15
296 0.21
297 0.29
298 0.34
299 0.34
300 0.34
301 0.32
302 0.33
303 0.35
304 0.31
305 0.24
306 0.18
307 0.16
308 0.15
309 0.14
310 0.12
311 0.09
312 0.06
313 0.05
314 0.05
315 0.05
316 0.06
317 0.05
318 0.06
319 0.07
320 0.07
321 0.07
322 0.08
323 0.1
324 0.12
325 0.17
326 0.18
327 0.19
328 0.26
329 0.29
330 0.32
331 0.32
332 0.3
333 0.28
334 0.28
335 0.27
336 0.22
337 0.22
338 0.2
339 0.21
340 0.24
341 0.26
342 0.26
343 0.3
344 0.33
345 0.33
346 0.38
347 0.39
348 0.42
349 0.46
350 0.52
351 0.52
352 0.54
353 0.56
354 0.56
355 0.58
356 0.63
357 0.65
358 0.68
359 0.71
360 0.75
361 0.77
362 0.81
363 0.84
364 0.83
365 0.79
366 0.78
367 0.79
368 0.78
369 0.81
370 0.78
371 0.75
372 0.7
373 0.64
374 0.57
375 0.46
376 0.42
377 0.32
378 0.24
379 0.17
380 0.14
381 0.16
382 0.14
383 0.14
384 0.1
385 0.1
386 0.1
387 0.1
388 0.12
389 0.09
390 0.09
391 0.12
392 0.14
393 0.19
394 0.21
395 0.21
396 0.22
397 0.26
398 0.29
399 0.27
400 0.26
401 0.23
402 0.22
403 0.21
404 0.18
405 0.14
406 0.11
407 0.1
408 0.09
409 0.07
410 0.06
411 0.05
412 0.06
413 0.07
414 0.08
415 0.11
416 0.14
417 0.2
418 0.26
419 0.32
420 0.39
421 0.48
422 0.58
423 0.66
424 0.75
425 0.78
426 0.83
427 0.87
428 0.84
429 0.85
430 0.81
431 0.79
432 0.78
433 0.8
434 0.79
435 0.77
436 0.82
437 0.74
438 0.76
439 0.77
440 0.76
441 0.73
442 0.74
443 0.74
444 0.74
445 0.8
446 0.75
447 0.69
448 0.63
449 0.58
450 0.53
451 0.47
452 0.43
453 0.42
454 0.43
455 0.43
456 0.42
457 0.41
458 0.39
459 0.37
460 0.33
461 0.25
462 0.19
463 0.18
464 0.18
465 0.16
466 0.14
467 0.13
468 0.18
469 0.22
470 0.29
471 0.33
472 0.4
473 0.49
474 0.51
475 0.58
476 0.6
477 0.66
478 0.66
479 0.69
480 0.68
481 0.68
482 0.72
483 0.66
484 0.61
485 0.52
486 0.49
487 0.44
488 0.39
489 0.38
490 0.4
491 0.4
492 0.39
493 0.42
494 0.4
495 0.35
496 0.33
497 0.26
498 0.22
499 0.23
500 0.26
501 0.27
502 0.27
503 0.28
504 0.32
505 0.34
506 0.33
507 0.39
508 0.44
509 0.46
510 0.53
511 0.56
512 0.52
513 0.49
514 0.47
515 0.37
516 0.27
517 0.21
518 0.15
519 0.12
520 0.14
521 0.14
522 0.14
523 0.14
524 0.14
525 0.14
526 0.14
527 0.15
528 0.17
529 0.19
530 0.23
531 0.32
532 0.39
533 0.45
534 0.52
535 0.54
536 0.61
537 0.63
538 0.66
539 0.63
540 0.6
541 0.57
542 0.51
543 0.48
544 0.47
545 0.47
546 0.41
547 0.4
548 0.37
549 0.39
550 0.42
551 0.45
552 0.46
553 0.49
554 0.53
555 0.59
556 0.67
557 0.69
558 0.72
559 0.73
560 0.7
561 0.71
562 0.75
563 0.73
564 0.71
565 0.74
566 0.74
567 0.75
568 0.77
569 0.76
570 0.74
571 0.72
572 0.67
573 0.65
574 0.64
575 0.62
576 0.64
577 0.68