Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5M9JVK2

Protein Details
Accession A0A5M9JVK2    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
374-401SKWSSGKRGTHFRKKRRWERIRHIVSTTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
379-393GKRGTHFRKKRRWER
Subcellular Location(s) nucl 10.5, mito_nucl 10, mito 8.5, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MHHLVKANAWVVLRLPSDNLKVLQVVPNTPISLGKYGTFPSNLIIDRPYNLKYELVDRQKDQKYSDLRIVPASEIHADTIAEEDAAANPVADDNVIIGGDGVEFELVGENGEVIMRSNRETIDDSARQTLTQEEIETLKRDGAAAGKDLIAKLMLSHTALDEKTAFSLAKYKLLKTRKYLRQFTILPMDVAMMDYWMMKERDASKIMELRDEMLALAGSWANVHFSEDLENEHADPLNTSGGGRLLVVDETGGLLVAAMAERMGLLYPEEGQDLPTEFTGALEEAQADKKSAPRDQLDRQYRPYASTNTLTLVHTNSQPNLSLLKYFNFNIDSPAASHPLTKHLLPISWLQLISPESDSLYSSPPPSATPEELSKWSSGKRGTHFRKKRRWERIRHIVSTTRHGDFTGLVVASNMDPISIIRRTIHLLRPGATITIYSPTIEPLVALADLYSTSRRTAFIQAPPEELKGLSQAEIATWQGNEDFPLNPSLILNTSVQSCRKREWQVLPGRTHPLMTSKGGAEGYLFTGTRVVPAEGKVAARGKFSKRPKAVNGGEDANMSIPEDTQESANKKVKLDMESLDAQTNDKSDVDMEI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.22
3 0.23
4 0.27
5 0.29
6 0.29
7 0.25
8 0.25
9 0.27
10 0.3
11 0.27
12 0.26
13 0.25
14 0.27
15 0.26
16 0.24
17 0.25
18 0.22
19 0.22
20 0.22
21 0.2
22 0.2
23 0.21
24 0.24
25 0.23
26 0.2
27 0.19
28 0.23
29 0.22
30 0.21
31 0.23
32 0.21
33 0.22
34 0.25
35 0.25
36 0.23
37 0.24
38 0.24
39 0.22
40 0.27
41 0.34
42 0.4
43 0.43
44 0.44
45 0.52
46 0.57
47 0.59
48 0.55
49 0.54
50 0.52
51 0.52
52 0.57
53 0.51
54 0.46
55 0.46
56 0.45
57 0.37
58 0.32
59 0.29
60 0.23
61 0.19
62 0.18
63 0.15
64 0.14
65 0.13
66 0.13
67 0.1
68 0.08
69 0.07
70 0.07
71 0.07
72 0.08
73 0.08
74 0.06
75 0.06
76 0.07
77 0.07
78 0.06
79 0.05
80 0.04
81 0.05
82 0.05
83 0.05
84 0.04
85 0.04
86 0.04
87 0.04
88 0.04
89 0.03
90 0.03
91 0.03
92 0.04
93 0.04
94 0.05
95 0.05
96 0.04
97 0.05
98 0.05
99 0.05
100 0.05
101 0.08
102 0.09
103 0.11
104 0.13
105 0.13
106 0.16
107 0.19
108 0.22
109 0.27
110 0.29
111 0.29
112 0.32
113 0.32
114 0.29
115 0.27
116 0.25
117 0.19
118 0.17
119 0.16
120 0.13
121 0.15
122 0.17
123 0.18
124 0.17
125 0.15
126 0.14
127 0.14
128 0.13
129 0.14
130 0.14
131 0.13
132 0.13
133 0.14
134 0.14
135 0.14
136 0.14
137 0.1
138 0.09
139 0.08
140 0.08
141 0.08
142 0.07
143 0.08
144 0.08
145 0.11
146 0.11
147 0.12
148 0.11
149 0.11
150 0.11
151 0.12
152 0.11
153 0.08
154 0.16
155 0.16
156 0.23
157 0.24
158 0.26
159 0.33
160 0.41
161 0.46
162 0.46
163 0.56
164 0.58
165 0.66
166 0.71
167 0.66
168 0.67
169 0.63
170 0.6
171 0.57
172 0.48
173 0.39
174 0.31
175 0.28
176 0.19
177 0.18
178 0.13
179 0.05
180 0.05
181 0.05
182 0.05
183 0.09
184 0.09
185 0.08
186 0.12
187 0.14
188 0.19
189 0.21
190 0.22
191 0.21
192 0.25
193 0.26
194 0.24
195 0.23
196 0.19
197 0.17
198 0.16
199 0.13
200 0.09
201 0.08
202 0.06
203 0.06
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.05
209 0.05
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.08
214 0.09
215 0.1
216 0.11
217 0.11
218 0.1
219 0.1
220 0.1
221 0.08
222 0.08
223 0.08
224 0.07
225 0.06
226 0.06
227 0.06
228 0.06
229 0.06
230 0.06
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.04
236 0.04
237 0.04
238 0.03
239 0.03
240 0.02
241 0.02
242 0.02
243 0.02
244 0.02
245 0.02
246 0.02
247 0.02
248 0.02
249 0.02
250 0.02
251 0.02
252 0.03
253 0.03
254 0.04
255 0.04
256 0.05
257 0.05
258 0.06
259 0.06
260 0.07
261 0.07
262 0.07
263 0.07
264 0.06
265 0.06
266 0.06
267 0.06
268 0.05
269 0.04
270 0.05
271 0.05
272 0.07
273 0.07
274 0.07
275 0.08
276 0.11
277 0.14
278 0.16
279 0.19
280 0.21
281 0.26
282 0.31
283 0.41
284 0.46
285 0.46
286 0.48
287 0.48
288 0.45
289 0.43
290 0.4
291 0.33
292 0.28
293 0.26
294 0.23
295 0.2
296 0.21
297 0.18
298 0.16
299 0.14
300 0.13
301 0.15
302 0.15
303 0.14
304 0.14
305 0.14
306 0.14
307 0.14
308 0.12
309 0.12
310 0.11
311 0.12
312 0.13
313 0.13
314 0.14
315 0.15
316 0.15
317 0.14
318 0.14
319 0.13
320 0.13
321 0.14
322 0.14
323 0.13
324 0.14
325 0.12
326 0.16
327 0.17
328 0.15
329 0.17
330 0.16
331 0.16
332 0.16
333 0.18
334 0.16
335 0.16
336 0.16
337 0.13
338 0.14
339 0.15
340 0.14
341 0.13
342 0.1
343 0.09
344 0.09
345 0.1
346 0.09
347 0.11
348 0.1
349 0.1
350 0.11
351 0.11
352 0.11
353 0.14
354 0.16
355 0.16
356 0.17
357 0.19
358 0.21
359 0.23
360 0.24
361 0.21
362 0.2
363 0.2
364 0.21
365 0.23
366 0.26
367 0.3
368 0.39
369 0.47
370 0.57
371 0.66
372 0.72
373 0.78
374 0.84
375 0.88
376 0.89
377 0.9
378 0.89
379 0.9
380 0.91
381 0.88
382 0.81
383 0.74
384 0.7
385 0.63
386 0.59
387 0.53
388 0.43
389 0.35
390 0.32
391 0.28
392 0.21
393 0.19
394 0.15
395 0.11
396 0.09
397 0.09
398 0.09
399 0.08
400 0.09
401 0.08
402 0.04
403 0.05
404 0.05
405 0.09
406 0.09
407 0.11
408 0.1
409 0.12
410 0.16
411 0.21
412 0.26
413 0.29
414 0.3
415 0.31
416 0.32
417 0.31
418 0.28
419 0.23
420 0.18
421 0.12
422 0.13
423 0.11
424 0.1
425 0.1
426 0.1
427 0.11
428 0.1
429 0.09
430 0.06
431 0.07
432 0.06
433 0.06
434 0.05
435 0.05
436 0.05
437 0.06
438 0.08
439 0.08
440 0.09
441 0.1
442 0.12
443 0.14
444 0.2
445 0.25
446 0.29
447 0.36
448 0.36
449 0.4
450 0.4
451 0.39
452 0.33
453 0.27
454 0.22
455 0.17
456 0.16
457 0.13
458 0.12
459 0.11
460 0.1
461 0.12
462 0.12
463 0.1
464 0.09
465 0.09
466 0.09
467 0.09
468 0.1
469 0.1
470 0.1
471 0.1
472 0.12
473 0.12
474 0.11
475 0.11
476 0.12
477 0.11
478 0.13
479 0.12
480 0.12
481 0.15
482 0.19
483 0.24
484 0.29
485 0.3
486 0.33
487 0.41
488 0.47
489 0.52
490 0.56
491 0.6
492 0.65
493 0.7
494 0.7
495 0.66
496 0.65
497 0.57
498 0.5
499 0.42
500 0.36
501 0.32
502 0.3
503 0.28
504 0.23
505 0.25
506 0.24
507 0.23
508 0.18
509 0.16
510 0.15
511 0.15
512 0.14
513 0.11
514 0.13
515 0.13
516 0.15
517 0.15
518 0.15
519 0.14
520 0.15
521 0.18
522 0.18
523 0.19
524 0.21
525 0.24
526 0.24
527 0.28
528 0.33
529 0.38
530 0.45
531 0.54
532 0.6
533 0.62
534 0.69
535 0.71
536 0.75
537 0.74
538 0.7
539 0.66
540 0.59
541 0.52
542 0.44
543 0.38
544 0.28
545 0.22
546 0.18
547 0.12
548 0.09
549 0.09
550 0.1
551 0.1
552 0.12
553 0.19
554 0.21
555 0.3
556 0.37
557 0.39
558 0.38
559 0.44
560 0.47
561 0.44
562 0.45
563 0.38
564 0.37
565 0.39
566 0.39
567 0.37
568 0.32
569 0.29
570 0.26
571 0.25
572 0.21
573 0.17
574 0.16